Blg01090.6 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01090.6
Unique NameBlg01090.6
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:4061690..4085831+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg01090.6 ID=Blg01090.6|Name=Blg01090.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=24142bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:4061690..4085831+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TAGACAAACCTCCCATTGAAAAACACGTCTGTTCTTTTATATCTACTATA ACCGAAAAGCGAGGAGAAGTAGAATTTATTTAATGATAGTCATATTCTTT TGTATCCGCTAACTGTACCTGTATTATCTTTTGTTGTGACCTGTACTTAG CCAAGTGTGGCAGAAATGTGCAATAAAGGTCTTCATTCATTGAGTAAAAA TGTGTGTACAGTCCTTAGCCCGTTGCATCTGTTCAGTATACCAGTCCAAC ATCTGTATCTGTATTTACATAGCCGGTATTGCCGCCGGTCGGCATAACAC ACCAGCTTCATACAATATGATGAGTTTGTTTTGTTGCTTCTTCGAAACGG ATTTGAACTAATCTCCAAGCAGATCTACACGGGGCGCGAAAATCGTATAT GCTAGCCAGAGAAGGTCCAGTCAGCCAGATAAGCTTATCTGGCTGAGACC TTCTCTGGCTAGCATATACGATTTTCGCGCCCCGTGTAGATCTGCTTGAG ATTAGTTCAAATCCGTTTCGAAGAAGCCACAAAACAAACTGGTGTGCGTG GCCTCAAAAGCAAGTAGTCCACATTTTACCTGCCCCGGCGGTTTCCTGGT GCACCATTTCTGCCCACTGCTGCTCTCCAGATAGCTGTTGATATGCTTCA CCTCGGCAACTACGTCATCCAGTTTGGCTTCGAGACCTTGAAAGGACTTC GTCTAAAAAAAGACAGATTCTTCAGAAATACCAACGCAATTCAGTTGTAA ACGCTGTCTTTTACTCTTCTTCACGCTGATTTAATAAGAAAATTAGATTA GAATTGAAATTGAAAATAATTATGTTAGCCTTAGGGCCAGATTTGCCTAA TGCATGGCGAGCTCAGTTTTAGAGGGGGTGCACGTGAATATCTAGTGGTC AGATTCAATATTTCCTCTCATTGAACTAAAGGACAGGCATGCTGGTGCAG 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GNTCTGGAATCACTTGACCCGGTTCAGTTTGGAGTTAGCTCAAAAAATTT CTATGAACCAAGGAATTCTATTGGTGTGGCCTCTATGAACAAAGTTTAAA CTAATGTTGTAAGTATGGCAGTTTTTGCTAAAGGCTTTGGACCTGAACTC GCTATGTTATTGTGGAACTTGAATATCCAATATATGCTACAAAATTTTGT AGGTCTTTGCAAAGACTTACTCAAATAGTTTGGATTAGAATAAAGCTGCC AAATGTTGAATACACATTATGTATAACAGACAACAGATATACCTAGAGTA ACATAAACCCATAATACTCTACCTCAGCACAACTGCTATACGGAAAATCA CAGAAGACATATTATATACCGCAAGAATTATGATGTACTGCCTGGCCAAA TGTTGTATTATATACTACAGGACTTTACAGTTATATACTGGTATAACTGA AGCTGATATGGTTGCGTCATCAATACATGTTGCACCTTAGTTGACGTTTC CACCGTATTTTATCCAATTATTGTGCTACTCTGAAACTTTTAGTGAAAGA TATACTCTGTCTACCTTGAAATTCATAATATTTGACTTCTGTTGCTTATT TTAAAAATTGGAGCTAAACTTCCTCTGTTTGGGTTTTTACAACATACGGT TTTTACGAAATACAGTTTGTTGTTGTTTTGGCAGCTCTTTTAGTTGATTA AACTTGTGGGAGGGCTTAGGAGTTTTTAACAATATTTTTAATGAATCTAT GTCGAATAATCATGTTGATTCCAACTCGTGTATGGGCAAATACACTGCAG TATTGGCCTCAATTTTAGACCTATCCCCCTTTCTTTTAGATATGTAAAAA AATCTTCAACCAGTAACTTATTTATATGCTGCATCCTTTGCCACAGAAAT TCCGCATAGAATGAAACAATGTATATAAAATTTCAATGATTTACATCTTT AGGTTTTCTCCGATATGTATTCAATCGTAGTTTGCTAATTTTGTATATGA TAAGACGTGTATGTAAATGTTACTACTCAACGTAGCTGGTATATGATATT AATGTGTATTGGGACCAAACATATCAAAATGGCCACTCCATACTATCGGA TATATGGTACTGTAAACCTTTGTTGTATTTTAAGTTCATGTACCTCCACT GTAAAATCACATACTGTCATTTGCACTGCGTTGCTACCATTGTTTCAACC ACAAACTCGTGATTTTTCTGCCGCAAAATGTAGGCGCTGCAAACTTGAGT GAATTCACGGTACCTGAACATTTAATTTGCACTGATACCTAGCTGGCATA TCTACTAGATAGTTGTGTTCTAGGTGGGGTGAAGGATAGTGCAAATGTGC AAAAAAAATGATATTCTACTGTTTCTCACAATTTCATCACCATCCTCACA GGCATTGTCAGTTTTGCCATATTCACAACTATTTGTAATTCCAATAATTC ATATTTAAAGAAAATTTTTTGATTACTTACATAGTTAACCTTTTACAGAA TCATAATACTGGTATGGTGTGGCCAAAAAAGTAAACCTCATTGATTCTAA TATATTTTTTGGGGACATTTGTGTTACTGTTACATGAATGTCTCTTCTCG AAGGTGAGTCAACTGCCAAACTTGAAGATATCACCACTGTTCATTTAAAA GAGTCTACAATCATATATAACACCAAATGTCCTATTGATAATTAAATGAA GCTCTGATATGATATCACAAATTGATACTATAGTACTAGAACTAGCAGAA CGTATTGTAGAATGTAGTTATGTGTGACGTAGGTAGTGTTTTATATCCAT TTCTTTGTTGCCTTGTCAGAATGTCTTTGTCTGAGCTGTGTGTGTTGTAA GTTACATCGATGTGTAGTAAGTGTTGTAGAATCTAGCAATAACTTTTGTG ATGATAGAAATTATAAAAGATAGATGTCTAACAAAAGTCACAAAATGAAA ATTTGCAGCCATTTTTCTATCATGATCTTTGTGTTACTTGTCAGGAATCG CCTGTATTTGTCAAAAAGTGTCCTCCAACAGTTGATCAGGTCATTGTAAG TTGAAGTTCTTTTAACAGAATAAAAAAATATCCACCAAGATTGGGTAAAA ACTCATGTTTGGGACAGCAGTTTTGCCACAAAGCTTGGAGTTATGATGTT TGATGTTTTATTATGTTTAATTAAAGACCTTTCCCTTCGATGGAATGATA GTATGGATTTTGAAAGTCTTCCTATGTTGCTTCAAATATGCTACAATACT ATATTAACGTACTAGATCATAAATCAACAATATAATGTTTCCCCCATCCA GAAGGTAGCAGAATATTCGTCACAAATTTTGCCATTTCATTCTGCAATGT CTGGTGCATTTTAAGTGAATGTTAAGACTTTAAGACATTGACTTTGAGAA AACATCTCATCTTAAAGTCTGTAGGTTGTTCTACATTACGCTTTATGCAA TGTCAATGTTCAAGTTCAGAAACTCTGTTTGCTTTGCTGTACAGGCTTTA GTCTCATGATATGTCAGCCATCTTTTACAGAAAGGCAGCTTTTTTAGATT CAATTTTAGTAAACATATCTGTATTTCGATGTTGTGTATATACTAGTTTA CTCCATTTTTTGTACAGGATTCTCTGGAAATGTTTATTTTGATACTTCAA TGTAGCATTGTTTTAATGAAAGTGTTAAGTTTTCTCTCGAATGGGCCATT TTTTGTAGGAGCTGCATTTTCAAACAGTTAAGGCCCGTACCTATTAGAGA AGTGGACTTTCCCAAACTGGACCATGCTTTAAGTAATAAGTGAGACAAAC TGGCCTGTACCACTAGAATGTAAGGGTAAAATATTATATTCAAACTTTTA TTCAAAAACCAACTGTTCAGATCAAGGCATTGTTTTTTTTTTATTGCAAG ACATACATAGTATTTTACATTCAGACTGAAGTTTTCTGGACTTTGTACTA TGTACTATTTTGAGGACACAGTAAAATTAAATGTATTTTCCTGTCACTTT TTATATTATGTGAAGATAATGTTAACTTTACATTGACCATTTCTTTGTGC CAAGTGCTAGCCACTGATGTTTTAGAGATCCATAACATTGTGATCATTGT TTTGTATCAATAAATTTGTACTGCATTTTACTTCACATGGTGTCTGATTG TGTTCATATATATTTGCACAGTATTTACCTCCATGAGAAATGGCAATCCA TCAAGGGCATCTAGAGTTATGATGGTGATCCACAAACATACA

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:4061690..4085831+

>Blg01090.6 ID=Blg01090.6|Name=Blg01090.6|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=801bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:4061690..4085831+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTTTAGTTTCCACAAGCCTAAGGTGTACCGCAGCATCAGCGGCTGCTG
CATATGTGGTGCCAAGTCGTCCAGCTCGCGGTTCACAGACAGTGCCAAAT
ACGAGGTGGAGTTCCAGAAGTGCTTCAAGCTCCACGAGGAACGCACCGGC
GAGATCTGCAACGCCTGCGTCTTGCTGGTCAAGCGCTGGAAAAAACTGCC
CAAGGGGACGGACAGAAACTGGCATCATGTTGTGGATGCCAGGGCGGGAC
CAGGGACCAAGACCATCCTCAAAGCCAAGTTCAAGTCCAAGCTGAGCAAG
CGCCCCAACAAGCGGCGCCACCTGCTGGCCAAGAAGAAGATGGGCCTGCT
GCGGAAGAGCAGAAGTGGGGAGGGTTCAGATGACGTCAGTGGCGAGGAAC
ACATGAGCGACAAGTCTCCGTGGTCCAGCGCCACGCCCTCCCCGGCCCTC
AGCGACCAATCAGACGAGTCGATGTCAGCCTGCGACGTTGACATCAAACC
GTCAAAATGCAAAGACATTCCATATCCCGTCTCATCATTCCTCAAGTCCA
GCTATTGGAGAAGAGAGGATATTTGCTGCGGCATAATCTTCAAGGGGGCT
CGTGGGGAAGTTGTGATCGACCCTCGCTTGCTACGGCCCTGCCAGGCATG
CAGAGGCTCCCCAACCCCCGGCACACCCTCCAAGAGCAGCAGCAACCCCC
TTACCAGCCACGGAGCTTCCGAGAATACCCTTCCCTCCCATACAATACCT
CCATTTGGAAGCATGGAAGGTAGAACAAAAATGTCTTCCAGTTTTTTGTA
G
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01090.6Blg01090.6-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4066988..4067150Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4066988..4067150Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4067660..4067831Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4067660..4067831Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4068298..4071731Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4068298..4071731Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4082948..4085831Blg01090.6-exon-Sc0000003-1570713199:4082948..4085831Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:4061690..4085831 +
Properties
Property NameValue
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