Blg01719.5 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01719.5
Unique NameBlg01719.5
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000261:330493..342054-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01719.5 ID=Blg01719.5|Name=Blg01719.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11562bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000261:330493..342054- (Branchiostoma lanceolatum)
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TTTTAGAAAACGGGGTATTTAGGGATATGTGCTAGATGCAACATAAGTAA TACCGCTAGAAATGCAAACCTGACAGACTTACGTATTCAGAACACTGTCT GAAAAGCTTCGATAAGCATGGATTCTAAGGCGACGAGGTCAAAAACTCTC CGTCCCTTATTGGAACAGTCTGGGGGCTTCGTGGGAGAATTACACAACAT GGTTGTCGGCTGGTTTATAAGAAAAATGTCACATCCGCTTCCTGCTAAAC ACAATTATTTACAAGACAACTTATTACAATCTCTTTTGCTAACCTGCAAC TGGATTCTAAGTGTGATCAATCATCAAAACTCCTCTCTGTTGCTACAACC TACGGCACGTGTATTTTCCCGCCGCCATATTGTTAACCAGAATCCTGTTG TCAAGCAGACGACAAAGGTTTGTGAGGAACACTTTTTTGTCTAAATGCTG CGTGTGATAGTGGACTGAGGAAGATATTTTCCTCAAAGTTTGCTCCTAAC ACAACAAGGAACACATGGACATAGTAGTATTACCATTGCTACGGCATCCA GCTAACTTCCCATGAATAATGTAACGTTACACGTTGCCCGATGATGACGA TGGGCCGACTTTGAGTGAAGTTCTACCGACTCAACACACGGGTTGTTCCC GAACCGGCCTGATGTGTGCGGTACGGCCGTTTTTTCGTGTATTTTTTTTA CTTGGACACGTCTATATCCATAGCACTCTCCTCAAGCCAAGGATGGAACG AATAGCTGCTGTATAAAATGTGATTAGCGGTAAGATATTCAAGACGAATC TTCTCTCCCGAATTAATGTGCCCCCCTGTCCGACAGCACNGTCCGACAGC ACCGTCATTGTGCGTGCGGCGGGCGGTAGTTTTAAGTTGAAATATTATGG TGTCAGCACGACTAGAGAAAAAATCTACCATATATATGATTAGTGCAAAG ATAGTACATGATACTGACAGAATAATAGAAAAAAAGGATGGTTTATTGTT CTGCTAGATTGATTTCAGTCAACCATTATCGGAAAAATCCCGAATTTATG TTACCCAACGTTACAACAGAATTGTTTCACCTGTGAATTCAAAACACTGC AAAAACTTAACCCTCCTGCCATGGAGGCACGAAATTAATCCCCGCATAAT AGACTCTAGAACAATTTGCAGTAATTTGACCAGTACCTACATGTTCATCA GTCATAAAGGTACATGACTAGCTTTCATTCAACGAGAAGTGGCCCACCTG TCACCAGTGATGATTTCAGATGATGCTGAGTTCATTGAAAAATCTATCGG CCCTGACAGGGCTTGAGTCAAGCACATGCAACCAGCAATTTGGTGGGACA TTTTAAGACTTCAGAAAAATATTTTGCCGTTTGGTTAACTGAATGAATCC CTTGAAATATTCTGTTTGACCAATGTCATTAAACTATCACAGCCGTTGGA ATTGATATCAATCACTACAGTCTCCCACAACCTTGGACTGGAGTTCAACA GTGTAACAGGCGGAGTGACAGTGTACTAGGTGTAACAGGCCATTCCGTGT AATACAACCAGTCCCTGCTGCGCCGCGTGCCTGGGAAGCTGGTGTATTAT GCTGAATGGCTTATACCGGCTAGATAGATACAGATACAGACAGCTTTAAG ATAGGAAGTTTGACATCTAGTAGTGAGCAAAGGTATTACCTAAATCAAAT ATCCAAAATGCTAGTGCTTGCAGATTTGGAAGCATTATGTTAATGTCGAC ATTCCTGTGACAGGTGAAGGCTATTTATGTTGGAAAGATGTCCCATAAGT CTGATAAGACCTATTCAGGCCAGGGTGATACAAAGTCCTTGGCAGGTATG TAGAACAATGACCTGGAGGCTGGAGTACATTACCTTATTGTGTTTCAAAC TACATTTTGTATTTCATGACTGGTAAATGCATTAACCCCCTTTCCACTAG AGCCTAGTACTCAGTAGTAGCTGCTACCTGGTTGCGACCGCTTTGCGATT GCTAAGCATGATCCAAACATTTGACAGGTCACTCAACGATAATGAAAAAA TCTATTTACGTTTTGTAAATTGTTTTGTTGTCTTTTAAGTCATACTTTAC ATGGAGCATTAAACAGACAATTTGTCAAAGTTTATTTACAATAACCAGTG TTAGTAAGTCACATAGTATGGTATGTAGGTTCTTCCCACTGTAGGTTCTC CCCACTGTGTCTGCCTCTTTTTTTTTGGAAAGGGATACACGTTGGATTTA ATTGTGCAAGACAAATGTTTGATTTAATTGTGCAAGACTAGATATATCAT GTCTGCAATTTGGTGTAAGACTATCAAGTAAATCTTGGTAATGTAACACT GTAAGATGCATACCAACAGCATCAAAGCTGCAAGAGTTCACATTTGACCC TGAGGCCTGTGGAAACTAGGTCAGCTCATTGATCAGTCCCATGATGTTAA GTCTAACTTGACTCCAACTCCAAGGGGCCCAGAAAAGGTAATACAATATG TAAGTTAAAGAAAAATAAGTTAAAGTCCTCCCCGCACCAGACAGTGCATA AGGCGGCACCCATCTCCGTTTCGGCAGCCCTGGGCCACACAACTTTGTGC AAGTCACTACTGTACAGCAGGGGGCTACATGTATACGATATGTAAAGCAA CCATCAATCATTGGATTAAACTAAAATTAAAGATGATTACCCAGTCTGCA TTGTTGTTTGAAATGGTTATATACGTTTGAATTTTGCAGTTGGCATTTTG GAGGGTAGCAGAAGGATGTCAGGGGCTGAAAATGAAGGTAAAAGCAATTC TGAAGAAGAAAAGAAGTTTTTGTCTTTTCACAGATTTTAGTTTGCAGTGT TGATTACCTTGGTTTGTGGGTTGTCATGTGACTCCATAGTCAGGTGTTGA CAGTGTGTCCTCCTGCTTTACTATCCTTCAGGCCACAGGAATATAATTCT AACCTGAAGTAGTAAGAATATTGTTTTTGATTAATAACAATTTAGAGATT TGTTTGTTTTCTATAGGGTATTAGAGGGTGCATTATTGTTGCTTTTACAG GCTGGTCATACCTAACCTGAACATGTATCAACCCAGTAGTCACAAGGTTA ATGAACGTAACAGTATGTAAAAGCCTGGTCACATTCATTGTATGATTGTC GTACAATAGCAAACTTTCAGGGCAATATTGGGATTGTCATGCATATGTCT TAGAAACTTCAGCTGTCCTGTTTCCAAAAAAGCTGTCTTAAATCCTTGTT AGCAGTTAAATTGGTCTGTCACCACTTGTTTGAAAATCCTCTGGCAAAAT TGTGCGACAAGCTATGATGAATATGACCACGCTGTATCATTAGATTCTAA GATTGTTGAGGACAGAACTGTAATAGACCGATCACCAAGCGCTGTCCACC TCCATCAAAACATCTAAATGTCAAAAAAAGAAACATAGAAATACAAAGAT TTGACAGGCACTCTCTCATTGGTCGAACCACTAATTGGCTGGCATTGGTT CGACTGCAAACTTAAAGTTTGATGGACAGTCAGGATTGGTCTATTATGAC TATTATGTGATCTCTCTGTATTACTGTAGACTCAACAACTTGGACATGTA TACTATGTACCAGTATGTAAGAAAAGACTGTTGAAGACAGAACAGTATGA ACATGAGGATTTCTGTATTTGTGTAGACTCGTGGGTGGAGCTCCACTATG CGAACAATGGAGACCAGCAGCAGCAGCAGGGGACCAATGGGAACCTGACG TCTCCTCACAACGGGAACATGGAGAAGCTGCTGATGGAGGCGCAGCACGA GTCGCCCAGAAACAGCTCCAGGGGCAGCAGGTCAGGGTCTAAAAAATCTT CTTGCCTTTGATGCCCATGGTCTTGATGACGACCATTCTGGCATGTTGAG AAAGTCGTGTTAAGTGTCTTTCCCAAGGGTGCAAGATCGGTGACACAGAA GGATTCGAACCCAGGACCGCTTGGTTCTGAGCTGAACATGCGGCTTTGCG CCACACGACCTCATGTCGTACCTACATGTACTTCTTGTTGAATCTCCTAT TTATCTGTCTAATATCTTACTCTTTACTGGCTGGACATTGTGTCCTTGGG AAAGGCACTTTATACGACTTTCCTCACTCCACCCAGATGTAAAAGGGGAA TGGGCTCCACTTTCCAAGTATACTGTGCCCTAGACACCCCTTGGCCCTAC AGCCTCAAAAAGGCTATGGGACTACCTTTACCTAATAGTATGTGAAACAT ATTCCCTCCAGAATAAAGAAGTTTCAGCTTAGTTGTATTTATTCTTCCAC TATACAGCAGCCCCAGAAGTCCCAACAGCCCACCCCTACCAGCGAATGGT AGTGACCATGAAATGGGGAGTCTGAACGGCTCCAATGGACAAAGTGAGAA GTCCCAGGTATGTAAATTAGCTTTATCAAGCTCCAAAGAATGATATTTGT ACCAAGTACTATATATCATCATCATCATTGAGTTCCACTCTATGATAGTT CTGTAAAGAGTTCCACTCTATGATAGTTTGAGGAAAATGCAAATTGTTTA ACACATCAATCCTGACGTTGTTGTATGGCTTGAATCATAATTTTCTTTCC GTCTCCAGTTTGAGACAGGCAGTAGCAACAGTGCCAGCCTGCCGCCACTG CCAGAGCGGAACACTGCCGAGTGGATCTGGGACTGGTCATCACGGCCCGA GCAAAACCCACCCAAGTAAGGACCCTTTACTCTGTAGTCCTCTAGAGACT GCGACCTCCCTGCACGCTGTGACCGCTGAGAAACCAAAGAATTCACAGAT CCCTCAACAAGTTTCATAGATAAAGCACAGATTTGTATACACATTATGCG TTTCTTTTAAAATCCTATTTATACATCTTGTATCATATTCCGATTGTGAG ATCAGGGGTCACACAAATTTTGGATGCTGTATGGTCGCTATGACTCCTCT GTTCAATACGTACCTGTGAGAGATGGGAGAAAACAGTAAATCAATGTATA CTATTGGAATGCAGTACTAGCCTTGCCGTCTCTATAAATTCACTTCAGCA AACTAATAAGGTCAAAGTCAAGGCAGGAGGTTTCTCCACAAAGTGTTCTT GAGCAAGCAGAGGGTCAGCAGGCTACGTGCCACCCAGCAACAACAAAGTC ATGGACTTTAGAACTGTTTTTCTTTGACGTTTGATGGAAGAAGTTAAACT ATGGTCCTGAGTTAATGTTACTCATTTTCAGGTTGATTTTTACCAGTAAA CCAACATAACTGTAAGGAGTCCCAAAGCAAGTTAGAAGATTCAGCATAAA ATCAGCTCAATAAACAGTTTCCACCAGCAGATAATTTATAAGTCACCTCA GGCTACAACTCATTCCAGCGATGTCGCACTACTCTGAGAACTTCATCATG TGTCACATAGTAAATTTGTGTTGCCCCCCTTCCCTCTACAGACCTTAAAT CTCAAACATCAAGTCACCTAACAATCCCTTTAGTATCCAAAAGGTCATTA TGATTGACTGGCTTCGTAGGTGTCAAATGTAAGAAATGTCCCATAAAAGG ACACCATATTTCTTAAGTGTGAAGATTGGGATGCTTGAGTTTCAGTCTAG CTTAGAGTCTGGTAGTGCTGGTCATATAGTGATAGATTGTGTAGCTGTAG TTAATAACGGGGCCATCAGGATGCATTGCCACTGCTCACAGGACTGCCAT CATGATGGTAACATGCATGTTTTCTATCCAAGGTATGTGAAATGTGGAGA AGCAAACAACAATTTTTTTTTCATATTATGGTTGTAACATTGAAACATTT TCAGCTGCAAACCTGGTTTTGAGTCAAAATTTGTGTTTCACTTCCAGTCC TAATCACAAGTGTTTCTAACTTCTTTGATTTTTCATTCAAGTATGAGGAT ACTGTGGATTTCTCTTCAAAATGTGTTTGTTCAGAACTTCATGCCATTGC AACTGTGTATTTTGTACATGTATTCAATCATTGATAATATACATTGTGTG TATCCTTCCTGCAGGGACTGGGAGAAGAAACTGAAGCACCCGAAGCACCG GCTGAGCATGAGGCACACCAAGGCTATGAAGAGGTGGGTAGACCCTGACT CATCTACAGTCAGTCATTCATTATGTTAGCTAAAGACAGTATGTACTCTC AGGGCAATGCTAACTGCTTCTGAACCAGTCAGGAACCGTGATGAGGGGGG ATATAAACTCAATCACATTTAGGACCGCACTCTTCACACTGCAGCAGTGA CACCTAGCTGCAGTGTGAAGTAGAAGCAGTCTGTATTACCCCGAAGAAAG TGACAGACGGTAACTGAAACATCAGCTAGGTACGAACACTAAGTCTTGAG TGTGTACAAGGAACTTTGTTATCCAATGACTGACAGTTCTTGTTCCACAC AGTGATGCTGCTGACTTCCTGACTCTGTACTTCAAGGCTCTTGTGATCAG CCACATAGCTGTGCTGGGCATCGGGATTGGCATTGGGTAGGTTGGAAGCT ATGTTGTGTTTGTACCGATACTTTCAATGTACTTTTACCTTGTCCAGATC CCTTATCTATCCACATAGGCCAATACAGTCATAACGCTATACGAAAAAAG AAACTGTACTATCCCTAAATGAGATTTGACGAACGTTAAGTCACAAAGTA GCCTAGAAATATGCAATGTGATATCTAGAATAGTTCCGTTTAGTTATCAC TGTAGAGTATATTTGATATAACAATAATAAAGTAGTAATTATAATTGTGG AATGGTACACCTAGATATTGTTAATTATGTTATCTGTACATTGCCATACA TTGTCACCGTTGCAATTGTGCAAATAAATCATTCAATTCATATAAAGATT TTTGCTAACAAATATAGCTGTTTCCATCAAGTTTTTGATCAGTCCTCAAG TTCAAATGAGCTGTTGCTGATTTAACACTTCTGATCAGGTCACATGACAT AAGCTTTGGGTCATTTTCAACTTTTGATAGAAGGGCCAGAAAACCTTTGT GTTCCTTTTAATATTTTCCATATTGTTGTCCCTGCCTAGGATCTACCTCG GCCATCGGCACATCGGCTCCAGCACCTTTTGAAGACACCATCATGCAAAA CAGAAAACATGCAAGTCCGCCAGATAGCTTGCAAAGGACATGTACAGCTT TAACTGTTATGTGACATTCAGGTTTGATGACTTTGACATTGACAAAGCCA CATTAATGTGTAAGATTTTAGGCAATTCTAACATCTGTCAAAAGTGCAGG CATTGTTGTTTTAATTGCATAGCCTACATGAAAATAGAAAGCTTAATATG AGAAGTCCTTTTGTAATTGATCTAGATCAGTACTACAGGAAAGCTAGATG AGAAGAAAATTGTATTTGATTTACAGTATTCACGTTAAAGCATTCTGAAA ATGAAAATATACAGGACTTGTATTTTTGTTTAATTGCTGTTTTAGTATGC TCTGTCAATGATTGTTAGGTGCCGTTTTAAAGGTCTAAGTATCGTTTTTA GGTTACAACATTGTCATGAACAAGGCTTAGTAGAGAATTCTGTTTTCTTT TGTTTGTTTTAACAATGGCTTTTCCCTGAATTCCCATGAAGGGAAATAGA AATGTATGATTCTCTGTTAGAGCCGTGTACAACATAGATATTAGAGCCGT GTACAACATAGATATTTCAGCTCATGTCATATAGATATGTCAGCTCACCC TCAACTTGTCTGTTTTTGATTTGAAGAAAACGAAGCAGTTGTCCATAATA TAAAGCTGCTGTGAAAAGGCTGCAAACTTGTCTCACAATTCTCTTCACTG ACAGATTGTCTCCCAGTTCCATTTTTCCTCGCCCCTGCAAGCTTGTAGTC CACTGGTGGCCCTTGCAGCTTGCTATGTGCTGTAGAGCTTGTGATAACAA CTTGATATCGATGTGTTGCTACCTATTCTCTACTTGCAAACCTTCAACAT AATGTAACACACTAATGCTTGGACATATTTGTCCCCAAAAGAGTCCACTG TACACAATCGGATGGGGGTCACTTTGTGGAGGCACATTGCACAATAGACT GATCCTGACTGTCCATCACAATTAGTAGTTCAACCAATGAGAGCATAGCC ATTAGCAGTTTGACCAATGAGAGAGTGGCTGCATGAATTTTTATTCTGCA CATTTCTATCTTTTGATGTAGGCGGGCTGGGCTATGCGATTGGTCTACAG TGGCACTGACTGTTGCTTCCACTAATCTTGTTAACCATTCCCAGAAAGCA AGTAGCTTGGTAATGTGCCTATTTATAGATTATGTAAATTGGCAGTTTGA TTGTAAGAGTAACTTGCACCATGGATAGCCTTGTAGATGTGTTGCATCAT GAGAATTTCCTTTTAGCCATTTCTTGTGTTATGCTATGTCTCAGCTATTG TTATGGTGTTACCCATTGATAGTTAATTGTACACTGTAATGAAACAAGAC TGACTAGTCACAGGAAATACTAGTAGACTAAACTTACAGTTGTAAGTGCC AAGTGGTACCTTGCTGTTCAAACAAAACAAATTGTAGCGCAAACCTTCAT TTGGACAAGGCTTGACCTCCAAAGACACAAATGTACTTTTGATAACCCCA GAGAGAAATCGGTTATTGTTCACATGGTTAACATTTGAGAGGGAAAAAAG TTGAGGATTTGTACTTGACTGTTTCGAGAGGGAAAGGTGATTAGTTGGGT GTAAATAAAAGTCTAACAGTGGTAAGTATTTTCATTCATGATCAAATAGA TGAAAATGTGAACTTTGCATGGCTATGGTGATGCATTTTTCTACAGGTTG AATCATATAAACCAAAGGAGAAAACAGACATTATGCTTCTCAGAACACAA GTTTAAAAACCCAATACGGACCGCTGATTTGCAGTTCATTTTTGATATAG AAACTTGGAAGGCCAAACACACGTACAAGAATCTAAGCTTAAAGAGACAT TCAAGTTCAAAGGCATTTTATTCCACCAAACGGTAAACCCAGCCTCTGTG TTAACTAAATACAGATATTTTAATAACATGTACCTTTGGCATTCCATTGC ACTTGCATTTCATACCGAGCAAAAGTCACATTTTTGTGTAAAGAAATGGT AGTTGTTAGCAAAAAGGAAATTGGTAGGAGGGGATAGACAGACAGGCTGG AAAAGTGGTATTTGTACATATCCAGTTTATGAAGTTTAAAGTACAGTGAG TTGGTAATAATATATGTGGAGACAAAGACACAAAGTGAATGCAGTGATGG GGAAACATTAGACATTTGTGGTCAAGCAAATCTTGCTGTACAAATAATTA ACGTTTAATAATCCGTGATGCAAAGCAAAGGAACTTTGACTTGTAATTGT GAGCCATGAACACTTGCATTTTCACTCCTGTTGTGTCATGAGTCAGTGTG CAACATGTTCAGGTCTCACAGTGTGATCTAGATGCACCCTTCTGTTTTTC TTTGTTGTTGTTGTCATTACATGTATTGACAAACAGTGTGGTGAGAATAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000261:330493..342054-

>Blg01719.5 ID=Blg01719.5|Name=Blg01719.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=606bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000261:330493..342054- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGGAGACATCCAGAGAGCTGTCGGACGACAACAGCTGTTTGAACGA
CTCGTGGGTGGAGCTCCACTATGCGAACAATGGAGACCAGCAGCAGCAGC
AGGGGACCAATGGGAACCTGACGTCTCCTCACAACGGGAACATGGAGAAG
CTGCTGATGGAGGCGCAGCACGAGTCGCCCAGAAACAGCTCCAGGGGCAG
CAGCAGCCCCAGAAGTCCCAACAGCCCACCCCTACCAGCGAATGGTAGTG
ACCATGAAATGGGGAGTCTGAACGGCTCCAATGGACAAAGTGAGAAGTCC
CAGTTTGAGACAGGCAGTAGCAACAGTGCCAGCCTGCCGCCACTGCCAGA
GCGGAACACTGCCGAGTGGATCTGGGACTGGTCATCACGGCCCGAGCAAA
ACCCACCCAAGGACTGGGAGAAGAAACTGAAGCACCCGAAGCACCGGCTG
AGCATGAGGCACACCAAGGCTATGAAGAGTGATGCTGCTGACTTCCTGAC
TCTGTACTTCAAGGCTCTTGTGATCAGCCACATAGCTGTGCTGGGCATCG
GGATTGGCATTGGGATCTACCTCGGCCATCGGCACATCGGCTCCAGCACC
TTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:341680..342054Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:341680..342054Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:336325..336478Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:336325..336478Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:335748..335847Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:335748..335847Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:335440..335546Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:335440..335546Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:334072..334140Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:334072..334140Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:333669..333752Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:333669..333752Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:330493..333115Blg01719.5-exon-Sc0000261-1570713199:330493..333115Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01719.5Blg01719.5-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000261genomeSc0000261:330493..342054 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01719