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gene from alignment at Sc0000046:250145..259954+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL96251 ID=gene:BL96251|Name=gene:BL96251|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=9810bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000046:250145..259954+ (Branchiostoma lanceolatum) GCAGATTTTGTCCCAGCAAAGCCCGTTCCTTCTCCTGTGTACCTTCCCTG
ATGCAGGTGTTCCGACAGACCCTAAACCCGACCACAGGCCGGGCGGAGTG
GGCCGCTATGGACGAGGACTACGACTATAACCAGGAGGTGGCGAGGTGAG
TACGCATGGGGGAGGGGGGCGTGAACGGCGTGAACTACAGGATGTTGTGT
TGGACTAGTGTGAAGCCTCAGGGAATCCTCTATATCTTGAGGATACCTTG
AGGATTCATCGGTGAAGTTGGCCTGGCCTGTGTTGTCACCCTCTTCTCAC
TCAGGAAGGTACCTCTTCTTCTCCTAATGTAAATCCAGCCTTGTTTTAAA
ACAGTTCGCAGTTTCAGCTTCAACTGCTAGTACGAGTTCCAATTGTTGAC
AACTCTCGTTACGAAAGACTTCCTGCGTACTGAAGTTTTTGCTAGTGACA
CATTCAACTTGAAACAGTGGCCTCTTGTTTTGTCCTTATTCTCAGACTGG
AATTCGAAGAAGGGCTCAAGATCTACTCTTTCTTTCCCGGTTACAATCTT
ATAGACCTGAATCATATCCCCTCTCTCTCTTCTGAACTTAAGTGACGGGA
GCCTCAACTTTTACATACTCTTACTGTAAGGGAGTGACTTGAGCAATGGT
ACCAGCCTAGTGGCCCTACGTTGTACTTTCTCCACTGCACTCTGGTCTAA
ATCTATCTATAAATCATATCCCTGACAGCTCTTTGGTGTAACACCCCAGA
TTCACAGTGTATGTTGGTGCCTGGTTCTATTGATAGATTGAAAACTAATT
GTATTATTAACGTTACTGTCACAGAATGAAATAATATTGTCTTCATAAGA
TGATAGATGGATATTAATCATGATGATTATAATGATGAGGCGCTTAAACT
ATAACGATATCTTTCTCCTCAGGTCTTCCTACACAGACATGCTGCATGAT
GAAGAGAGGGTGAGTCAGAACCACTGCTTCTGTCTTGTATATGAAATGAA
ATGTGTCCCACATCCCCGAAGGGACCTTGGGTATAATCTCGGGCTGTTCG
TTGGCACGGCATGCATTTTTGGCCATTTATATATTATGCTCGCACCGGGT
CACGCCTAGTCTTTTCTACTAGTACTAGTATAAGTGCGTTGGGTTCTTGA
GGCTTATGCCCCGGCCGCGAGCTCCCTCATACATGGGGCCGCCGGCTTTA
TGTCACCATCCGAAATGACGAATGCAGTCTCTTACAACATGTCCAAGCTG
AGCCGACCCAAAGATCGAATTACTAGTAGGGCCCCAGGATCCACGGACTT
TGATCCAGATGGGGAAGCAGCGGAGTTGCGTTACCGCTTGTGCCACAGGG
ACATGCCTTGTATGATCAGAGTTTATATTTTTGATTTGTTAACCGTTAAT
AGATAAGTAAACGGTAACTTTTAGCTACTTTAACACACACCGATCATGAC
CTATATTTTGCTTCAAAAGACTTTTAATTCAACTTTTTTTTTCTTCCACA
CAGAATAAGAAGTACAAGGCAGGTTTGGAGCTGGCGATCGGGCGTGTCCG
TGGGCGGGGCCAGCGTGCACACGTGTTGGACATCGGGACCGGCAGCGGGC
TCCTGTCCATGCTGGCCGCACAGGCGGGGGCAGACAAGGTCACCGCTTGT
GAGGTTAGAACACAGGTTACAGAGAACTGGCCTGTAATCCATTAATTTTT
ATTTTTAGAATAAAAAAGCTATTTTATTCTTAAAGTCTAGAATAGAATAA
GATTAAGTTCTTTTTTAGCCTACTAGAAGCTACCTAATAGTATCTAGTAT
CTATCCGGTAGTTACAAAGAGCTGGCCTCTAATCCAGTCTATTCTTTAAC
CTATCTATGCTGTAGTTCTTGTTTCTTTAACTGTAAATTTATGGTTCACT
GTTTTCACAGTCACCTCTGGACTGTGAACTTATCATCACCTTGAAAAACC
TACGTATGACACATGTCATAATTCCTTCGCACATTTATTCCTTCGTTCAT
CTAAATCAGCAAAGAGGGGCGCTGCACCCTCTTGTTTCAGCCCAGCGCCC
CCTTGTCGAATTCAGATTTTAGCGTAATATCAAGCATACAGCCTTCACTC
AGCAATTGATTCATCCACAAATACATAGAATTCACTCCCTCGCCGGTGTG
TATTCCCTCTTGTTCAATTTTTCTAGAAAAAACCCCTGGTACTACCAGAG
CTAGCTAGCTAGGAAATCATAACAATTTTGCCTCTCAACATATGCTTTGA
GATTACAGTAAAATTAGTGTATGTTATTTATACAGCATGCTTCCAACTGT
AAAACAACACCTCATGCCTCATTTATGCTGTGTACATGTACATAAATAAG
TTAAATGATTCGTTTCAGCTTACATTTATTATATACTTTGGTATTGTATA
TGGTACAACTACATGTATTTTCACATGTAAGTCCACACACAAGACTTAAA
TGCATACTATACACATCTTATTAGTTATATCGGATTATAGAAAACAAGCC
TTAGGGTTATTTCTTGAAATTAATTAAAGGCACCCAGAGCATTTTATGAG
GCTTGAAAACTGGAAATACTAGATAGTTGTTGTAATTTTTATGAAATTGA
CATATAATGCCACTGTTAACCACATTTGCGTGCGAATTTATCAAAAGTGC
TCAAAAGCGGCACAAAAATAAGCTACATGGTGATCTTTTAGTTTCACGCG
CCTAGTGTAAATAGACCAATACCATAGCCCCGCCCACCTCCGTCAAAACA
TAGAAATGCAAAATCAAAGCATAAAGATGCAAATATTTGTCACATGCAGT
CACTCTCTCATTGGTCGAACCGCTAAAAGGGATGGACAGTCAGGATCAGT
CTATTAGGGCTTGGATTTTCTATCAGTTCTCACCACACAACGACATCGTA
TCCTTGCTCCTTTAATGTCGATATGTAAATTAAATGGTATAGTGTTATTG
AAACTTACTATGTGTAGGAATGACTAGAAATTGGATTTTTTTAATTCAAG
TTTCAAGCCTCATAAAATGCTCTGGATGCCTTTAAATGTGATTTTCGACT
CCCACCTCCAGTGTTTTAAGCCAATGGCGGGGGCAGCACGAAAGATCATC
CAGAAAAACGGCTTTGCTGACAAAATCACGGTCGTCCCTAAACGTTCAAC
TGACATGACAGCTGGGCCAGGTATGTTTCAATGGACCGATTCAGTTCGAA
CACCATAAACCTCGCCCCGTTCTATTTCGAATAGTCCGTCAAGAAACGGT
CGCGTGCGCTTGGCTGTTGAATTTGTGGACTATCTTCTCTTGAGCTTTTT
TGGCTCTGAAACCCTTTCAGAGCGGACCAAATAAAAATGATATGCCTTCT
TTGTGGACTTATGTATCCAACGAGTAGGGTCGTTTGAGGAGGGGGTAGAT
ATAGTTATGGTGAGGGTGATATGTTTTTGGTCAATGCGGAAGTGGGTTGC
GTCGCATAGCATTACCTTGTTGGTGACCATCAGTGCCCAATTTTTGACAA
GCAGCCAATGCACCTGTAAAACAGGGTAGGTATATCTGTGACAGGGTTCC
CACTGTGTTGATTGCCGAATTGAAACTTAACACATGCCATTTCTGTCCAA
CTAGCGCTGTTCTTGACGGAGGTATTCCAAATAGAATAGGGGGTTCTATA
TGTTCGATATGGTGTTTGACTGGATTAGTCCATTACGAAGTAAGGGTTAA
TGACCCGCCTATCCCTCGGTCGGTAATACATGTATTGTATATGGTGCCAT
AATGCCTGGTCATTTGCTATCACCACCAAATTACGCCGTCATAACTGACA
TGCAATGGGGACTTCTGATTGGTCAACGTCATCAGGTTATATAATTATAA
ACATTATAAGAGGTTTAGCTTCTGTTCTCTTTACCCAGAGATGCTCACTG
TGTTAAATATAATAACTGCTTTTCAGTAAAGCCTTAGACGCATAGCTGTT
TACAGCAATACATGTGCAAGTAAACATTGTCAAGCAAAAATAGATAAATA
GTTCAGTTTGAATAATCTGAAACCATATACATGATGTTATCCTTAGTCAT
AATCAACGTTATGATGATTTAAATCTTAGACACACAAGAATAATCTTATA
TATTTCTCTAAAAAGGGATACTGACTTAAAGCACAGTCATATGCAAAGTC
TTCCCTAGAACATTTCTGATAAATCTGATACCATGCCGTTTTCTTTCCAT
TTGCAGGAGGTGACATGGAGGAAAGAGCGAACATTTTAGTGGCAGAACTT
CTGGACACAGAGCTGATAGGAGAGGGGTGTCTGTACACGTACCAACATGC
ACTCAAACATCTGGTCACTGTAAGTCTAGATTTGATGCAACAGTACAGGG
TTTAAAATGTACTTAAAATGAAAAAAAAACAATAGGTCAGGGCTCTCTTC
AGCTTCTGTCTTTCCATTTTAGGATGAAATTTTGCTGCTGAGGAAAACCA
TTCTATCCCCCTAAATGAACAAAAGTAGGAACTTTACTGCATTTTTATGA
AGCTATCAACAGTGCAACAAAAATGTCTTCAAATTTAAAATGTTATTTAT
TGAACAGTATTACAATCATGATCGGAGTATGTGATAGACTTGCAATCATG
ATCATCTGACAGTCATGTGATGATCATGTGATGAGCATGTGACAGTCATC
ACATGTGACAGTCACAATGACTTGATGACCACCTGGCCATTTGAAATTGC
TTGAAATAGCATTTAGGAGGTTAAGATACCAAACTGTTAGGACAGTAACA
GCTGGAAAGAGCCCCAGGACATCACCATGTTCAGCACACCTGGCCCAGGT
GATCATCATGTGACTGTCACATGATCATTGCATGACTGTCACATGATCAT
CACATGACTGATCATTACTTGTTTATCACATACATGTACTCATATCATTG
TTACTAATGTTAGACTGTGACTTGATGGTCAAATTTACTAGTCATGAATA
TCACATTACATTGAAGCTTACTTGTAAAAAGGTATGAACTATTGTCATTT
TCATCATTTTCTCCATCCTGTTCTGCCCCCCTCCCCCACAGCCAGACTGC
ATATTTGTGCCCCATGCTGCCACAGTCTACGCCCAGGTGGTGGAGTCAGA
CTTTATGTGGAACTGGCACAGGCTACGGGACCTACCACTGACAGGTAGGG
GAAGAAGGGAATAAAATCTAAAAGCAATTATGGCGCAGTCAATTTCATCA
TAGGTTGTCGTACAATTTTGGTGTCGTCGAATGTCCGTCTCTGTTACAGA
GACAGGCATTCGACGACAGTATCTATACTAGTATCTCATTGGCCACACAT
GCAGGACTACAGTAGAGGGCTAGTCCACTGGTAGTTGTGTGTGTTCAAGT
CTTTCTCATATATTAAAGTACTGGCAAAGTCTTTGTTTTGTCCTTGCCAG
GGAAACTGAAACTGAAAAATGACATGTACATTGTAAGAGCTTTTTGCTTG
TTCTGACGACACCTTAGAAGCTTGGTTGGGTCTGACAATTTTTTCCTCTT
TTTTTTCAGGTTGCAAGAAAGCTTTAGTCCCCTCATCAGACATGGAGGCC
TGCACGGGGGCTGCGGCAGTCCATGATATACAGCTGAGTCAAGTCAAGCA
GGAGCAGTTCAAACCCCTTACAGAGCCCATCAAATTTTTCAGGTGCACAA
TTTTTTTTTCAATGATTGACACCAACAAGAGGGAACACCTAACACAATTA
TATAGTGACTCTAATTTTTATATAACTTAAAGTACAATGAACAGTTCGCA
GTCATGTTCTATATATAGGACTGCCACCTTTTACAGTAGCGTCCATGTTG
CATGAGCAGTAAAAGCTGGGATTCGAACTCCCAACCTCTTGGTCCTGTGG
TGGGAACGCTAACCACCGCACTACAAAAGCTAGGGCTGTGTTGTGAAAAA
GAACAAAGTTATCAGTTTAGAATTGATTTGTATTTTTTTTGTTTTTTTTA
AAGTTTTTTATCTCAGCATATATTTTTTTTCATGATCAGGTTTGAGTTTG
ACAAGAAGATGGAATCTCTCGAGCGCCAAGTCGATCTGAGTGTGACGGTG
ACAGAAACCGGACAGGCACAGGTGGTTCTGATGTGGTGGGACATAGAGAT
GGACCCAGATAGCTCAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCATGGGCACATC
CTACTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTAATGTTAGTT
AAACTAGTCATACAGACAAGTACAGGAGAGGTCAGAGGTCACCCCGGGCG
GGCGGTCGGGCTTTCTTGGAGCTCGCCCTGCCTGGCGCGGTTGTTACGAC
TCCCACCGTTGAGTCTTTCCACGCCAGGCTGGAGGCCTGCCCGCCTTAGC
CCGGGACCTCCTCCCCCCCTACTTTGCCCCTTGCGGGGTTATCTGGGGGC
CCAATAAGTTGAAGTGAAGAAGTTCTGATGTGGTGGGACATAGAGATGGT
CCCAGACAGCTCTGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCATGGGCACATCCTA
CTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTAATGTTGAACTGG
TCATACAGAGAGGCACAGGTTGTTCTGATGTGGTGGGACATAGAGATGGA
CCCAGACAGCTCAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCATGGGCACATCCTA
CTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTAATGTTTAACTGG
TCATACAGACAGGCGCAGGTGGTTCTGATGTGGTGGGACATAGAGATGGA
CCCTGACAGCTCAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCATGGGCACATCCTA
CTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTAATGTTAGTTTAA
CTGGTCATACAGACTGGCACAGGTGGTTCTGATGTGGTGGGACATAGAGA
TGGACCCAGACAGCTCAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCATGGGCACAT
CCTACTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTAATGTTAGT
TTAACTGGTCATACAGACTGACACAGGTTGTTCTGATGTGGTGGGACATA
GAGATGGTCCCTGACAGCTCAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCATGGGC
ACATCCTACTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTAATGT
TAGTTTAACTGGTCATACAGACAGACACAGGTTGTTCTGATGTGGTGGGA
CATAGAGATGGTCCCTGACAGCTCAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCAT
GGGCACATCCTACTCCTCACAACATGCAGGTATGTAGGGCTGTACATGTA
ATGTTAAACTGGTCATACAGACTGACACAGGTTGTTCTGATGTGGTGGGA
CATAGAGATGGTCCCTGACAGCTTAGTTCTACTGTCTGTAGCTCCGTCAT
GGGCACATCCTACTCCTCACAACATGCAGGTAAGGAGAGCTGTACAATTA
TAATGACTTTGTCATGTATGGGTTGATGACCTGCTCGAGCTGCTTACGGT
GACATATAGCTTGGCCACTGAGCTAAACCCCCAATTACGAAGTGTAAACC
AAGTGAGTGAGCGAAGCAAATGAGGTGGTTTATTAGGTGGTTTATGACCC
ACTTAATGTGACTAATCATATTATATCGTTGCTAACATTACCTAATGCCT
GGCCAGTGATCCATAACTAGAATTAACCACCGAGTGAGTGAAGTAAATGA
TCATGAGGTCTGTATCTGTATCTGTATAGCCGGTATAACAGCCCTTCGGC
GTAACACACCAGCTTCGCAGGCACATGGCGCGGCAGCAGCTGGTTATATT
ACACTGAACGGCCTATCACACCTAACTTTTGCACATCTGACTGCAGTCGT
TCTTTAAAGCTATTTAGTGAAGACGTTCCTACAGCATCTGATGACAACTA
GTTCCATTCTACTATGGTTCTTGGGAAATACGAATTTTTGAACACATCAA
TCCTTGGTTTATAACTCTGGTACTTAAAGGCATGACTATTTATTTGTCCT
TTTCTGGGCTGGTATTAGATAATTATCAGTCGGTACATCCACAAGTTTAT
TAGTCATTTTGTACATCGGCGCAAAGCCTGGATATTTTTCTTCTGTCTTC
AAGTGACTTCCACTGTAGATTTGTTTTCATTTTAGTGACACTAGCACCCC
TGTCATAGTTGACATAGGTCATTTAAGACCTGCTTCTCCCTTCGTGTTTG
CATGGCCAGTTATCATGACCTATATCCCCCCATCAAACCACTGAGTGAGT
AAAGCGAATGAGGTAGTTTATGGCTTGGTTCTTCCCTTGTGTTTACAGTG
ACATAACGGCAGACCAGTGACCTGTAACCCCAGAATAAACCACTCTGCGA
GCGAAGTGATTGAGATGGTTTAACTCGATACTATGGTTTCTTGAGATTGA
CAGGGTATATCTCTTGAATGTAATATGTTTACTTGTTTTTTGTTAATTTC
TTTTTCTGCCCAGTGGCGGGACCATTGGATGCAGGCAGTGTATTTTAACC
ACCAGTCCATCCCTGTAGAGAAAGGTACAATAGACCCTTTCCAAATACCG
GTGCCATTTTGTATCTGGCGTGTTCAACAGCCCGTCAGGAACTGGAGAAA
ATCATCAGAAATTCACAATTTTTACTGGCTGATATCAAGTCTAAGTGTCC
ACAACAATATTATCTACTTGTGTCATGCATATACATATCGACGGATTTCA
CCGAGGAGAGCATCTCTCCGCCGACTCAGACGACTCAACGCTGCTTTCTA
TTGGGGACGCCATTCTTTAGCCTTTCATTCGCCGTCCTCTTTACCGTTTG
TTTACTTTTCCCCTGCTCAAATAATGCACGCTCCCGCCAGATTCAAAATG
GCGCCTGTTTTTGGAAAGGGGTCTATTACATCATCTACATGTACATTTTT
GTCTGCCATCTGTCAGAATAAGTCTACATAGATGTAAAACTGAAGACGAA
AGCACTTCTCTAATTATACGTGCAACATTAACACAAAGAATCAAGTTCAA
CTTGTTGAGTATCTTAAAATTTCCGTTTCCAAATTGGTAGATTTTGTAGA
AAATATTCCTTCCTCCAATGATATTCTTTGTAATCCGTGCATTATGTTAT
TTTCAACAGAAGTTAAACCATCATAGAATGTCTCAGTCAATTCCTATAGA
CTGAGAGTAAAAGTGCTGTTCCTCTCCAGGTCAACAGGTGGCGCTGCATG
GCAGACATGATGAGTACAGCCTGTGGTTCCAGGTGCAGCAGCAGGGGTCA
ACGAACTCTACAGGGTAGGCATCATACATGTTTTTTTTCAAGGAAAGTCT
AGAAATCCTTAGATCTGGAAGCTGTTATATGTGAAAAAACAAAATGAATG
GAATGAAGAAGTTTGATAATTTTTTTCCGTCCATCCAAACCCCATCCACA
AAAACCGTAAACAATCCCAGACACAACCACAATCATTTATTAAAGAATAA
GCAACAACATATTGATATTCTTGGCAAAGGTAAAAATCTTAATGTAAATC
TTTTTGCAGTGGTTTTATCTTTAAGATAAGTTTTCCATTGCAAATAGCAC
ACTTCAAATGTATTAAACAATAATTATTGTTTCAGCCACAAACTTAGAAC
ACTGAAATAGATGAATTTGCAGTATGTCATGACCATTGTCTTTATGGTGA
CCCTAGGTCAGAGGTCAGCTTAGAGAGACCCGTGTGTCACTGCGGGGGTC
ACATGATGTGGAGCCGGCCGCGGCTGGGCATGATGAACGACACGGCCAGG
TGGCACACGTTCGCAGCTGCTCTGAAACAAGTGTTGGCACCTGGGCAGAC
GTGTGTGAGC
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000046 | genome | Sc0000046:250145..259954 + |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | gff3_genes |
Gene id | BL96251 |
Biotype | protein_coding |
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