XLOC_003964 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003964
Unique NameXLOC_003964
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000073:665629..674272-

Legend: transcript
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_003964 ID=XLOC_003964|Name=XLOC_003964|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8644bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073:665629..674272- (Clytia hemisphaerica)
TGAGGTTACCTACGTTTTCTACCATGAAAACACTGTCTCTATGATAAGGT
TGGAAATTATTGATACCGTTTTTTATTGAAAAATTTCATGTTCTTGTTTG
GTTAAAAATCTTTTAGCTATAGGAATTTCGCTCAAGGGGGTTTTAATATT
TTAATTATTTTCTTCAGTGAAAAAGATAAACATACAGAAACATATTTAGA
TAAAAACAATGGATTGATTGAACTTATTGGTTGACCAATTTGAATGATGG
GAGACCCCCCTCCTCCTTCATACGATGCGGTGGTATCTGGCACGTGGCAA
GGTGGTAGCCAGCCTCCACCTGAAGGAAGCAACCCTCCCTACCCTTATAT
CCCTAGTGCAAACCCAGATCTGCCAAATCCTTCAGAATATCCACAACCAC
CAACAACTGCACTGTACCCGTCAGCTCCTATTTACCCACCAGAGGAAAGC
TCATCAATATCTCCAACGACACACCTCCCTCCAAAAGACGCATCATGGAC
TAGGAGTAGAACACTGTCTGACACTGATATCACCTCCTCCAGGTCGTCCA
TCCCTCCTTCAGGGCTCACAACGGAAGCACCACCTGACTATGGGTTAGTG
AGTAACAGACTGAGAAGCAATAGCTTGGACAGCATGAGAAGTATGATCCT
TCAACTATCAACAATACCGCCAAGACCTAGAAGTATGGGAGAAGTCTCTC
TCGAACTTGAAAGCAGTAGACGCTCCAGTGTTGTCACTAATGCCACCTAC
CAGGGTGCGAACAGTCGACGAGCAAGTTTGGCCACCATAGGTGCTTCTAT
GCTTGTCCTTAATACTGTTAATGCTACAGGGAAGGAAAAAAGAGAAAAAT
TTCGTGAGTATATCTCTCAACTATGCCTTTAAAAAAATTTCTAGTCTTTT
TTCGTCGACTATCGTGACGTTATTAAAAACTAAATTCAGTAGAATTATTA
AGCAGTTTTATATGCAGGGTGTCTCGAAAAAAAGTACTGCCAGTTCTATG
TGTAAGTAGAAAAAATGAGTTTGTATTACCTTTATAATGGGATAAACTTT
CGCGGGGATTAAATTTCGCGGATTTCGCGGATTTGGGTGTCATCCGCGAA
AATCCGCGAAATTAAGTCCCAATGGAAATTTNNNNNNGAAATTAAGTCCC
AATGGAAATTTGGAAGGGCCTTATCCGCGAAATATTTCTAAACAAAACTC
AAAATATGTCAAATAAATACTTTTTGAATGGTTACTTTTATCAAAGAGGC
GCAAATAATGTGTATTTCAACAACCAACTTGTATGATTTGACAGTGAAAG
TAAAAAAATCGTGAAAATATTGACACCCAATAGTGCCACCCACGAAATTA
AGTCCCCGCGAAATTTTTAAATTTCGCGGATAGGCCCAACCGCGAAATTT
AATCCCCGCGAAAGTTTATCCCATTAAAGTACCCTTTTTAAATTTCTTTT
ACTGAGACCAGTTTTTTTGCGTTTTGTGTTTCTTTGTTCTATCATATGTT
ATAAGTAATCAAGTTTTAATTACAGTTGCTTTAAAAAAAGTAGCTTTGTC
ATATACACATTGACAAAATATTTTTCTACTTATATAAGTGGTCTCACACA
CTACTCTATTTGGAACATCCTGTATATTGACCTTTTTTCGAACTGCCATT
GTTCTTTTTACTATAAATTCTCCTGAAAAAGAGAAAAAGGAAATTCTTCA
CTAGTCAGCTTCAGGTTTTTGAACTTCTTCAACTTGAGGACGAGTTCATT
TCTTACTACAACCATGTCAAATTCACTCTCTAGAGAAAATAGAGTATAAT
TATGTTGACATGGTAGAACAGGCTTTATTCTTTTGTTTTCATTTTTTAGA
GAAATACTTCTTCCTCTGGTGCTTTCTGTCCTTTCTACCTGGAGCCATGA
TTGTGAGGGGTGAGTTCATTTCTCATTTGGATGACGTGTAGTTATGAACT
GACTCCCAAGTTTACATACTTTAGGCGTACAAACTTTAAGCCATTTTCGC
GAAAGTAAATGTCTTTGAAATTTCTTGAAAGAACCATTCGCAAAAGTTTA
TGCTCTTGAAAGCTTCTTGGCAAAGTAGAAAATCTGTAAAACCTAAAATT
ATAAGTCAAAAGACAAAGGTTCCCAATTCAATTTAAGGTCTTGATTCGCG
AAAGTTTTTGCGCAAAAAGAATTTCGTAAATTTCACGATTTTTCGACTTC
GCGAAAGTTTTTTTTTTTTTGAAAATTGATTTTCTATCATCGTTCAATTG
ACTTGGGAATTCAAGAACTCTTTTTCATTGTTTTTGCCTTTATAATACTT
ATAATAACTTTAAAAAATGATTCCTGCAGTGACGTAGAAAAATATCATGT
ACTAAGATCACGAATCCTATGAAATAGGCTAATGGGTGTTATCAGATGGT
GCATTGGGGTCGCGGCGCCGCGTATTTTTTTTCCGTCAGCGGTCTAAACC
CAACTTCAGCGGTCGAAACCCAGCTTAGCGGTCGAAGCCCAACCTAACGG
CCGAAACCCATTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNTCACAGTTGAATGATTCTTTTGTTTTGATAGCCCAC
GAGCGAAAGAAGTCAATCTCAAGCTTTTTCGTCGGGATTTATCTATAGGA
ATATTCTGACAATTAGGGTAGGTGATAGTTAGATTGATAATTACTTTTAA
ATAATATATATTATCCAAGTTTTCAAGTAAAAAAATCAAACTCAAACTCA
TGTCAGTGATCATGATGCCGTGTTTGCCTGCTTGAATACTCGTGTCGCCC
GATTCGAACCACGGTACAAAGTAATACGTGACATGAGAAACTTCAACTTA
CCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAACATTCCGTCACTCCTGAC
CAATTCAGACCCGTCACTGTTTTGCCTATCTTATCAAAACTTTACGAACG
TTTAATGGCAAAGCAGATCGTTGAGTACATTGAAAGAAACCAGATATATC
AACAAACCATGTCTGGTTTCCGCAAGCGTCATTCTACCGAAACGCTACTA
ATGAAGATACGAGACGACATCATTGGTGCGATGAACAAAAGCGAAGTCAC
ACTAGCCGCCTTTCTTGATTATTCCAAAGCCTTCGATACCGTCGATTACA
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTGG
GCTTCGACCGCTAAGCTGGGTTTCGACCGCTGAAGTTGGGTTTAGACCGC
TGACGGAAAACAATACGCCGCGGCGCCTAGGTCCCTACTAGTTGCTCCAA
TCAGAGAAGAGTGTGACAAACGTATCCATTCCTCTGGAATTGCCGTTTTA
TTTATACAATACTTTTGTTCCATAGGATTTCTTGACAAGGATTGCTTATT
TGATCCTAACATTTCGTATTTCCTGATGACGTCAGGTGGAGTGACCATGT
TGGCGTTCGCTGCAATTTGCCTCTACATCTTTTTGGACGAAGTTAATGAA
AATTCCTCTGCAAAGTTCTTTATGTATCTAGGTAAGCTGATCAATTTAAC
AACCCCCGTTTACAAACCCCATATAAGTCCCATTTACAATGGAGAAAAAA
CAAAAAAAGAAAAGGCTAGATTCAATCCGTCGAGAAAGGCGGTTGAAGAT
TCTTCTCTAGCCCCTTTGGTGTTTTAAATTTAATGGATCAACTCTGCTCT
CACCAAGTTCACAGTTTTATCACTCTAACTTGTAGGTGTGTTTCTATGGG
CGTGTGTTTTTGGTGTTCAAGTTTGGGGAAGTACTTTCATTTTTAATCAC
TGGACCGAGTGGAAAGACGATTTGCATAACTTCCCTTGTGATGTGGATAA
TTTCAAACTAGCATTCAGCTTGCTTGTTATCTTTTGGATACTTTTCGGAT
TGAGCCTCAAATGCTTCAAAAACGATTAGTCAATATCTAATATATACTTA
ACATGAGCTTGGTTAGGGATTTTTTTATTATTTCACAGTTAGAGGCACCA
GTAAATTGTCAATTTTTGAACAATCATATTGTGCCGCACAGTAGATAGAA
GCAAAATATCCAAAANGGTTAGGGATTTTTTTATTGTTTCACAGTTAGAG
GCACCAGTAAATTGTCAATTTTTGAACAATCATATTGTGCCGCACAGTAG
ATAGAAGCAAAATATCCAAAATGCATCTGTAAAGGGTTGAAAAAATCAAA
CTGCGCTGTAGGAAATTTTAATGTATCCAGGAAGACCGAGAACTTTGTCA
AGATGCTCTAAAAGGATTGGCTGTTATTGGAAAATGCACTCATTTTAGCC
TGGGAATCTGTTCTGGACTCAAATATGGCAAAAAATTTCAGCATATGCTA
AGCATTATCACGAACCTACAAAAAATGTATTTTTTCGACTTTGCCTATTT
TTGGCTGGGATATTCGGAATTTCCCTAAAATTTTGCTTAGGATAGCACCC
TTCAAACATTTTCAGCTCTTGGGCTAATCTCCAAGCCAATCTTTTCAGCT
GTACTGTGCGAGGGTGCAATTTTAAAAGTCATTTTTATGCTGCGAATGCT
GACTTTCTTTACATAATGCAAAATATTATAAATTTGATGATTTCATACGA
TATATTAATTTATCCTTTTTCATATTTTGCATAATTTATTTTTGATAAAA
CAATAAGATATTGCACATAGGTATAACTTGAAATAAATTCATATTTATAT
TTTATATCTAGAAAATTTAAATTTAAATTTATAAATGAACTTTTGTATTT
TTGTATATAAATCAGTTTAGAGACAGCTGTTTGCACTCAACTTAAGCGTT
ATTCTTCTCCTCGGCCAACTTTATATCCTTCATGAGGCCCCCCCCAGCGG
TTTGCGTGATGGCGTGATTGGGACTTTTTTCTTGCGTGATGGCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007093TCONS_00007093Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000073supercontigsc0000073:665629..674272 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
12.76	13.7	5.51	2.5	10.73	8.33	6.06	5.76	3.85	5.67	4.49	2.98	8.18	7.18	2.43	2.44	9.6	12.13	8.79	9.68	19.56	18.34	13.64	16.46	11.29	15.15	7.07	5.78	4.66	5.41