Blg01264.12 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01264.12
Unique NameBlg01264.12
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000051:1700460..1715802+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01264.12 ID=Blg01264.12|Name=Blg01264.12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=15343bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000051:1700460..1715802+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CCCACATTTACGAGCATTGGCAATCAGCTCCGAGCTAGCAAATACCTTCT TTAATGACTTAATGTTTCTATGATATTGTTTTAGTGTCGTAATTGTGTCT ACAATGGACCCTATTCAATGGTTCCCTACCCTGTCCCATTCTAGCTTCAT ATGGGTGACAAAGGATATTTGTGAAAACAAAGGTCCAGTTTGAGTGACCA GTTAAAAAGATTACCATAAATAAAAGTAGTAGGTTTGTTCAAGAATCATC AACATCGTCTGATAGTAGCTACTTTTTAAGTCTTAATTAAGTGTTATAAT GCTTATGAAGATACATACAGCAATAGCATGAAATTATAGCTGACAATTGT GAAAAATGGTGTCAGACTTACCATTTAGCCCTGTTTGACCTCAACATCTG TTCTGATAAATCTCTATGTGATAGAGTCATTTGCGTCTTTGGGGTTCAAT AAAGGTTTGTCAGGAGAGTTGAATATGTGAATGTTGTGATAAGAAGGAAT CCCGGACCAATAAGGCACTCCTGGTGTTATAATGTCACGAGAAGGCTCCG CTGTCAAGTGAAGGGAGTTGCTACTGAACTGAACATCCTAATGATTCCTA TCCTTACTCTCCAAGCAGAGGTAAGATCCGGGTTTTTTTCGACGTATTTT TGCTGTATTTTATACGTCTTTCTACTTTATTTTCCGTTTTATGTTGGGCC TCGAGGAGAAAGCCAACTACAAACGGAAAATTAGAAGGACGTATAAGATA CAGCGAAAATACGTTGAAAATACCCCGGATCTTACCTCTGCTTGGAGAGT ATCCTATCCTCTCTGTCTAAACTGTAAACAAGTGGTGTAATTGCTGCTTC GTATTGTTGTTGTTTATGTCTGTAATAAAACAAGATGGGCTAGCTTATCT AGCCTGAAATGCATCTATCATCTGGAGTGCCAAATAGCCGCCTGCAACCT ACAATTGTCAGGTAAAGACTATAAATTTACCTGAGTCATTTGCTAAGCTC CTTTGAAAACGTAAGGCTCGGGCTTGGTATGATAAACAATCATTGAACCT CCAGCACAACTTTATTTCTAACAAAAGAACACAGTTGCGTTGTCTCAGAG TCCTTGTGGTACTGTTTGGTGTTTTTGTTATTTCTTACACAATGTTTACC ACTGGCTTTAAGACCAGGATTTTCCCTGGCCTCCATAGTATCAAGGAGGT CGATAGCATACACTCTGGGCCTTTTGGGGGGATTATAGTACACTTTTGCT GATGATATCTTTTTGTACTATTTTGTGTGTGCAGCCAGCCCATAACCATG AGCCTGCATGAAAACGGGCCATGCGGTTACAGGCTGGCTGCACAAACGAC CTGCCAGTACAAAAATCAGCCAAAGTGAATTATAAGCCTAAAAAAGAGCC TGCTATGGAGGCTAGTTTTTTCCATCAACTGCTATGTTAAAATTGCTTCC TTCAGGTTAAACTTTTGAAATGGCAAGACTTAGAAGATCCCCTCAGGTTT CTTTACTGTGGTACAGAGATGAGACAGGATGTGACACTAGGAAGGAAGGA AGTAGGCAGGTCGTCATGTCTGAACTGTGCCCAGGTGACCTCACCTGGTG CAGGGGTTTGTCTCACCTGGTGGTGCTGGCACACCTGGGGGTCTGATTGT CCCAGCTTAGTCCTGTCTATTGTTGTTGTTGAATCCTGCTGAAGTTATGT TTTTCACTAGCATTTCATTGTTGGTTTGTGGCCAGAATATCTCTGATGCA GGGCCCCAGCAGCTTCTGTTTGAATTGCAGCCTTCTTTTTAGCCTGGAAA GATGAAGAAAAGAGCTTACTTTATCCCTAAATGACTTGCCAACCTGGCAA AGCGACCAGTATCAATAGAAAAACTTGTGATATGTTTCTTTTTCAGCGAC 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TATTGCCAAATATACTGTCTGTCAAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCT GAATCCCATATATTGTTGTCAACTAAAATGTTAAATTTAAGACTTNGTCA TCTTATCAACTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTGACGTTTGTATTG TTGCCATGACAACAGCTGCGGGGAGAGCTGAAGGGCGGTCTGAACTCCAC CATGATCATGCAGTACATGGCCAAGGGGTCAGAGGGCATCACCGGGGCAA CGGACACACTACAACAGGACGTGAGTTTTTTTTATGTGTCAACTGAAAGC TTAAAATGTATCTTGTGATTTCTATTGAGTTTTTGATTTTTCAAAAAATG AAATGTGCATATAACTGTTGACAATTTTTCGTCCCTTGTTAAAGAATTTG AAATCTCAGACTATCAAATCTTAGGGTTTCTGTTGAGTTTTTAATTTAAA AAAAAATGAAATGTGTATTGTAACTATTGGTGATTTTCTGTCCTTGTTAA AAAATTGGAAATATCAGACTGTCAAATCTTATGATTTCTATTGAGTTTTT GATTTTTCAAAAAATGAAATGTGTATATAACTTGGCGATTTCCTGGCCTC ATCTCAGACTGTCAAATCTATGATTTTATTGAGTTTTTTTATCCTTCATA GAATGAAATCTGCCTAGCTGTTCCTCTCCTTGTTAAATGATTGGAAATCT CAGACTGTCAAATCTTACGATTCTTATTCCTCTTCTTGTTTCCCGATTTT CTGTCCTTGTTCAAAGAATCTCTGACTATGAAATCTTTATCTTTATTGAG TTTTCAAGAATTAAATCTGTTTAACTGTTGGCAATTTCCAATCATTCTCT GCACGCAGTTCCGTTGCTGTGGAGTCCTAAACTGGCGGGACTGGAAGGCC AACAGTCCGTATTTTAAGACAGGGCTGGCCAAGAACATGACAGCACCAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000051:1700460..1715802+

>Blg01264.12 ID=Blg01264.12|Name=Blg01264.12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=510bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000051:1700460..1715802+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCTGAGTACAAGTCTGCGAAGGAGAAGAAGTCCAACACCTTGGGCTG
TCTGAAGGTTCTTCTCCTAATCTTCAACTTCCTCTTCTGGTGTTCTGGTG
CGGCAGTCCTGTGGCTGGGCATCTGGATCCTGCAGACGAAGACGAAGTAC
GTCGCCCTGCTTAACTCGGCCACATACCCAGCCTGCGCCTGGATCCTGAT
CGTGGCGGGGGTCATCATCTGTATCATCGGCTTCGTGGGCTGCTGCGGAG
CCATCCGCGAGAACAAGACTTGCCTTATTGTGTACTTTGTCTTCCTGCTG
ATCATCTTCCTACTGGAGATCATTGCTGGTATCCTGGCCTACGTCTACCA
AGATCAGCTGCGGGGAGAGCTGAAGGGCGGTCTGAACTCCACCATGATCA
TGCAGTACATGGCCAAGGGGTCAGAGGGCATCACCGGGGCAACGGACACA
CTACAACAGGACGTGAGTTTTTTTTATGTGTCAACTGAAAGCTTAAAATG
TATCTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01264.12Blg01264.12-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1700460..1700572Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1700460..1700572Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1711973..1712079Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1711973..1712079Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1712848..1713039Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1712848..1713039Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1713500..1713574Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1713500..1713574Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1714875..1715802Blg01264.12-exon-Sc0000051-1570713199:1714875..1715802Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000051genomeSc0000051:1700460..1715802 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01264