XLOC_004441 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004441
Unique NameXLOC_004441
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000080:320483..341185+

Legend: transcript
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>XLOC_004441 ID=XLOC_004441|Name=XLOC_004441|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20703bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080:320483..341185+ (Clytia hemisphaerica)
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TATTGTCGGATAAAGCTTACTGTGTTCGGTATAAACAGTGTAGCTTTTTA AAAACCTCACGGTTGATGAAGCAAACACTTTAAATCAAACATCCAAAGCT CTTACTCGTGGCCTAACCTTGATTCAAGAcacgtttttaaaattttctaa tttcaacgtatgttttaaaaacagcgcTTTAGCCCCGGTAGTACCTAGGC CAAAGAGATATGGGGATGTGCAAACCTTTTTTATGTTGAGAATGTCTGTC AGGTTTCCGTCAAAACAAGGCCAAAACTGCTTGAACGTTGAGGCAGACTG GACACTACttcaggcgtacaaactttcgcgagcagaaactttcgcgattt tcgcgaaagtaaatgcatttgaaaattcttaacaaggtgatttgcgaaag tttatgctcacgaaaaattctctcaaaagTTAAAAATCTATCCAAAGCCt ccaaatcaaaatcaaaattagtaATTGTTGCGTTTTTATGCCTTAAAAGC GTCATTGAATTCATATAGTGCCAGTTTTAATCAAATCCAAGGAGTAttta cgtcacttttaaattgtttttggtgaaaattctcattttgatcatccaat tcgcgaaagtttttgctcatggaaaatatctttcctcgaattcgcgaaag taaatgccgtaaatttcgcgaattcacgacctcgcgaaagtttgtacgcc taaagtaaccaagatctttttttctttagtCACTCAAAGTGGTATTGGGG AACGAAGCATCGAATACGAATCAGTGAATACACCGTTCATCCTGATCATC CAAATATGGCTGACCACAGCTCAGAGCTACCATTATTAGAAATCGACCAA CCCGAACCTAACCATAATGGCGGTATGCTGTTATTCGGAACTGATGGATA TTTATATGTTTTCGTGGGAGATGGCGGGGGTAGTGGTGACCAGCACGGTA TCCATGGCAACGGTCTGTTAATGTCAACCATGTTGGGGAAAATCTTGAGA ATAGACGTTAATGTAGAGCACAAGAAATACGGCATTCCCAAAGATAACCC GTTTGTCAATTTTCGCAATGTGAAGGATGAGATTTATGCTCTTGGGATTC GAAACACGTGGCGATGTTCGGTTGATTTGAAAGGGAATGGTAGAATGTTT TGTGGAGATGTCGGACAGAATCGCTTCGAAGAAATTAACATCATTAAGAA AGGACGAAACTACGGTTGGAGAGCTTATGAAGGTTTCTCTTGCTTCGATA AAGATCTTTGCCGAAGGGAGTTAAAAAACCTAGAATTTCCCATCATCGCA TATCCGCATTCAGTAGGACGTTCAATTGTTGGAGGATATGTTTATCGGGG ATGTCAAAATCCGAATATGTACGGAAAATACTTCTTCGCTGATACAATGA ACGGAAAGATATTCTCTGCTGAGGAGAATCCGGGGACTGGAAAGTGGGAT TATCGGGAAATCAAAATCGGAGATGAGAAATTTTGTAATAACGGTTTTTC CAGTGTTTATCATAAGGCAATCTTATCTTTTGGTGAATCTGAATCGGGCG AAATTTATCTTCTTAGTACACCGAATCCTCATCCTGATTTTGAAGGATCG GTTTTGTTTCGGCTCGTTGACCCATTGCGTCGTAATGATCCAAAGCAATG TGTCACTCGTGTCATCGAGGCAAAACCAATAAAAACGATCAAAAGACGTg ctattttcgaaaaataccaaaaagagAAAGACAAAGTGATGAAATCAGGG GAAGGAGATGGGAAAGCAAAATGTCGTGACTCGGGCAGCTTTTGTAAACA TTACAGACCGACTAAAAGGAGAAAGAAGCCGTTATTAAGTTGTTTGAAAA CTAAACATTTAAGCAAACGATACTGTCCTGTGACATGCAATTTTTGTCCA AAGTAAGAAAACGACGAAATAccttcttttttataattttcagaaGATGA ATTTGTAGTTTGTAGAGAATGTAATTAGGGTTAAAAGCGTTGTCTAGGTT TTACCGTAACATTGGGATATAGTATTTGGTCACCTTTACTTACTCCACTA TCAAAAGATATTCTAATATATATAACTCTTATAATCTTTTCCAAACATTT GCAATTTTGCAGcagttgaaaattgaatttttaaaccGTCTCCAATTTAG ATCTCGgatgtaccttatcggggaaaacttcgtcggggaaaattttcgtc ggggaaaaattcgtcacttgtccaaaatttcgtcacttttccccaacgaa gttttccccgataaggtattgtcCAGTTTCTTGGACAATGAAAAAATGTA GCAGGGCTTTTTGCTGACGTTTCATGTAAGGGTGAGAAAATTGGAGAAAA GATTTACGTAATGattgtaagcaaaaaaatggaaaatggtTAGTAAGGTG ACCAATACTTTCTTCCAATGACGTAAaagaaacctttaaaaaaaccTTCA TATCAATGTCCAATATTTTTCATCGTGTAAATTGAAACGCAAAATGTAAC taatttgttgtatttttttggaatttcgtttttgacgtttttcaatCAAA GTCTGACATCATTAAATAATAACTTCGTTAGAATTTCCCCTGATGCAAAA CGGGAAGGCCCTTTTGTGGAAATTTGCAATTTCAAACTTAAATTAAattt aaa
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007824TCONS_00007824Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007825TCONS_00007825Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007826TCONS_00007826Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007827TCONS_00007827Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000080supercontigsc0000080:320483..341185 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PUS3tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
12.11 10.71 7.76 7.95 14.08 10.9 9.72 10.03 7.45 7.63 8.16 6.97 9.7 12.16 8.81 9.81 8.16 7.76 5.26 8.54 8.98 8.56 11.63 10.81 11.05 10.89 6.35 4.78 6.98 7.49