transcript:BL82838_cuf2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL82838_cuf2
Unique Nametranscript:BL82838_cuf2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL82838_cuf2

>transcript:BL82838_cuf2-protein ID=transcript:BL82838_cuf2-protein|Name=transcript:BL82838_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=447bp
VTYWKYGRSLSCGYDGKGGPWSNQVYQIVGLDKVTPTLPPVARGAYCRAY
GDPHYQTFDGQNYDFMGICTYTMSKYQSTASDDTLQPFNVEIKNEHRRNN
FHVSYTAEVYVDVSGHRITLQKGRRVLVDGVFTRLPYKGAGFTIHLQGRQ
VVVVMEFGVRVAFNGLNMAEQVYVPPPYMGKLVGMCQDFNMDKSDDLLKA
DGTWASSATELGNSWNIDPECREMEDEYVFNCPVSIQRRVEDKCKALLDP
DLEFSACHLLLDAQMYTENCMIDMCEDESEEHRCDSFATFAEDCAEHGVV
IDWRSATGCDSLLKCPENSTYSTCVSPCQATCRDNTPADCAGERCLEGCQ
CKDGYVLSGETCVLPRDCGCLLPDGRYYEIGDRWGEIRTRGDIGETRECE
CRRGDQGAEKVCLSVRCQPPNTWTLMDGVLGCHCPGCLDDKTPVLTV
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000073:876541..880645-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL82838_cuf2 ID=transcript:BL82838_cuf2|Name=transcript:BL82838_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=4105bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000073:876541..880645- (Branchiostoma lanceolatum)
AGGTCACGTACTGGAAGTATGGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGG AAAGGAGGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTACCAGATTGTTGGTAGGTCAAG TTTGCTTGCTAGATTTTGTTACTGACTTAGAGCTATTTTAGTTGGTTTTC AAAATGTCAAAATTCAAGTATCAGTGAGGAGTGAAGCAGTTTGTATATTA GATACATGTATAACGTTATGATCATGATGATGAAATATTGATTCTTCTTT TACTTATGTTTGCAGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATTGCCACCAGGT GAGTTCTAAATAAAAATGTCTGAATGACAAATTTAGGTTTGTGATTAAAG GGCAATGTGCATGATGTACTGCTGATTGAGCACACTTTTATCTGCAAGAC TGAAAAGTTGGATTTTAAACTATTCATCGCTGAAATAAAGGAAAGGGAAT AAGGATCAATTTGAAAATGCCAGCGTCCTGCTAATGTGATAGGGGAGGCA ATGTATATGAAATTGTTCACACAAACTTATAGTGAATGTGACTTGATGAC AATATCCTTGATATCTACTAATTCTGTATTTTTCCCTTATAAAAATGTAT TACTCAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACTA CCAAACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTACCTACA CAATGTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTTC AATGTGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCATA CACGGCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAGA AGGGAAGGAGGGTCTTGGTAAGACTCTATACTACTTATGATTTTTCCTCT GTATTCTGTACCTTTGTGCATAGCTTGGCTACATTTTATATCATCATACC ATATCCCTCCTTGACGATGATATTTCCCTGCCCAGGTTGATGGAGTGTTT ACCAGACTGCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGCG GCAGGTGGTGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGC TGAACATGGCAGAGGTATGACAGCATCAATATTTCTGAACCTGAACAGAT AGGTTTGTGCCTTCGTAATTGACATATTCATCCTCTGTGTTGGCCGTAAC AATGTAAGTGAGTACGCAAAGCTCACAGTGCTTTCTATTGAAATAAAGAT GTTCTTGGTGCAACGTGGCCATAATTTTCGTGAATTTATTCATCCGGTCG CAGGGTGGCGCTTTCCTATACCCGCACTGTACCTTTGCTGTCCTTGGTGC TGAACTTGTAATCTTATTTTGGGGCGTTGTTTACTGCTTTAAAATGACTA GTTTGCTGTTCGTCCTCTTATTTTTTGAAAGTTTGAGACGTATTACTTTA TTTCCTTTGTCAAGACGTTTATGTTTTTTGATAGCATTCATGCATTTGTC TATTTGTCTGTCTGTCAACACGATAACTCGAGAAGGCTTAAGTTTTGCCA TACAGCACATTGCAAACCTAAAACTTAGAAATCTCTGCATCTCTTCTTTC TCAGTGTGTAGTATGCAAGGCAATGGTTATGTACAGGGTAACTCTTGTAT TGCTATGATCATTGAGAAGATGTTTGCACCAAAGGCAAATGATGTACATT GTACCACCTATACATGTACATGGCCCTGTAGGACACTTTGCTTAAATTGC ATTCTGGTCTGGGAAATCTGCCTAATGAAAGCTGTGAGTGTTGCACTATG AGATTCTAAGGCTTGTGTGTCCACAGGTGTATGTGCCTCCCCCCTACATG GGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGACTTTAACATGGACAAGAGTGATGA CCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGGCAAGCAGTGCCACGGAATTGGGCA ACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTATGTCAACATTGGTATTTCGAGATCA AAGTGCAATGAATATTTTTGACAGTGACACCTGTAGTTGGAAGCATATTC AGAATGAATAATGGCAGCCAGGTACAAGCAGAAATTTGTGGAAACATTTA TTGGACTAGATTCGCAAAATGAGATGTCTGATCTCAGTTCAGTTGGTTTG ATGTACATGATGGAGCAACTTTGTAGATACTGTAATTGTTAAAGAAAATA GATGCAAAATGTCAACTGCATCACGTCATTGCGCTACCAACACGCAGTCA TTTAACCATGTATATATCCTGCTTCTATCAAGAATGGTGTCTCAGACATC ATATTTTTGCCAGGTCATCTGTCTGACAGTCATGTGTCTGTGTTTGTCTC TTGTTCAGGTGTAGAGAGATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGT CAGCATCCAGCGACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTG ACTTGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGGTAGTAAAA AACAGCTGACATCTTGCATAGTGATTTCTGAAAGAAATATTTTGACTGAT TTGCGGATACATTTGTGATGCTATATTGAATAGAACAATGTCTGTAGAGA TGCATTTAAGTCAGCCAATCGTTTCTTTCTTTTGTGTGTACAACTTGATG GTCAGTGTTGATACCAGGATGTTGTATAGATAACATGTCAGTTGCAACAG CATTTGGAATCCAACTACAGTTGATAAACTAGAAACGACGAAGAGAAAAG AGTCTTGTAACATTTGAAGTTGTCCAGACATTCATTGTGCTCCTGTCGAC AGATGTACACTGAGAACTGCATGATTGACATGTGTGAAGATGAGAGCGAG GAGCATCGGTGTGACAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGGACTGTGCGGAACA TGGTGTTGTTATTGACTGGAGATCTGCAACAGGATGTGGTGAGTACACAC AAAGTTTATGGTCATTTGAAGCAGTTAATCCTTTTCCAACAAAAAGGGCA GAAGAATTCATCCTGTGAGAAAATTCATAAAAAATCATGGATATTGTTAG GCAAGATCGTAGCAAAATCTGGTTATGGCTCATTTGTTGATTGAAGGATT GTGTAACTTATTAGATTACCAATATTAGGATGATAGTCATTGTGTATCTT AAAATTTTGACACTTGTTGCATAAATAATACATCTGATGTTTCAGACTCC CTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTACAGTACCTGTGTCAGCCCCTG TCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGCAGACTGTGCTGGGGAGAGGT GCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGTACGTGCTCAGTGGGGAGACG TGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTACTGCCCGATGGACGGTACTA TGAGGTAAAATGTTAAGGTTGATGTTTAGGGTCATCTCAAACTGTCAGGA GCCAGTTGAGTAATTGTTTGTTATACCTAAACATTGAGCTTAATGTGCGC AAAGTTTGTGATACAAATTTTTAGTAAAAAATTAACTTGAGATTGAACAT GTTGTCGCATGATCTGTTCAAAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCGG ACCCGTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAGA CCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAACA CATGGACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTTA GATGGTAGGGAGGATCAGCTTCTGTAAGTGTTAGTAACAGATTACAGTCA ACAAAGCAGTACAGAGATCATTTCAGGGAGAAAATGTACAGGCTGGAAAA GGTTTCAAATTGTTGCAGACTGCACAGTCAAGTGTCCAGGCTTTTGGTAG CAGCATTTTTCTCAGATCATTGTATTTAGGAGAGGCACACAATTACACAT TGATTGTTTCTAGGTAGTGAGTCCCATCAACATGCTGTTTTCTGCATGTA ACGTTAAGTGCTTGAATATGTGTCAGTCTCAGTACAATTTCCTCTTTACC ACAGCTTTTGTTTGTCATTTTGTTCAACAGATAAAACTCCTGTCCTGACA GTCAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000073:876541..880645-

>transcript:BL82838_cuf2 ID=transcript:BL82838_cuf2|Name=transcript:BL82838_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=13410bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000073:876541..880645- (Branchiostoma lanceolatum)
GTCACGTACTGGAAGTATGGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGGAA
AGGAGGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTACCAGATTGTTGGCTTGGACAAGG
TCACACCTACATTGCCACCAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTAT
GGTGATCCCCACTACCAAACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGG
CATCTGTACCTACACAATGTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACA
CACTGCAACCGTTCAATGTGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAAT
TTTCACGTGTCATACACGGCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCG
CATCACACTGCAGAAGGGAAGGAGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTTTACCA
GACTGCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGCGGCAG
GTGGTGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAA
CATGGCAGAGCAGGTGTATGTGCCTCCCCCCTACATGGGGAAACTTGTGG
GGATGTGCCAAGACTTTAACATGGACAAGAGTGATGACCTGCTAAAGGCT
GATGGTACATGGGCAAGCAGTGCCACGGAATTGGGCAACAGCTGGAACAT
TGACCCAGAGTGTAGAGAGATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTG
TCAGCATCCAGCGACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCT
GACTTGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGATGTACAC
TGAGAACTGCATGATTGACATGTGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCATCGGT
GTGACAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGGACTGTGCGGAACATGGTGTTGTT
ATTGACTGGAGATCTGCAACAGGATGTGACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGA
GAACAGTACGTACAGTACCTGTGTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCG
ACAACACTCCTGCAGACTGTGCTGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAG
TGCAAGGATGGGTACGTGCTCAGTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCACGTGA
CTGTGGGTGTTTACTGCCCGATGGACGGTACTATGAGATAGGTGACAGGT
GGGGAGAAATCCGGACCCGTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAG
TGTCGCCGTGGAGACCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTG
CCAGCCACCAAACACATGGACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACT
GTCCAGGCTGTTTAGATGATAAAACTCCTGTCCTGACAGTCGTCACGTAC
TGGAAGTATGGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGGAAAGGAGGCCC
CTGGTCAAACCAAGTCTACCAGATTGTTGGCTTGGACAAGGTCACACCTA
CATTGCCACCAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCC
CACTACCAAACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTAC
CTACACAATGTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAAC
CGTTCAATGTGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTG
TCATACACGGCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACT
GCAGAAGGGAAGGAGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTTTACCAGACTGCCGT
ACAAAGGAGCCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTA
GTCATGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAACATGGCAGA
GCAGGTGTATGTGCCTCCCCCCTACATGGGGAAACTTGTGGGGATGTGCC
AAGACTTTAACATGGACAAGAGTGATGACCTGCTAAAGGCTGATGGTACA
TGGGCAAGCAGTGCCACGGAATTGGGCAACAGCTGGAACATTGACCCAGA
GTGTAGAGAGATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGTCAGCATCC
AGCGACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTGACTTGGAG
TTCTCTGCCTGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGATGTACACTGAGAACTG
CATGATTGACATGTGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGACAGCT
TTGCCACCTTTGCCGAGGACTGTGCGGAACATGGTGTTGTTATTGACTGG
AGATCTGCAACAGGATGTGACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTAC
GTACAGTACCTGTGTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTC
CTGCAGACTGTGCTGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGAT
GGGTACGTGCTCAGTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTG
TTTACTGCCCGATGGACGGTACTATGAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAA
TCCGGACCCGTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGT
GGAGACCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACC
AAACACATGGACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCT
GTTTAGATGATAAAACTCCTGTCCTGACAGTCGTCACGTACTGGAAGTAT
GGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGGAAAGGAGGCCCCTGGTCAAA
CCAAGTCTACCAGATTGTTGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATTGCCAC
CAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACTACCAA
ACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTACCTACACAAT
GTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTTCAATG
TGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCATACACG
GCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAGAAGGG
AAGGAGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTTTACCAGACTGCCGTACAAAGGAG
CCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTAGTCATGGAG
TTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAACATGGCAGAGCAGGTGTA
TGTGCCTCCCCCCTACATGGGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGACTTTA
ACATGGACAAGAGTGATGACCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGGCAAGC
AGTGCCACGGAATTGGGCAACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTGTAGAGA
GATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGTCAGCATCCAGCGACGCG
TGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTGACTTGGAGTTCTCTGCC
TGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGATGTACACTGAGAACTGCATGATTGA
CATGTGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGACAGCTTTGCCACCT
TTGCCGAGGACTGTGCGGAACATGGTGTTGTTATTGACTGGAGATCTGCA
ACAGGATGTGACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTACAGTAC
CTGTGTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGCAGACT
GTGCTGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGTACGTG
CTCAGTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTACTGCC
CGATGGACGGTACTATGAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCGGACCC
GTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAGACCAG
GGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAACACATG
GACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTTAGATG
ATAAAACTCCTGTCCTGACAGTCGTCACGTACTGGAAGTATGGACGGTCA
CTGTCCTGTGGATATGATGGGAAAGGAGGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTA
CCAGATTGTTGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATTGCCACCAGTGGCCC
GTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACTACCAAACCTTCGAT
GGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTACCTACACAATGTCCAAGTA
TCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTTCAATGTGGAAATCA
AGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCATACACGGCAGAAGTG
TATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAGAAGGGAAGGAGGGT
CTTGGTTGATGGAGTGTTTACCAGACTGCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCA
CCATCCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTC
AGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAACATGGCAGAGCAGGTGTATGTGCCTCC
CCCCTACATGGGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGACTTTAACATGGACA
AGAGTGATGACCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGGCAAGCAGTGCCACG
GAATTGGGCAACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTGTAGAGAGATGGAGGA
TGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGTCAGCATCCAGCGACGCGTGGAGGACA
AGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTGACTTGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTA
CTTTTGGATGCTCAGATGTACACTGAGAACTGCATGATTGACATGTGTGA
AGATGAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGACAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGG
ACTGTGCGGAACATGGTGTTGTTATTGACTGGAGATCTGCAACAGGATGT
GACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTACAGTACCTGTGTCAG
CCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGCAGACTGTGCTGGGG
AGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGTACGTGCTCAGTGGG
GAGACGTGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTACTGCCCGATGGACG
GTACTATGAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCGGACCCGTGGGGACA
TTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAGACCAGGGCGCAGAG
AAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAACACATGGACTCTAAT
GGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTTAGATGATAAAACTC
CTGTCCTGACAGTCGTCACGTACTGGAAGTATGGACGGTCACTGTCCTGT
GGATATGATGGGAAAGGAGGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTACCAGATTGT
TGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATTGCCACCAGTGGCCCGTGGTGCGT
ACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACTACCAAACCTTCGATGGGCAGAAC
TACGACTTCATGGGCATCTGTACCTACACAATGTCCAAGTATCAGAGTAC
GGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTTCAATGTGGAAATCAAGAACGAGC
ATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCATACACGGCAGAAGTGTATGTGGAT
GTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAGAAGGGAAGGAGGGTCTTGGTTGA
TGGAGTGTTTACCAGACTGCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCACCATCCACC
TCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCT
TTCAACGGGCTGAACATGGCAGAGCAGGTGTATGTGCCTCCCCCCTACAT
GGGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGACTTTAACATGGACAAGAGTGATG
ACCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGGCAAGCAGTGCCACGGAATTGGGC
AACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTGTAGAGAGATGGAGGATGAGTATGT
GTTCAACTGTCCTGTCAGCATCCAGCGACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGG
CTCTGCTAGACCCTGACTTGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTACTTTTGGAT
GCTCAGATGTACACTGAGAACTGCATGATTGACATGTGTGAAGATGAGAG
CGAGGAGCATCGGTGTGACAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGGACTGTGCGG
AACATGGTGTTGTTATTGACTGGAGATCTGCAACAGGATGTGACTCCCTT
CTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTACAGTACCTGTGTCAGCCCCTGTCA
GGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGCAGACTGTGCTGGGGAGAGGTGCT
TGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGTACGTGCTCAGTGGGGAGACGTGT
GTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTACTGCCCGATGGACGGTACTATGA
GATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCGGACCCGTGGGGACATTGGTGAGA
CGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAGACCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGC
CTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAACACATGGACTCTAATGGACGGGGT
GCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTTAGATGATAAAACTCCTGTCCTGA
CAGTCGTCACGTACTGGAAGTATGGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGAT
GGGAAAGGAGGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTACCAGATTGTTGGCTTGGA
CAAGGTCACACCTACATTGCCACCAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGG
CCTATGGTGATCCCCACTACCAAACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTC
ATGGGCATCTGTACCTACACAATGTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGA
CGACACACTGCAACCGTTCAATGTGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAA
ATAATTTTCACGTGTCATACACGGCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGT
CATCGCATCACACTGCAGAAGGGAAGGAGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTT
TACCAGACTGCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGC
GGCAGGTGGTGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGG
CTGAACATGGCAGAGCAGGTGTATGTGCCTCCCCCCTACATGGGGAAACT
TGTGGGGATGTGCCAAGACTTTAACATGGACAAGAGTGATGACCTGCTAA
AGGCTGATGGTACATGGGCAAGCAGTGCCACGGAATTGGGCAACAGCTGG
AACATTGACCCAGAGTGTAGAGAGATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTG
TCCTGTCAGCATCCAGCGACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAG
ACCCTGACTTGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGATG
TACACTGAGAACTGCATGATTGACATGTGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCA
TCGGTGTGACAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGGACTGTGCGGAACATGGTG
TTGTTATTGACTGGAGATCTGCAACAGGATGTGACTCCCTTCTGAAGTGT
CCAGAGAACAGTACGTACAGTACCTGTGTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTG
CCGCGACAACACTCCTGCAGACTGTGCTGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCT
GTCAGTGCAAGGATGGGTACGTGCTCAGTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCA
CGTGACTGTGGGTGTTTACTGCCCGATGGACGGTACTATGAGATAGGTGA
CAGGTGGGGAGAAATCCGGACCCGTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGT
GTGAGTGTCGCCGTGGAGACCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTC
CGCTGCCAGCCACCAAACACATGGACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTG
TCACTGTCCAGGCTGTTTAGATGATAAAACTCCTGTCCTGACAGTCGTCA
CGTACTGGAAGTATGGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGGAAAGGA
GGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTACCAGATTGTTGGCTTGGACAAGGTCAC
ACCTACATTGCCACCAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTG
ATCCCCACTACCAAACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATC
TGTACCTACACAATGTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACT
GCAACCGTTCAATGTGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTC
ACGTGTCATACACGGCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATC
ACACTGCAGAAGGGAAGGAGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTTTACCAGACT
GCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGG
TGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAACATG
GCAGAGCAGGTGTATGTGCCTCCCCCCTACATGGGGAAACTTGTGGGGAT
GTGCCAAGACTTTAACATGGACAAGAGTGATGACCTGCTAAAGGCTGATG
GTACATGGGCAAGCAGTGCCACGGAATTGGGCAACAGCTGGAACATTGAC
CCAGAGTGTAGAGAGATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGTCAG
CATCCAGCGACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTGACT
TGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGATGTACACTGAG
AACTGCATGATTGACATGTGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGA
CAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGGACTGTGCGGAACATGGTGTTGTTATTG
ACTGGAGATCTGCAACAGGATGTGACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAAC
AGTACGTACAGTACCTGTGTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCGACAA
CACTCCTGCAGACTGTGCTGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCA
AGGATGGGTACGTGCTCAGTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCACGTGACTGT
GGGTGTTTACTGCCCGATGGACGGTACTATGAGATAGGTGACAGGTGGGG
AGAAATCCGGACCCGTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTC
GCCGTGGAGACCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAG
CCACCAAACACATGGACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCC
AGGCTGTTTAGATGATAAAACTCCTGTCCTGACAGTCGTCACGTACTGGA
AGTATGGACGGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGGAAAGGAGGCCCCTGG
TCAAACCAAGTCTACCAGATTGTTGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATT
GCCACCAGTGGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACT
ACCAAACCTTCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTACCTAC
ACAATGTCCAAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTT
CAATGTGGAAATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCAT
ACACGGCAGAAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAG
AAGGGAAGGAGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTTTACCAGACTGCCGTACAA
AGGAGCCGGTTTCACCATCCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTAGTCA
TGGAGTTTGGTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAACATGGCAGAGCAG
GTGTATGTGCCTCCCCCCTACATGGGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGA
CTTTAACATGGACAAGAGTGATGACCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGG
CAAGCAGTGCCACGGAATTGGGCAACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTGT
AGAGAGATGGAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGTCAGCATCCAGCG
ACGCGTGGAGGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTGACTTGGAGTTCT
CTGCCTGCCACTTACTTTTGGATGCTCAGATGTACACTGAGAACTGCATG
ATTGACATGTGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGACAGCTTTGC
CACCTTTGCCGAGGACTGTGCGGAACATGGTGTTGTTATTGACTGGAGAT
CTGCAACAGGATGTGACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTAC
AGTACCTGTGTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGC
AGACTGTGCTGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGT
ACGTGCTCAGTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTA
CTGCCCGATGGACGGTACTATGAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCG
GACCCGTGGGGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAG
ACCAGGGCGCAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAAC
ACATGGACTCTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTT
AGATGATAAAACTCCTGTCCTGACAGTCGTCACGTACTGGAAGTATGGAC
GGTCACTGTCCTGTGGATATGATGGGAAAGGAGGCCCCTGGTCAAACCAA
GTCTACCAGATTGTTGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATTGCCACCAGT
GGCCCGTGGTGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACTACCAAACCT
TCGATGGGCAGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTACCTACACAATGTCC
AAGTATCAGAGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTTCAATGTGGA
AATCAAGAACGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCATACACGGCAG
AAGTGTATGTGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAGAAGGGAAGG
AGGGTCTTGGTTGATGGAGTGTTTACCAGACTGCCGTACAAAGGAGCCGG
TTTCACCATCCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTAGTCATGGAGTTTG
GTGTCAGGGTGGCTTTCAACGGGCTGAACATGGCAGAGCAGGTGTATGTG
CCTCCCCCCTACATGGGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGACTTTAACAT
GGACAAGAGTGATGACCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGGCAAGCAGTG
CCACGGAATTGGGCAACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTGTAGAGAGATG
GAGGATGAGTATGTGTTCAACTGTCCTGTCAGCATCCAGCGACGCGTGGA
GGACAAGTGCAAGGCTCTGCTAGACCCTGACTTGGAGTTCTCTGCCTGCC
ACTTACTTTTGGATGCTCAGATGTACACTGAGAACTGCATGATTGACATG
TGTGAAGATGAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGACAGCTTTGCCACCTTTGC
CGAGGACTGTGCGGAACATGGTGTTGTTATTGACTGGAGATCTGCAACAG
GATGTGACTCCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTACAGTACCTGT
GTCAGCCCCTGTCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGCAGACTGTGC
TGGGGAGAGGTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGTACGTGCTCA
GTGGGGAGACGTGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTACTGCCCGAT
GGACGGTACTATGAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCGGACCCGTGG
GGACATTGGTGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAGACCAGGGCG
CAGAGAAGGTCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAACACATGGACT
CTAATGGACGGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTTAGATGATAA
AACTCCTGTCCTGACAGTCGTCACGTACTGGAAGTATGGACGGTCACTGT
CCTGTGGATATGATGGGAAAGGAGGCCCCTGGTCAAACCAAGTCTACCAG
ATTGTTGGCTTGGACAAGGTCACACCTACATTGCCACCAGTGGCCCGTGG
TGCGTACTGCAGGGCCTATGGTGATCCCCACTACCAAACCTTCGATGGGC
AGAACTACGACTTCATGGGCATCTGTACCTACACAATGTCCAAGTATCAG
AGTACGGCTAGCGACGACACACTGCAACCGTTCAATGTGGAAATCAAGAA
CGAGCATCGGAGAAATAATTTTCACGTGTCATACACGGCAGAAGTGTATG
TGGATGTCAGTGGTCATCGCATCACACTGCAGAAGGGAAGGAGGGTCTTG
GTTGATGGAGTGTTTACCAGACTGCCGTACAAAGGAGCCGGTTTCACCAT
CCACCTCCAGGGGCGGCAGGTGGTGGTAGTCATGGAGTTTGGTGTCAGGG
TGGCTTTCAACGGGCTGAACATGGCAGAGCAGGTGTATGTGCCTCCCCCC
TACATGGGGAAACTTGTGGGGATGTGCCAAGACTTTAACATGGACAAGAG
TGATGACCTGCTAAAGGCTGATGGTACATGGGCAAGCAGTGCCACGGAAT
TGGGCAACAGCTGGAACATTGACCCAGAGTGTAGAGAGATGGAGGATGAG
TATGTGTTCAACTGTCCTGTCAGCATCCAGCGACGCGTGGAGGACAAGTG
CAAGGCTCTGCTAGACCCTGACTTGGAGTTCTCTGCCTGCCACTTACTTT
TGGATGCTCAGATGTACACTGAGAACTGCATGATTGACATGTGTGAAGAT
GAGAGCGAGGAGCATCGGTGTGACAGCTTTGCCACCTTTGCCGAGGACTG
TGCGGAACATGGTGTTGTTATTGACTGGAGATCTGCAACAGGATGTGACT
CCCTTCTGAAGTGTCCAGAGAACAGTACGTACAGTACCTGTGTCAGCCCC
TGTCAGGCCACCTGCCGCGACAACACTCCTGCAGACTGTGCTGGGGAGAG
GTGCTTGGAAGGCTGTCAGTGCAAGGATGGGTACGTGCTCAGTGGGGAGA
CGTGTGTGCTGCCACGTGACTGTGGGTGTTTACTGCCCGATGGACGGTAC
TATGAGATAGGTGACAGGTGGGGAGAAATCCGGACCCGTGGGGACATTGG
TGAGACGCGAGAGTGTGAGTGTCGCCGTGGAGACCAGGGCGCAGAGAAGG
TCTGCCTGAGTGTCCGCTGCCAGCCACCAAACACATGGACTCTAATGGAC
GGGGTGCTGGGGTGTCACTGTCCAGGCTGTTTAGATGATAAAACTCCTGT
CCTGACAGTC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL82838gene:BL82838Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL82838_cuf2transcript:BL82838_cuf2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL82838_cuf2-E1BL82838_cuf2-E1-1564476830-267268Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E2BL82838_cuf2-E2-1564476830-267265Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E3BL82838_cuf2-E3-1564476830-267263Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E4BL82838_cuf2-E4-1564476830-267261Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E5BL82838_cuf2-E5-1564476830-267259Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E6BL82838_cuf2-E6-1564476830-267257Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E7BL82838_cuf2-E7-1564476830-267255Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E8BL82838_cuf2-E8-1564476830-267253Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E9BL82838_cuf2-E9-1564476830-267251Branchiostoma lanceolatumexon
BL82838_cuf2-E10BL82838_cuf2-E10-1564476830-267249Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000073genomeSc0000073:876541..880645 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL82838_cuf2
Biotypeprotein_coding