Blg03199.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03199.0
Unique NameBlg03199.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000020:3080444..3099269-

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03199.0 ID=Blg03199.0|Name=Blg03199.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=18826bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:3080444..3099269- (Branchiostoma lanceolatum)
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GCGGCGGCGGGAGAGCTCCACGAGGACAGCGGGCTGGGGAAACTGGCGGA GCTGGCGGAGATAGACGTCGACAAGGAGGGAGTCAAGGGCGCCAGGGACT TCTTCTCCGCTAAGGTACTGTCTCGGGAAATTCTAATATGATGAACCTGT ATTAATTTATTGCACAATCTGGATGATGGAAATTACAATAACATGTCGTA CAATAGGGTAAACGTTTGCCTAACTAATTGCTACGTTTATGAGCTGAAAG TGGTGAAAATAACTAACTGATTTAGCATGTGGCAATGAAGACCTGTTTCT CCCTAACAGTGTAACATATACGTTGATGAAGGTTAGTGTAACATACATAT GTTGTTGGACAGACAGGGCAGTTTGCTAGATTATCTGAAACTTCAGATGT TTTTCCTTGAAAAAGACTGTTAAGACGACATACTGTAATTCTTGAATTTT TAGGCATTGACGGCAAAGACATTTACAGTACTATACCGAAACCTTCTCCC TGCTGCCTAACTCTAACCAATATGGAATTGCCAAACAGCTACTTCAGTGT GCAAAAAGATTAACGTATCTGACAATGGCATAAGATGTATTCTCACAACA AAGTTTCTAACAGAATCCTAACTCTCCATCCTGCACAGATCGAGGAACAG TCGAAGGGTGCGAAGTTCGAGGCGGAGATCAAGGCTGAGATGGAGGAGAA GAAGCGGGAGGCGGAGGAGCGCAAGATGAGGAGGCAGGCCTTCAAGGAGA AACAGGCTGCATTCATGAGTGCCTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000020:3080444..3099269-

>Blg03199.0 ID=Blg03199.0|Name=Blg03199.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=453bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:3080444..3099269- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGTGTCTCAAAGCCTTCTGTACACTCCACAGGTATGACGTTGACAAGGA
CAATGTGATTGACATCAACGAGTTGAAGCTGATGATGGAGAAGCTGGGGG
CTCCTCAGACCCACCTGGGCCTCAAGACGATGATCAAGGAAGTGGACGAG
GACAACGACGGTGCCATCAGTCTGAGAGAGTTCCTCCTGATCTTCAGAAA
GGCGGCGGCGGGAGAGCTCCACGAGGACAGCGGGCTGGGGAAACTGGCGG
AGCTGGCGGAGATAGACGTCGACAAGGAGGGAGTCAAGGGCGCCAGGGAC
TTCTTCTCCGCTAAGATCGAGGAACAGTCGAAGGGTGCGAAGTTCGAGGC
GGAGATCAAGGCTGAGATGGAGGAGAAGAAGCGGGAGGCGGAGGAGCGCA
AGATGAGGAGGCAGGCCTTCAAGGAGAAACAGGCTGCATTCATGAGTGCC
TAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03199.0Blg03199.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03199.0-exon-Sc0000020-1570713199:3099090..3099269Blg03199.0-exon-Sc0000020-1570713199:3099090..3099269Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03199.0-exon-Sc0000020-1570713199:3081106..3081240Blg03199.0-exon-Sc0000020-1570713199:3081106..3081240Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03199.0-exon-Sc0000020-1570713199:3080444..3080581Blg03199.0-exon-Sc0000020-1570713199:3080444..3080581Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000020genomeSc0000020:3080444..3099269 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03199