Blg03531.5 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03531.5
Unique NameBlg03531.5
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000216:242199..304791+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg03531.5 ID=Blg03531.5|Name=Blg03531.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=62593bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000216:242199..304791+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCC ATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCAGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCA GGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTAC AAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCC TATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTA AATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCC CACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCG GCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTT TGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTT GTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGG CCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGT TAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGT CCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCC CAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGT ACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTT CCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTG TAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGT CCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGT CGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATG 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TGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTATGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGC CTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTT AGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTC CATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCC AGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTA CAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTC CTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGT AAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTC CCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTC GGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGT TTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTT TGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGG GCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTG TTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATG TCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACC CCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGG TACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGTGTAAATGTCCATGTTTGTT TCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTTGTGT GTAAATGTCCATGTTTGTTTCCTGTGTTAGGTCGGCGGTACAAGGGCCTG 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AAGATTTTGAAACTTTGAAATCTTATCCAGTAGCTTGAGTAACTATTTTT GGCATATCTTATTACCTGGATGTCTAACCTTCATCAACATAACAAGCACT ACTAGTACTCAGATATCATTGTGGACCAAACAGAATTGTCTCCAGGACCT GTGTCTTTGTCTTGGGACAAAAATTTGCTTGGTGTGACGAAATTTTTTGT TACCATTTCCGTCCCGAAATCTGAACTTAATGACATGAAATTGATGAAAA TGTATCCTTGTTAGCTTAAAACAACATTTTTTTTAGCAAGGAAAATTCAA CACAAAATTTGGCTCCCAAACAATGAGTGGGACAGAAAAAACTAGCTGGA GACAGCCCTGGGACCAAATCTTTGTCACTCACTCAAACTGCACAGTAGTG GCTAAAATTTTGTTGAGCAGTAGAGAACATATTCGCTGAGAAACTTGTAC CCTGTAGCTTTGATGCTACCATTGTTTTATAATTCACAATGACTGCTTAA CTGACCAATTGAAAAATTGGTGTGTTGAAGCTAGAGTCTGATGTTCATGT TCATATAGACACCGTTCCAAATGTACAGTTTATTTTCTGTCAGATTGACA TGTAGTAATTGCTGCCTGTTGTATCAACTTAAAGTGTTTTTAGTTTAGTA GATTACCCTTGTGAGGATGAGAACCATGCAAGCACAGAGTTTCACACAAA ATAAATCAATTTGATTATGCAATTGTCAGAACCAGGATATCTACGTTCCC ACAGTTAATAAACATTTTTCTGCTTCTACAGAAACGTGTGTTGGTGTATC CCAACGGGGAGTCAGCAGACAAGGCAGTGTACGCCTGGGGAGCCAACTTA CCGCAGGTAGGGAACACAGGAGGGGAAATCATGGGAAGGATGGAAAAATG GAAAGATAATCAGTCATGTTAGGAAAAAAGGGAATTAGAAAGTGATCTTG 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ATAATGATATATCTAAGCAAGGGTGTCAAAGTATATAATTTTATAATTTT GTACCTATGAGGGACGCTTCGGTAGTTTATACTCTTAGACTAGAGACATT CTAACCAAACTATATAGATCAGATGTAAACTTAATCTCTTACTCAAAATT TGAGTCTTTAACACAAGTTTTGAGTCATTGACATGTATACAGTCACCATT TTAGTCTATGACACAACATTTGAGTTTTTACCAACTGGCTATATCCTCTA ACCAGTCCCAAGTTGGATGTATACAAGTATTTTTTCCAAGATGTAACTTT TCTGAGGCTGCCATGGCACTGAAACATTAATTTTTAAAAATCGTTACCTC CCTCTCCCCAGCGTCCCGCCGGAAGGTTGAGGTGAAGGCGGCGTGGTCGC GAGCGAGGAAACAGGAAGGGATGGAGGCAACGGACGTCCTGATGGTCACG CCGCGCACCAACCCCAAAGTAGAGGTATGACTTTCTCAGGCAAATAATGA TGATAATGTGTGAAATGTACATTATAGAGGCAATACTAAAATGTAGTGGC TGTCTTACTTACTTCTTTCTTGTTTGTCAGTTGTTGAGAATCAATCTTAC TTAATTTGAAAGTACGTGATCATTGAATGTACTAAGTGTTAATACGTTTT GGTTTGTTGAAATTCTGTTGTTGTTTTTACCCGGACTGGGATCACAAAGG AAATCCTGTTTCCCTCTGTCCGTTTACACCATGATGTAATAAAGCTGAAA CAAATAAATAAACCATCTAAATCTAAGCCTTGGTTATTAGCAAATGGTTG GGAATTAACCCCAATATACAAAGTAGAGGTAGCGCTTCCTGGCAGATGAA TAATGTGTGAATTGTACATCACGTAAAATATGTTTACTGTACATTATTTG ATATGCCAATACATGTAGATAATCTTACCTTCTTCTTCATCTCCCGTTGT 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GGCCCTACCCGCTCCAGGAGAGGGGGGAAGTGGAAGCAAAAAGAGACCCC CACTCCCTCCTTCTGCTAGCAAGAGGAGGTAAAGCTGGACACCCCCAAAC TGCAGTGGTACTGCCCTGATTTCACTCAGTTTCGGATCATTCCAAGTCTA AATGGGGGTATAATAGGAGACATTGAAACATATTGTTAGACTGAATGTAC GTGTATATCATAGATTTCTCTTGCCTTTCCAATTTAGAGTTTGCTATTTC GTTACAATACCAACTGTATAGGGCTTTAGATAGGCAACCTTCTATACATG TCCTTGTAAGTTGTAGCCACAGTCAATCGTGTACATACTGTCTGATAGCT TTTATTTGTTGTACAGAGGTAAATGATAGGCTATTTTTGAGGGACATGTA CATGTATATTCCTAGTAAGTGTGTTGTACCGAAAATGAGGCATGGTAATA TATTAATTACAAGTTAGGCAAGCAGAATGTTATCAAAAGCTGTACAGTAA TGTTATATTTCAAAACTTGAAAGTTTGTTATCAATAAAAACATTACAGTT ACAGTCTGTACACTTGTAAGGCTCAGTCCCTGTCTTGTATACAAAACATA TCAAAGGAACATGACATCTTATTACATACTAATAATATGGCATGTCAGGC AATCTTGTTAATGGAAGGGTTTAACGGACCACTATGATAGGGTAAAGCCT TCCATTGTCATATTGGAATGAGAGCAGACATACATGAAAGCAGAACATTT GTGCTATGTCATGGTTTTACCCCAATGATCCCCAAAAATAGACTGATACA TTGTTAGCATGATGTACATTTTTTAAAGGTCTTGGATGTACAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000216:242199..304791+

>Blg03531.5 ID=Blg03531.5|Name=Blg03531.5|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=6297bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000216:242199..304791+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TGATAAGTGACTTGAGCGGAACCGTCACGAAGTACAAGGAGCAGCTGAAG
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CTGATCTACTTCAACATGAGGGATGCTGAGAGGGCGGCAAAGGGGGACAG
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TAGCCAATCCGGTGTCCAATCCCGGCCCCGCCCTCAGCAGTGTCGCTAAG
AAGCTGTACGACCGGGACGGCCGGGAGATCACCAACATCTACGGCCTCCA
GACTGAACAGGAGGTCTGGCTGTCATTCGGGGAGGAATTCAAGCCACCCA
GTGTGTCTGTGCTACAAGTGTGTTTTGACAAAGCCCAGGGAGTGACGTTA
CCAGACGGCAGGACTGTCGCCTACAGAGAGCCTGTGGGTGGGGAGGACTC
GGTGGAGGGGATAGACAGACATAGCCACTGGGAGGCTACTGTTGGCTTCC
CTCTGGAGTATGAGTACGCAGAACTGCGTGATGACAGGGACATAGAGGAT
GAACAGGAGAGGATCAGGAACAAGGCAGCTACAGACAGGGTGGTCACACA
TGTCAAGTCAGCAGGGCTGGACACCAGGGGAAGCTTTCTACAGAATAAGG
AGGACACTAACACAGTGCTGTACCCAGAGCTAAGCGTCCAGACCAAGAAG
AAGAAAGGATGGCCGCCTGGTTGTCAAACCTGGGTTATCAACCAGAGTGG
ACTGATCTACAGCCGTGCCATGCCCCAGCTGGCGCTGACCGTTAACGACA
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CTTCAGTCCTGATGGTTACATCTTCTCTGTGGCGTATCCTGACCTCGTCC
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GGACAGCGACTACCACCCCAACCTCGTGGACCTGGACGGAGAGGAGGTGC
TGCACACACGGGTCGACCCACTCGCAGGGCTGGGGGAGGGGGACCGGTTC
TCCGGACAGAAGAGTATCGTGGACGTGGTGGAGAAAGTGCCCGCGAAACA
TCCCTGTGCCAAATTTCAGAGGTGGGCCCTGAAGCAGGAGGACCTTGCTA
ACATGGGACAGTGGAAGAAGTCTAAGATCTCCAACCCTGAGTGGAACAAG
CTGGCGTACTCCTGGCCTGTCACTGAGGAGGGGGTCTGGAACAAGGAGTT
TAAGTGGCCCCTGGAGGGTTTTCTCATTCCAATGGCTCCTCCTCTAAGGA
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GTGAGGAATGGAGACAAGAATCCCAAAAACTCAGTAGTGATTGTGGGACC
AGACCTGACCAATATGATGCGTGACATGAACAAGACGGCGCTAAACGGGA
AGAAAGCGCTGCACCACAAGCGGCGCTCCTCTACCACCCTTCACGTGGAC
GACCTGTCTGAGGACATGGCCGACGCCCTGCACTGTGACAACATGCCCAG
GTTCAGGGAGCTAGAGATGCAGCTGTTCTTAGAGAGATGTACAACACTGA
TGGACCTGCCCTTTGCGGCGCGGCGGCTGTTTGGCGACAACGGGAAGGAA
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GTGACACTCAGGAACCCAGAAGAACTAGTGATGATGGTGTCGGGCCCTCT
CCAGCCTGGCTCCTCGGTCCTGGTGGAGAAGTGCACGCTCAGCGCGGAGC
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GGGGAGCATGGGGAGGAGAAACCCCACACTCTGGAGGAGATCCTGGGGGA
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CGTCACGTAAGCGTCCCTGGGAACAGGGATTCACCAGCAAGTACGATGAA
ATCATAGAGCTGGGAACGGAGGAAGAACCTCAGTACAGTGACATGGCACT
GTACAGCAAGTTCAGACCGAAGAGCCGTTCCCCGCGGCGGAGCTCCCCTC
TGAGCGCCCAGCGGTTCCTGGTGCAGGACGGGTGGGTGGAGATGGCCGAC
GCCCCGGGGCTGGTACTGGGGGTGGCCGAGCAGGACGTGACGGGGACAGC
CGTCTCCGTGGTGCTCGTCAGGAAACGGGACGACGACATCAACCAGAGAT
GGACGCTCAACAAGGACGGCTCCATCAACATCAAGAGTAACTACAGCCTG
GTGCTAGGAGTGGCCCTGCCTCCCCTACCCCCTGGGGAAGATTCCCCACC
CCCGGGGTATGCAGGCGTGCCCATCTCCCTACAGCCCCGCCGGGTGGCAG
CCCTGGGGGCGGCTAACCAGCGCTGGCTATGGGACCCCGTCACCGGATTC
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AACCGGGTTACACGTGGGCCATGCCTACAGCTAAGGGGAGCCAGCAGGCC
ATAGTGTGCGTGGCCTGCTCTCGTGCAATGCGTGGAAGTTTCCGCCTAAC
CAAGCTGAACGTCAGCATTCCGTTTTCCTGTGCCATGGGAACAACAATAA
AACAAAAGGGACAGAAGTTTGGTGGCTGCTTCCACTGTTTGAATGGAAAG
GTGGACCTGTCGACCTACGAGGCAGAGAAGTCGCTGGAGATGTGGGAGGA
GCAGCTGGAGCAGCTGCGGAAGGAGCGCAGCGTGCGGACCATCCAGCGCC
AGATCTCCGCCGTGCAGATGGTCCAATCACTGCGCGTCCTCGCCTTCAGG
AACGGGGAGGGCTGGTTCGCCGACGGGACGGTGCTGGTGGGATCTAGCGT
CTACGGGTTACTAGAGCAGGCGACCCACCGCCTAAACCTGGCGAGCGCGG
CGCGGCGGATCTACACGGCGGACGGTAACCTGGTCCTAGACATGAAGGAG
CTCATTGACTGGGCGGTCAACGACTATGAAGAACAGGTTCAGGCCTATCT
GCATGATGAGAAGGACCAGAGAGACATGACTCAGGAAGAGAACAGGAAGG
AGGAGGGGGGAGGAGATACGATGGAACAGCCCGATGAGCCTGAGTTCACC
TACCGCTACACCAACGACGACTTCGACTACTGCTGGGACGGCTTTGAACT
CCCCGACCCCAGCTCCACCTTCAGCTTCGAGGTCAAGGCCGCGAGCGACG
CCCACATTGCTCTCTCCGAGAGCAACGCCAACGAGGAGGGGATGTACGAG
ATCGTGATCGGAACCATGATGAACAGGATGTCCGCCATCCGTCAGTTCAA
ACACGAGGGCCTTCCGGACATCAGGATCACGCAGAGGACTCCTGACGTCC
TGTCCGCCACCGAGTACCACAAGTTCTGGATCAGCTACGACGGGAACGGT
ACGATCGAAGTGCGGAGGGACGGGGAGACGGACCCCATCGTGGAGTGGAC
CGACCCGGACCCCCTGCTTGTGAGATATGTGGGATATTCCACTGGACATG
GGTGTGACGGGGAGTGGCACTTCACCTTCAAATCAGATGAGGATGAATTA
GATGGAGGTGGGAGGAAGACAGAGGAAGACAGCATGACAGACACGTTCAA
GAGAATGGACATCCAAGAAAGCACCACTACGGCAACTCTCAGGGACAGGC
CGTCCTCGGCGCAGGTCGGGGACCGCGAGCGCCGGGGGAGTGACAGCGGG
ACACGACAGCGACACAGCAGCGTAGAGGTGAACATCCAGGAGCTGATTCG
CCACCCCATCCCCGTCTGGGTCTCCTGTGGGGAACCCTTCATCAGTCCTG
ATGTTGTTGCGAGTCAGAGAGCGCTGGACCAGGTCCATCGGGAGGAGCGT
GAGAGCGTGCTGAAGGAACTACAGAAGGAGAAACACATTCTGCACCAGAT
GCAGGGTCGGCGGTACAAGGGCCTGTCCCACCCCAGGTTCGTGCCCACCA
CCAGCAGTAGGAACCCAGTGATGCTGGAGGGGGGATGGATGGAGCCCTCA
CGGGACGAGGTCACCAGGGAGGAGGCTGTGGAGAAACTGGAGACCCACCT
GTCGGAAGTGAAGGCTGTTCAGAAGGTGGAGCGTAAGAAGGCAGGAGTGG
GCCCTCGCACCGTCAGGACCAACAGGAAACTCTACCAACAGCCAACAACG
AAACGTGTGTTGGTGTATCCCAACGGGGAGTCAGCAGACAAGGCAGTGTA
CGCCTGGGGAGCCAACTTACCGCAGCTGCTGGAATCCTGCACAATCCGTC
TGAGTCTGCAGAGAGCAGCACGGACACTCTACACAGCTGATGGACAAAAG
GTGCAATCCTGGGAAGATGTAGAGAGAGACCAGCTGTTATGTGTGTCCAG
TGGAGAGAGCTACATGAACAACAAAGCGTCCCGCCGGAAGGTTGAGGTGA
AGGCGGCGTGGTCGCGAGCGAGGAAACAGGAAGGGATGGAGGCAACGGAC
GTCCTGATGGTCACGCCGCGCACCAACCCCAAAGTAGAGGTTGACCCGTA
CGGCCCCCCAGTGCTGGCCCTACCCGCTCCAGGAGAGGGGGGAAGTGGAA
GCAAAAAGAGACCCCCACTCCCTCCTTCTGCTAGCAAGAGGAGGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03531.5Blg03531.5-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03531