XLOC_009276 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009276
Unique NameXLOC_009276
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000243:82569..122108-

Legend: gene
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>XLOC_009276 ID=XLOC_009276|Name=XLOC_009276|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=39540bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243:82569..122108- (Clytia hemisphaerica)
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ATTTCTACTGCTTGATGTTACTCGTAAAAATTTTACCTTCCTGTGTGTGT AAAGTAAGGGAGAGTAGAATGTTTTCCACATGTTTTCCACACAGCTGTGG CCTTTCCCTTCTCTTATAGTTATAGATCGATGTTGAATATGTCTTCTTTT TTCGTAGATGGTTGATTTGGGATTAACAGAAAACATTGGTGAGAGTGGTT TAAGGTTTGAGGTCTGGTACCGAAGATGGAAGAAGGGCAAAGCCACTGAA AGCTATATTCTTCAAGCGCCATCAGCCTCAGAAAAAAATGATTGGACTCT AGCCATAAGTCAAATTCTATGGAAACAAGCTACAAAGAATAAGGAGTACG GGCTAACGGAACAATCAACTGGAATAAGTGTTGAGAGCACGCCGTCATCA GTATTCTACGAACCTTCAACGCCCACCCAACATGTATACACACGCCGAAC GCCCGTAGATGTTGGAAAACCTACGATCATGGATGCACCTCACAATAAGC GATTATCATGGATAAGCGCCGCTGAAAGTTCCGGTAGTTCAGGAGTTCAC GATCTCGGAAGCCTACCGGAGGAGAGTTACGGTGCACCATCACCAAGAGC ACACGAAAATGGTTTCTTTTTTCGCGGAGATGTCGATCCTAAATATTCTT CTTTGCCTCGCAAGAAGGGCTCGTTGGGTCAAGTTAATCAAGCGACCAGT CGCTCTCAAATTTTGAGTGATCCATATGCAACAGCGAATGTTAATTTACG AAAAAATGGGTCATCGAACAGTGGATATGATGGTAGTTTTATTCGTAATA ATGTTTACAGAAAAACATTTCAACCTGATGGCGTAACCGTTAATGGTGCT AGCACGCCCATACGTCCGCCCCGTACGAAAAAAGGCGCCCGAAGGCGTGA TGCTTCCGCGAACGGGCGTTACGCAACGCAACCTGTTATCTTGCCGAGTA ATTACGATCTAGGCGGTTACGGCCCTCCGACCAGCCATTGGCCACAGAAG ATGATGGATGTACGATCACCGGCGCAATCGGAGATGAACTCGCCACTCGT CGAAAAGAAATACCCATCGTCACCAACATCGAAAACCATACAAATTGCAC GAATGTCAAAATCCATCACTGATTCTGATTTGTCGGCAGCCGCAATTGAA ATGAATAAAACGAGATCAAACTCCTCCAAAAGCGAAGGAAGCGGTGACGA AACTATCAAACGAACTCTTTCAAAATCATACACCGATCATAATCTCTTGG GACGACAATACAGTAAGTCGGTAAACGACAGTTATGATTCGTTACCGAGA GATTTCACTAAACGACGATCATCGTTTAATAAAGCAATGAACTCCCCCGA CGCTCGTTCAATAAGTGTCGACGAGCGAGATAAACATCGTCGGGCATCTC GACAATTGTCGTTAACTAATATCCATTGTTCGCCTACCTCACCGACAACC GAGAAATCTAATTTGGAATTGTCTCAACAATCACTTGTTAGTCCAAGATC GGTAAGCAATCTTTAATTCTATTTGGATTTATTTATTTGCTGATATTCCA CTCTATAATATCTTTCAACGATTACAAAATCACAATCAAAATCAAACCTT TTTAAAGGTTTGTCCGCTGCAATTTGTGTTTCCCCTTCCTAGACCTCCTA GATTTTATTGATGTTCTTGATAGACAAAAATTTGACCCTGTAAGATAGCA AATCTGAAATCATTTTATATACTCTCCTGAAATATTGCATGAACGGTCAA ATATCGAACCATGTGCACCTTTTTATCTGAGTTAATCCCCAGGGCATTAA TATCATAGAATTTCTCAGTATAACCCTCCTCCTTTCCTCGAGGGGCAAGA AAATTTTGTAGTAATTGTAGTAGTCTAGACTGATATTATCCCGTAACAAT TATCGTATTATCATTTAACACTCATATTACTGTATTACACTGATTGTAAA CAACTCCAGTCTATAGGCCTTTTCACAGTCGCAAAGCGTAATGGGTAATC AGGACCACTGCGCGCTAATGACGACTTACTCTTGGTCAAAAGTTTTGAAA TTTTTTGAAGATTTCTGCGTCTAACCAACGGGAAACCGTTATCGGGGCGC AACCACTCCTGATTACCCATGATCCATTTCGACTGTACAATGGCCTATTG TAGTAGTAAATCGAATTAATCAAGTACATGCCTTTTTTCCNCTTGTTAGC CCAAGATCGGTAAGCAATCTTTAATTCTAGTTGAATTTAATTATTAAGTG AAATTCCACTCAAAAATATCTTTCAACGATTACAAAATCACAATCAAATC AAACCTTTTTAAAGGTTTATCCGCTGCAATTTGTGTTTCCCCTTCCTAGA CCTCCTAGATTTTATTGATGTTCTTGATAGACAAAAAATTGACCCTGTAA GATAGCAAATCTGAAATTATTTTATATACTCTCCTGAAATATTGCATGAA CGGCCAAATATCGAACCATGTGCACCTTTTTATCTGAGTTAATCCCCAGG GCATTTAATATCATAGAATTTCTCAGTATAACCCTCCTCCTTTCCTCGAG GGGCAAGAAAATTTTGGGTCAAGCTGGAGTTTTTACAAGTTCTTTGATGA CTCTGTTAGTCGTTAAATGTTGAGACAAACGATTTTATTACTTTTTCTAA AGAACGCGTCATCCCTATCGTTAAAAAATAACCAATCAGTTAAGCATCTT GTAAAAACTCCAGCTTATCCCAAAATTTTGCAGTAATTGTAGTAGTCTAG ACTGATATTATCCCGTAACAATTATCGTATTATCATTTAACACTCACATT ACTGTATTACACTGATTGTAAAAGACTCCAGTCTATAAGCCTTTTCACAG TCGCAAAGCGTAATGGGTAATCAGTACCACTGCGCGCTAATGACGACTTA CTATTGGTCAAAAGTTTTGAAAATTTTTGAAGATTTCTGCGTCTAACCAA CGGGAAACCGTTATCGGGGCGCAATCACTCCTTATTACCCATGATCCATT TCGACTGTACAATGGCCTATTGTAGTAGTAAATCGAATTAATCAAGTACA TGTCTTTTTTCATTTTTAGGAGCGCAAAACGAACAACAGTCCCTTATACA ATTTGAAAGCAAGATTTTCCAAATCGTTGTCTGAAATGTAATGAATGAAA TGATGTTATACAAAATACAAGTTGATATTATGAAAAAAAAATCAAAATGT TTTCTCCAAAATGTTGTATATATTATCTAGTAATTTAATCTATTATTGAA TATCATATTATATATTTTTATACCATTAAAATATTCTTATATATATTTGT TAAAATAAACAGAGGAATTTTTTTATTATAAAGTATACCATAGTTGTTCA TACAGAATTTTTTCAAAAAATTTGCTTCAAAGTTCTGAATGTACGTTATA AAAATGACTTTCATAATATATGACGAACAATAACAATAAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016596TCONS_00016596Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016595TCONS_00016595Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016594TCONS_00016594Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016593TCONS_00016593Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Puratrophin proteinTCONS_00016596-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000243supercontigsc0000243:82569..122108 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7 6.41 2.08 1.46 25.07 16.76 16.03 17.86 7 14.54 11.11 6.66 12.66 11.79 4.1 6.17 16.17 19.35 18.94 20.65 12.51 12.72 9.92 12.11 105.67 74.4 6.66 8.33 9.48 9.04