XLOC_007288 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_007288
Unique Name	XLOC_007288
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000161:114599..123726-

gene from alignment at sc0000161:114599..123726-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_007288 ID=XLOC_007288|Name=XLOC_007288|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9128bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000161:114599..123726- (Clytia hemisphaerica)
TTGTTGTTGAGTGAGTTTTGTTCTTAATCATATCATTATATCTTCGTAGA
CTTCGTAGGATATTCAAAAAAAACGTAAACAACTATATACAAGATGGGTA
ATTGTTTGTTTTCTTTGGGTTCATGGTTGATAGACACATTAGGTTTTGGA
GTCAAACGAAGCAAAGTTCCCACAGATGACGAAGATGATGATCATATCGA
TCGAGATGAGATTGTTATCACCAAAATTGAAGAAATGGAAGCATACTGCA
AACCATTAATTTTCTTGCGATTCTGCGGGCAGACAAGTAGTGCAACTGTA
AGTACTGATTGATGATAACAAACTTGAACCCAGTCCCTTATTTCGTTCGT
TTTTTAGATTGTAGCACTTCCATCAGTATAATCTAAAAGTTGTGGCTCTG
AGTACGAGATTGTGATCTTTATACTCTGGATGTAATCACCCCTCACCCCG
TTTTTTTTGTATACCTATATCTTAGTTCCAATGACCCCCGATGATCCCTC
TCAATTTCTTACATCCCTGTCTCAGTTTTTTGGTGTAATCTTATTAGCTT
TCTCCTATTTTTGTACCCCTATCCCAGGTTCCTATTCATTTTCAATTCTT
TTTGAAAATTAAATATTATTGTTCTTACAATCTAGGACACGGATACTAAT
GCAGAAAAAGGCCCTCAAAATACCGGATCCTACCTCCAAATGTTGGATGC
TTTGATTCGAACCCTCCCTAAAGATGAACTTAAAGAAGGATTCTGTCAAA
CCAAAGCTTTCCAAGGTTTATTATGGAAGATTGCTGATCGAAGACATCGA
GATGAAGAATCTGAGCAGAGATGTTATAGGAGATTGCTAAGAGATTCCAA
ACGATTTGAAAAAGTCTTCCTTGAACGTGCAGGTATGAAATCAAATCAGT
AGCGTGATGGCATGCCAGGGGGGAGGGGTACCCCTTTGCTTTTTTAAACC
TTAAAATTAGCAGTTTCAGTCAAAAAGAGAAAAAAAAACAAAAATTGTCG
TTTCGTCTAAAGATTTAACTTTGCAAAGGGGAGCAAAAAAACAAAAACGA
AAATTTCCTCTCCAGATTTGGTCGACCCATAAGGAACACTATGATCAAAT
GTCCCATTTCGGACAATGATATTGATGCATTCTACCCAATCAACGGATTA
GAATAGGTGGATTAAGAACTCATAGAAAACACTCCTCGTTAGGTTATCAA
ACTTTTTTACGAGTTTGCTAGCAATTAAAACTTGATAAGTTGTANNNNNN
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CCGCCACTCCGTCCGAAAAAAGGGCCGATTCCGCTCCTCCGCCAACCATG
AAACCCCCCCAAAAAACAATTCCCATTTCCATCTTACACCTCCTAAATGT
TAAGAACCGTACCCAACCCAGGTTTTTAAATCTGATCGAAATTCGTTATC
AATTTTTTATATTTAGCCAAGAAAGCAGAAAATCAAGAAGAGCCTTATTC
AGAAGAACTACACGAACAACATGCTGAATACTGGGGCACGCGGCAACAAT
TATTGGCTGGTAAAGTCATCTGTGATTGGCTCTCAGAGGACGATCAACCA
TCTATGGACCCTATCTACGGCGTCTTATTAAATCCAACTGCCGGCCGCGT
TGGGCCAGGTGATTCTGGTTTTGTCCATAGTTTATTATACGATAATTCCG
GTGAATGGGCTCATCATTCGGCTGTTCACGATGCTTTTGGTTATTTGTTT
ACATTTCATCAACTTGGGCCGGGGTACAATTATATGTATCGATCGTTTTT
CGACGCAGATAATCCATTGGCTGGACAAATCTCTGGTATTGATTTTTGGA
AAAAATATGTGGCTGAAGTTGAAACCAAACTTAAAGTCATTGAAAATTTC
CGCTCAGTTTGAAAAAACAAAATTTTGTAGATAGACTTTCTTTGTATCAT
TATTTGTTAAAAAAACATAATTGAATTTGTGTAAATATAAACGCAGAATT
GTCAAACGTATTGAGCACTTGCAATTTTTTTGGAGTTTAAGTTTTGTAAA
AACTAATATTTTACTATGTCTTAGTTTCAAGTAAGTTAACATTTTAAAAG
TTGAAATAAACTTTTTGTCAAAACCTTTAATTTAAATATTTTTGGTGCAC
TATGTCTCAGATGAGCACTTTGATATGCTAGTGCAGTACAAAATNNNNNN
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TTTCTTGTAACAATGAGAAGACAATGGATCTCTCTTGGGAGCAACGAGAG
AAGTTAATCCACCTATTCTAATCCGTTGACCCAATATACTTTGAAATTGA
GATCTGCAATTCAGTTTCGAGAAGAATGAATTTGAAAAACGAGTCAAAAC
ACTCATCGTTATTGACACATGAATTCTACTAAATAATGAAACTTGAAACT
TTCTTTTGGGCTCTTAATAATAAGAGGGTACGCAGTAAGGCATCAATTAT
TTGAAAGATGACTGCTAGACCATGACGTTTAACCATTTATTCAGACAGAA
AAACCCTTTCACCCTTTCATTTTACGGGCTGAAGAGATGCTGCAGTGAAT
AAATTTTGATAAATTATGTCCCGATTGATTCCGAGAGCAGCTCATACTGT
ATTAACGCTTGAAAACTGAAGGGGATTCGATCATTATGGTAATGGTTTTA
CCTTTTATAAAAACACCAAATTAAAAAACAAGTTTACAGCTTTGGATAAT
ACAGATTATATTCTAAATAGTTTTATGCAACGTGGAGCCATCATGCGGTT
AAATTCGTACAGACAGAATAAACTTTGGACGATAATTGTTGTTCATCTTT
TTATGCACGTAGAAGGGAAATAGATTTAATCAATCATAAAAATACCGCTT
AATTGATTCATAGTGCATTATAAAAACACTGGTCTGGAAGGCTTTTTATT
GTTAAAAGATCGAGCTTACGTACCAAACCGATTTATTTTGCAAACTTTTT
GATCATGTGATTTGAGAAAATAGACCAATCCTGTAAATCGCAACTTGTCT
TTTGTTTGTAACAAAAGATAATTGAACAAAAAGCCAAAACAATACATTGC
CAGACAGGTTATTTATAATGACTATGATTGATTACACGCTTTCTTTTTTT
AATAAGAGAGCTGGTTTTTTTCATTTCATGATGGATATTCTTAACTTTTT
GGGGAAAAATTATCCTAAAATATTCTTAAGGTGCACTTTATTTCAAAGAA
CAATTTTATAAGAACAATGAGGCTCAAAATCCACAATTTACAATAGACGA
TATCGGCTTTCTAAATTCTCCCCGAATGATTACCCATGATGCATTGTTAG
GGTTTGGGTTATCGTCCGTGAATTTTTTTGCGCAATGCATCATGGGTAAT
CATTCGGGGAGAATTCGGTAAAGTCGATATCGTCTATTCTTAGGAAAAAT
GCTGTAAGAGTCGGCATTCTTAGGTTCAGTTGCCGAATTTAATGATGGTG
ATAATCTTAGCATATTTCTAATTTTTGGGCTAATTTCATCATGAATATTC
TTATAAAAAAGGCGTGTACTTTAGTTTCCAGACATTTCTAAGTTAATGGA
TAGGCTGGTTTATTGCAAGCTGAACAGTCGTTTCTTCCCTTTGGATTAAA
TAGGAAATAGCATGTTTAATAGATGCACTAATCCTATGAACTAGGCTAAT
GTTTATTACAAAATTCCATGCAATCAAACACTTATTTGAAAAAATCGGCC
GGGTCAACTACAGTAATACAGTGATCTTTTCTCTATAGGATGCCCTTTTC
ATCAAGATTTGAAGGATTTAGAAATTTGAGTAGACTTGAGGGTCTCATAT
TTATTCACAAACTGTGGTAACCATTTTCAAAAAAAGGGGGGGGGGGNNNN
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CTCCTAAATGTTAAGAACCGTACCCAACCCAGGTTTTTAAATCTGATCGA
AATTCGTTATCAATTTTTTATATCTAGCCAAGAAAGCAGAAAATCAAGAA
GAGCCTTATTCAGAAGAACTACACGAACAACATGCTGAATACTGGGGCAC
GCGGCAACAATTATTGGCTGGTAAAGTCATCTGTGATTGGCTCTCAGAGG
ACGATCAACCATCTATGGACCCTATCTACGGCGTCTTATTAAATCCAACT
GCCGGCCGCGTTGGGCCAGGTGATTCTGGTTTTGTCCATAGTTTATTATA
CGATAATTCCGGTGAATGGGCTCATCATTCGGCTGTTCACGATGCTTTTG
GTTATTTGTTTACATTTCATCAACTTGGGCCGGGGTACAATTATATGTAT
CGATCGTTTTTCGACGCAGATAATCCATTGGCTGGACAAATTTCTGGTAT
TGATTTTTGGAAAAAATATGTGGCTGAAGTTGAAACCAAACTTAAAGTCA
TTGAAAATTTCCGCTCAGTTTGAAAAAACAAAATTTTGTAGATAGACTTT
CTTTGTATCATTATTTGTTAAAAAAACATAATTGAATTTGTGTAAATATA
AACGCAGAATTGTCAAACGTATTGAGCACTTGCAATTTTTTTGGAGTTTA
AGTTTTGTAAAAACTAATATTTTACTATGTCTTAGTTTCAAGTAAGTTAA
CATTTTAAAAGTTGAAATAAACTTTTTGTCAAAACCTTTAATTTAAATAT
TTTTGGTGCACTATGTCTCAGATGAGCACTTTGATATGCTAGTGCAGTAC
AAAATTTTATTTAACGGTGACTCAGCAAAATATATTGATCTTAAGCCTAA
ACTATTTTGCGATCTATACATCCAAACC

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00013002	TCONS_00013002	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00013001	TCONS_00013001	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00013000	TCONS_00013000	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00013001-protein	TCONS_00013001-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000161	supercontig	sc0000161:114599..123726 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
302.33	327.79	381.46	396.08	56.33	46.03	107.2	96.39	92.54	142.34	95.39	77.88	29.28	18.89	86.08	99.46	71.04	58.35	52.09	65.11	21.11	20.41	101.86	99.72	23.23	23.05	77.53	43.01	27.4	26.35

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XLOC_007288 (gene) - C. hemisphaerica