XLOC_009445 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009445
Unique NameXLOC_009445
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000253:124445..131647-

Legend: gene
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>XLOC_009445 ID=XLOC_009445|Name=XLOC_009445|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7203bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000253:124445..131647- (Clytia hemisphaerica)
ACTTCAGTTTGTTGTGTGCTAACTGATTCAGTACCTTCAGTCTCCGTTTG TTGAGTACTGACTGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGCTTGCT GAGTTGCAACAGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTCGA GTACTGGCTGCACCCGGTTGTTGAGTACTGGCTTCTTCATTTTGTTGAGT ACTGGTTTCTTCAGTTTGTTGAGTTGTAGCAGCTTCAGTTTGTTGTGTAC TTGCTACTTCAATTTGTTGAGTGCTGGCTATTTCAGTTTGTTGAGTTGTA GCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTGTACCTGCTTCAGTTTGTTGAGTACTGAC TGCACCCGTTTGTTGATTACTGGCTACTTCAGTTTGCTGAGTTGCAACAG CTTCAGTTTGTTGAGTACTGGCTGCTTCAGTTTGTTGCGTTGTGACTTTC TCTGTGGCTTCAGTTTCGGTTGGGACTGTTTTCTCTACAAGTGGTGCTAG CGTTGCTGTATCGTCATTTTTTTCTGTTTGAATGTTTGTTGTCGCAGATA TTGTTGACTTTGTTGTTGATGTTGTCTGTTCAATCTGTTGAGTAGTGACT GCCTCTGTTTGCTCAGTAGTTACAACTTCTTTCGTTGCTAAAGCCTCTGT TTGTTCAGTGGTAGGTTCTTGTGTTGCAATTTCTTCAGTTTGTTGGGTAG ACTTTACAGCTTCAGTTTTCTGAGTAAATGATTCAGTTTGCTCAGTGAGA GGCTTTTGAGTCGTTGAAGTTATCGTTTCAGTAAGAGCAGCCGTAACCTC CTTCATAATTGCTGTAGTGGATTGAGCTACGGTGTTTTCAGTTTGTTGAG TTGTTTTAACACTTTCTGTTTCTGGTTCGACAGTCGTAGCCAGGTCAGTT ATTTCCCTTGTTACAGCAACGGTAGTCTCAGCTTCAGGTTGTTGTGTAGT CTTTACAACTTCTGTAATTCCGTTAGCTTCTGTGGTAGACGTCGTTGTTG GAGCTACGGTCGTTTCTACGGCTTCAGTTTGAACTTGTTTTTCATCCGGA AGTGTTTTAAGTGTTTCGGTAACAGCTTCTTTAGTGACGATTTTGACGAG TGTTGTCGATGCTGTCGTGGTTGTTGTGGTGGCTTTTCCGACATTGTTGT TATCTTCTCCTTCAACAATAACAATAGGAGAAACTGGTTCTTTTGTTGTG GAAGTACGTGGTTCTTTCGTTACGACAGACTCCCCTGTTGTGATGTCTTT GGTTACAATTGGCCCCTCGGTTGTGGCTGACTCCGTAGTTTCTGATTCTT GCGTTACAGACTCTTGAGTTGTAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTC GTGACTGATTCTTGGGTAGCAGTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTG TTGAGCAGTAACTTGCTCTTGTGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAG TAACAGATTCTTGTGTCGTAACTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTG ACATCTGAGGCTTCTGTTTGAGTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGT TGCGGCGGTTACGTCTGGTTGTGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTG TTTCTTGTTCAGTACTTTCAGTTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTG ATTTCATCTGTTGTTTTTGAATCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGT AGCTGCTTCTGTTTGGACTTGCTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGG TTAACACTTCTTCAGTTGTCGATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTA GCTTCAGTTTGTCCCGTTTTAGGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTG TTGAGTAGAAACATCTTTTGTTTTAAGCTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAG 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TAGGAGATTCTGTTATTTTGGCCTCAGTCGTGACTGATTCTTGGGTAGCA GTTACTTGCGTAGTTTGAGCTTCAGTTTGTTGAGCAGTAACTTGCTCTTG TGTTGAGGCTGATTCAGTTTGGTGACTAGTAACAGATTCTTGTGTCGTAA CTGACTCAGCTTCCCGTGCTTTAGTTGTGACATCTGAGGCTTCTGTTTGA GTAGAAACAGCAGTGGGTTGTTGTGTTGTTGCGGCGGTTACGTCTGGTTG TGTTACTTCTACAATAGTTCCTTGCGTTGTTTCTTGTTCAGTACTTTCAG TTTGAGGGGTCTCAGTTGAAATCTCTTTGATTTCATCTGTTGTTTTTGAA TCTGTTGCAAGCTCTGTTTGCCCAGTGGTAGCTGCTTCTGTTTGGACTTG CTGAGTAGTGGCTGATTTAGTTTGTTGGGTTAACATTTCTTCAGTTGTTG ATTCTCGCTCTGGTAATGGAGTTGTTGTAGCTTCAGTTTGTCCCGTTTTA GGTTCTTGCGTTGAAACCGATACAGTTTGTTGAGTAGAAACATCTTTTGT TTTAAGCTCTTCTGTACTAGCAAGTTCAGTTGGTTTTTGGGTCGACAATG CAATGTTTTGAGTGCTTTCACTTTCAGTTTTTCCTTCGGTACTTGAAACA CTCTCTGGTGCTTTGGATGGTTGTTGGGTTGTGGTGATCTGTTGAGTAAT GACTGTTTCTGTTTGTGTGCTGACATCTGTGGCGACTTTTTTGGTTGTAG AAACTTGTGCTTCTTCTGTCGTTGCTTTTGGTTCTGGAGTGGTTCTTGTT TCAGTTTTTTCTCCAGTACTGCTAACAGTCACATAGACAGTAACATCCTC TGGAGTTTCGGATGGTTTTGGAGATGGTGTTGTTTGAGAGACTGTTGCAA CTTTTTCTGTTGGTCCTGTCTCAGTTTGTTCTGTAACGACCTCAACAGTT 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AACTGAATCAGTTTGTTTAGTAGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTGAATCAG TTTGTTTAGTTGCAGGCTCTTGTGTTGTAACTAAATCAGTTTGTTGAGTT GCAGGCTCTTCCGTTGTCTTTGGAGAATCGGTTCCCTTTGTTGCAGATCC TGGCTGCTGAGTAATGATTTCCTCAGTTTGTTGAGTTGTATATTTTTCTG TCGAAAGTTCTTTTTCTTGAGTGGTGACAACTTGAGGAGCATCAGTGACA ATTTCTTGAGTTGTCGCAGACTCTGTTTGTTCTGTCTGTGGTTGTTGAGT TGTGACTGTTTCAGTTTGTTGTTGCGTGACCACTGTGTTAGTTTGTTTTG TTGGAACTACATCAGTTTCAACTTGCTCTGTGGTAACAATTTCTGTTTGC TGAGTAACTGGCTCTTCCGTGGTGATAGATTCAGTCTGTTGAGTAACAAC GTCGGTCTGTTGAGTGGAAGGTTTTTGAGTTGTAACAAGGTCAGTCTGTT GAATTCCTGAATCAGTTAAAGCTGCTTCAGTTTGTTCTGTGGATGGCTCT TGAGTGGTGGTTCGCTCAGGAAGAGGCGTTGTAGAATCTGTTCTTTGCTC TTCAGTTTGAACTTGAGGAGTAACTGAATCCGTTTGTTGAGTAGCAGGTT CTTGTGTTGAAACTATTTCTGTTTGAGCTTGTTGAGTAGTGGCCGATTCA GTTTGTTGGGTTAACACTTCTTCAGTTGTTGAATCTCGCTCTGGTAATGG AGTTGTCGCAGCTTCAGTTTGTTGAGTTTTGGGCTCTTGCGTTGAAACCG ATCCAGTTTGTTGAGTTTTTGTAGCTTCATTTGTTGAAACTTGCTCTAAA GGTTGAGTGGAAACTTTGCCTTGCTTTTGTGTAGTGCTTGTGACAGATGC TGTAACTGTTTCTTGAGTGGTAGAAGCTTCGGTTCTCTCTTCTAAGTCTC CAGTGACCGCTGGTTGTCCTGTAGTAGATTTTGCTTTCATGGTGATTGGC TTTTGCGTTGAATCTTGTTTTGTTGGAAGGCTGGTAGATTTTGGAGATTC AGTTTGGATGTTTTTTGTGGTTTGTTGCTGTGTGGTAGTGGAAATAGAAC CCTCAACAAAATCTGTTGTTTGTTTTGATTCTGTTGATACTTCTGGTGAA CTTGTTGTGGTAAGTTGAGGTGCATCTGTTTCAATCTTGTCTTTAGTTGT GGTTTGTTCAGATTCTGAGTCGGTGGTGATTTCGTCGGTTGGTGAATCTG TCGTGCGTTCACTGGTGGATCCTTCAGTGATCACTAAAGGAGTATGGGGA CCTTCTGATGGCTTTGGTAAGGTTGACTTTGGTGAATCAGTAGTGGTTTG AGCAGCTGTTGTAAGGACTTGTTCTGTGGTCTTAAAGTCTGGTTCTTGAG TTGTGGATTGTTCAGTTCTAAAATCTGTGACAACTTTAGCGTCTGGGCCT TCTGTTTGTTGTGTGGATAATACATAAAGGTCCTCAGTTGTTGAAACTCG GCGTTGGTCAACATCGTCAACTGTTGTCTGTTGTTGCTGTGTTGTTGGTG TTGCTTGAGTTGTGACAACAACTAGTTTGTCGACATCATGTGTTGTGTAA GATTCTGTTGTTCGCTCCTCTTCTGTTCGGATTGGATCTGTAATCAGGTC TTTTGTTATCAGATCGTCAGTTCTCGTCTCTTGAGTTGTGGAGACATACT CAGTTTGTGGCATTTGAGTAGTTATCTCTGTCTGTCGTTTTTGCTCAGTT GTTTGAAGATCTTCAGTAGCAACCGTTGATCGTACAGATTCAGTTGACTG TTCGCTTGTTCTAACACGATCAACTGGTGAAGAGGTCTTTGTGCTTAGTG ATTCTGTGGTCGATCGCTCTGTTGACTCTGTTGTCTTGGCAACTTCTTCG GTAGGTTGTGGACGGGCCGTGGCGACCTCTGGTTCATCTGTTTCGAGACC TTCAGTGACGACCGTTGTTTGGCGGATTTCTTCCGTCGTAGGTTTCAATG TTGTAGTAGTTGTAGACGTTTTCGTTGTTGAAGCGACAGTAGTGGCAACC TTACCGCATCGTTGTTGACATTCGACCAAGGTGAAAAAGTTGTTTGAGTT TCCATCGCAACCACCGTATGCAAACTGCTCACATTTTTGTGTCTCCACAT TGAAATAGTATCGAATCATATATCCAAAGCATTGTCCAGTATTCTTAGGC ATTTCACAAATACTTTTAAATTTCGGACATAGGACGCCATTTTGTTTTGG TGTTATTCCATCTCTACAGCAGCCGAGATCACTTTTGCAGCCTGGGCGCG CAACAACTGGTGTGTCAGTACAGAAGCCACATGATTTTGGACACATGGTA CCCATGAAGGACTTGTAACGTTTGCAATACCCTGGGGATGCGTACTCCAA GCATTTCACTGGTTGCTTGTCTTGGCAATTTGATTTGTATTGATCAACTG GTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016876TCONS_00016876Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016875TCONS_00016875Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016874TCONS_00016874Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016873TCONS_00016873Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000253supercontigsc0000253:124445..131647 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.05 0.1 0.08 0.04 13.6 10.31 11.51 16.12 3.72 7.55 6.36 2.35 5.28 6.46 3.76 3.63 4.11 4.68 3.96 4.26 3.03 2.02 0.88 1.93 4.61 7.06 0.22 0.43 11.2 14.73