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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000136:349124..357419+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >Blg01979.3 ID=Blg01979.3|Name=Blg01979.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=8296bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000136:349124..357419+ (Branchiostoma lanceolatum)
GACGACGTTACATAACTAGCAGACGACGCGCTGCTGAAGCACACAAGATC
TGCCGCTATTGCAGGTTTTTATGGACGAAGACTGCTACAATTACTTAATT
ATTTTCATCTGGACAAGATTTCACGGCAGTTTGAAGCAAACGGTGTACAA
CTGTAGTCGGCGTCAGAAGAAATTCGTGCGCAGCTCACCCCCTCCTCTTG
CCCCCCTCCCCACTTATTCCAAGACCAGGACTGAAGTTTTGTAACGCCAC
GATGGCGACCAACGTGCACGGCCCTTCCGTCGCTATCGTCGGCGGTGGTA
TAGCGGGTCTGGTGTGTGCAGCGCGCCTGGGACAACTCGGCATCCCCGCT
GCAACCGTGTTTGACACGGGAAGCCACGCCCCAGGCGGCCGGTGCTCCAC
CAGGAAAATCGACGTCGCAGGAAAAACGTTCCTCTTTGACCACTCAGCCC
AGTATTTTACAGTCAGCGATAATCGATTCGCCAAAATTGTCTCATTTCTG
CATTCCAAAGGAGCCGTGAAGGTATGGAACGGGCCAGTCGGTGTACTGAA
AGGGGGTCGGTTTGAGAGGAAGTCCAATCTGCAAGCGTTTGTGGGTACAG
AGGGCATGAAATCCGTCCCAGAGTGCCTCGCTACTTTGTCAAGAGTGGAG
AGGCCGGTTTGGATCGGCAACGTGGTCTGGGAACCTATGGCCAAGAAATG
GAAAGTTGGCAAGTAAGTGTGATAACTATGTAAAGTGTGTGTATGTGTGT
GTGAGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTACAAACGCGTGTCAGTGTGTGC
GTGTGTGTGCGTCCATGGGCGTGTGTGTGCATTTGTAGTTATTTAATAAT
TTATGTTCCCTGGTTGACAAGTCTCGATGTTACAGACTGTTTTGAGTATA
TATTTAAATGCAACGATCCCCACAAAGCAAAAGTAGGTAAATATTCAAAT
GACTGCTTGAAAAAGTACCGAAACCAATGATTAGCCCTACTTGATTATAA
CACTATATCAAAAATGTATGCTAGCCCTTATTGTATTAGTAATTAGGATG
TTAAGTATTATTCTATACTTCTATTTTGCATTATATTTAAGAATTCTTGC
CATACTTTGTACCATGTACAATTGTCGTGCAATAAAGTTCTTTTTCTGTC
TTCTTGAAACAGATTACAAGGTGTACTAAGATATGAGATGTTACAATCTG
CACAGGTCACTGTCAACTTACAAGAACTAACATATTATCTTACTATGTTC
TTGTTCATAACAGGTATGGATACTTTAACTACCTTGTTATCGCACATAAT
GGGAAGTGTGCAGACCGTCTGATGGGCAATGCTGGTGCTCCAAAGATCCA
CGAACTTCTCCGAGTGCGCTTCACTCCCAAGCTGATCCAGAAGGTCCAGC
AAATGCAGCTGTGCTCTCTGTGGGTGTTGCTGGCGCTGTTTCCTACCAGC
CTGAAGTTACCGTTCGAAGGAGCGTTTGTGGAAGACTCGGACGTGACATG
GGTGGCAAACAATACGGCCAAGCTAGGTCAAAGGGCAACTGGGGACGGCA
GCGAGTGTTGGACTATTTTTAGCTCCCGACAGTTTGGAGCTGCTCACAAG
GTGAGGGCTTTCATTATGTCAAATGTGTTCTTTCAAACTTCATAATCATT
AATGCTGATCTTTTAACAGTTTTGTATATTTTCTTTAACTTTCAAATTGT
GGTGTATTTCATGATGTTGTTAAATTTATGCCACTTTGCATTGAATGTTA
ACACAATATTCATTTGTGCATAAGATTGTAAAATATTGCATATGGAGAAT
AGCTACGTTTCTATCTTCTGGTTGCAGGTGCCACAAGAGAACATCCCGCC
AGGCAAAGCTGACGAGGTGACAAAGCGACTCCTAGCAGCCTTTGCAAAAT
CTGCAGGTCTGGATTCAAGGGCTCTCCCGAGTCCAACCTACACCAAAGTC
CAGCTCTGGGGGGCAGCTGTACCCTTGAACGTGTTGGACGGAGCAGACTG
CGTGTTCCAGGCGTCACAGAATGTGGGGATCTGTGGAGACTGGCTTGTTA
GCCCTTGTATTGAAGGCGCCGCCGTCAGTGGATTGGCCCTTGCTGAGTCT
ATCCACCGCCATGTTAGGGGGGAGCGGAGGGATACAGGCCTCGGCTGCAC
ATTCAAACCTGTTTATGGACCTGCCATGGGGTCGTTTCCAACCAACAGTA
AACTGGTTTTCAACCCTGGAGGAAAAACTGGTTAAAATACTTGATCTTTA
GGCTATCAAAGATTTCCTTTACATTCATAACATGCTAAGGCCACACCATT
TTAATTTCTTAGTTTAACAGAATTTAAAAAAAATGCTAGATTGGAAAATC
AACAGGAAAACAGAATCTCAGAGGAAAGTTTGTACTTTGGTGCACACAAT
TTCAGGGAGTGGACAGGGTCAGATGCAAGTTTTCACCCCAGCCTTCTGTT
TTCATGATTTTTTGTGTGCTAAAATTAAAAAAAAAATCCGTTAACCAAGA
AATTAAATTGGTGTGGCCTAAATGTGAGATTCTTTAACAATGCCTTACAA
TAGGAGATTCGCTTGAAAATGGTCCCTTTTTAAAGAAGATAAGATAATTA
TAATCAGCAGTAAAAAAGGAGAACGATGCACACGTCAGATAAGCAATAAC
GATTTACTATAGAAAAAAGCTTAATCAAAATTCTAAAGTTCACACATCTA
CCTGATGCATGGATTTCTGAATTGGTATAAATATTGACATATTCATAACC
TTTTGGACTCAATGTTTCAAATCAATCAATCTGTTGTACAATATAGTGAC
AAACTTTCCCAGATGTTCTTGTGAATTTTACTAATGTAATCAACTTTTCA
ATAATTTATTTAAGGCTGAAACAATAGTTGCCTTGATAACATTTTCGAAA
ACAAAATTATGTTAGAATTAGATCATGTTACATTGGGTTTCCCAAGTTGA
TGAAATGTGATAAGACTTAAATTACAATGTATGAAGAAATGCTAGCGTTG
TATCATCTGTATAATACAACTAGCAATTTGATGTTAGACTTGATAAAGCT
ACTATTTAAGCTATGAATTTCACTTAACTGTCCAACACAAGTACACAAGC
AGAGATTATTGAAAACAAAATAACTACCTCAAATATGCTTCAAACATTAT
TGTACTTACGTCTCAAACATCTTAATTACACGATTTAAAATTTTCATTCA
TACTATGTATATTTAGCAGAATATATGTATCAGTTTTGCTCTTTTGAATA
AACTAATCCAGTGCAGCCCTCTTGTCTGCATCTACTTTTGTCCATTCACA
GTTCCCACTATTTATTGATAGATTGGGCAGACATGTGAAGGCATCGATAA
CATGTAAACTAATCTTATATTCTACAGCTGGTAGTAATGGTAGTTATACT
ACGTCATAAAAACTTAATCCTCCCAGCAGGCTCGGTTCATTACCTCCCAT
TGCGGCCCTGCAATTTCCAGCCTGTGAACTCGCTTCTGGCGACGCTATTG
ACAGTTGCTCATGAATGATTAATGAGCTAGCCTTATTTGGCACAAATAGC
CGTTATGGCCAATGAATGATTAATAAGCGATGTAAGACGTGACCTGATTG
GTTGATAGCCTCCCAGCGTCCTTTGCGCTTTTGCTCGAGATGAGCTTTAG
CAAACCCTCTGATTGGCTGAAGCTGTTTTGGTGGTGACGTCGCCAGAAGC
GAGTTCACAGGCTGGAAATTGCAGGGCCGCTATGGGAGGTAATGAACCGA
CCATAGCGGGCATGCTGGGAGGATGAAAAACTTTTGACCGCTGTTTTAAC
ATCAGGTTGTATGACATGGCCACATAATAGTGGGGTCCTCGTGCCTCATT
ACATGTAGATGGATCTAAAATTACCGTGCGTCTACTTTGACCTACGGACG
AAATTAGAAACTGTGGTGATCACATCACAGCTTATTTTAACCAGACGCTG
ACGAAGTTGGAGTGTCGTCTCCTGCCGTCCCGTGCGATGGGGGCATGCAG
GATGTCTGTGTCGAACCCCTCCACCATGTCACCAATCTCCATCACACCTA
CTGCCACACACCTAGATAGATGAAAAAAATGCATTGGCTCTGAGTGCTCA
AACGGTTTCCAAAGAAACACTACCCTTTCAATCTTAGCTCGTCTTTATTT
TCTCAAATGTCTTTCCGACATCCCAAACGGTTTCCAAATAAACACTACAA
TTTCAATGCTAGCTCGTCTTTATTTTGCTCAAACGTCGACATGCCATCTC
TAATTTGTCGCTCAAGCTTTCCTTACTATTGCCAGCTATATTGGGTCACA
AAGATATAGTGATGGATCATTGAGGGCAAGGGATATTACTGTAAATGCAG
AAATGTTCGCGGTGGTTTTATTTTCGCGGTGAATTTTCAGAGCGAAAATA
AAACCATCGCGAAACTTTTTACCCACCTATGACTGTACCGCTATTATTGT
TTCAAACGCGAATTTAAAACCACCGCGAACACTCCATTTTCTCCCTACCG
CGAAATAAAAACCACGCGAACTTAAATGCATTTACAGCATTCCCAATACA
AGTGTGTAAATATCTATAAAAAGACTAGTTGCCAATGTGCTACTGCCCAA
ATGGCTCAATCTACTATGCTCCACTAACATCAACCCAGACCCTACCTGTC
AGAGAAGTCCACTGTCCCTGCCATGTCCGAAGCTACGCCCGGGAAGGCGC
CGCCATTCTCCGGTCTAGGCAGCACGCCGTACTTGTTCTGATAGCACACC
GACTTCTCCCCGTCCCATGACGTCACTACTACGGGGGTTAACTTCTCTGC
AGACACCGTTGACTGTGAACAACATGGACGATGTTAGTTTTAAACAACAT
ACCTAAAAGTAATAGATGCTAAGCTGGCGAATACATTCAGCGCATGGGAC
AGACCCCTTCCTCAATTGATGGCGTTCAGCACCAAGGACAGGACCCATAC
ACTTGCAAACGCATGTAGTGAGAGTCTGCTCACTTGGTGACGGTATTCAG
TATAGAGTTGGAACCTATCCTGTCTGTAGGGCCACAATTGCCTCCCAATT
TCCGTGATTTACTGTTAGCGGTAGAGACGCAGGTAGGTAGGTAGAGGTCG
GAAACGATACCCGGAAATTTTGGCGATGCCTTAGGGGCGGGGCGAGTGGT
ACTTCATTGATTCTCTAGGTCGTCGTCGAAGATCACGTTAGGACAGGAGT
GAAACGAGATTAAGTCCAGTACGTACAGCATTATCACAGTTTCTGCAGTC
AAGTTTACCCTATGGTAAGGCGAAGTGGCGTCGCGGTGGCGTAGTGGCAA
GATGTTTGGCCCCAGAACCCAGAGATTCCGGGTTCGAATCCGGGGTTCCC
TGATAAGAATTTAAAAAAAAAATGCTAGATTGGAAAATCAACAGGAAAAC
AAAATCTCAGAGGAAAGTTTAATTTGTACTTTGGTGCACACAATTTCAGG
GAATGAACAGGGTCAGATGCAAGGTTTCACCCCTGAGCCTTCTGTTTTCA
TGATTTTTTGGGGCTAAAATTAAGAAAAAAACGTTAACCAAGAAATTAAA
TTGGTGTGGCCTTATCGTGGACAAAAAATAAGTGAGAGACTGAAAGAAAG
CTTTTTTTTAAGTCACATTGTGCCCCCTAATTTGAAATGGAATAATCGCT
TACAGTCTCGTGAGAATTGACGAGATTTAAAAGCTATGACGTGTTTGGCA
GACGACGTTACATAACTAGCAGACGACGCGCTACTGAAGCACACAAGATC
TGCCGCTATTGCAGGTTTTTATGGGCGAAGATTGTTACGATTACTAAATT
CTTTTCATCTGGACAAGATTTCACGACAGTTTGGTGTACAACTGAAGTTG
GCGCCAGAAACTCGTGCGCAGCAGCTCAGGCCCCTCCTTTTGCCCCCCTC
CCCACTTATTCCAAGACCAGGACTGAAGTTTTGTAACGCCACGATGGCGA
CCAACGTGCACGGACCTTCCGTCGCTATCGTCGGCGGTGGTATAGCGGGT
CTGGTGTGTGCAGCTCGCCTGGGACAGCTCGGCATTGCCGCCGCCACCGT
GTTTGACACGGGCGGCCACGCCCCAGGCGGTAGGTGCTCCACCAGGAAAA
TCGACGTCGCAGGAAAAACGTTCCTCTTTGACCACTCGGCCCAGTATTTC
ACCGTCAGCGACAATCGATTCGCTAAAATAGTCTCATTTCTGCATGCCAA
AGGAGCCGTGAAGGTTTGGAACGGACCTGTCGGTGTACTGAAAGGGGGTC
GGTTTGAAAAGAAGTCCAATCTGCAAGCGTTTGTGGGTACAGAGGGCATG
AAATCCGTCCCAGAGTGCCTTGCTACTTTGTCAAGAGTGGAGAGGCCGGT
TTGGATCGGCAACGTGGTCTGGGAACCTATGGCCAAGAAATGGAAAGTTG
GCAAGTAAGTGTAATAACTATGTAAAGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGTGT
GTGTGTATGTACAAACGCGTGTCAGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTCCATGG
GCGTGTGTGTGCATTTGTAGTTATTTAATAATTTATGTTCCCTGGTTGAC
AAGTCTCGATGTTACAGACTGTTTTGAGTATATATTCAAATGCAACGATC
CCCACAAAGCAAAAGTAGGTAAATATTCAAACAAGAAAAAGTACCGAAAC
CAATGATTAGCCCTACTTGATTATAACACTATATCAAAAATGTATGCTAG
GTTTCTAGCCCTTATTGCATTAGTAATTAGGATGTTAAGTTTTATTCTAT
ACTTCTATTTTGTATTATGTTTAAGAATTCTTGCCATACTTTGTACCATG
TACAATTGTCGTGCAAAAAAGTTCTTCTTCTGTCTTCTTGAAACAGATTA
CAAGGTACTAAGATATAAGATGTTACAATCTGCACAGGTCACTGTCACTC
AACTTATACAAGAACTAACATATTCATATCTTACTATGTTCTTGTTCATA
ACAGGTATGGATACTTTGACTACCTAGTGATCGCACATAATGGGAAGTGT
GCCGACCGTCTTATGGGCAATGCTGGAGCTCCGAAGATCCACGAACTTCT
CCGAGTGCGCTTCACTCCCAAGCTGATCCAGAAGGTTCAGCAAATGCAGC
TGTGCTCTCTGTGGGTGTTGCTGGTGGTTTTTCCTACCAGCCTGAAGTTA
CCGTTCGAAGGAGCGTTCGTGGAAGACTCGAACGTGACATGGGTGGCAAA
CAATACGGCCAAGCTGGGTCAAAGGGCAACTGGGGATGGCAGCGAGTGTT
GGACTATTTTTAGCTCCCGACAATTTGGAGCTGCCCACAAGGTGAGGGCT
TTCATTATGTTAAATGTGTTCTTTCAGACTTCACAATCATTAATATATAA
TGCTGATCTTTGAACAGTTTGGTATCTTTTCTTTAATTTTCTAACTGTGG
TGTATTTCATGATGTTATAAACTTTATGCTACTTTGCATTGAATGTTAAT
ATAATATTCATTTGTACATAAGATTATAGAATATTGCATATGGAGAATAG
GTGAATAGCTACTTTTGCATCTCCTGGTTGCAGGTGCCACAAGAGAACAT
CCCGCCAGGCAAAGCTGACGAGGTGACAAAGCGACTCCTAGCGGCCTTTG
CAAAATCTGCAGGTCTGGATTCAAGGGCTCTCCCGAGTCCAACCTACACC
AAAGTCCAGCTCTGGGGGGCAGCCGTACCCCTGAACGTGTTGGACGGAGC
AGACTGCGTGTTCCAGGCATCACAGAATGTGGGGATCTGTGGGGACTGGC
TTGTTAGCCCTTGTATTGAAGGCGCCGCCGTCAGTGGATTGGCCCTTGCT
GAGTCTATCCACCGCCATGTTAGGGGGGAGCGGAGGGATACAGGCCTCGG
CTGCACATTCAAACCTGTTTATGGACCTGCCATGGGGTCGTTTCCAACCA
ACAGTAAACTGGTTTTCAACCCTGGAGGAAAAACTGGTTAAAATACTTGA
TCTTTAGGCTATCAAAGATTTCCTTTACATTCATAACATGCTAAGGCCAC
ACCATTTTAATTTCTTAGTTTAACAGAATTTAAAAAAAATGCTAGATTGG
AAAATCAACAGGAAAACAGAATCTCAGAGGAAAGTTTGTACTTTGGTGCA
CACAATTTCAGGGAGTGGACAGGGTCAGATGCAAGTTTTCACCCCAGCCT
TCTGTTTTCATGATTTTTTGTGTGCTAAAATTAAAAAAAAAATCCGTTAA
CCAAGAAATTAAATTGGTGTGGCCTAAATGTGAGATTCTTTAACAATGCC
TTACAATAGGAGATTCGCTTGAAAATGGTCCCTTTTTAAAGAAGAT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000136:349124..357419+ >Blg01979.3 ID=Blg01979.3|Name=Blg01979.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1206bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000136:349124..357419+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGACCAACGTGCACGGCCCTTCCGTCGCTATCGTCGGCGGTGGTAT
AGCGGGTCTGGTGTGTGCAGCGCGCCTGGGACAACTCGGCATCCCCGCTG
CAACCGTGTTTGACACGGGAAGCCACGCCCCAGGCGGCCGGTGCTCCACC
AGGAAAATCGACGTCGCAGGAAAAACGTTCCTCTTTGACCACTCAGCCCA
GTATTTTACAGTCAGCGATAATCGATTCGCCAAAATTGTCTCATTTCTGC
ATTCCAAAGGAGCCGTGAAGGTATGGAACGGGCCAGTCGGTGTACTGAAA
GGGGGTCGGTTTGAGAGGAAGTCCAATCTGCAAGCGTTTGTGGGTACAGA
GGGCATGAAATCCGTCCCAGAGTGCCTCGCTACTTTGTCAAGAGTGGAGA
GGCCGGTTTGGATCGGCAACGTGGTCTGGGAACCTATGGCCAAGAAATGG
AAAGTTGGCAAGTATGGATACTTTAACTACCTTGTTATCGCACATAATGG
GAAGTGTGCAGACCGTCTGATGGGCAATGCTGGTGCTCCAAAGATCCACG
AACTTCTCCGAGTGCGCTTCACTCCCAAGCTGATCCAGAAGGTCCAGCAA
ATGCAGCTGTGCTCTCTGTGGGTGTTGCTGGCGCTGTTTCCTACCAGCCT
GAAGTTACCGTTCGAAGGAGCGTTTGTGGAAGACTCGGACGTGACATGGG
TGGCAAACAATACGGCCAAGCTGGGTCAAAGGGCAACTGGGGATGGCAGC
GAGTGTTGGACTATTTTTAGCTCCCGACAATTTGGAGCTGCCCACAAGGT
GCCACAAGAGAACATCCCGCCAGGCAAAGCTGACGAGGTGACAAAGCGAC
TCCTAGCGGCCTTTGCAAAATCTGCAGGTCTGGATTCAAGGGCTCTCCCG
AGTCCAACCTACACCAAAGTCCAGCTCTGGGGGGCAGCCGTACCCCTGAA
CGTGTTGGACGGAGCAGACTGCGTGTTCCAGGCATCACAGAATGTGGGGA
TCTGTGGGGACTGGCTTGTTAGCCCTTGTATTGAAGGCGCCGCCGTCAGT
GGATTGGCCCTTGCTGAGTCTATCCACCGCCATGTTAGGGGGGAGCGGAG
GGATACAGGCCTCGGCTGCACATTCAAACCTGTTTATGGACCTGCCATGG
GGTCGTTTCCAACCAACAGTAAACTGGTTTTCAACCCTGGAGGAAAAACT
GGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:349124..349835 | Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:349124..349835 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:350387..350620 | Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:350387..350620 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:356312..356414 | Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:356312..356414 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:356657..357419 | Blg01979.3-exon-Sc0000136-1570713199:356657..357419 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000136 | genome | Sc0000136:349124..357419 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | Blg01979 |
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