XLOC_006715 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006715
Unique NameXLOC_006715
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000134:130792..160235-

Legend: gene
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>XLOC_006715 ID=XLOC_006715|Name=XLOC_006715|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=29444bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134:130792..160235- (Clytia hemisphaerica)
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AGCCTGGAAAATTTTAAGACTCTAGGCTCCTTAATGTATAGGCTATGCAA TAGAAAGACTTTGCATGCGTATCTCTTAGGGTTAATACCTTAATATGTTT AAAAACGTTCGTGAGTGATTGTGACCTTGAAAACCTTAGAGGCATTAGTC TCGACAAATTTTACTTTACTAGCTATGCTTACAGACGTGCTTGTCTGCAT AAATATCTAAAAGCTAAAAATTTTATCCAGGTCATTTGATTTGAACACTA TAATATATTAAAGGTACTTTTCCATTATCGAGCACCACTTAAATATAATA TAAATATAATTATAAACAAATATAAATATAAATTGACGAGAAGATCTTGA TTACTTATTCAAGGTCATGACTCAGTAAGAGAATCCGCGCTGGTCGGTGA ACAGCTTTGATGTTCATCTTGATTTCGAATGAAAATTTTGGCTATAAAAA CAAAACATTAGTACCGAAATCAAATGCCAATCTTAAACAAAAGAAATTAA AGCCCGGTCACTTTTGCTTTCGCTTTCGCTTTCGTTTTTAAAGAAAAGAC ATATTTCTGAGTGTTTTGACTGGACAACCATCCCCATCGCCACATCCCCA CAGAGTAGGGCGTGGTGTACGCAGAATGAATGATTATAACGTTAAAGATG AACGTTAAAACGACGTTACAATGATGTTAATTTATCTTTATCTATATTCT AGATTGGTCATACAATGGTCCGACTGGTCCTGAGTTTTGGCAAAAGAGTT TTCCAGTTGCCGCATCAGAATATCAAAGTCCTGTCAACATTGATACAAAG AAAATTATATACGATTCTAAATTGAAATCGCTTCTTTTTGACGGTTATCG GGATTTCAGAGGCGGAGCTAAAGTTCTGTTACAAAATAATGGATCAACTG TCAAGGTATGTTTCTCAATTTGTTTATTTTTTCAATCGATAATTTCTAAT TGAACTCGAATGTGGCTGGTCTTTCAAAATTGATCTACTTTAATGATCTA TTCCACTGATCTCCAAACCACTTGGCTGGATTCGGATTTCGCTTCCTATA ATAACGAAATTGTATCTAGTCTTTGAGCTGACTAGTCCGCCATTTGTTTT CTATTCTGCTTGACGACCTACGGGATTGGAATGTTTGAATTTTTTTCGAA AATCCAGTGTAAAACAGAAAACAACAAGTTGAATTAGTCGACCATAAAAC TCTTCGACGGGACACAGATTTCCCAGTTAGACTATCTAGTGTGTAAAACA CCCCTGTCTCACAGCCCCGGTGATAACTTTTCCTATCGAAATCTTAATGG GGGTAAACATTCTATTGTTACAAGTTTAAAAATCTAGTGGTGACGGTTTT CGAGTGTTTTACATTGAATTTCGAATGGTGATGAAAAAAAAGTCAATTTC CCAGTGGGGCTGAAAATTGTAGGATATTTTCCTACCGGGACGATATTTTG GCCACATTGTTTGTTCCTAAGATATTCTGTTTGAATTCTGTTTGACTCTC CTACTAAATCTATCTTTAAATCTATCTAAAGATACCCCCAAAATGTTTAA CAATCCTTTATCAACCTGCAGAATTGTATTTGCTTATCAAATTCGATTTC GACAAAAAATTGAAACAAAGTCAACAAAAATCTTTAAATAAAATATTTCA ATATTTTTTCACCTGTCGTCGTGTTTGGGAGATTTGTGTAAACAAGACAA AATATTTTGAAAAAACATCAAAAATCAACAACAGAAATTCAATCTACCTT ATTTTTCCAAAGTTTTCTCACGCCCTTTTAATTCGCAAAATCTATACGTG CTAAAGGAAAATTGTTGAACATCTTTAAACATTGCTAAATGTCCCTATAA AATATCTTCGTTTAAATCTTAACCTTATGATAATTTAAAGATATTGTCCA 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GTGCAAATTTCTCAATGATAATGATTTTGACTCAAATGGCATCTGATCCA AAATATTGAAATTCATTACAAAGTCTTGTTTGTTTCCGTTTGTTTACCGC CATTCAAAGAACACGCTGTCTTATCCGTAAACAATATGTTAATGTATATT TAACGGAATGGTTTTTTTTTCATGGCCATTCCATAATTATAATAGACGAT ATCGGCTTTCCGAATTCTCCCCAAATGATTACCCATGATAAGGGTTAGGG TTATCGTCCGTGAATTTTTTTGCGCAATGCATCATGGGTAATCATTCGGG GAGAATTCGGTTAAGCCGATATCGTCTATTAGTGCATTGAATTTTGTAAC CGTGAAGAGGCTAGGCAAGATAATCAAGCTACTTTACGTCTCATCAAAGA CGCAAATTTTAAAGTTTCCACTTTTCTTGTCTAAAGAAAAGGTTCGAAGG TTTGTTCATAGTTCCTTCAAGGTTTTAAATTCGATGACTCAAAGGCACTA TGTTAAGTTTTTAGGCTCTTACTAGATATAAATTTGGTGGTTTAAATTCC TATATCCTTAAATTTGAAATCAGCCATTAGACCAACGAGATCTTACATTA AAATGTGATTAATCAGTCAAAGCCTGCATGAAATGAAATTGAATTTTTTT TCTGGAGGATACAGTTAAGTCTCATAAATTAGAGCTTCTTTATATTATTC AAATCTTTCTTTAGTTCGAACTTACTGTTAGAGTTCTAATTAGCCAGAAT CTTGCAATGCGCCTTACAGTCATTACGCCTTACGGTTATCTTATAATAAT ATACCTCTTTTGTAAATATTTGACCTGATTGTGATGTGTACCCTAGACCA AATTTCTTTTAGGGGAAATTTTTTTATTTATTTATATAAACAAAGTTATT GTTACAGTAAATCCGGATTTTAAAAAATACAATTTTTCTTGGAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011971TCONS_00011971Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011970TCONS_00011970Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011969TCONS_00011969Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011971-proteinTCONS_00011971-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000134supercontigsc0000134:130792..160235 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.04 0.81 1.52 1.88 0.51 0.42 2.25 2.51 1.17 1.37 2.46 1.96 5.29 4.44 12.86 8.72 2.77 2.63 4.08 4.77 4.51 4.51 1.79 2.58 3.39 3.37 0.79 0.64 4.07 6.14