XLOC_009049 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009049
Unique NameXLOC_009049
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000231:80830..91643+

Legend: gene
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>XLOC_009049 ID=XLOC_009049|Name=XLOC_009049|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10814bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000231:80830..91643+ (Clytia hemisphaerica)
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TGATTTTACGAAACTTTGATTTCTATATTCTGTCGATTTTCTGACGTGGA TAACTATTATCATCATGATTTCGTGAACTATTTGAATGCAGGATTTATCA ACAACTTTGTATATCAGCTCGTTAAAAGTCTTTTCCTCTCCTTCCTAGGT GTCAGCCTGCACCAGCCACCCATGTAAATACGGAGGAAGTTGTCAACCAG ATGGATCGGATGATGGATACACTTNCCTGTACCAGTCACCCATGTAAATA CGGAGGAAGTTGTCAACCAGATGGATCGGATGATGGATACACTTGTTCAT GTCTTACTGGATTCTTTGGAAACCAATGTCAAGTGAGTTGAATCTTCTAT CTCAAAGCTTTCTTTCTCAAACATTCTTAGCCTATTTGATGGCATGAAAA AGGTGAATTGAGTTACTCTAAATTTACTTAAAACTTTGATTTGAATGTAT TGTTTTCATAGTATTGTGATGTTTGTAACTGGACCAAGTCTGTTTTTGGC ATTTATGGTCTTTTGGTGTTTCACATTGAGAAAACTAGGATCTAAAAAGC TGTATTATTGACTTGCTGAAACAAGATTCAAAACTAATTGCGACATTTTA GTTACAAACGCTGCCCTGAAATCTGCCCTATCTGAGCTAAACTTTCTTCA AGTACCAAGGGTTTTTCAAGATAGTCTGTCCCTTTGATTGATCTCTGTAA GAAATCCCTTTCTATCTTAGTTGAGATCTTGTGTTGGAAGTAACCCGTGT CAAAATGGTGGATTATGTTTTCAACAAGGAATATCCCAAGCTTGTATCTG CAACAATGGATTCAGCGGCCCCAACTGTGAGGTAAGGAGTTGAATTTATA AAACTAACTAAACCGTAAATTATAGCACTTGAAAAACATAAAACCAGCGC TTAGAATTAACTAATTATGGCTTAATTCTTTTCTATTTAATTAGGTTCAA CCAACCCAGCCTGGTgtttaagatttttttgttatcACCACATAGATCGC ACCATCAACCCCTGCCCCACAGACCAACCTACCAACAAACCCACCGACCA ACCCACCGACCAACCCACCAACTAATCCACCAACCAATCCATCGACAAAC CCACCAACAAATCCAACAACTAACCCACCAACAAACCCACCAACTAATCC ATCAACAAACCCACCAACAAACCCACCAACAAACCCACCAACTAATCCAC CAACAAACCCACCAACTAACCCAACAACAAACCCACTAACTAACCCACCA ACAAACCCACCAACAAATCCACCAACAAACCCACCAACTAACCCACCGAC AACAACTGCCGCCCCAACTAATCCACCGACAACAACTGCCGCCCCAACTA ACCCACTGACTACAACTGCTGCTCCAACAAATCCAACGACAACAACTGCC ACCCCAACTAACCCACCGTTTACAACTACCGTCCCAACTAACCCACCGTC TACAACTACCACCCCAACCAACCCGCCGACAACGACCGCCGTCCCAACCA ATCCACCAACCACAACTGCCGCCCCGACCAACCCACCAAGTAACCCACCG TCTAACCCACCGGCAAACCCACCGACAACACCATTTGATCCAAGGACATT CTGTAATGGAAGAATTGGTTACTTTGCTCACCCAAACCGTAACCTTTTCA TTCGCTGTACTCAACTTGGAAGCTTTGTGCAAACATGTGGAAATTTGGTT TGGCTTCAAATCGCAGAGGGTTACGGTACCTGCGTAAGATCTTCAGCATC ATTCCCTTCGATTGTCACAACTGTCGCCCCAACCAATTCACCAACAACAA CTGCCGCTCCAACTAACCCATCCACTACAACTGCCGCCCCAACAAACCCA CCAACAACGCCCTTCAGTCCATCAGcattttgcgtcggaaaaatcGGTTA CTTCGCTCATCCAAATCGTCATCTTTTCATTCGATGCACACAATTTGGAA CTTTTGTTCAAACGTGTGGAAATTTCTTAGTCTGGCGCCAAATCTCAGAG GGTTTTGGAACATGCGTCCGTCCTTAGGTAGACAGTACTtgatttgacaa aattttttaaCGAAAACGGAATAATTTTTAACCCATTTATTGTACTAacc aatgtttattttttaagcctttttaatttgaaaacttattgttttgtaac atttttatCTGACATTCTAATCCATGTATCATTAAAGTAATTATACAAAC AAAGACAACAAAGTGAAACAAGATTTTGCACAATAATGTCACTTTTTTAG GCTCCCTCAAGATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016189TCONS_00016189Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016190TCONS_00016190Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016191TCONS_00016191Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016192TCONS_00016192Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016193TCONS_00016193Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016194TCONS_00016194Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016195TCONS_00016195Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016193-proteinTCONS_00016193-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000231supercontigsc0000231:80830..91643 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
DNERdelta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.78 0.61 0.39 0.17 1.05 0.73 0.65 0.7 0.52 0.68 0.85 0.21 5.09 10.39 0.3 0.41 0.15 0.22 2.59 1.75 0.19 0.32 0.53 0.56 0.68 0.53 0.05 0.05 0.28 0.61