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protein sequence of transcript:BL96527_cuf18 >transcript:BL96527_cuf18-protein ID=transcript:BL96527_cuf18-protein|Name=transcript:BL96527_cuf18|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=497bp
DKMAAVSVRTVGKLLFFFTFFSTVKAIDSPTDEEILQYQQQRAVEYNVVP PSSRHHHHTEEVPRMTMDTAILKVNTSLDYAVQIWAVSAECHKCNMSFMM EVDPTIPTEPFLVQTAFMTHISIVKDNHDGTNESICSLDKLFGEHGEYQM FINVNGPSAENKFDCPVYADKDPIDSNIPILVAFCIYVGLVLIFLAVRQL YYTIGRSKYAWFIGYFPFRETDRLVNSDLGAPSPSSTATEDGRPVPNSTA QAAPQRLRRLKSLDTFRGLSLAVMVFVNYGGGGYWFFKHARWNGLTVADL VFPWFVFIMGTSIALSFRRLLKKGVSRPSLLWKVVQRTVILFLLGLFIIN TKKGHNSWTTLRIPGVLQRLALTYFIVALMEVVGATAEDRNYTSRIAPVR DIVNSWGQWLVMVVMVTLHLVLTFWLKVENCPIGYLGPGGLSDMAHYNCT GGATGYIDRYIFTDDHIYQHPTPITVYKTEVPFDPEGLLGRKDFLAH Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000006:2901274..2912676+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96527_cuf18 ID=transcript:BL96527_cuf18|Name=transcript:BL96527_cuf18|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11403bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000006:2901274..2912676+ (Branchiostoma lanceolatum) GACAAGATGGCGGCTGTGTCGGTCAGAACAGTCGGCAAGCTATTGTTTTT
CTTCACTTTCTTCTCAACAGGTGAGTTTTGCGCCTTATTTCTCACACTGC
AACAACATTCACATATTTCTTCAACAATCGCAAGCGTTTTGTTCGGCATG
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GACGTGGGTGTAGTTGGGGGTGTGGCAGTTATACTTGTTTTCCCACTGCA
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GCTACCTGCAACAATCATGATATTGTGGGAGATTGGGAATTTAGGGTATT
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TTTTGTGAGGGGAATTTTCTGACTTGTTATGTTTTAACTCAGCTTAGACA
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GCCCTCTGCGTAACAAACCAGCTTTGCAAGTGCTCGGCACAACAGCAGCT
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GAATATAGTACGGTAGATCAAAGAGAACTGCCCATCTCTCAAACTTTCTT
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GGACAGTGGCTGGTCATGGTCGTCATGGTGACGCTCCATCTGGTGCTGAC
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CCATTGGTGCTTTACTGTGTGATGGTGTAGGTGTAGGTGGTTGTGTTATA
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TGATGGTGTAGGTGTAGGTGGTTGTGTTATATTGATGTTAGAACATGACT
GTTTACAGGGAGCCATTGGTGCTTTACTGTGTGATGGTGTAGGTGTAGGC
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TGCTTTACTGTGTGATGGCAGGCAGAATGAAGGATGGATTCCACTCAACA
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CTTACCTCCATGAAGAAGGGGTTTGTTTTCACGTATGAACAGGATAGCTA
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AAGAGTTAACAGTTTGGACCCTTGGCAGCTTCTTTCAAACTGCAGATGAC
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TGTTCATTTCTTTGCACAACACGATAAACAATAGAGAAAAACAGATGCAG
AAGGAGGGAAAAAGCATATATATACTTGGGCCTCCTCCTCTATATCAATC
AAACTTAATCATAATCCATAAATAATATGATAGCAAACCATGTCAACACT
ATTAGAGAAACCATGCTGTTTTGATCAAGGTGTCTGTTCTCTACATTTTA
CCAAAGTTGATTCTTTTGTGCCGCGTGCAGGTCGCTGTCGTTTGTGCTGG
TTCTGTCCTGTTTTGCCTTCGTGCTGCTGTCGGTTTGTTACATCATCATC
GATGTCAAACAGTGGTGGACGGGGGCTCCATTCTACCAAGTTGGTAAGGC
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GACAGTGATCTAACTTTGGAATGCTAAGTAACATAATAACCNGATATCCT
TTGCTCAAAACGTTTTCACCATAACTGTTTGTTGAATTGTTAACTCAAAT
TCTGAGCTTAAAAAAAATAATTCTGATATGATATATGTCTTGTCATATAA
TGTGTGGAAACCCCAGTTGTTGTTAAGTTGTTCCCCCTGTGCTGTAGGTA
TGAACTCCATCCTGGTGTATATAGGCCACAAACTGTCACAGTGTGAAACT
CAAGCAATTGATAAGTTGTTTCCCCTGTGTTGTAGGTATGAACTCCATCC
TGGTGTATATAGGCCACGAGCTGTGTGCAGACAAACTGCCCTTCCAGTGG
GCGGCCTCGTCAACACACGCGCATCAGCTGGCCACAGACCTGGTCGGGAC
TACGTTATGGGTTCTCATCGCAGTTTGGCTGCACTACAAGAAATTCTACC
TCAAGATATAGTCATCCTCCTACCATTTTGCTCAGTCAGAGTCTTACCTG
TAC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000006:2901274..2912676+ >transcript:BL96527_cuf18 ID=transcript:BL96527_cuf18|Name=transcript:BL96527_cuf18|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1494bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000006:2901274..2912676+ (Branchiostoma lanceolatum) GACAAGATGGCGGCTGTGTCGGTCAGAACAGTCGGCAAGCTATTGTTTTT CTTCACTTTCTTCTCAACAGTAAAGGCAATAGACTCCCCAACAGATGAGG AGATTCTACAGTATCAACAGCAGAGAGCAGTAGAATATAACGTCGTTCCA CCATCCAGTAGACATCATCACCATACAGAAGAGGTACCCAGAATGACGAT GGACACAGCCATCCTCAAGGTTAACACAAGCCTGGATTACGCTGTCCAGA TATGGGCTGTGTCTGCTGAGTGCCACAAGTGCAATATGTCCTTTATGATG GAGGTTGACCCCACCATTCCAACTGAGCCCTTCCTGGTACAAACAGCGTT CATGACGCACATTTCCATTGTAAAAGACAACCACGATGGGACAAATGAGT CCATCTGCAGCTTAGACAAGTTGTTTGGAGAACATGGTGAATATCAGATG TTCATCAATGTCAATGGACCAAGTGCAGAAAACAAGTTTGACTGTCCTGT GTATGCAGATAAAGACCCCATTGACAGCAACATTCCCATCCTGGTTGCCT TCTGTATCTATGTGGGACTAGTTCTTATCTTCTTGGCCGTCAGGCAGTTG TATTATACAATTGGCAGGTCTAAGTATGCTTGGTTCATTGGATACTTTCC ATTTCGAGAAACCGACAGATTGGTGAATTCAGACTTAGGAGCACCGAGTC CCTCCTCCACAGCTACAGAAGACGGCAGACCAGTGCCCAACTCCACTGCA CAGGCTGCTCCACAAAGACTGCGTAGACTCAAGTCCTTAGATACATTCAG AGGGTTATCGTTAGCTGTCATGGTGTTTGTGAACTACGGAGGAGGGGGGT ACTGGTTCTTCAAACATGCCAGATGGAATGGCCTCACGGTAGCAGACTTA GTCTTTCCCTGGTTTGTGTTTATAATGGGCACGTCTATCGCGCTGTCGTT CCGGAGGCTACTGAAGAAGGGCGTGTCCAGACCCAGTCTGCTGTGGAAGG TTGTCCAGAGGACAGTCATCCTGTTCCTGTTGGGACTCTTCATTATCAAC ACCAAGAAAGGACATAACTCCTGGACCACCCTCAGGATCCCGGGGGTGCT ACAGAGACTTGCCCTGACGTATTTCATAGTCGCCCTGATGGAAGTGGTCG GAGCTACAGCAGAGGACAGGAACTATACTTCGCGGATCGCGCCCGTCCGT GACATCGTGAACTCCTGGGGACAGTGGCTGGTCATGGTCGTCATGGTGAC GCTCCATCTGGTGCTGACGTTCTGGCTAAAGGTCGAGAACTGTCCAATTG GATACCTGGGCCCTGGTGGTCTGTCTGACATGGCGCACTACAACTGTACC GGAGGGGCCACAGGTTACATAGACAGATACATCTTCACTGATGACCACAT CTACCAACACCCAACACCGATTACTGTTTACAAGACGGAGGTGCCCTTTG ACCCAGAAGGACTTCTTGGNCGGAAGGACTTCTTGGCACACTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000006 | genome | Sc0000006:2901274..2912676 + |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL96527_cuf18 |
Biotype | protein_coding |
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