transcript:BL95842_evm1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL95842_evm1
Unique Nametranscript:BL95842_evm1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL95842_evm1

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KQ
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000157:689664..693527-

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000157:689664..693527-

>transcript:BL95842_evm1 ID=transcript:BL95842_evm1|Name=transcript:BL95842_evm1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=12795bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000157:689664..693527- (Branchiostoma lanceolatum)
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GGTTCTGNCCCCCACCCCCATTTTTCGGCAAGCTGTCTATGTGTAAAAAA
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TTGGGAAGCTTATCGTGAAGCATGTCGGGAACGAGGGTTCGAATGATAAT
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AAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCT
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GGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCC
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TACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTT
GTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGT
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TTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGT
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GTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCG
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ACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCA
TGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGA
CATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTA
AGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTG
GTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGT
GTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTA
ACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGG
GCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGAT
CTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTGCGGGCGGGTTCTTTGTGTG
TTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCG
GAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGG
TTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGT
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ACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCA
TGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGA
CATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTA
AGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTG
GTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGT
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CACCGAACTGGAAAGGGAAAAACCGGATGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGG
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CCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTAC
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ATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCT
ATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTT
CCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGA
GCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTT
CTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGG
CGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGT
CCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTC
CCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAAC
GACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATG
TTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACA
TGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAG
GTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGT
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GTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAAC
GCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGC
GGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGG
TGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTAC
ACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTGTGGCGTAACGCGGA
GCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTGCGGGCGGGTT
CTTTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGG
CGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGT
CCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTC
CCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAAC
GACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATG
TTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACA
TGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAG
GTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGT
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GTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAAC
GCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGC
GGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGG
TGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGAAACGACTAC
ACGGTGCGGGCGGGGCAGGCCGAGAACAAGTTCGTGGTTCACCTGGACGG
ACAGGACGAGATCAGACTCACCTGTACCGACAGGAGCAGCAAAGGCTTCT
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CGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCG
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GTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACA
CGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCC
CGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGG
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GACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCC
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GTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCG
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GGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCC
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CTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTT
TGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATG
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TATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGA
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GTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGC
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GTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTG
TGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACAC
GGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCC
GTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGG
AACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTGTGGCG
TAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTGC
GGGCGGGTTCTTTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCC
CAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGA
CTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTT
TGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATG
TACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGT
TATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGA
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GTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTG
TGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACAC
GGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCC
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AAGGCTTCTTCGGGTGGCTTCGGGGAGGAGGCGGCAGCAAGGCTAAACCT
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GGGACAGAAGAACATCGTGCACAACAATGAGGCGTGTAATACCCCCTCCC
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TACGGGAACGACTACACGGTCCGAGCGGGTTCTGNCCCCCACCCCCATTT
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TCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGA
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GTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGT
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GCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCA
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ACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTG
TCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTA
CGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTA
TATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATC
TATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGT
TCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGG
AGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGT
TCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTG
GCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGG
TCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGT
CCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAA
CGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCAT
GTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGAC
ATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAA
GGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACT
ACACGGTGCGGGCGGGTTCTTTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTG
TCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTA
CGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTA
TATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATC
TATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGT
TCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGG
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TCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTG
GCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGG
TCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGT
CCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAA
CGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCAT
GTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGAC
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GGTATCTTCGGGACAGAAGAACATCGTGCACAACAATGAGGCGTGTAATA
CCCCCTCCCCATTCGTGCAAGTCGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATC
TATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGAGCGGGTTCTGNCCCCCA
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AATACGTCGAAGTTCAGGAGATCAACAAGGTGGTTCTTGGGAAGCTTATC
GTGAAGCATGTCGGGAACGAGGGTTCGAATGATAATAAACGAGAAGAGGT
GCTGAGGCAAATGCTGCAGAGGGTCATCACCGAACTGGAAAGGGAAAAAC
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GACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATG
TTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACA
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GATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGT
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GTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTC
CGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCC
CCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACG
ACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGT
TTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACAT
GTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGG
TTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTG
ATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTG
TGTTCCTAAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACG
GGAACGACTACACGGTGCGGGCGGGTTCTTTGTGTGTTCCTAAGGTTATA
TCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTA
TGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTC
CTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAG
CTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTC
TGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGC
GTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACGACTACACGGTC
CGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGTTTGTCCCGTCC
CCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACATGTACGGGAACG
ACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGGTTATATCATGT
TTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTGATCTATGACAT
GTACGGGAACGACTACACGGTCCGGGCGGGTTCTGTGTGTGTTCCTAAGG
TTATATCATGTTTGTCCCGTCCCCAGGTGTGGCGTAACGCGGAGCTGGTG
ATCTATGACATGTACGGAAACGACTACACGGTGCGGGCGGGGCAGGCCGA
GAACAAGTTCGTGGTTCACCTGGACGGACAGGACGAGATCAGACTCACCT
GTACCGACAGGAGCAGCAAAGGCTTCTTCGGGTGGCTTCGGGGAGGAGGC
GGCAGCAAGGCTAAACCTAAACCTATAGAGGCCTCTAAACAGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL95842gene:BL95842Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL95842_evm1transcript:BL95842_evm1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL95842_evm1-E1BL95842_evm1-E1-1564476830-354622Branchiostoma lanceolatumexon
BL95842_evm1-E2BL95842_evm1-E2-1564476830-354620Branchiostoma lanceolatumexon
BL95842_evm1-E3BL95842_evm1-E3-1564476830-354618Branchiostoma lanceolatumexon
BL95842_evm1-E4BL95842_evm1-E4-1564476830-354616Branchiostoma lanceolatumexon
BL95842_evm1-E5BL95842_evm1-E5-1564476830-354614Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000157genomeSc0000157:689664..693527 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL95842_evm1
Biotypeprotein_coding