Blg00976.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg00976.3
Unique NameBlg00976.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:5220531..5239923+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg00976.3 ID=Blg00976.3|Name=Blg00976.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19393bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5220531..5239923+ (Branchiostoma lanceolatum)
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ATCTATAGTAACCAGGACGATAGCCAGAAAGAATGGTAGTTCGACAGTAA TTTGTGTCAGAGATTTAGAGTGTCAGAGTTTTAGAAATGATTTGTTGTTT TAAGTCAGACATGGAAATGGTCATTCATTTGTGCCAGGCCAGAAGTTTTG AAATGATTAGTGATGATTAGTCCAACAAGAAATGGTCATTTAAGACAATG GCCAGTTTTGAAATGATTTGTCAGAGAGGAAAATCATGGTAATTTGTGCC AATAGCCAGAAGGGAACTTCAAGGTAGTTTAGGAATGATTTGTTGTGACA AGAAAATGGTCACTAACTGTAGTAAAATGTATTAAATGTCACTTGTTGTC TTTCAGTAAAATGTTGTTGTTGTGAGATTTTGTACTAGTATTACCTTTTT TCTGCGCTGACTCCTGAATTTTTGATTTTTCAATACCAGTGTTACTTTAA GTGTTGATTTTTTTCAGTTTGCACTGAATTCTACATTTTACTTCAAAGGG TGTCTGCAAGTATAATACAAACTGATGTCAAATATATAACCACAGTTTGA ATACTGGGGAAGACATTATTTAACACGTATACTCAACTGTACTTCACTAC ATGCATACTTACTTTACCTACAAAATAAATTCAATTACAGAGAACATTGA AACAGTCATGTGTATTGGTACAGGTATGAAAATATATCCTACGAGACATT GGGGAAAAAAAGTAAAAAGAAAAAGTTGATGAAATATTGGAAAAAACATA GAAAGAAAAAGTAATGAAATACCAGTATTGGTAACACAATTTTTTTTAAT CATTATGTTAGCAGTTGGCTGAAACTAAGCAGAATTATGTACTGTATTTG GAAACAAATTGATCTGCTAGACTAAAGTGTTGATTATCATATCATATAGT GCACTATACTGCCAAAGGTTGCATCTTACACCGGTCGTACATTAGTGTTC ATACTTATGGATGAAACTGTTGTTTGTAGACATTGTCAGTATATATACAT TATGGTGCATTGTATTCTTCTATGTCAACTCACACAATTAGAATATAATG TATCAGAATGCACAACTTTGTCTTGTCTTTTTCCCTTAATATATTTCACC CAGGTCATACTGAGGTTATGATCAATTGAGACGGTTAAAAATTTACGCCA TTTGTGGTCCATTCTTGTATGCGGGGGACATTTGTTAAAATTCAAATTTG GAATTTTTTTGGTGGATGGGGGCAGGGAAATGGGTGAAATATGTTGTATT TGCTCTCGCAAATATTGCCTTTCAAGTATCATACTTAAATTTAGAGTCAC AGTATTTGAAATTTTTACTCGATTTGCAGAGCGTTTCATTACA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:5220531..5239923+

>Blg00976.3 ID=Blg00976.3|Name=Blg00976.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=642bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:5220531..5239923+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGAAGACTGTACTGCTGATCACCCTGCTGTGTGTGATGGTCAGCTGTCT
GCAGGCACAGGAAGACACCGCAGGAAAACGTCGCAGAGACTGCCGCTACC
GCCGTGCACCATGGGACGAGTGCGACGCTGACACCAACATGGAGTCCCGT
ACTCTGGAGCTGAAGCGAGCCGTCAAGGGCGCGACCTGCGAGGCTGAGGT
CGTGCAGACACGGCCGTGCAAGGGAGCCTGCAAGTATCAAAGGAAGGAAG
CCACCGACTGTAATGAGGAGAGCAACACCTTCACCATCACCAAGCAGCTG
AAGGAGGGAGACGCTGCCATCTGCCAGGAGGAGATTGTCAAGACCAAGAG
ATGTAAGAACAAGATGGTGGGAGACGGAGAGGCCATGACTGGAAGGGGTG
CACGCAAGGCTGCAAAGAAGGCGGCACGGAAGGAGGCCCGCAAGGCAGCT
AGAAAGGAGAAAAGGGGCAAGAAGGCAGAAATGAACGGGGAAGCAGCAAC
TCCTAAAGGGCCGTGCCAGTACGGAGCGTGGAGTGAGTTTGGGGAGTGCG
TGGACAACAAGCAGACCAGGACCCGCCCGATCATGGCTGGCTCCGAGAAA
CCCAAGTGCCAACAGAGGGCCACTCAAGTCCGCAACTGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00976.3Blg00976.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5220531..5220541Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5220531..5220541Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5234497..5234588Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5234497..5234588Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5235865..5236002Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5235865..5236002Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5236827..5237108Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5236827..5237108Branchiostoma lanceolatumexon
Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5237529..5239923Blg00976.3-exon-Sc0000003-1570713199:5237529..5239923Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:5220531..5239923 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg00976