XLOC_002707 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002707
Unique NameXLOC_002707
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000048:335584..344091-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002707 ID=XLOC_002707|Name=XLOC_002707|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8508bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:335584..344091- (Clytia hemisphaerica)
CTGGTTTTGATTGGTTGCGAAGTTTTGGTTGTAGCCATTTCCATTGGATT GTCCAACATTTTGGTTGGTTTGGTCTTGATTGTTTGGTAGATACGGGTTG ATTGTTGATGCTTGATTTGTCGTAGGTAAGTATGGGTTGGNAATACGGGT TTATTGTTGATGCTTGATTTGTCGTAGGTAAGTATGGATTGGGCGTGCTT ACCAGAGTAGTGGTGGGTGTGGTGGATATAGAGGGCGTGGTAGGTGGCTG ATCCTGGTTACTGAAATTAGGCGGTTGCATGCCTCCAGGCATCAGACCAT CTTCTTTAGCTTCAATCCTAACGGTACCTTTGGTGGTAGAGAGCTTAGTT GTTGGTGGTTGGGAGGTCGTAGGGGCGCCAGATAGGTAGCTGTCTATATT ATACCCAGCTGATTTTAAAAGTTCTTTATATTGTTTCAAAGCTCCATCTG CACTTAGTGTTGTTGCCTGGTTACCAGTCGGTGCTGGAGTAGTTGTATTT CTGGAGGAAGTTACTTTTGATTGAGTTGTTCCTGGTGGTGTGGGGTTCAG ATCTGAATCGTAAGCATTGTAGAGCACATTATTGTTTTCTTGTTTTATGA CTGGAGGGAAAAGAGTTGTTGAAGTGGTACTGAATTGGGAAGATTCTGGT TGGTCATNCTTGTTTTATGACAGGAGGGAAAAGAGTTGTTGAAGTGGTAC TGAATTGGGAAGATTCTGGTTGGTCATGGGTGTCGTATTCTGCATTGTCA CTTGCCATAATTACCGGAGGAAATAGAGTCGTAGAAGTAGTGCTCACTTG CTGAGGTTCTGGTTGGTCGTATGGACTGTATTCAGCATTGTTGCTTTTTG CTTTAATAATTGGTGGAAAGACTGTTGTAGATGTTGTCCTTGCTGGTTGG TCGAAAGAGCTACTATCTTGATTTTGATTATCTTTCATTTCATTACCGGA GACTGTTGATGTCTTTGAGTTTGTTGTTTCAGATGGAGTAGTTACTGGAG GTGTAGTAGGATTCAATTGAACATCTTGTGGTTGGTTATATGGATTGTAT TGCGAGTTGCTGTTTTGTTGTTTAATGATTGGAGGGAAAATAGTCGTTGT TGATTCTGAAGTCTTGGTAGGAGATTTGTACGGCTCATACAAAGATTTGC CGATGTCTTCACTTGGATTGAAACTCTGATTGTTTTGTTGAGTTGGCGAT GTCGTTATTCTTACGTTTGTTGTTTTGGATTTGGTTGTTGCTGGAGGTGT AGTAGGATTCGATACATATTCCGGTTGATCATATGGGTTATATTCGGCAT TGTCTTCTGCTTTAATAATTGGTGGAAAAAGAGTTGTGGAAGTTGTGCTT GATGATTGGTCAAAAGAACTGACACCTTCGGTAGGATTCTGTGTTACCGT TTGATCTTCCAATGGTCTTGGCGTGGTTGTGTTTCTGGTGCTGGTTGCAG TGTTTGGAGTTGGAGGTGGAGTTTGGTTTGACGTTGGTGAATGGTCAGAA TTGTAATACGAATTACCGGCTCCATCAACTGGGTTTTGGTTATCAACCAT CCGAGGAGTGGTCGATGTTTTATTATTGGTAGCACCTTTCTGAGTTGGCG ATGGTGTTTGATTCATAGTTGGTGATTGATATTGGAGTCTTTGGTCATTA GAACTTTGGTAATTAGCATTCATTTGAGCATTTAAAAGTGTTGGTGTAGT TTTTGTTGTTTGAGGAGTCGTTGGTGAATTTGTAGGATTCATCGGAGTAG GTTGTTGCGACTCTTTTTGAGATTCAAAACGGTTTGCACTTTGTGGATAT GTAGGACCTTGGACACCATTATGATCACTCAATGGTGACGTTGGCTCTGG TGAATTTGATGAATCTGATTGATATTCAGCACGACTGTTGGTTTGAGGAT ATGTTGGACCTTCAACACCACCATGAGATCCTGGTGATGAAGTCGTGGTT GTGGAATTCAATGGCCGATTAGTGGTCGTTGGGGCATTCGTTGGTGATGG AGTTTGTGGTGATTCTGAGCCTGATTGACCTTGGATATTAAGTTTGTATT GGTTATTATAGAGTAAAGGAGTACTCGTTGTTGCAAGTGTGACTTCTGTG TTTGAATTCTTGGTTGGTGCATAAAGAAGGTCTTGGTAATTTATGTTTGC ACTTGTTTGTTGGATGGTTGGACCTTTGACGCTGAAAGTGTTAGTAGGTT TGTTGGCAGCATTTGGTGTTGGCAGCTTCGAAGTTGATTGTGAAACAGTT GGTTGACTGTTCGTATCCATTCTTTGCGTCAATGGTTCATCAGAATCCGG TCCTGGTACACCATTTGTTGACGAGGTTGTACTTGAATCATGTTTTTCTA AAGTAACATTACTGGAAGATTCCTTAACGCGAGTTTCAACTGTCTCGATT GCCCATACGTTTAACTTCTGTGGTAACCCGGGCATTGGAGCTGGTGTAGA CTCATAAGGATTGACTATATTGACATCTTCAATCGGACATGGGAATCCAG GGACGCAGCTAGAAGGTGGCGATAGGACTGGAGGTTGTTGCTGGACGCAG CCAGGAGGACAGCCACCGGTAGCTTGGATGCAATCATTGCAATCTCCAGT AACCGGTACTAAGGGTAGTACTGGCTGTGCTACGACTGTTTGATTCTCTG ATTCTTCTGGATAACCTGGCACAGGGACAGGAACTGGCTTCGATGTTGAA TTATCAGATTGTTTAGACATATCTGATGATTGGGGATATGAAGGTGCAGC GGTGGTCAGTTTCTGATCATTTGCACAAGGCCAGTTAATTGGTAGACAGA TAATCTTGTAGCTTGTCTTTGTGTAAACAATTGTAGGAGAACCAGTAGGT CCATTCTTGTTCTTTGATGTTTCTTGATCTTGGCTTTCTTGGTCGTCGGG TACTCCGGGACCAGCGACCCCTTGATCTGCATTTGGCTGGTCTGTATTGG TTTGTCCTGTACTTGTTTGACCAGAGGTATTACCAGCACTGTTCTGTCCT GTATTTTGACCTGAGTTGTTTTGATCAGCATCGCCAGGACCAGATATTCC TTGACCTGCGCTGCCTTGTCCTGCATTACTTTGCCCAGTATTTGATTGAT TAGCATTACCAGAGGTATTATCAGTATTTCCTTGCCCTGCATTTTGACCA GAGTTTTGATCATCATTCCCTGGACCAGAAATCCCTTGACTTGCATTGCT TTGTCCAGAATTACCATGACCTGTTTTTCCCTGACTTGTACTTTCCGGAG TATTGCCGGCATTGTCATGCCCAGAGTTTTGATCACCATTGCCTTGACCA GAAATCCCTTGACTTGCATTGTCTTGTCCAGCATTACTTTGACCTGTTTT TCCTTGACTTGTACTTTCCGGAGTATTGCCGGCATTGTCATGCCCAGAGT TTTGATCACCATTGCCTGGACCAGAAATTCCTTGACCTGCATTTTGACCA ATTTTACCTTGACCAGCGTTGTTTTTACCGTGGTCATTGTCATTTGAATC AGTATTACCATTCTGACAGCAATTTCCTTGACCAGGGCTGGTTTGACCAG GGCTGCAACAGTTGTTTTGATTAATTTGGCTTGAACTTGATTGACTTTCC TCTTGTTGAGCTTTGGATGTCGACGATACTTTATTACTTGGTTTCGAGGT ACTAAAAGGTTTTTTGGTTGGGGATGCTTTGCCATTCTTGTTTGCGGTTT GGTTACCAGAAACTTTGGTTGGTTTGTTGTTTTGAGACTTTCCACTTTGT GGTTGTTTCTCAGTTTCCACATTGTTCGGATGTGTGAATGGTATTGAATC TTGTGGATTCTTTGTGGTCATACGAGCTGTCGTTGGTCTTGAAGTTGTTG TAGGTGTAGTGGTCGTTTGTAGTGTTGTAGTAGTTGTGGCAACCCTTCTT GTAGTGGTCGCATAAGGATTTGTTTGTTGTGGAGCAGGTGTTGGTGTTTT TGTTGCAGCGTTGGTAATTGCATCTTCAATGTCTTCATCTTCTTCATTAT CCGTATTGGAGGATGCTGAGCCACTATTTTGTTTGCTGTTCAGACCTGAT GATCCAGTTGCTTTTGGACGAGATGTGGGAGAAGCTGTCTTCATCGATTG AGTTACTTTATCAGAATCACGAATCTTCTTGCCTTTGGACGTGTTTTTAA GGTTGCCGTTGTTGTCGTTGTTGTTTTGTTGTGTATCGGTGACGCTTGGT GATTGAGTTGGATTCTGCAAACTGTTTTCTTTGTCATTAGATTTATCTTT GTTGCTGTTAGGAGATGCTTTGGGTAGATTCGAGCCTTGATTATTTGTAT TCGATTGGGAAGGATGTTTAGGAAGATTCTTACCACTTTGACCTGATGTT GGAATTGCTTTGCCTGGGTTGCTTTGTAGTTTTTCTTTGTTCTTATCTTT TGAAGACTGAAAAGTGGGTTTCGATGATGGTGCTTTGTTTTCTGTCTGCA ATGTAGAAGGGAGAGACGATTCAGATTTCTCTTTGTCAGCCTTGTTAGCT TTTGGTATCGGCATTGGTCGGGATGCTTTCTCGTCTTGCTTGTTCTTATC GGTAGATGATATTTCTTTGTTATCTTTTTCGGCTTTGTTGTTATTCTTGG AAGAATCTAAAGATCCTTGTTTCATATTTTTCGAAGGTAATGGAGAAGAT CCAATTCCTTGGGTTGGTTTATTTGGATAAGAGGACGAGGGCCCGGAGCT GCTTCCACCAGACTTATCAGGCTTAGAACCAGATTTGGGGCCATTGCCAG TAGTTGGTGGTGATGCATTGGATTGCTTATTAGATGCAGACTTTGGTCCT TGGCTATCAATAGGTTTTCCATTTCCTTTATTGCTATTGTTATCACCAAT AGAAGGTACTTTATTAGATGGAGGAGGAGTATTTGATTGATTTACACTTG ATGTTTTTGAGGATCCTTTACTGCTTCCTGGTGGTAGAGAATTTGCAGAT GGTGCTGATGAACCTTGGTTCCCTCCAGAGCTAGATGGTGAGTTACCAAC CCCTCCATTGTTGTTATTTTCTCCTGATGGTGATGCTCCGGGTCTGTTAG TATCTTGAGTATTGCTTCCTGGTTTATTCTGCCCAGTTGATTGACTTGAG CTTGAGGATCCTTTATTGCTCCCTGGAGGTGGAGAATTTGCAGATGGTGC TGATGAACCTTGGTTCCCTCCAGAGCTAGCTGGTGAGTTACCAACACCTC CATTTTTGTTATTTTCTCCTGATGGTGATACTCCGGGTCTGTTAGTATCT GGAGTATTGCTTCCTGGTTTATTCTGCCCAGTTGATTGACTCGAACTTGA TGATCCTTTATTGCTCCCTGGAGGTGGAAAGCTACTAGCGCCTCCATTAC TGTTACTACCTTGAGATGGTGATGTATTGGTTGAAGCTCCTGGTCTGTCT GAACCATTGTTACCAGGTTTATTCTGTCCACCAGATTCTTCTTTATCGTG AGGAGGTGGACTCTTTTCTTTATTCTCATAATCTTGGTCATTACCATATT TTCCTGAATCAGATCCATCAGATGTTGTTTTGTTGCTTGTCACTTTGATT GGCATGGGTTTTGCAGAGCTGACAGTTGCTCCATGGACATTCATACCGCT TGCACTTTGAGAATCACCGTATTTATTTGGTGATGGTGTAGTGGACATTG ATAAAGAACCCCAAACAACTTTGATGTCCTTGCTCGTCTTAGATTCACTT ACAGCAGGCTGAACTGCTACACCTTTGGATGGATTTAATCGGAAATCGAT CCACTTTGGTATAGATTGTGTAGTAGATGTTACCGAAGATGGTGTTGGAC GAGGTGCCTGTGTTTTGATGCTGGAATCTTCAACAACATCATCTGATTTG TTAGTTGCTTTTGTCTGTTCACCTAAATGAACAACATCTGTCAAGGTGAC AGGCCCTGGTGCAGTTAATGTTAGATCTGATGAGATCGCTGGTAACTGAA ACACCTCCATACCTCCTTCTAATGCTATATCAGGAGGGTTAGCATTCAAT TTTTGTTTATTCTCATTAGGAGGTGTGGCTTTGGATATCCCGCCCCAAGT CACCTTTATGTTCTTGCAACAACTGATATCCTGGCGTTTTGCGATAGTAC TTCTTTTACTACAGCAGTTATGTTTGAAATGTGGATTCTTTGCACTTTCT TCACAGCATGTTAGATTCCTGTATCTGACACTGTCTTCAATTATGTTTGG GTGACTCTTAGTGGACGATGACATTATCATCAAGTCATCATCTTCAGGCT CTTGAGATTCTGACTTTTCATGATAAACCTGGTTAATTGGTGCGAATCCT TTTGGATGGTTAGGAGAACTTGCCGAATATTTTTGCTGGTTCGGTACTTC AGATTCTGCAATCTTCTGGCGATTCTGACCTTGAGAGTCAAATTCTGTGT TCTGTTTGTTCATTTGAGTTTTTCCCGACGAATCGTCTCTTTTGTGTTGA GATTCTGTCATCTTCTGAAGGTTATGATCAGTGTTGGTGATAACAGATCG ACCAGTTCCTTGAGAAGTTTGTTCTTCCTCTTTATCATCCTCTAGGTCAT CCAGATTCTCATCCTCGTTCATGAAATCATCTTCATCTAAATCCAACTCA TCCCCAGATTCGATATGATCCCTTTTGTGATGCGATTTCTGTCGTCGTAT ATTCTCCAAAATCAATCGTTTTGGGAAATAGTTTTTCACGTTGAGTTTGA ATGAAGACTTCTTGGTACCGTTATTTTGACGAAGAGGTTTCTTGGTCAAC TCTAAATCAGGCTCTGTATTCTCATAGCTCATTTCAACAATTCCTGAATT CGGATCTTGATTACCAACACTGATCTCTTCAGATTCTTGAGTTGGTATGA TTGCAATGAGCGAGCGACCGCTTAAGGCGTCTGCGTCATCCTCAGCAGAT CCGCTTTCACTCTCACTGCTTCCACTACCGTCTTGGATTTCAACATCATT TTCTGTAAACAACTTCGAAGATAATGGTACATGTTTTCGTTTTCGTGTCA TGATCATTTTGATACGTTTTCTTCTAGATTTTGCTTTTCCAATTCGTCCT AAATTTGGATTGTGTTGTTTCTTATGCTTTGATGTTTTCGTCTTTTTTGC TTTTAAGCTACGCGATTGACGTGTTTCTACAGCATCATAGAATATATTGT CTGCTCGTTTTTCACGCTTCTTGTTATGTTTAATTTTCGTTTGACCAATA GCTTTGGAGGTTTCAGAAAACATCGTAACTTTCGTTTTCATTTGAGAGTT ATTCTTTGAAGAGTATTTAGTCTTTGAATACTTTGAAGATTTTCCTTGCT TTTCAGGGACAGCTCCCCATGTGTCAGATTTTGGATCATATTTCATTTGG ACAGGGTTGTTAAGCTTTGAGCTCCTTATCAAAGGCTTTTCATGCTTTTT AGTGCTGTTTTTATCTCCTTTCTTTCCAATCACAGGTCCCGAAACAGCAC CCCATGTCTTAGAATTAGCATCAAATTCCATTCGAGCTCCTTGTTTTCCT TTAGTTTTTCTTTCGCCAGTCTCCTGTTTTTTAGTACTGTTCTTATCCTC CTTGCCATCAAATGTAGGTGTAGAAACAGCACCCCATGTTTTGGTATTAT GATCATAAGCCATTTGAGCAATTTTCTTATCAGTCGATTTCCTTTGACCA TCCTCATCAAAGTTTTTCGCTTTAAACTTCTTCTTTTCTTCGTCGGTATT TTTAAGCTTCAGACTACCCTTTGAGACAGCGCCCCATGTTCCAGTCTTCG AGTCGTAAACAAGATCTGCACCTTGTTTTCCATGTGCTTTCGGCTGGCCA AATCTCTTAGTGCTATTCTTTCCATTGTCACCCACAAAGCTTTCTTTCTG GTCTTTGTTGACTACTGCGCTCCATATCTTTTCCTTTGGGTCATACACCA TATTAACATGCTTGGCTTCACCACCAGTTGATTTCAAATGCTTTTTAGTA CTGTTGTTAACAGCTCCAACGTGTTGAATCTGTGGAACAGCACTCCAGGT TTTATCGTTAGGATTAAAGGTGATTTGGGTAGCAAAATTTGGTTTAGGGA AGTTATTTTTCCCAAAATACGATCCTTGATTCATGCTTTTTCCGGAAGAA GGAGCAGGCATCTGTGGTGGTTGTTGATTCTTAGGACCCTTCGGTTGAAC CATAGTTTGTGATTGCCCTGGAGTTGGAGGGTTCGGTACATTAGGAGGCG GTTGTGGTTGTTTCGGTGGTTGTTTCGGTGCTTTGGGTACTTGCTGTGGA GGAGCTGGTGGCTGCAGTTGGTTACCACTACCTTCGTTCCCAGGTTTGAC ACCTCCAGAGATAGATCCACCTGAGTTTCCACCTCCTTTCTTCCCTTTCG ACTTTTTACCCTTCTTCTTCTTTTTCTTTCCTTTCTTCTCCTTGGAATCT TTACCAGCGTTCTTCTCTTTCTTCTTGTCTTTTTCCTTTTGAGCTTTGGG AACGATGGGTTTATAATTACACCCACTTCCAGATGCGGAGCCTGCTCCAC TTCCAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004788TCONS_00004788Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000048supercontigsc0000048:335584..344091 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0.13 0.08 0.18 0.39 0.01 0.03 0.11 0.04 0.1 0.14 0.08 0.1 0.12 0.05 0 0 0.06 0.06 0.01 0.05 0.33 0.43 0.01 0 0 0