Blg01100.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01100.0
Unique NameBlg01100.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000003:8341440..8360979+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01100.0 ID=Blg01100.0|Name=Blg01100.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19540bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:8341440..8360979+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TTTGTAAGAAATCATAAAAAAGGGATTGTGAACAAAACATTGAGATGGGA AAATTAACTACCTTCCTTAAGCCCCTGTGACACAGTTGTCAAGCTTCAGC TGTATTTGTTACTTGCTAGAATGTCACCGTATATAAAAATTGAGACAGAA ACTCAAGCAACATTTTCACCTGAAAATCTACCCCATAACATTGAACGGGG ACCTGCAAACGGATGGTGATCCAAATGACAATGGCTGCATTGCTACCAAA AATGTCCTTTTAACTCGCAGACCCGTCAGGCTAACTATTTTCCTACTGTG TGATGACAACTTAAGGGCCTGAACGTTGTTGATGTGTCTTAGTAACCCCC TTCATACCCTCTGCCCCTACCCAGCCTGAGGCAAAGAAGGACGCCCAGGA AGCCTTCCTGAAGGACGTCCTGAACCAGCAGCTGGCGCTGAACGTGGAGT ACAAGAACCAGGGGGCGGACATGGTCATCCTGCTCACCTCCGACAAGACC ACCGACATCGGTCTGGGGCTGGTCAAGGATGGGCTGGTCATGGTGGAGGC ACGCCGCGAGAAAAGGCTGCAGAAACTGGTGGGTTTAGCTTAGTTCTCTG GCCTGGCACCTACAGTCAACATTCAGACTGACATTGAGTGAAACAGTCAC ATTCTGACATTGCATTTCAAGCTGTACTACATTTCCACAAGTCCCATGCC ATTAAAAACTATATTTGCAAGTGTGTCAGTTAACAAACTTACGGTCTATT TCCTACAGGTCAATGACTACAAGAAGGCCCAAGATGCAGCCAAGAATGCT CGGGTAAGAACATCATTACTTAATATATGTAAGCTGTTAAAACATTGGAA CGTTTCTGAGCAGGGATTTTGTGTCAGCAGAGACCACCAGAGATCTGAGA TCATGAGTTGTTGGCTTTGCCTTGGGGTCAGTTACATTATTTAGCTTTCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:8341440..8360979+

>Blg01100.0 ID=Blg01100.0|Name=Blg01100.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=942bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:8341440..8360979+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCGTCCTCCTCTGACGGCCGCAGATGGAGAAACATCTCGTGGGGCAGC
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AGTACAAGAACCAGGGGGCGGACATGGTCATCCTGCTCACCTCCGACAAG
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Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8347258..8347390Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8347258..8347390Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8349378..8349501Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8349378..8349501Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8352905..8352971Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8352905..8352971Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8359192..8359299Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8359192..8359299Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8359864..8360067Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8359864..8360067Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8360248..8360292Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8360248..8360292Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8360914..8360979Blg01100.0-exon-Sc0000003-1570713199:8360914..8360979Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01100.0Blg01100.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000003genomeSc0000003:8341440..8360979 +
Properties
Property NameValue
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