Blg03085.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03085.2
Unique NameBlg03085.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000111:960636..980167+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03085.2 ID=Blg03085.2|Name=Blg03085.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19532bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000111:960636..980167+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CTCAGGGGCGGAGCCATTGGTATAGTGCTGGGGTAAGAAAAGGAGGAATT CTAACAATTCCGCGCACGCATTCCCCAGGGAATTGTTCTTTGACAATACC TAGGGAGGAACTCTAGTATAATGCGCCGGGTGCAGAAAAGGCGTAAGTTT ATACACACTATTACAGCATTGTCCTGACGTTTTCACAAGTTTTTGCTACA ATATAAAAATTTGGTTAGGCAGGGTATGTTGTGATGTAGATCAATATGTC ACAGCTGTTTGTCAATGTTTTTGACTTCTTACAATAAAATAAAGGATTTC ATGTTTGGACACATAGCTGATATAGGTAGTTTTTTATAGATGTATGTGCT CTCTGAAGACTAGTTAACACATAAAGGTAAGACGCAGAGACAAGCTTTCT TGAATAATGGGCATGGTAGGTGTTTTGTGTGAGACTTTTAATTTATTTTT TGTTTCATTGGAGAGTAACGTTACCTTACAACGCTTTTTTACACTCTCTT GATATTGTCTTAATTCGTAGATTTTTCTTTCTTTCACAGGCAACCGCACA ACTTCGCTGGCATTTCTAAAGCTTTAAAAAGTGTGAGCAGCCTTTATCAC TGATGTATTGATGAGTGTGTGTGCATGTCTCTGTATGTGCGTGCGTGCAC GTGTTTGTGCAAGGAGGTTATAACGTTATATATATAACCCCCTTGGTTTG TGTGTGTGTTTGTGTATGTGCCAGATATGTCAACTGATGGTTTCAGTCAT AATTAGCTTCTGACCTCTGACCTCAACCAATCCCTTTCTTCAATTCTACC TGCTTTTACCAGTATGTAAATATGTAATTATGTGTGTACGTATGTATGTA TTTTGTGATGTACATGTAGTGTTTATGAGCCCTGGAAGATTAGCCCCCTA GAGGGGCTAAAGGGTATCTCAATAAACTCAATAAACTCACTCATGCGTTT GTGTGTGTGCGTGTGTGTTTATGCTTCTGTGTTGACATGTGTTTCCTTTC ACTATCCCTGCTTCTGTGTATCTTTGTATCTTTGTGTGTTTGCTTGCTTT TGTGCTTACAATGGTTGTCTGTGTTTTATTTGATTGTTTGTTTGTGTAGG CAGGTGTAAATGATGATTGTGATTATTCAGCCTTTTGTTGTGTAGAGTTA CTAACTATGATTAATTTTTCCCACACACGATCATGTTTTTGTTCTAAAGA TTTTCAGGAAGTCGAGATATAGTTTACAAGTTTACGTGCATTTCACGACA TGTATTTCGTTTTTGTTATACCGTGTGTTGGTCAAGTTGATTAAGTTGAA AACATTTCAATTCTCTATATTAAGACATTGAGATAGCATTGGAGGAGACA ACACTAACATTGGCTTTAGGCACTAGATTCTTTTAATAAAGTTTGGCTTC ACTTGAACGGTAATGGCTCGTGTGTACTTAATTTGAACAGGAATGATAAG TCTGTAATGTAGATACATTATGTAGAATATGG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000111:960636..980167+

>Blg03085.2 ID=Blg03085.2|Name=Blg03085.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1248bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000111:960636..980167+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGCAACAAGGTCAGTAGTCGACACAGCGTCCAGGCGCCGTCCCGTAC
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AACAAGGCGTGACAGAGCGTGACTTTGACGTCATAGGCATCATTGCCAGA
GGAGCATTTGGGGAGGTGCTGAAAGTTGAAAAGCGTGACTCTAAAAAAGT
GTACGCCATGAAACTGATGCCAAAGTCGGAGGTCATGCGGTACAACGCTG
TCCAACAGGTCAAAGACGAGGCCAGCATCCAGACGCTTCTCGGACACCAC
CCGTTTGTCGTACAAGTGTACTACTGTTGGCAGACGCGGAAGGACCTCTT
CCTGGTGGCGGACTACATCCCTCACGGCGACCTCTTCACGATCTGGACCC
TGGAGGCTCCGATGCAGGAACCCGTGGTTCAGATCTTTGCGGCAGAGATC
TCGTTGGGCCTCGACTTCCTCCACAGCGCGGGGGTGATCTACCGCGACCT
GAAGATGGAGAACATCCTGCTGGACAACAAGCGGCACGTGCGCCTGGGGG
ACTTCGGGCTGTCCAAGTGGCTGACTCTGGGCAGTTTCACCAGGACCATA
TGCGGCACCATGCAGTATATGGCTCCGGAGATACTGAAGGGCCAGCCTTA
CACACATGCATGTGACTGGTACTCCTTCGGAGTTCTCATCTATACCCTGT
TGTCAGGTAGATATCCCATCGAGGCAGCTGCTGACCACACGGCCATGGCT
GAGCGTGTGGCTGGATTCTACTTCAACCCTGTCCGAGAGCTGTCCTCCCC
CGCCAACTGTCTGGTCTCCAAACTCATGCAGAAGGACCCCAAACAGAGAC
TTCAAACCCTGGAGGTTCTCGAGGAGGAACTCTTCTTCCAGGAGTTGTCG
TTTGAAGACGTCTTGGCGAGGAGGTACGCGCCGAATCTCATTGACAAGAA
CGAGGCGGAAGATTCCCCCGCCATGACCAGGATAGCAGCCGAAAAGAAAA
GGCACTCGAAAAAGTATCAAATGGACGACCTTATGTTCCATGACTTTGAT
TGGTCAGATGTGAATGAGCTCATTGATGGGTTAGCATTTTCAAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03085.2Blg03085.2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:960636..960683Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:960636..960683Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:970172..970356Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:970172..970356Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:971604..971715Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:971604..971715Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:972186..972233Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:972186..972233Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:972524..972648Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:972524..972648Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:973409..973849Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:973409..973849Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:974254..974483Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:974254..974483Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:974788..974972Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:974788..974972Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:975709..980167Blg03085.2-exon-Sc0000111-1570713199:975709..980167Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000111genomeSc0000111:960636..980167 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03085