XLOC_007659 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007659
Unique NameXLOC_007659
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000171:269286..292980-

Legend: gene
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>XLOC_007659 ID=XLOC_007659|Name=XLOC_007659|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23695bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000171:269286..292980- (Clytia hemisphaerica)
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AAACTCAGAAAACTAAGAACATCCGAAGGCGTCAAAAACTTTAAATGTTC TTATAAAAAAACGTGTATCATATAGTGACTCAATGCAATATCATGACTCT GTTTAGTACAGATAACCTAAACCCCTTTTAGTTTTACCGTTATAATCAAG ATATCCAGAGGTTGGACTTTTTTTAACTAAGTGGAGGTTTTCTCGAATGA TTCTAAATAAGATTTTAATTTCTAGAGGAATACACCTTTTCGACCGTAGC CGCCAATTACCGCGCGGGCAGTTTTTTATCCGTTTTACCTCCCTAAAACC TTCCCAGTCTTTTTTCGCACCTATAGACAATAGAAAAAGGTAGGAAAAAG TGTAAAAAAAGGATTGAATCGAGTTTAGGGGGATAATTGAATACTAAAGT GGCACGCACCTGACCGGGCGCGACTACGGTCGAAAAGGCGTATTTACAGT GTATTTTTGGTGTATTTGTTTTAACCTTTTGTCTCAAATTTTCAAACCTA CCACTACTCATTTGAGAAGAGAATGTCTTAAAGCTATATTTCAATATCCT GTTTGAATCCTGCTTTATGCAATTTTCATATTGTCTCGTAAGAAGTTTAG CTATCTTTTTTAGTACAAAGCTATAGGTCTCACAGTTGGTTCCTTTTAAA AAGACATTTTCTTTCCTTTTTTTCAATATTGAAACTTGTGCAATAATCAT GCTTCCATATCCATACGTTCAAGATAAAAGCTCCTTTTCCTGTTTCCTGC AGGAGCAGCTTGAAATACTTTTTTGACGTCTGAATTTCAAAATACCATTT GTTTGAAGTACGAACTACTCCTCTCCAAGGAAATTTGAGTCTAAGCCAAT GAGGTATATATCCAGATATATCATAAGGCTTACGAGGAATCTTCAACTTT TCCTAGTCAAGCAAAAATGGTTGGATGACGGATTGAATCTAGCTTTTAGC ATCATAATCTTCTTTTTTTTGTTTTTGCATTTTACATTTTACGATTTCTG GCGATAATGTTCTGATTCTGTCTGATCGAAATTTTGTCGGCTGCACAACT TATGTAGAAAATAAGTGGCTCTAAATTCTTCCTAGGAGATTAACTCTGCC CTTGGACTATATCTTATTGGGCTAAGTTGCAGAAGGACTTTGCAATTTAC GAAACATATTATTTTATAGGCCCTTTTTACACCGGCCCTTATTGGCGTTA TTTTTGGGTTCGTGGCGTAATAAGGGCCGGCGTAAAAAGGGCCAAGATTT TGCAATTTTAACCTAAAAGCGGCATTAATTTTTTATCATTATTTCTCAAT TTAAAGGATTTTAGGTACGATTCGAATTGTTTTGTTCCATATTTAAAACT TCAGTAATATATTTAATATCCTTAAAAATCAGTGATTTTCGATGGAATTT TCAACAGTTTACTACTGAAAAATGACATTTTAATGTAAATTTTAGTCAGT ATTTACTAATTTGAAGCATAAGTAGCCATTTTTAAAAATGTTGGCGTTAT TAACGGCCCTAATCGGCGTAAGCCCATTATTAGGCTGTGGCGTAAGGGTT ATCATCCGGTAAGGATTAAGATCGACTTGTAACGTAAAGCTAATTTCCAT TTTCCTTTTTCCCTTAATATCTTTATATATGAAAGCTTTTTCCCATATGC CCCAACTTTATAAACAAGCAAACGGATACTTAGCCCACTCGTACAGACAG GACCCCCTCTTTGTCAAAACTTTCATCATATCACCTTTTAGTAATACGCC CTGAACTTCTCTTTGATACCGAAATGTTTCTATGTTTTGTTTGTGATCAA AATGAAGATTACTTTGTAGGTCTTTCTTTCTTCTTTACTTCACAGAGAGA ATATTTCATTTTTTTCGAGATTCGATTTTTCTTTAATCAATACTTTATAT CGATTGAAATTTCTCTGATCGATCTTTTCTTGACATTACAAAGAAAACGT TTTAATAGCCCTCTCTGGATTGTCGCTTCCCTTTTTCATCTTTTGACGAT GTAACTATGTGGAAGCTCTTTCTTACCGAAAGCGCACTTGTTTCTCTCAT GTACGCATAGGGTTGATGGGGTGGCATTCAAACGAGGCTTGAGCTAAATC AAGATTTCGTGTTCTTTCCGGCAACAGTCGCTTCCGGAAGTTTCTAAATC CCTTTTGTTCGGGAGATGTTTTAACACAAACTTCTGTATTTCTCCACCCC GTTATAAAGAAAGGGTTAACCATGCAAGTCCCTGCAAATTGACACTGCAA ATTCTTTCCCAATCCAACCCAAAGTATAGCGAGTTATATATCTCAAAAAT GAATCGAATGTTTTTCTGCATTAAAAGAATTAACGCTAACGTTACATAGC GCACCCATAGCTTTTTGTCACGCTTCACCCAGAGATGGAGTTTTTATAAG ATACTTTAATAATTGGTCATTGGAAGTAATAGAAATGACGCGTTCTTTAG AAAAAGTAATAAAATTGTTTTATTACACAGGTTAATGACCAACCAAATTA AATAAGAGCTTGTAAAAACTCCATCTCGTCCCCTCAATCTACATTCCACT TGTCACCAGTAATGTAGTAATGCTCCAATGAATTAATTTTTTAACTTCTT TATTTTTCAGAGTTGTATTTTGGCTGTTGGAGGAACTGAGGACCGTATCA TTCCTGCTAATAATGAGGCCGGGTAAGACAACTTCCGAATCATTATCTCT TTTCCCTTCAGCATTAGGGGTGTATTGTAGTAGCCTATATTTTGAGTGTG CACTTTTAGACAGTATTGAGATTGTTTTCACCAGGGGCCACTGGAGAAAG GGGAAAGGCGAAATGAGAAAGGGAAAGGGAGAAAAGGAGAAAGGGAGAGT AAGCTAAACAAGGAACCAAGATAAAGAAGCTCATCATACCGACGTTCGGT CCACTTAGTTGGGCTGCCGGGAATCATATCTATGTGAACTATAATTTTTT TGATACCAGTAGTTTAAGATATTCATTATGAGTAAGTAACCAGTTAGAGG TCTTGTGCTTATCATCGGTAACAATAGCAAACGGATTCCTCTGTGAATTT AAACATCGCCGAGAGGGATATCATTAGAGATGAAGAGTTTAAGTTATCGA ATCTTCATATAAAATTATAAACTTAAAAAGTAAAAGTTTGCGATTTTCAG AGAATCCATTCTGTTGGTTTTTTGGTGAGTCATTTGAAAGCTCGTTCGAA TGTCTAAACTATCCAGGAGTCGCATATCGAGAGTATTGTCAAGCTACAAA GAGTTGATATTGTGTAGTTTAAAGAGTTTTGATATGTTCTCTTCTACTTT TTGAAAGAGAATATTCATAAGAAAATTTGAAGCGGAGTCGGGAGGCTGTT AGTAGTAAAGACTTCACCTAACATGTACCCAGAGCCACTTGCACCTCCTT TTGATTTTACTGGTGGACGTGATACAATCGTGAGCATCTTTACGTAACCG CTATCAGAATTATAAAAAGTACACAATGAGACTGGTTTCGAGTTTGAAAC TTCACATTTGACAAAGAGCTTTTTAACTCTCGTTTAGATTTGCTGCAGCC AAAGTGATGAGTGTAACATTGAGTTGTGACCATCGAGTTGTGGATGGGGC TGTAGGTGCACAATGGCTCAAAGTGTTCCGCTCATTCCTGGAAAACCCTA TCACCATGTTGTTATAACGCGCATGCGTGTACGATGAAGTCCTCTCATCT GATTGGTTAACTGCTCCAAATACTCATCACTGATTGGCTAAGTTTTGTTT GATTGTTTGGAATGCGAGAGAAAGATATTGTGAACTTTTTTCGAAAACAA AGTAACTGACCTTTATTGAGTCCACCTTTCTCAATGATGGTAGATGGTAT ATGCTGATCTGATTGGATGAAATGGACTTTTCACGTGACTTTGCACGAAT TTGATTGGTTATGTGGAATGTAGGATGTGTGTAAGACGCACAGTAGAAAT CCATCGAGTGGTATTTTAGTGAAAATTCGATTTTGTGGTAAAAATTGGTA AAAAGGCTCCATAACTAGTGCCCCCTAAATTAATGTCAAATCAACTATAT AATGTTTACCAAAATTATTAAGCCTGGGATTGGCTTTGAGAAGTTTTCCG AGCTGAGTTTTCATAGTTTTAATCGTAGATCTCAGTAGATATACTTCCTA TATAAAACAAAACTGTTAAGAAACTCTTTATTTCGCTTGAGGATGAGCAG AAGCCTAGAGTTTTCACTACTATACCACTTGGCAGGAAGGTTTCAGTAAT TTGATTCTACCCCATGTTACACCCAAACAACAAAAAATTGATTGAAATGA ATTTGAAATAATTTATACTTCATTATTATTAAAAGTAGACAAAGATATAT TTATATTAAACCTTGACTAACGTTCTCAAATAGTTCTATTGTTGCATGAG CCAGCATGAGCAAAGATGTGGATTTTATTTCGAACCAAATTAAAATATCA AGTTTGCACAATTCTATTTGCTATTTTTCGTTCAGTTAGATTTTATTTTT AAAGCAAGAAAATTTATTTTTTGGAATCTTGATGATTTCTATTATCTAAA CTTCGTTTTCAATCAAGGCTAATTACCCAGAACCCTCTCAATACTCGATC CATATACCCCTTTGGCCATAATAATGTTGTTGATGTATTTTTATATAGAA AATCTATACGAAAAAATTATACTTTTAAAAAGATACTGTTTTAGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013723TCONS_00013723Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013722TCONS_00013722Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013721TCONS_00013721Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013720TCONS_00013720Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013719TCONS_00013719Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013721-proteinTCONS_00013721-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000171supercontigsc0000171:269286..292980 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
DLATdihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
76.33 70.03 41.34 38.26 23.95 19.12 28.75 32.28 33.77 40.02 55.3 38.35 75.1 74.17 56.14 67.7 163.32 184.78 64.86 65.31 197.73 212.07 93.97 104.23 133.37 131.15 72.35 78.38 88.26 85.8