Blg01944.10 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01944.10
Unique NameBlg01944.10
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000487:52625..73005+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01944.10 ID=Blg01944.10|Name=Blg01944.10|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=20381bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:52625..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CGGCACTATCGAAGCTGGAATATTGTAAACATTATCCCTGTTATATGTTT ACGGAACTACGCTCTGTATAATAATATATCAAAGCGTTGTTCTGCCAATT AGTGTTGGCGTTTTTATAAAATGTTTCCATATAAGGCCCGACGACTGTGT TCCTGTTTTAGACAGGCATTGGTTCCTCTTCTCCAGACAGAAATAATCGT TACGTAGTCTGCTTCCCCCTTTCGTGTTTCAAGTTCCTCTTTGTGTAAAC ATATCGTAGCGGTTTTAGTCCATCTGAATTTACTCGAGTGAAGGTCTGCT CAGCGCAGTGTAATAGGTAATTTTACTGTAATTCTAAGGTATTTACATAC TATTGATTCGTCAATAGCTCAACGTACCTTCTGGTTTTTTTTCAACCATC AGTCGACTGTTACGCTCATCAGCTTTCTGTTTGCTGCTTAAAATGTTCTT TCAAGACTTAGTCCTACGTTTCTAATGGTCAGGAACATTATTGTTGCCAC AGATTGAAGCCACTGTTCCACGATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCC CAGACCTGGAGCGAAGCCAGACCGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTA GACAGCAGGGAGCGAGAGTTCCAGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTC TCCCGTCATGAACGAAGTGGAAAGGAGGCCACGGAAGAAAGGTAACACAC CCTTTCCATGAGAAACTGCGACCGTTGAACGACCGCTGAGCGACCACTGG GTGACTAACAAAGTGACTCAAATAATTTCATAAACAAATAACAAATCTTT TTTTACGTATATGTTTTGCTGTCTTTTAAATCGTACTTTGATATCTTGCA TCACATTCCTCTTATAAAATCAAGGGTTATACCAAGCTTATTTCGGTCGG CCAACGGTTTGTCGCCTCGATATGAATGTTAATTTAGTGTAGTATTAACA TTGTTCTGTTTGCCAGTTTGGGGCCATACGGCAACATTCGTATGTGCAGT CTGAAGTGCCTCATGTAAGCAGATGGTGTATGCCTTTTCGTATGACATCA TATCTGACACGACAGTGCTGTGTTTGGGCAGTAGCGAGTACTAGTGCTGA ACTATTGTTTAATTACAGTGCTAATTATGTTTTCATTAAATCTCAGATCG TGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAAAGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACC TTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAGATTCTAGCAGTACAGCAAGAACA AGCAGATAACATTAGAAACATATGGCACTGTAAATATTTGTCAAATTATG TATTTTGATACTTTTATACAACCAAGTATACTGTATATTCAGCTATTCTA ATGAGGAAACTTTACTAAAATATGGAAGAGTTGATGTTATCTTCACTGCA GTTTGAATCGATTCACCATTGCAATATTAATGTGTCTAAAACAACTTTAC ATTGATACAGATATGATATTTTTCTTCCTCGCGATACTTTATCTTGATAG CCAGCTCAACAGGTCCTCCCAATTCAATATGGCGGTAAAAATAGCGCAGC CTTGAAATCCACGTCATCAGGGGTTAGCTGCACCGGCTAATCAAACGGCG ACAGTTGAACTATTAACCGTTAACGCAATCGATATCGATAGTGCCCGGTA CCGCCAAGCGGGGCGATCTAACTTGCAGTGTAATTCTGTTAGCAAAGACC CGGACCGGCTGTTAGCTTGTGTTATATAGACTATTCGCTAGAGGAATTGT TATCTATGTAGAGGTTGATTGCTGATGATCTTGTAGGGAACTACATGTCC ATAGAAATGCTTAGTGTGGGACTAGTACAGTCATGCTCCCTGGCTGATCG CAGTCGGTAGAATTGTATTTACAGAGAAATACATAATCATGATGTGTTCT GTTGTACAGTTTATTCTACATTGTGTATTAGCTATAGATTTAAGTTCAAT ATCATAGATACAATTAAAGCACTCATAATGTCTTCAAAGTCTGACATGAT CTTTGATGCTTCGATGTATACGAGTAAATACGAGTGAATAAAAATATGCG AGGTTTTGTCAAATTCACGAGTTTGTCCCTGTATATTCCCCCTTCAGTTG CAGGATTGTTTTGATGTAGATATTAATTAGAAAAGTATCATCGTTTCTTC TTGTTTCCCATTCATACAACATATAACAGTAGCAGATACAAGACCTGAAA CACGACTTCCTAAAAAAGATGGGAACTGAAACCTGGCATTGGTTTTTAGT ACGAGGAGGGGAGACTATACCAGATGCTTTCGTAAAATAAAGGGATGGAA ATATTTCCTATTATTATGATTTTGTGCGCCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000487:52625..73005+

>Blg01944.10 ID=Blg01944.10|Name=Blg01944.10|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=282bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:52625..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGAC
CGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCC
AGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAA
AGGAGGCCACGGAAGAAAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAA
AGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAG
ATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.10-exon-Sc0000487-1570713199:52625..55527Blg01944.10-exon-Sc0000487-1570713199:52625..55527Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.10-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Blg01944.10-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.10-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Blg01944.10-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.10Blg01944.10-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000487genomeSc0000487:52625..73005 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01944