XLOC_005043 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005043
Unique NameXLOC_005043
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000089:69855..77913-

Legend: gene
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>XLOC_005043 ID=XLOC_005043|Name=XLOC_005043|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8059bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089:69855..77913- (Clytia hemisphaerica)
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GTGTGATATTAATTTGTTTATACCATCTACAACAAAACTATTATTTCAGA TATTGTAAAGGAATTGGTGATATCTGTTCACACAGGACAACATTTTAGAT ATCATATTTATCTGATCGTTTTTTCAATTTCTTTATAGGACTTTGATAAG TGCAGCAGTTCAGATGGATCAAGGGAGTGTTGATTTCAATAGCTTAGCTC TTCACTCCATTGGGAAATTTTGCTTGATGTTTTTTGTTTCAGCCATCATT GGAACGATCTTTGGTTTACTTTGTGCTTTGGTAAGTTGACCATTGAACAA TTTCTTTCCTGGTTGAATTACATATAAGATTACATATTTGCGAAAGTGTT GACAAATCACCCAGATGTTATTTATTTACCATTATTGGCAACTTTGTCTT TGCCATGGAAGTTTGTCTATTTGTTTTTTTTTAAGTTTGGAAAATCTATT TATCTCATTTTTTTCACTGTTTGATATTTCCAGGTTTTGAAACATATTAA TTTGAGAGTTCACCCATCGTTAGAATGTGTTACAATGTTCATTTTCGCTT ACATGCCTTACGGTCTTTCAGAAGGTTTAGAATTGTCAGGTAAGTTGAAT TATTTAAAGGTTTTAATGTCCTTCATTAATTTATTATGAAAATAATATTG CTTTTCTCGAAAATATTCACTTTGTCTTGACTAAGTCTTCAGAGCTTACA GAAAATTACTGATTGGTAATTGATCAAGCATATATATTACTCCACAACAT AATTTGATGTGTTTACAGGTATAATGGCAATCTTGCTTTGTGGTATCACT ATGTCACATTATGCTCATTTCAATTTATCACCGATGGGTCAGATAGCTGT GCAACATGTCTTCCGTGTTTTGGCGCTTGTTGCAGGTTTGTCGTTCTTGT AATCGCTATTATTTTTCGTTATATTTTACGACCATAAACTAGTAAATAGT 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TCAAAATCTTTGAACCCCTATAATGCATTTTGTACCTCAAATATTCACTA AGTCAGCAGGACCAACATTTTTTAGGTTTATACATCTAGCCAACTGGAAA CCGTTATGAACCGTTACGGGACCTCAATTCGTCCTGATTACCCATGGTTC ATTTCAACCGTTATATAGCCTATGTTGTTCATTCATATTATTTTTTTTCA GGTTTGAGAGGTGCAGTTGCATTCGCACAAAGTTTACATTTACCGTTAGC CAATCAAGTTTCACGTAATCTGATCATGACAACCACACTGGCTATCGTTG TTTTCACCAACGTTGTGCTTGGAGGAATGACTCTTCCTTTAATCAAGGTA AGAAGGTTCAATAAAATTAAGTGTGCAATTTGTGAAACTTTTACATTTAA CGAGAATTACTTGTCGCAAATTGCAAGAAAGGTTTTTCCTGAAATGTTGA CTTTCATTTATGTTAATTTTCATAAATCTGGAACGAATTCTCTTTTATTT CTATTAAAGAATTAAACGCATTCCACAAAGTAAAACACTAGGTAAAAGTG GATAAGTGTTTGAACATCCAGGTGGTTCACTTTTTCAATATTTTTTCTTC ACGTTTTAGTACTTTAACGTTCAAAGCAAACGACCAAAATCAGGAATTAG TAAATCTTTAGGAATGGTAAGTTTTGAAGGTTCTGTTTATTTAAAGTTTT CTGTTTAGATGCATTATATTAGATATTGATGAACTGCTCTAATGAATAAT TTCTCGATGAAAATATGATCAAAAATTTGTATTTGCGTTTCAAAATTTAT ACCAAAGTTACAGCGGTGATTTCAATACTTCTTTATAACATTCCTTCATA TTTTAGGGTCGAATCACCATGCCGGCAGAGGCGTCTAACCAATCACGAAT CTACCAACAGCGCCGTCGTAAATCACCCATGAGTATCATTCGTGGATGGA GAAGATTTGATAAGAAATATCTCATGCCTTTCTTTATCAGGACCAACGAT TCTAAAGTAAGAGACTCTTCTTGAGTAAACTTTCTCGAGTTTTGAACTGT TTAAAAAAATTTTGATTGGTAATTTTATATATTTTTTTCAATTGGTTAAA TTTAATACTCAAATAAATCATAAAACCACAATCTGAAATTGATTCGAAAA CTTTAAACGCTGGAAGTACGATGTGATAAGAAAACCTTCAGAAGCTTTAT AGTAGTGGTTCGCTAGCATCTCTTTGACATGAAATCTTCCCTTCCATCTT AGGATTATCGTTCTGCAGTGACGCACATGATTGATCAATGGGCGGAGAAT GAAGAGCGAGCCGCCCATCAATTCCTTAATTCTTCTGCTGAACTCGACGA AAATCGCCATCTTGTCATAAATCGCACACGAAAGAATATCGTTCGACCTG TCCGCAAATTCTTCCGGACATTGGATGGAACAAAAACTGAAGATGAATTC ACTGAAAATGAAGGAGATACTCCAGCTAAAGAACCTGATCGAGTGAGATT TTGGTTTCTTCATTAAAAGCTTAACGTTTTTGTTTACGGTCTCTGGTTCT AATAGGAGATCTATTGTTTTAATAGAACAATGAGAATGTTTAGGATCATT TCCATCTATAAAATGCATACGAAATGCACCCACTGCTCTTTCACCTAAAG ATAGTTGGACAGAAATTCTATGAATTTCTTCACGTATGTATTATATACGA CATGTTTAAAAATGGAATCTCATTGACGATAACTTTTCNTCATAAATCGC ACACGAAAGAATATCGTTCGACCTGTCCGCAAATTCTTCCGGACATTAGA TGGAACAAAAACTGAAGATGAATTTACTGAAAATGAAGGAGATACTCCAG CTAAAGAACCTGATCGAGTGAGATTTTTTTGAGAGTGTTTATGGTCTCTG GTTTTAATAGCAGATCTATTGTTTTAATAGAACAATGAGAATGTTTAGGA TCATTTCCATCTATAAAATGCATACGAAATGCACTCACTGCTCTTTCACC TAAAGATAGTTGGACAGAAATTCTATGTATTATATACGACATCTTAAGGA TGTTTAAAAATGGAATCTCATTGACGACAATTTTTTTTACTTTTTTAGGT TCGTTTTTCGAGTGTTAATGAAGCCGGTGAACAAAGGAACGGTTATGGAA GCATCAACCACACTAATGATGACACCGAAACATTGTTGTAAAAAGTAGGA AATTGGCTTTGGGTGGGATTGAAAAAGGTTGATGGAGATTGTTGCGTTTT CATTGTGTTTCATCTTTATTTATGAAGTGTTCTCTTTCAATATTGAGTTG AAATCAAATCAACATTTTAAAAATGTGTTCTTTTACGGGAAATCCTTTGG ATACCGATGTACCTTGTACGTTAAAATCGCGTTTTCAGCCCAATGGTTTT TAAAAATGACCTTTTCTGAGTGGACTACTTGGCAGAAGAAGAGTAAATTA TCATTGTTTTGATCATGGTCCAAATTTATTAGTATTACAACATTTACAAA TTAATGCATGCAGATTTTAGACAACATTCAGCCAAATTATTTATCGAAAT TGTTGATTTTCATTTGATTGATTTCGTTTGATCTACTCCCTTTTTTTTAT ACAAGCTTTTTTTATAATAATAACTTCTATAAGAATACCAGGGTAAGATT TCAGAGTTAGAACAATAGGCCTATTGTTTAGAACAATTGAAAAATAAGAA TAATTCTCACCCTCAGCCAAAGTACACTATTCTTTTTTTTAAAAGCGTGT ATTCAATTTCAAAGTATTTGTAATTACTTTGTTATAAGATAGGTCACATT TTATTGGCCAAAAGAAAATAAAAATAAAAATTACGATCTTAGTTATAATC GTGGACGGAACCGATGTTTCTCGTCAAGCCCCTTCCCCCTCACTTTCAGT CTGGCTCGAATTTCAGGTAGAAACATACAAACAGGTTTGTCCAAGATTGT ACTCTGGTATTATGCATGTACTTGTAAGAACATCATATCGTATTTATGGT AATTATCATTTTATTTATATTCACAAAGATTTTTGAAACGCAATTTTTAA TGATTTAGATTTTTAGCTTACTTTAAATAAAAAACACTAGTGAAATCGTT GTGCTTTTGTTAAAAAAAACTATTTGGGAATTGACAACTTTTGGAAAGTT TCAGCCTTGTTCTGAACGTTATACATAATTTTCTTTTAGCCATTAATCAA ATATTTTCTAGGGTTTGTAGCATCTACTTTTGTTGTTTTACATTGTTTAT ACATTTCCATTTACTTTTGTTATATATTATATCTATTCTTTCTAGGTGTA GTAGCCAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00009019TCONS_00009019Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00009018TCONS_00009018Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00009019-proteinTCONS_00009019-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000089supercontigsc0000089:69855..77913 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.62 7.71 6.05 5.94 38.94 30.22 18.1 18.54 17.74 21.97 11.59 13 19.92 16.81 12.07 14.83 8.49 8.47 13.7 14.16 9.81 9.19 6.09 7.36 3.76 4.91 4.84 4.26 7.43 5.73