XLOC_004659 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004659
Unique NameXLOC_004659
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000084:586870..594445+

Legend: transcript
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_004659 ID=XLOC_004659|Name=XLOC_004659|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084:586870..594445+ (Clytia hemisphaerica)
TTCAGTAATAAAAGATgaataaaagtgaaaataaaaatgaaaatgaatca aATACAATATGGAGCTTCCATCATGAAGAGCTGTGCATCGATGCAAATTT TCCTAAGCTCGGTGGTGTTTGCTTTTAAGGAGGGTTGCTTTTCCTTTTGA CAATTCCTCAAGAAAATGATTTATGGTAAGTAGAAAATGATTCAAAAATC AACGATTTTGTACAGATGAGActgagtttttataagatactttaataatt tgGTCATtttaagtaataaaaatgacgcgttcattaaaagtgacaaaatt tgTCTTATTACTGGTAAAACGACCAACCAGATCAcaaaagagcttgtaaa aactccatctcgtcccattTTCCAATTATAAAAAAGATCCTTGTGGTTTG CGTCAGCAAGACCATCTTTTTCCCCCTATCCCAGATTACCCAGTGAGAAC TTTTTAGCCTGTGGTGCAGTGTGGTTATAAAACGAAGCAGATATTTGGAA ATTTGAatgcaaatatttttttgctaacAAAATTCGgtcattttattaaa agttattAACTACACGAGGTAACGTGGTgacataaaaaaagaataaattg atttttatgaTACACGTTTTGAAGTATAtgtaaaaaacaaagatttcgag GCTGGCCAAAGTTAATAATGACATTGTGAATACACACACGGTGAGCTGCT GTGAGCATGTTGtgatttttagtgaaaatactctcaaaatatgcttaaaa tattttatgcTCTTAGCCCAAAAAATCTTAAGAATGTTTATTCAATAATA GGTATATGATGTACAGGTTTACACTTTATCTTATGCAAGGTTGAATATTG TATCATTTTATCTTTTAGATGGAAAAAAGTGGCTGGATATTTCTTATCTT TGAAAACTGCTGATGTATAAGGTAGTTATTGGTGTCATTATACCCCCATT TATATTCATTATGCAAAATTCACTCTTTTCAAATTCACTCTTTTCAAATT CGATCATCACTTTGCACAGGATATACATTAGCTGTAGTTTAGACGGgcca ctttttgccctgcctattaTAATTGTGAACTAAAgagggcataaagtggg ctgtctccACTTGCGTGCAGTGCGATCGCACCTtctggcttcaatccttt ttgcttggaaaaaagattacatcataaaaatgtagcgcgcgctcgaaaaa aaagttaaacacaTTTCATCCTTTTTTCATTAcatcagatcgcgccaatg gaattgctttatttttcttttgaccaatagcgtggaagctttgctcgaga AATTgtgatcgaagcgcgcgcaagtggagaccagtcttaaagtcaatgca ttgccatCTTTTGACGTccatgcaatgacttctttcaatcttttccaagc gAAGATTTTAGCTGCCAACTTTGCctattagaataggcagggcagaaagt cggccgtctaaactagagcatACAAAAGGTTCGACCCAATTAAAATTAGc taaacaatttttgtttttgacgtTGCAAAATGTATTTTTGAGTAATATGA AAGCAGTACTTTCAAAAGTCACTAATAAATATTCCCATCGGGACATGTTT AATTTCAAATGATATTAGGTCTCCTTAGAAACAGTATTAATGAAATTGCC AACTTTTAATTATGGTAATAACGCATCAAACGACCTTATAGTCATTATGA AAATCAATTTACTACCGACTTTAATTGACTTTCTTAATCAATATTGTATG TGTTtctcttgttttcattttagttgtGAAAGCAGTTGGAAAACGTGGTG ACCACATTTCCATTTGTTGTTGATACGATATAACGTTGTGAAGATTTCAT TTGGTTGGTTTTCTTGACTTCAACGATAGTAATAAGTAAGTAAATAGCAC TTTTTTGAggaataccttattacacaaatattactaggtAAGTATTTAAT GGCCTTAAATTTACAGGATCTGAAATTAAGacgaatttttctgctttttc aaggaaacagcgGCTGATTTTAATTAAGGGgctttttattaacacgaaat ttttcaattcgtgttagtaaaatgactagtaatattcgtgtaataaggta tttagAACACATTTCATTTTCAGATCATTTGGAATATTGGAAATTTATCT TgagttttcatttatctttaCAAAACGCCAACCGAAGAACCAAAGATTCG TTTGATTAGAAATAAAGGCTAAAGCTTAGTTAAAAAAATCGAACCGTccg ttaaagaaaaatttaaattttcaacaaagaaaacagttacagttgacgct ctctaatttgatcttcGAGGGGAATCGGATtatcatcgaataagggagct catcaaataagggagcgtcgtttatgagggttttcttgttgacggggact ttaaatttcatcgaataagtgAGCCTATAgcagaacgtcgaattagacaG CGTCAACTGTGTATACAATTTCAAGTTGAAAAAAGACAGAACCACGTTTA AAAAACTTTATACAATAATTGTAGTATTACCATGCATGACTATTTTAATT CGTCTGGAATTCTTTTGAACATAACTTCAGCTCATGCTAAGCTTCCCAGG ATATTAATCAAAAGATTTAAACGATTAATCCGGATAGATTTGTCTAATAC TGACTGACTTAAATGCACTCTCTCTTTATTTCTTATAGAGCAATtctcta ttgtttaatttatatcGAAATTtgacaaatcaaatcaaatcatgaaacac ttttctttttacatGGTTGATTATATTATTCTGAGTTGTGCTTGAGACCA ATATTACTTTAATCTAAAGTCACCcgtgattttccaaagcaaaaaaaatg ttgataaaactATTGATTGTAATTTTGAGGGTTTTTTTGACATTATAACC GTGGTTTTTGTATTTAAAGTTCTAAGTTTGCAGTATTACTGGCTTTAACA TTTCTTTCGCCTGGTATGATATTGTGTAACAAATGTAGATAAGAGTATAA TTTCTCTATATTCTCTCTAGTCATCATCGCCAACCATCGTCTTTTTACTG AAgacttactcttaggtgcccaATAAACGGGGAGGTGGGTGTTCGAATAA ACAGGGGgttcaaataaacgggggggggaggttggaaaattttcgaaatc ttcataaacgggggggacctaattgccggggggggttggaaaattttcga aatcttaataaacgggggggggaggttggaaaattttcgaaatcttcata aacgggggggacctaattgccggggcgggttggaaattgtacttatgaaa acccaaaataaggtaaatataggctaaaataaggctatttagagcaaaat agggggccttctctttgacagctgaaaatattcataaaaattaataaacg ggggggggtcctaataaggtccgggggggttggaaaattttcgaaaaatt aacaagttaGTAGTACATGGGGTTGTGAGTTTACATGAATCATTGCGAGT TTACATGAATCGTTGCAATCAGGTTTTCTATTATTTAGACTATTTGTGAA TGGTATGAGTGAAAAGTTAGACTCTATCATTGATTCTGGATATCAACTAA CTGATAAATAGCCCTCAAAGTACGAAAAGTAATCAAGGACAGCTTATGCT TATTAGTGGATGTCAACTAACTGACCAGTCACGagtgaagattttttctc atgGTTCCTTCAAGTTTCcctcaaaattcttttttcttagatGTCAACTA GAGCCAGTGTAGATGAATTTTTCTCATGCTCTCCTCATATCAAGATTTTG TTTACATCTATAGCAAACCTAATTCATTAGCAACAAGTGTTTAATTAGCT AAGGACCAGGAAATTAGATTGATGTAATCATTATAAACGACTTCTTCTCT GTTCAGTTGAAGTTGCTGTGTATAGTTGAATTAATTTGTTGCTAGGAGTT TCTTAAAAacttatttatttgtttttctttgataaAGAAGCATGTACAAT GAATTGCAGAGTTTATTCtcagtttttaaaagaaagccACTTAATAAGAC TTGTCTTGATCTGACTTATTTGATATGCGTTCTTTGGGAGAAAATTCTTA CTTAAAATCGTCCATTTTTTTACACGTATTTGTGATAAAGATGTCACTTT AGCAACGTATTTCTTTTTATATGTTTATTAAAAATAATGCACCAATGACG TTACAGtgatttgaatttatttattatctcTCGTCGGTTATGTAATGAAG TAATTTGTTGTGATTATGTCTGGGTCAGCAGTGCTGTcaacagtctttcg attgtggCTTATTTCTGGTCTGTTGTTCTTTTTTGCTATTTGGTTTTCGG CGTTAATTGGTTACGCGTTTTTAATAAGAACGTGAGCATTATTGTGCGAC TTTTTAAGAAATTGGGTTTATCAGAGTCCTCGAAGTCTTAGAATCTCCTT AAAATTTCCATATTTTGTCCAAGCCTGTTGTATGttccactcctttccct ggatttcttcaCTTACCCTTGACCCGTCTCTTTAGGTGCTGAGTATCATA TCAAGCAGAGGCATTAattaccattttgggaatctttggtatgacccggc tggggatcgaacccataaccttgcgcaccgtagctagATGCTCTACCTTT ATGCTACGGCCGTACCATATTTGAGTGAATAATTTTTCTGCAGCCAAAGT TAGTTTGAGATTGAATACAGTGTATACTGTAAATCATTTAGATATAATAC TACAGAATATTTGATAGGTAGAAATTTGAAAACCTCAAgcttctttctct ttttttacagCTTTTACAACTTTAGAccttttttttctcaggaaATAGTG CACGTTAGAAATGTCAGAGATTCTATTTGAGATAGGTTTCTCTACCGAAC CTTTTTTAAAAGCATAATTCACCGTGGGCAGGCTACTAGACATTAATCTC GTGGCAAacatcaaactaaaaatcacaGAAAGACGGAAGCTATTTCAACT CATGACTTgcatgattttttataagaacatacacaatgtttgaagccttc agatgttcttacataagttttaaacctaaattgttcttaacatgttcttt ttttcatcgttttgtgagcatttttgtccattttcctaagaaatcgagtg ttgTACTGTctacaaagtcttaaaatgttctgaacttgttcttaatattt tggagATGGAAGCCTTATgcttttatatagtttgttcttataaaaatatg tgTATTATTaatgttgcaaaaatgttgCATTATTAGAGAAAAACGTCATT AacttattttattgtttttttcgcCAATTAAAGTAAACATTAGGATTTTT TCTGCTGTAAAAAATGACCCATCTCTTCTCGTTTAAGTGGCTTCTCTCTG TGTTGTTACAGTTGATATTTTGTGTGAGAAAATATTCGTTGTTTTTGATG GTCACTTCTTTGAGGTGTGTAATGAAGTGGTCATCAAAATATTTCTGTCA AAATTCTGTTATCACGTTAGAGAAAAGAAGTCGTATTTATTAATGGACTG AAGTATATTTACTATAGTTTTAGAAATAatctttttggaaaatcataatt tcaaaGTCACATAAAAGCTTACAGCTTGTGAGGGAGACGATGATCTAGGT ACAATTTTCATACATTGTCTAAAAACCCTTGAATCATAGTCAAGACCTGT GTTTGGCACTTTTAGGAGTTAATACCAATTTTGGATACATTGAACATAAG CTGGATTTAGATTTTGCTGGTTTTCTAGTTTAATATAAGCTATACGAATT TTTAAATCTGTGTAAAGGTGTGATATGGTTCTTACTGGTTACATTGTTTT AGTAGTTTGCAGTTGTTCACATGCTTGTCACAGCTTGTGAGATAAGAAAA CGTGTTCGTAGAGCTTATAAAATTTTGTTGAAGAGAGTTTGAAAAAGCTG GTAGTCGCTTACTGAAAAATTGCAAGCAAAGAAATATGGGGAAAGTCAAA GGAGCAAGTAATACCGATACATTACTTTGGTATTGCTTGTATATTAAATC ATGAAATATGGGGCAtaacaaattttttgatgaagAATGAATTCCAAATA AAGATTGACTTCTAAGATACGATACGAGGATTGTAACATAGTACCAAGTC ACTGTGGTAAAAAGAGTACTGTGAGCTATTAGTTTTATGAGAATGTCAGA CAATATCGTGACAAAGGAAGGtagagaaaattttcaacagttaTTTCCTT CGCTTTTATCACTAGATCAGTTATCGTCTATCATTCAGATTtgaataaaa caataaaacacgTTGCACACAGTACATAACCAAGGTCTGAAACTTTGAAA TaactttatttcttttctatattACAGAGAACGAATAAAACACACAATTG TCAAGATGACTTCAGACGACCTGCAACAAAAGCTTCTGCAATACATCAAC GAGGCGCGCTCAAAACCTGCACTCATGGCCGCCAAATTCAGTTTACTCTC AGAAATCGACCCAACTCTTTATAACAAACTATTCAAATATGCGTCCGAAT TATTAGACGTTTTGTCCGAAATTGACAATCCTGGTATCAAATTTTCGGAC ATTTACACTATATTGTCAAGTCCGCATAATGATGTACAATCAACCGTCAA GTTATCGTTATACATGTATAAATTACGGACCGGAACCATAACAGATTCGG AATTAGAGGACCAGCTTGCAAACACGTTTAACGAAAACAGTGTCAAGGAA CTTATCTGTAAAGGAATTGCTTCTTTGTATTGTGAACATTACGGAAATGC ATTCGCTTACCTGTCAGATGCTTGCGAACAAGATGTGCACACCGCGCGGT CAATCTTGTCCGCTTTTACTGTACCGTTTTTGAACTCTGTTCGTAGTGAC TTGGTCGATGCGCGTGAAAAACATTTGATTCCTTGTTCGTGTGGAACCGG AGTACAGAATCACGGTTTTAGAGTCGGGCTAGTGCACGCCGTTAAGACAG CAGCCAGCTGTGAGAATTTAGCAGAGACATCTTTCATTTCGAACCTTGTC AATAACAACTCGAGTAAAACAAACCAACCTAAATTGTCTTTCCAATTATG CCGTTTGCACCGGTTAATATCGgaattcgatgacgtcattcgaTTGTTAC AGAATTCGAATTTTGACCGTACACCCATATTGAGGATGTATCTGGATGCT GGTCGAAGTGATTTCGCGGACATGTTCATGGAATTGAATGAACGTTTGAT TGATCAGAAAGGTTTGAATAATTTCAATTCTGGTTCTAATGGTATTGAAC AGATTGTTATGGACAGGAGTATCagtgtttgaaaaaaatgttaagatttg ttttgataataaaCTTTTACACGGAGAATGTAAACTTCTTGATTAAATTG GAAGGCTACTGTCAACCTATTTCCCTGTTTTGCTTGCTGCTTACTGGTta cagggttcagacagaccctggaaaacctggaaatatgataaattttcaga aaaatcagggaaactcagggaaacccagggagaaaaattttttttcccag cgtctgctcagggaaactcagggaaa
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008290TCONS_00008290Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008291TCONS_00008291Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000084supercontigsc0000084:586870..594445 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.12 10.13 2.81 2.68 21.46 18.07 25.22 27.85 22.32 33.93 25.44 38.16 41.81 48.88 57.8 39.93 19.74 21.98 25.86 27.8 9.18 9.6 22.35 21.66 16.79 17.23 6.15 6.47 17.45 15.66