Blg00976.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00976.0
Unique NameBlg00976.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:5220380..5239923+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg00976.0 ID=Blg00976.0|Name=Blg00976.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19544bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5220380..5239923+ (Branchiostoma lanceolatum)
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ACGAAGTGGGGTTTGTCAGACCACCATATACAGCACTACCTGAAGAAGGT TGATTTGAATGTTTTTTTATTTCTCCTCAAGTATACTAAAAGACTGTTGT CAATGTTTTATTCACTAGATATTGTATACGTTCGTTTTGTGGATTACTTC AATCTATAGTAACCAGGACGATAGCCAGAAAGAATGGTAGTTCGACAGTA ATTTGTGTCAGAGATTTAGAGTGTCAGAGTTTTAGAAATGATTTGTTGTT TTAAGTCAGACATGGAAATGGTCATTCATTTGTGCCAGGCCAGAAGTTTT GAAATGATTAGTGATGATTAGTCCAACAAGAAATGGTCATTTAAGACAAT GGCCAGTTTTGAAATGATTTGTCAGAGAGGAAAATCATGGTAATTTGTGC CAATAGCCAGAAGGGAACTTCAAGGTAGTTTAGGAATGATTTGTTGTGAC AAGAAAATGGTCACTAACTGTAGTAAAATGTATTAAATGTCACTTGTTGT CTTTCAGTAAAATGTTGTTGTTGTGAGATTTTGTACTAGTATTACCTTTT TTCTGCGCTGACTCCTGAATTTTTGATTTTTCAATACCAGTGTTACTTTA AGTGTTGATTTTTTTCAGTTTGCACTGAATTCTACATTTTACTTCAAAGG GTGTCTGCAAGTATAATACAAACTGATGTCAAATATATAACCACAGTTTG AATACTGGGGAAGACATTATTTAACACGTATACTCAACTGTACTTCACTA CATGCATACTTACTTTACCTACAAAATAAATTCAATTACAGAGAACATTG AAACAGTCATGTGTATTGGTACAGGTATGAAAATATATCCTACGAGACAT TGGGGAAAAAAAGTAAAAAGAAAAAGTTGATGAAATATTGGAAAAAACAT AGAAAGAAAAAGTAATGAAATACCAGTATTGGTAACACAATTTTTTTTAA TCATTATGTTAGCAGTTGGCTGAAACTAAGCAGAATTATGTACTGTATTT GGAAACAAATTGATCTGCTAGACTAAAGTGTTGATTATCATATCATATAG TGCACTATACTGCCAAAGGTTGCATCTTACACCGGTCGTACATTAGTGTT CATACTTATGGATGAAACTGTTGTTTGTAGACATTGTCAGTATATATACA TTATGGTGCATTGTATTCTTCTATGTCAACTCACACAATTAGAATATAAT GTATCAGAATGCACAACTTTGTCTTGTCTTTTTCCCTTAATATATTTCAC CCAGGTCATACTGAGGTTATGATCAATTGAGACGGTTAAAAATTTACGCC ATTTGTGGTCCATTCTTGTATGCGGGGGACATTTGTTAAAATTCAAATTT GGAATTTTTTTGGTGGATGGGGGCAGGGAAATGGGTGAAATATGTTGTAT TTGCTCTCGCAAATATTGCCTTTCAAGTATCATACTTAAATTTAGAGTCA CAGTATTTGAAATTTTTACTCGATTTGCAGAGCGTTTCATTACA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:5220380..5239923+

>Blg00976.0 ID=Blg00976.0|Name=Blg00976.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=816bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5220380..5239923+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAGACTGTACTGCTGATCACCCTGCTGTGTGTGATGGTCAGCTGTCT
GCAGGCACAGGAAGACACCGCAGGAAAACGTCGCAGAGGCAAGAAGGAGC
CTAAGGAAGGGTGCAGTGGTTGGACCTGGCAGCCGTGCGTGCCTGCCGAG
GGGGACTGTGGGCTGGGGGAGCGACAAGGAACACAGGAGGGGCCAAACTG
TAAAATACTCAGCAAGACCATCAAGTGTCGCATTCCCTGTGGCAGACGCA
AGGAGTATGGAGACTGCCGCTACCGCCGTGCACCATGGGACGAGTGCGAC
GCTGACACCAACATGGAGTCCCGTACTCTGGAGCTGAAGCGAGCCGTCAA
GGGCGCGACCTGCGAGGCTGAGGTCGTGCAGACACGGCCGTGCAAGGGAG
CCTGCAAGTATCAAAGGAAGGAAGCCACCGACTGTAATGAGGAGAGCAAC
ACCTTCACCATCACCAAGCAGCTGAAGGAGGGAGACGCTGCCATCTGCCA
GGAGGAGATTGTCAAGACCAAGAGATGTAAGAACAAGATGGTGGGAGACG
GAGAGGCCATGACTGGAAGGGGTGCACGCAAGGCTGCAAAGAAGGCGGCA
CGGAAGGAGGCCCGCAAGGCAGCTAGAAAGGAGAAAAGGGGCAAGAAGGC
AGAAATGAACGGGGAAGCAGCAACTCCTAAAGGGCCGTGCCAGTACGGAG
CGTGGAGTGAGTTTGGGGAGTGCGTGGACAACAAGCAGACCAGGACCCGC
CCGATCATGGCTGGCTCCGAGAAACCCAAGTGCCAACAGAGGGCCACTCA
AGTCCGCAACTGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00976.0Blg00976.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5234497..5234588Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5234497..5234588Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5235149..5235322Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5235149..5235322Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5235865..5236002Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5235865..5236002Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5236827..5237108Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5236827..5237108Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5237529..5237807Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5237529..5237807Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5237946..5239923Blg00976.0-exon-Sc0000003-1570713199:5237946..5239923Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:5220380..5239923 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00976