Blg02943.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg02943.3
Unique NameBlg02943.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



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Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000127:815394..833059+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg02943.3 ID=Blg02943.3|Name=Blg02943.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=17666bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000127:815394..833059+ (Branchiostoma lanceolatum)
ACATTGATGTACATTTCCAACAGCCTGACACTGGAGCCACGGATACCCAG
CGTAACCTGACGGCCTGTCAGTTGCTAGGCAACCTGTGCGTGCTCCGCCT
TTATAACAGGCAGAACGATGGGACCAACCAAGAGGACGGCTGTACACTGC
TGCAAGCCTTGAGTGATGCCAATAATGACAACGTTGGCACTGTACAAGAC
TGGTAAGCACACTTCTATTCTTAATATTGTTTTGGAGTCTGTGCATTGTT
TAGTAATATTTTTTTTTCTTTATCGCATTGTGTAACACACCAGTTTTGTA
CTCTTAAGTACACATTTAGCTGTGTACTAAGACCGGACTGTAAGTTTGAT
CCACTCACACCAGGAAGAACCCCCACTCTTATCAATAAGTGAGTCATGTT
TTGTTTTAGCATGCTAGAGGTGTGGGTTTCCTGAAACAAGGCTTTATCAT
TATTACTTCTCATTCAATAAGATGTCCCTAACCTAAGCAAGGTGATCATT
TTCACCCGAGCCAAGTGAGGGAACCTGTGTTACATGTCCTTTCCAAGGGC
GCGACGTTGGGGCCTGCTAGGGGTTCAAACCCAAAACCCAGAGAGTTGAC
CACACTGTATCTCTAGGAATTGAAATTTGTCACAAAGTTGCAACTGTTTT
CACAGTTACAAATTAAATTCGAAACAGTTTTTTTAAAACTGTTCCAAACA
GTAAGTTTCAATTTTCAATTTCAATTTTATTTATTTTACCAGGGGACATC
TCAGATCCACAGATCTGCTCTTCAGATGACCCTGGGCACAAACATAAAAA
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ACAGTGCACTATTTCTATCTGGGTCAGAACCTGTATGGGACGTCTAGCAT
TGAAATCAGCAACATATGATTACCTATGGTTTAAGTATCGTTCTTGCCTC
TTTTTTTGACCTGCAGGAAAGTCGCTATGCCATGGCTGTATTATGATCAC
GTGCTGAACGACGTATCTGAGATACTGTCGGACACGGAAATCTCCACCAA
GTTCACGTTCAGTGCTGCGTCCCAGGTAACATTTCCTACCTTTTGTTTTA
GATACTAACCCTGACTGGCAAATAAAAGAATTTACTATGTTACTTTATCT
TTTTTTCCCTAGCTAGAGTTTAGGTCATGGATAAGATTACCATTTCAGAT
ATGTAGAAAAGAAATTAATAGAGCTGTGTACCGGTACACTATTACCGATA
CAGTACAGGAACAATCAATTGGGCCCCCATTCCACTAGACGGCGATCGTG
TTGCGGTCTCGCTGCGACTTACATCGAATTTGTCTAATCCTTGATTTAAT
AGTTGGAATATCGTGCAAGCTGTAAAAGTATTGGCTGAAAAGACAGCAAA
ACAAAAAAAGGGTAAAAAGATACGTTTTTATCTATGAAGTTCGTTGAGCG
CTCTGTTAAATGATAAGTCGCAGAAAGCGTGCGGCGAGAGCGCCGTCCTT
GTGGAATGGGGGTATTACTGGTACTGGTCCAAAATACCTGAACCCTGCTG
TATGGCACTGGACCGGTACTAATCAGGTCAAGCCTGACTCAGGGGATGGC
CACTTTGACAGATAAAATTACTATGAATTTACCGTGGCAGTAGTGCACTA
AAGCCACATCTACAGTATACTATACTCCAGCACATAAAACACATTTGCAA
GACGAGTCAAATTTTCATCTGTGTTTTCAAGAAAATGATACATAGCACAA
TCAAATATTATGTTATTACCAGTTCAATCGTGCTAAAATTGTCCTTATTG
AAAATCTACCATTTTCTGAACAAGTAGTTTAGGTACAGGTTCAGGTCCAG
ACCTGTACCTAAGCCTCTGTACCTGTACCGTGTAACTGAAATTTGTTTAG
GTACATAGCTCTAGAAATGAAGCTAGGCAGCAACTTGAAGATTCATCCTC
CTTGTGATTTTGTCAGATAAAATGTACAGATCTGTAGATATGTTACTCTG
GTTTTATATGAACTGAACATATATATATATAAACCACTGTTTGAAATTGA
AGATGAAAGAAATTAACATGTATATTTGTATCGTCCTATTGAGCAAAAAA
TGACAGAATTATGCAAAGTTGTTGCATACGAGTATCCAATATGAAGGCCC
CTTTTTACTGCTATGTTGATATGATATTTGCACCTCTTCATATGAAATAT
GGTGTCATTTAATGTAAGCCATGACAATGCATTGTCTTGTCTGCCACATG
TATTATGTATTAACAGAGTTTCCCCCTCTCTTTCTGCCCTCTTGGCTTAC
AGCTGACCAAAATACTGGGAGGACTATTTGTACCGTACCCTCTTCTTCTC
TTTTTCAGTAGTTTGTAGTTGTTGTTGTTAACGTAGAAAACTCTCCTTAC
TACATCACAGTTCAAAAGCTACGTTATTAGATTGTAACTTTCTACTTGTT
TCCTTCTACTAATCCTTGTACTTTGAACCAAAGACCAACAAAAATTAAAC
TTTTTATGTAAAAACTATGGAAAATCCAGGAAAGTTTTGTATCATAAATA
CATTCTGAAAACTTTTAAGTGGTTTATGCTAGGTATAGAATTTAAAACGA
ACCACCTTTGCTTGATTTCAGCATTTTAAGCAGAATCTAAATTTCAAAAA
AGTTGGTAAAATAATAAACATGGCCTTTGTAATGGAGCAGGGAGTTACAT
ACATGTAGAAAGATTTTCTTCACATTACTGAAAAAAGAAACAAATATTTT
GTACAAAACACCACACTGTCGCACAGTAGGAAGTTATGTCAGCTCACAAG
GTTGAACACATGTAAGCCCTTACAAGTTTGAATTTCACTGTTTATGTAGT
TCATGTTTTATTGAGTTTGACAAAGTTTCTTCATGTGTGTTCTTCACCTT
GCCACTCACTGTTCCTGTTTGTTCAATACACTCATCATTTTTTCCACAGT
ATTTACATACTGGTTGGTAGGCATCAGGAATTTCTCATCAGAAAAATATA
TCCTCATGGATGAACTTCAAAATTACCCTTGAGCAATCCCAATATCAGGA
CAAGTCTCTTTATCTTGTAGCTATGTAATCAAATTCCTGCTACATACCCT
CCGTCATGCTCATTTTGATACCTTCAACTAGTTTACTAGTGGACTCAGGT
CTGCATGTATATATTGTGCCTTGTTGATTGATTAAAGCTTGTTTCTCAGA
CATGGACCATGTATAAGATTATTTGTTCCATCCAGCATCCTTGTTTATGC
TTGATGCTAAGGCCATGTTGATTCGATTATATGGATGACATCCTTGGGCA
TCCCAAAACTGATGCGAGCGTCCCTCCAAGATAGTTTTGGAAAAGAAAAT
GTTGCCTTCATTATGAAACATAAGTGATCAGGAAGGTTGAACATATGATG
AAACACAAAGAGTATGGTATAGCTAAAAAACCAAATAGATTTTTAATTTT
TTTCTTTCACATGTTCTTCTTTGACTTTGGCATTCTGTGACATTAGTAAC
TGTTTTCCGGTAATTTTTGAAATGTACAACACTTATTTTCTTATTTTGCT
GCTGCTTTTTACGATTTACAGGATGGTCAAATTTTCCTTTTTTTAAAACT
GACGAAAATTGTCATCCACATAATCAAATCAACATGGCCTTATTATCATT
GCTACTTGATATTGTACTTGTGATGGTTACAAAGTAATCCTGGATTTCCT
AGCTGTGATTTCTTGATTTTTTCTTAGTCCTCCAAGTTGGACCTTGTAGT
GGCAGCCTACAGTCTGAACGGGGAGTTTCTAGGAATCCAGGATGTCACGG
GTGGGCTGCTACAGGTGGGACAGCTGTTTATAGGGTGTTAACATGTGACT
TTGTGTGGCGCAATCGGTAGGGTGTTTCGCCCACAACCGAGAGGTCACGG
GTTCGAAACCACCGATATGCCCCGATTTTGTTTCCTTTGGAAAGGCACTT
AACACGACTTTCCTCACTTCACCCAGTTGTAAATGAGTACCTAGCTTCGG
TTAGGGACGTCCCTTGGATAGGACGTTAAATGGAGGTCCCGTGTTTGAGG
AGAGCCACACCTCGAGCATGTTAAAGAACCCAATGCACGTATCGAAAAGA
GTAGGGGTCCTTCCCGGTGTGAGTGGTTCAAAACCTACAGTCCTATGGCC
GCACATGGGTTCGCTCTTAGTAACAGCCTCCGGCTAGTTGGGCAATCCTA
GCATGTACATGTTGAACCAATAAATAACTAAATGTGACATCACAGCTGCC
ATACTGGTTAGTTAAACCTGGCAGAGCAATATGATGTGTAAGTTTGTGTC
ATGTGCCATCTATAATGGCAGGGTGGCTATGTAGGCTAGCAGACACAAAA
TCGAGAGGTCACAGGTTCGATTCCTGGCATTCATGGCTCTAAATTGTGTC
CTTACACGACTTTCCACCCAGGTGTAATTAAGAATAATGGGTACCTGACT
TTGGTTGGGGAAGCAAAAAGGCCCTAGACATGGTGGATTAACAACCTACA
AAAAAGGCTATAAGACTACCTTGACCTACCTTTTTATGTTGTGATCACCT
TACTGTAATTACAGATTTGTACTACATGTATCTAAAACTGAATGTAACAA
GTATCATGCTCAAACTTGGACATTCCGATAATGTTTCTTTTTTGCGCTTG
CCCCACAGCTGTGTAAGGATAGCAACACCAGACTAGATGCTGCTTATGTC
TTTGGAACAACCTACTCACAGAGGGTAAGTCATGTAGGATGTACTATAAT
CTTTTGGTGTTGTCATCCTCTACCTTTTATCAGTATATCCTAATCAATTA
TCCAAATAAGAGACATGCACCTGTACTAATGTACATGTACCATATTGCAT
TTACAGAATGTTGAAGTTAATTTGATAGTACAGAAAGCATAAAATCTACA
TATATGTCATTGGTTGTTATTTAAGATGATGCATTGAAAATCATAGAGAA
CTGAATGCCGATCTAACCTTTTTGTAAGTCAATAGCATGTAGTGTAGTAA
AAGGTTTGTAATGTAAAGCACTAAGCCCCACTCTTTTTCCTTCCAGTGCC
AACTGAACGTCCAAGACTTCTGGAACAACACCGCCTACCAGCAGATGGCC
TTCTACGACCTGTGTATCCTTTATCAGGCTACAGAGTGTTGAGTAAGAAG
CGATGAATCAAGTCATTACGACAAATCATGTGAAGGGACAATAATACATT
GCGCAAAACTGATGGTCATTCCAATGTGTTTTGTATTTAGAAAATGTGTT
TTGTATTTAGGCCATGTTGATTTTATTATATGGATGACATCCGCGCGTGC
ATCAATTTTCATCTTCCACCATACCGTTCATCATACAAAGTAGCAGCAAA
ATGATCAGATATATGGTGTAAATTACAAATGAAATATTGGAAAACGATAC
TAATGTGGTAGAATGCCAAAACCATTTCCCGAGGCAAAAAAAGTTTTAAG
GAACAAAAAAGAAGAACCTATATTTCGGTGTACCATACTCTTTGTGTTTA
GTCATTTGTTCAACCTTCCTGACCACGTAGATTTCATTAACTTTTTTTCT
GCTAAACTTTTTTTATTCGCACGCTCGCATCAGTTTTGTGGTTCCCAGAG
GGTGTCATCCATATAATCAAATCAACATGGCCTAATGTACAACCCTAATT
ATTTAAGACCCTCTTGTGGTTGGAATTGGTATTTGAACCTTGACCTTTTC
CCCAGTTTACCGTAACCCAGATGACAGTGCCCTCCGTACCCTATACGCCA
TCCCTGTCCTCATCACTAACGTCCAATACAGCAACACAGACAACTCAGGT
ACGTATCACAGTACACTGTATGATAGGAGTTAGGCTAAGTGAATGCAAGG
AGGTTAGAAATAAAAAATCTTATTTTTAACCTCCTCGGTGAAATTTATCA
CTTGTTTAAAGGATATCACTGGTATCTTTTGTAAATTGAAAAAAAAAAGA
TTGATTGAAATCCTTTTCATATCCTTACATACATATTTTGCTTCAAAGTT
CAATAGCCGTTTCGTCCCTTTGCTACACAACTCCCTCGGCTACACAACTC
CCTTGGCTACACAACTCCCTTGGCTACACAACTCCCTTGGCTACACAACT
CCCTTGCCGGCATTAGAGACCNGCTACACAACTCCCTCGGCTACACAACT
CCCTCGGCTACACAACTCCCTTGCCGGCATATTAGAGAACCTTGCCCTCC
CCCCCCCCCCCCCCAATATATACGCCGCCGTTATAGGAAGTCTGCGAAGG
AGGCTAAGTAGTGCTACAGTTACACAATGGAACAGCTTTTCGCGATGGTT
TTAAGTTTGCGGTAAAGAGTTCACTGCGAAAACCGCAGACATAAAACCAC
CACAAACATTTATATGCATTTACAGTAGCTTGACATTTCAGCTATTATTC
TTCCTGCGGTCCTTTATATTTACATGTGTAGTACATCAATACAAAGTCAT
GTAATAGAACTACAGAACAATCACACTTAACCTTTAGCACATTGAAGCTA
TAGCCGTTTGGCACCCGGGATTCTCTATTGGTTACAGAGTTAGGCAGCAT
GGAGAAGGTTAAACTTAAGGTATTCATTGTGAAATTCTTATCGTAGCCGG
CGACCGGACCCGGTGGCAGTTAGTGCGGCGGTTCTTCCTGGTGGACCCCA
TTGGTACAAAGTTGGCCGCTGACGGAGAGCCTCAGGTGGTCAGATATGCC
AGCAGTTTTTCCATCGGGTAATATGTTCTTTTTTTTGTCGTTGAAAGATC
AGAACTTTTTGAAAGATCAGATAATGGCACTGATAATGGTGTCTGTGCAT
TGTCTGAAATTCATGAAAAAGGTGATTTAGAAAATAAAAAATTTTGGTTG
AAAATGATTAATCATAATGGATACAATAAACAAAAGTCCACAAACATTTG
ATACACATGTATACCCAGTACAAGGCTCGTAGACATAAGAAAGTCCAGAA
ATAAGATCAGTAACCGCTAAACCCTTACATTATTATAGTTACATATTGCA
CTTAAGGTAAAAGGTAAACTAAAGGTAGTTCTATAGCCTTTTTGAGGACG
TGATGCCACAATTTACCATATTGGATTTACCAAGCAATGCCAGAACAATT
GCACAATTTCTAAAGTGTAATGTGTTATAATATGTTATCTCCAGCGTACA
ACTGCGATCAGGGAACAGGGAAGGAGAGATCTACCCACCCCTGGTCAGGA
TCACATACTCTGAGGCCACCCTGGATGACTACACTGCCAATGCCAAAGTC
ACAGTAAGTCTATAGGCTGTAAAGTGTCTCTTGGAATCTCAAGTTACATT
AAGATGTCAAGCCTGCTAATGTTAGTTTTTTTGGCAATGCCTCTGAATGG
TAAAAATTCAATTTTGGGCTTGGTTGATTATTAAAAAGGTCCAGGTTTTT
TGGTGGAGGAGTTTTTTGAATGGTCCAGTTCTGTATGAATATGGGTGCCT
GGAAGAGCTCATCCAAGCATAGGGTTTCAAATTGGGAGAGATCCATTTCT
GACTGGTCTTCAATTCAAGTCTTTATTCAAATACCAACATTGCAGACATA
CAACAAACGTTAGCCTGGATGGCGTTGATATTTACAATGGTCATTACATG
GTCTTACTTTATGATAGTTAAATGTTATTTTGGAATGCTCCATTTTTGCA
TTAGAACAGTCGCTTTTTGCATGGGGAGGGAAATGGGCAATACATGTTGT
ATTTGCTCCTGCAAATGTTGCCTTTCTAGTTTTTTATTGCTTATAATTAA
GTGAGCTGGATTTACATCTTTTTGCATTTTTGTTGCCAGGCCTTTGGAAA
AAGAAAATTTTAAATTGATTGAATTTCAGGAACTGTCTTTTAATTTCTTA
GAGGATTGTTCACCATTGCAAGAACCTATAGGGCTAATGTTGCCTAGATA
TATAGGTTTGAGCCGCTCTTGAATTGCTGTCTACTTCATGATATTTTCAT
CTTATTCACCCCTACAGGTGTCCTTCAGTGTAAACTATGAGATGAGCACA
GCCACTTATGAACAGGATGTACAGGTATGTTATGAACTAGTGCAAGGCTT
GCACAACGGAATGACTAGAGGGTATCTTGAAAATCACATAAGAATTATAT
ATATGTAACATAATAGTTTCTCTAAATTTTCAGAAAGGTTCTGTAATTCT
TGTTTCCTTCATGGTAACTTTGTGTGCATGGTTTTCACGGTCACTTTTGT
GCTGCGAACTTAAGCCCCCTCCTACATGTATCTCTCTTCAACATTTAGTA
ATAATACCCTAATACTATGCCTACTACTCCTCATCCTTCCCCACAACATC
ACCTACTTTGTGTGCATTTGCCGCCATCGTGAAGTTCAGTGAAAAGTCCC
TTTTCCTTACACTGTGAAATTTTGAAACTGTGAAGATAAAGTGAATTATA
GTATCCATGGACTACTTTGCTTGGTGGAAGGCATTGCTTTAGACGATGTA
TTACCGTATAATCAAATGTTCACTGCCATTATTATGATGGGTGACATTCA
TCAATGTGATGACATGATTTGATTTTGATTTTATTAGAATTGCAACAGTG
CAATACACGTGGGACACAGGCAGCTATTGCTGGTGTCGTGACCCACACAC
CTGATATAGCCGGTTTTACACCTGGATGGAGTGGGGAAATTCGTGTAAAG
TGCCTTTTTTTCAAAGGCACAAGATCGGTTGTGTTAGGGGATTTGAACCC
GGGACCACTGGGTTCTGGGCTGAAAACCCTGCCGTTATGCCACACGACCC
CACTCTCCCCATGAAAAGTCTTTTAGTGAATTCAGCCATTTAAAACCGAT
GACTGTATTCTCACATTTCAGATTGCCATAGGTGTGCTGAGTGCGCTGGC
CATACTCTGGGCCCTCTTCATATCCACCTCCAGTTGGAGACGCAGGATTG
GAGCACAGATGGTCGACTGTACGGTAAGGACATGTGGATTTTTACGTCTC
AAATCACACAGAAAGAAATAGAATAAAGTACATGATATGTTGATGCGAAA
AAAAAGTATATAAGCAAGGAAGGCTTAGTACGTTATGTGTTTTTTCTGTG
CAAACCAAAATACATGTATATCAAGGGATAAATAAATGTCCAGGTTTTAG
ACCATCGCACACCGGGGCATGCCCCTACTCTTTTTCGAAAGGCGTGGTGG
GTACTTTAACGTGCGTGTGGTGTTGCTCTCCCCAAACACGGGACCTCCAT
TTAACGTCATATCCGAGGGACGTCCCTAACCTACTCATTTTCACCTGAGT
GAAGTGAGGATAGTCGTGTAAAGTGCCTTTCCCAAGGGCACAAGATCAGT
GACACTACTGGGTTTGAACCCGGGACCTCTGGATTCTGGGCCAAACACGT
TGCCGTTATGCCATGCAACCCCACGGTTATGATGGTCATAACACATGCAC
ACAGGCACAGTCCTACCATTTTGGAGTACATATTAATGGCTGACTTCCTT
GTCTCTGTTTTGATTCCAGTCCCTGTTGAAGTTCATCCTGTACACATTTG
GACCCCTGGGGAACGCCTTCTTCCTCGTAGCCATGGGAGCTGCACTGTCC
TGGCTACTGTTCTTCAAGGTAATAATGATAGGATACAATCTTAACCATGA
ACGGGTGAGATTCATTTTGATAAAGCTTGGCACCATGTACAGCAAAGGGC
ATACAGGGACGTTTGTAGATTTTTCTTAGATTGAAGGGATTTTGCAGCAA
CGGTCTTGTAGTGTTTCAAGAAGTGCTGCATAATACCTAAACCCCGAACC
TGATCCGGACTGGACCTAACTTTTAGGTTCAAGACTTAGTCTAAAAAAAC
CTAAACGTCTGGAAACAAGTTCGGACTTGAAAAAAGATATCTCTTGCTTA
AATCTATAGTCTCTTTTTTGTTCTAAACCATCTTAAACCTTCCTTAGATC
GTGAAATTTGCACTGGAAAAAATTTGAAATTGCTGTTTTTGTGTTTATAA
ATGTTACTGAACTTTTGTGTTTACTACTGACTGTATAGAATTTCGCATGT
ATAGTTTTCAAATTGCATGGAAAATATATGCCAGTATGCAATTTTACATG
TATTATAAACAGGAAAAAAATATTTTCAGCACACATATGCCATGGGTTCA
GGTCCGGACTTATAAGTCTGCACTTAATTGAACCTGAACCTCTGGATCTA
AATCCGGACCTGAACCTGAGCACGGGTTTAGGTGTACACACAGCACTAGT
TTAAAGTTGTGGTTGGTACACATAGTGTATTGCTGACAGAAAATCGGTAT
TGTTTGTGCTGTGATGATTTCACGTTGGAGAGATCACTATGAGGAATGTG
GACATAAAACCACTGTGAATATTATAAGATTTACAATTTTTAAGTAGGAT
TTAGGATTCTTTTTTCTTTGATGTTGAAAACGTGATCAAGAAAACAAAGT
CTTCCCCACATCTTCTATTTTTTCCCAGCTTATTTACTCTTTTGTTTTTG
AGTGTGACAAGAAGTTATGGTTGAAGATTATAACGTTTTCCTCCTTTATT
TCCACACAGAGACAAGACCAGGTGTACTTGCTGCTCCCCACACCTGCACA
GGAGGAAACCTTCATCATCTACCTGTCTGTGGCATGTGCTCTCAAGGTAA
TGAAACTTAAGCTTAACTAACCTTTAGTCTTTAAGCTTTAGTATGCTTTT
GTGCCTAAGGTAGCATAACACAGTATTTCTCCGGTTTAGAACCTGGCACT
CCAGTTTGCAAAAAAAAAAGGTTCTTTATAGAAGTAAACAAAACAAACAT
TACGATATCTTCCAACTGTAAGTAATTACAATGATTATGATTTTTTAAAT
TTTTTGAATTTTGATTTTATTAGAATTGCAACAGTGCAATACATGTGAGA
CACAGGCAGCTACACAATGTATTGCTGGTATCGTGACCCACACACATAAT
ATACATGTTTTTACACTTGGGTGGAGTGAGGAAAGTCGTGTAAAGTGCCT
TTTTCCAAAGGGCACAAGATCGGTGACGTCAGGGGATTCAAACCCGGGAC
CGCTGGGTTCTGGGCCGAAAACTCTGCCGTTACGCCACACTACCCCACAT
GATTATGTACTGTTTGCTTATCGAAAGAACCTTTTTTGCTCAAATGTCTT
AAGTTTACTTGAATGTATGTTTTTTGTCAGTTTAGACATGTTTTCCATTT
TTCTTTCTACAGTGTCTGGAGATGCTTCACTTTCTCTTCACCCAAATGAC
CGTCGACATTTTCTTCATCGACTGGGAGCGCCCGCGCGGGAAGACCGCGG
ACGTGGAAGGCGGGAACGGGAAGTCGCAGTCCGTCAGCATGTGGAGAACG
TACTTTGTGGCCAATGAATGGAATGAAATCCAGGTTTGTCTTAAGTTTAC
ATTGTTTTAAGTATGGTTTCTTTATGTTTCTTTTGTGTTTTTTAAATATC
ATCATGTATATGTAAGAAAGCATTAATGTTATGCATGCCTGGCAAAAATA
ATAAATAAAGGCAGAAATTTGCTTTAAATTTGTGATTTTTCATAGAGACC
AGGAATGATATTTTCAAAAACTTTGTCTCACATTTGCCTGTGCAGATACT
GTAAATGCATTTAAGTTCGCGTGGCTTTGATTTTGCCTTAAGGGGAAGAT
GGAGTGTTCGCGGTGGCTTTAAGGTCACAGCAGCGCTATAGTAAAATACT
GCTACAGTACTGGACAAAACTTTTGCAGCGGTTTTAAGTTCACGGTGAAA
CGGTCGCCACGAAAACTGTGAACATAAAACCACCGCAAACATTTCTACAT
TGACAGTACTCTGCAAAGATTTTGCCGTTTCAATGGATAGGTTGATAGGT
TTGATCTCTGGCCTTCAATTTGAAATGTTCTACCGAACTGACTGCCTTTT
TTTACTGTTTTTCAGACCACCAGGAAAAGTAACACCGTCTTCCAGTTGTT
TACTGTGCTGCTCTTCATGAATGTAAGCTACGTAAAACTATAGTCACATT
TCCTAACCAATGCCCATCTGGGTACTTAACGGACTGATTTTCATATTGGT
ACATGTAGTTCCTTAAATTGTACCCATCAGACCATAAGACTTGCTTTCTT
ATTTAGACTCCTCTTGTCCCCCTTAGTTTATCTTAAAATAACTAAATTAA
GATCATTTTGATACTTATTTGTTCCATGCATTCATTGTACTTTGAAAAAG
TGAAAAAGTACCTCGGTTTACCATGTTTACAATATTTGTATTATACATCG
GTCCTGTGTATGAGGGAGCTTCAGGCATAAGCCTCTAGTGTCAAACCTCT
GCGCATAAAAGAACCCAACACACTTGAAGAGTAGGGGTGACCCGGTGTGC
TTGGCCAAAAACGCGAGCCGTAGTGAAGCCACATTGCACAACCTCTAGGT
ACTTGAAAAAGCATCATGATTCACCTCAATTGAGGATGACTGCTTTACCT
TTACCTTATACATCATGTAATACTATGCATAATTGTAAGAGCCTGCTGGG
CGACTAATGCAGTGGCTACCTGAGGGAAAACGAAGGGTTGGAAGACCTCA
CACAACTTTAATGAGTTTGATCGAAAGAGACACTGGACTCTCAGGTTCTG
AGTTATTTTCCACCATGAAGGACAAATTGTACTGGAAGAACTTTATTGAC
TGTATCCCACCGGAGTAATCCGGACGAACGATGATGATGATGATGATTGT
AACAGTAATATGATATTTTTAACCAGGTGATTGGGTTTGAAAACCTGACC
ACGACAGATCCGCGTGCATACCTGGTGATTGACAGCGAGCAGTACGTGGG
AGGGTACAGCAAACTGCTTCGCTTCGGCATGATGTCCACCGTCTACCTGG
TGGTGGCTATCGCACAGGTAAGGACACTAACACCACAGTCTTTGATGTCT
CAGTAGTATTACATAACCTCCTTTGCAGACTTCCTAGAATGGTGGCATAT
ATATTTGGGGGAGGGGGGTGTTGCGATTTCTTACACGGGTCAAGGTTTTC
TAATGCCGGCAAGGGAGTTTTGCTGCCGAGAGAGTTATGTCGCCGAGGGA
CGACCGCCTTTCTATCTGGATAGAAAGGCGGCGAAACTCCGTTGCCGGCA
TTAGAAAACCTTCGCCCATGTAAGAAATCGCATCACCCCCCCTCCCCAAA
ATATATACGCCGCCGTTCTAGGAAGTCTGCAAAGGAGGCTAAGTATTACA
GGTAAGTCAGAGACTAGAAAGACTTATGTGTAAAAGTGGGGATGTGAGAA
AGTCGGAACGAAACTGCACTATAGTACAAGTACGGATAAAAATGCCACGT
TCTTTAATGCGTTAATAGTTTTAGCCCAGAATTATATGTGAAAGTGGGGA
CAAAAATGCATACTATTAGACTGAATATCAACCAGTCCTGCTTTTCAAAA
TCTTGCTCAGTGTATCTGACGAAAATTAGTGGATACTACTTGAAACGTCT
GACCGTTTCCATAATCATATCCACTTGCTTGAAAGACTGCTATTTGGCGT
ATTAGACTGAATGATAAAAAGAACGTCGAAATGAAAGTAGAATCAGAAGG
GAAAGTCTGTACCTTTGTGCTGACAGTTTCAGGGAGTAAAATATGATTGC
AGCCCTCTTTTCATATTGCCCACTTGCCAAAATGTTCTCATAAATGTCAA
GGAAACAAGGAAATACAGTGATGTAGCTTTAATGAATTTTTATTTCTTCC
ACAGTGGCTTTTCTTCACCTTCTTCTACGAGCGTTTTGTTGAGGACAAGT
TGGGGCAGTTTGTGGACCTCTGCTCCATGGCAAATGTAAGTGGATCTTAT
AAGTTCTTATTAAACCTTTACACACAGCAATTAATCAGCTCTCTGGAAGA
TTTTGGGACTAGATCTGTCCCCTTGTCAACCAGGGCCCGAAATTCTGGGT
ACATGTGCACCCAAACTTGGAGCTGTGCACCTAATTTTGGAATGTGGGTG
CACTGGCGCACCTACTAGATATTTTTGAAGGCTAAGGTACTATTGTACAC
TTAGAATATTCTTCAATGATAAGTATCTGACAAAGCAATATAAGTTGTGC
TGTAATTTATTTGATGTATTACTTGTATAAAATTTTGAAGTTAGCTATAG
AATTACAGATTAACGTTCTTAAGAGAGGCAGCAGGGTTAAACTTTGTAAT
TACGTTTGCTCACATTCTATTTTATTTTAGTTGTGCACCCAAAATTCTTT
CTGTGCACCTACATATTTTGGTTGTGTTCACCAGTGCATTTATTCCCCAA
AACAAATTTCAAGCCCTGCTTATTCTTAGTTTGGCCTATGGACATCTGAG
AAAAATGTGCTAGAGTTAATATAATCATGAGGCAGGAATGGTAGTCATTT
ATAATATTGATCTAGCTTAACAAGCCTGGATTTGAATTCTCTGCATTCCT
TCATATCCAGAGAATGAGAGAATACATGTACATTTAAGAGAAGTCAAGGT
GATAAAAATTGCCTTACTCAGAAATGATGCGCACTATAGTTGTTTGTCAT
GTTAGACTTTCCAGTGTAAAAGTGTACTTGTACGGATGTTGTTAACCTCC
GTGATTATTTCTATGATCAGGTGAGTGTGTTCATCATGGCGAACACCCAC
TTTGGGTACTACATCCACGGGCGCTCCGTCCACGGTCAGGCCGACACCGG
GATGCAGGAGATGTACGAGATGATGGTCAGGGAAGAGGTGAGAATGGGCT
TGAATGTCTTCGCCTATATCTTTTATTTTCTTATCTTTTTTTAATGGGTG
TGGCAGACAAATTAGCCAGGCTTTACATTTAGTAGATTCATATTCCAAGA
CTAGCTAATACGAGTACATGTATGCACCCACTGTATGCTAATATTGGCAG
TAGGAATTTTCAAGGTTTTAAAAGAAAAGACCATTTAAGTTACAAAAGAA
AAACAGCCAATATTCTTCTTATTACAGTAGTTTACACACTGTCAGAAAGA
AATTGTAGAATGTATCTTGATCCAGATTTAGCTTACAAAAACTATTCTGG
TTGCACATAAAAAATGGTTGCGATTTACAGCATAGGGAAGTTGATGTACA
AGGTAACTTTTCCAGCTCTTCTTGACAAGTGCAATGAACAGTAAACCAAT
GCTTACAGCTTCACAACCTAAGGGCTGTAACCTTTTACAGTATAGCAAAG
TTAGGGGAGCAAAAATCCAACCCTCTAGTCCAGAAGCAAGGTTTCTAAGC
ATCCCCAGTTCTATACCAGTCCTCTAATACTTTAAGGAATTTTAGCTACG
CAAAAAATTGAAAATCCTATACTACGCTTAATAAACCCCAAAGTCAAGTT
CTTACTTTTTTCACATAAGTCCGTCATAGTTCTGGGATCTTCCACCATTT
GCAACTTATGCCGTGCTGAAGCCTTCTCACCTGATGATTGAATTATATGA
CGTCAGTTTTGTAAATTTCCCAAAGAGAATAAATAGTACCAAACGAAGTG
CTTTTCAAACTGGCTTTCCTCAGAGAGGATGGATTACGAGGAACTTTCAG
AATTCAAAGCCTACTATAACTGGTCAATTCCCTCGAATTAGAAGGAAAGT
TCCTCGACCTCCATCCTCACGAAAGCCAGTTTTGTTTATTTATTTATTAT
TCATTTCAGCTTTATTACATCATGGTGTAAACGGACAGAGGAAAAGAACT
ATTCATTCTGTTGGGGAAATTTAGAACACTGATGTCATATAGTTCATATA
AGTAAGAACTTGACTTTGGGGTATGTTAAGCATAGTATAATAGGCTTTCC
AATTTTTTGTGTACAAATGTAGCTTTCCTTTAAAAGATATACTGACTGAT
TGTGTCTACCCTCCCCTCAGGACAACAGATGTGGTCAGCGTGGGCTGCTC
CCCAACACAGACAACCAGACCTTTGAGATGTCTCTCCCACACAAGCTCAG
GGACCAGTACGACAGTATTATCAAGCCTCTGCAGGTGCTGCAAATCCATT
TAATATTGCGGTTGGTTAGGGGTGGATACCGGTTCACTGGACCTGATTCT
GACCTTTATAACATCCAAGAACCGAGTCCAAAAAACCTGAAAGCCAAAAA
CCTGAGTCCAAAAAAAACCTGAACAAAGTACAATATATTTTTCTATTTTG
TTTGATAAAAAATGTTTTGAGTCTCCCTTCTGACGAAAAAGGCACTTAAG
ATAAGTGCAACATTCAAATATTAAACACCGGTTTATCTTTAAAGTCTTCT
CACCAAGAAACGTTTTTAGTCGTGCGTGTCAATATTAATTCTAGTCTATG
CTTAATATTGGTCTAATAAAACAAAACATCAACTGGACAGGATCAGGTCC
AGGTTCAGGTCCAAGACCTGAACCTAAATCTCTGGACCTAAACTTGGACT
TGGACCTTATTAAGCCAAACCGGTATCCACTCCTACGGTTGGTAATCTCA
GCGGTTTGGAGCAAAGAGAGAGGTTCACAGCATTCAATTTTACCGGTACG
AACAAGGTTCTAGCTGGCCTCAGCACAGTGATCAAAATAATTGCAATGAT
GAATTTCTAGCGGTTGAATAGTTGCCACTGTCGCTAAAATTAAGTTACCG
CTAACAAATCAAGAATTATAGTATACAGTACAATATACATTGTGTATTAG
TTTTTCTTTTAGCAAATAAAACAGTTTTGTACCATCAGATACTGTTAAGA
CTATCATGGTGTGCTGTCTCAGAAGCTGGATAACTTGATGAGTTGATTAA
CTCTAGCTCGACTTTGGGCTATCTTTATCAGATGATATTCCTTGTCCATA
TTTCTTGGAGGTGGTGAATTTTTGTGTGTTGTAAAATGCTTGTAAATGAA
TTTTTATTACACAATGTTAACCCGTATCACTTATTCTCCCAATAGCAACA
AGCTGCAGCAGCGAGGGGTCAAAACAGACCAAGAGGTAATATGAACTATG
TAAAGTCTTCTTTTCCCCTTCAGCCGAATGTTCTTAACTTGCCTGACAGC
TGTCTATCATGGTAACTGACACAGTTTCAATTTGACAAATTCTTCACCCT
TCTCCGCGTAATGGATGGACTGGAAAAGATTTTAAAGGGAGGTTGGTCTT
AATAGTATCTGAAGACATCATAAGATTCCCTGGGACCAGAGGTTTTGTCC
ATTCTGTCCAAATGAGATTGGACATAAACGTCACTTTATCACGATATGAT
GAAAAACGCTTGAAGCTGTTCAACCTTCTTTCCGCTTGCTCAACAGAATT
TGATACATTCTATCCTATAGATAGATTCAAGTACACTGTAGAAGGAGATA
ACGGTTACTGTGTACAAATAGGTAAATACATCAAAGAATGTTTAGAGCTT
TAAAATAGTAGTATAAGTGATACACCCATATAAATCTGTCCGGATGTGCA
GCTTGTACTCTTCAGTACAACCCTGGTGTGTTAAGCCTTCATGCAGTTTA
CCTGGTATGCAATACAAACAAACAAATACCAAACTCTACATGCTAATTCA
TTCACATATTTGTATGCAGGTTACTACATTTTGTATCCACTTGTTTGTTT
GTATTTACCAAAGTCGCTGTACTTTTGTTTCGTCAATGAAGATTTGTTTG
TATTTTCAGCTGGAGGAGGAAACACCACTAGTGCAGGTGTGGACATCAAC
CAACAGGTGGACGCTTACAAGAAACTCAACAAGTACCTGGCTGCCTTCAT
CGACCATGTAAGACTACCCTTTACCCTTTTCCTATCTAGTTACAGGTTTG
CGTAGCAAAACCTTTG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000127:815394..833059+

>Blg02943.3 ID=Blg02943.3|Name=Blg02943.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1854bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000127:815394..833059+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCCATGGCTGTATTATGATCACGTGCTGAACGACGTATCTGAGATACT
GTCGGACACGGAAATCTCCACCAAGTTCACGTTCAGTGCTGCGTCCCAGT
CCTCCAAGTTGGACCTTGTAGTGGCAGCCTACAGTCTGAACGGGGAGTTT
CTAGGAATCCAGGATGTCACGGGTGGGCTGCTACAGCTGTGTAAGGATAG
CAACACCAGACTAGATGCTGCTTATGTCTTTGGAACAACCTACTCACAGA
GGTGCCAACTGAACGTCCAAGACTTCTGGAACAACACCGCCTACCAGCAG
ATGGCCTTCTACGACCTGTTTTACCGTAACCCAGATGACAGTGCCCTCCG
TACCCTATACGCCATCCCTGTCCTCATCACTAACGTCCAATACAGCAACA
CAGACAACTCAGCCGGCGACCGGACCCGGTGGCAGTTAGTGCGGCGGTTC
TTCCTGGTGGACCCCATTGGTACAAAGTTGGCCGCTGACGGAGAGCCTCA
GGTGGTCAGATATGCCAGCAGTTTTTCCATCGGCGTACAACTGCGATCAG
GGAACAGGGAAGGAGAGATCTACCCACCCCTGGTCAGGATCACATACTCT
GAGGCCACCCTGGATGACTACACTGCCAATGCCAAAGTCACAGTGTCCTT
CAGTGTAAACTATGAGATGAGCACAGCCACTTATGAACAGGATGTACAGA
TTGCCATAGGTGTGCTGAGTGCGCTGGCCATACTCTGGGCCCTCTTCATA
TCCACCTCCAGTTGGAGACGCAGGATTGGAGCACAGATGGTCGACTGTAC
GTCCCTGTTGAAGTTCATCCTGTACACATTTGGACCCCTGGGGAACGCCT
TCTTCCTCGTAGCCATGGGAGCTGCACTGTCCTGGCTACTGTTCTTCAAG
AGACAAGACCAGGTGTACTTGCTGCTCCCCACACCTGCACAGGAGGAAAC
CTTCATCATCTACCTGTCTGTGGCATGTGCTCTCAAGTGTCTGGAGATGC
TTCACTTTCTCTTCACCCAAATGACCGTCGACATTTTCTTCATCGACTGG
GAGCGCCCGCGCGGGAAGACCGCGGACGTGGAAGGCGGGAACGGGAAGTC
GCAGTCCGTCAGCATGTGGAGAACGTACTTTGTGGCCAATGAATGGAATG
AAATCCAGACCACCAGGAAAAGTAACACCGTCTTCCAGTTGTTTACTGTG
CTGCTCTTCATGAATGTGATTGGGTTTGAAAACCTGACCACGACAGATCC
GCGTGCATACCTGGTGATTGACAGCGAGCAGTACGTGGGAGGGTACAGCA
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GCACAGTGGCTTTTCTTCACCTTCTTCTACGAGCGTTTTGTTGAGGACAA
GTTGGGGCAGTTTGTGGACCTCTGCTCCATGGCAAATGTGAGTGTGTTCA
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GGTCAGGCCGACACCGGGATGCAGGAGATGTACGAGATGATGGTCAGGGA
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AGACCTTTGAGATGTCTCTCCCACACAAGCTCAGGGACCAGTACGACAGT
ATTATCAAGCCTCTGCAGCAACAAGCTGCAGCAGCGAGGGGTCAAAACAG
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AACAGGTGGACGCTTACAAGAAACTCAACAAGTACCTGGCTGCCTTCATC
GACCATGTAAGACTACCCTTTACCCTTTTCCTATCTAGTTACAGGTTTGC
GTAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:816360..816468Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:816360..816468Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:819121..819207Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:819121..819207Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:820052..820117Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:820052..820117Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:820440..820506Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:820440..820506Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:821099..821191Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:821099..821191Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:821990..822110Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:821990..822110Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:822538..822646Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:822538..822646Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:823361..823417Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:823361..823417Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:824215..824316Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:824215..824316Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:824863..824961Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:824863..824961Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:825903..825989Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:825903..825989Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:826556..826726Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:826556..826726Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:827259..827315Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:827259..827315Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:828070..828210Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:828070..828210Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:829048..829128Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:829048..829128Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:829914..830030Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:829914..830030Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:831164..831277Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:831164..831277Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:832189..832228Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:832189..832228Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:832903..833059Blg02943.3-exon-Sc0000127-1570713199:832903..833059Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02943.3Blg02943.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000127genomeSc0000127:815394..833059 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg02943