XLOC_010090 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_010090
Unique NameXLOC_010090
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000282:162457..173966-

Legend: gene
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>XLOC_010090 ID=XLOC_010090|Name=XLOC_010090|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11510bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000282:162457..173966- (Clytia hemisphaerica)
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CTTAAACCTGTTTGATATTACTTTAAACCTTCTCCTAACTGCTACACTGC AGTGTGTGTCCGGAAAAAAAGCACAATGAATTAGATGGACGTTTTTTTAT AAAAACATCAACAATTTCGAAGCATTCAGATGCTCTTAATTTTTTTAGTT TTAAGCCTAAAAATGTTTTCAACATGTTTTTATTTTGACCATTTTATAAA TATGTTTGACCATTTTCCTAAGAAATAGGGTGTTTTGAGTCCACAAAGCC TGAAAGTCTTAGCTTGTTCTTAGCATTTTGGCCAGCGAAGCCTTATGTTC TTATATAGTTTGTTCATAAAAATAAAACGTGTATTGGCGATAAAGACAAT TCTTTCTCTACAGCATTCAATAATGCCGCCATTAGAAATCTAATTCTTTC AGAAAAGAAAGTCAGCTCTACGACCTCCAAATCGCCCAAGTTTTCTATTC AGAAAACTTCTTTCAGACATTTTTCAACAAACAACAAATAAAGGTTAAAG CGAATTTTGCGGACACACTATAGTATTTAAAATACACATTTGTAGTAAGT GATAAAAAATCATCTTTAAATCATTGCAAAGCCACATGTACTGCAAGTCT GTAGTCAAACTAAAACTAATTTGACTAAGATTTTTCACCCTCAACATAGA TACACTAAATGCCTGGGTCCTTCGTTTGGAAGGAAAGTTGTACTTTCATG GTTAGACTTAGACTTAATACCTTTATGTTTCCCTGGACCAAGCTTCATCC GCCATCTTTGATCCAAATTTTTTATGAATTGGTACCCATAAAGGAAACCA TTACAGTGTTAAAAATTAACGTCTAACGGCGCTACATCATCAAAAGTTTT CGNCCCCCCCCCCCCCCCATCAAATTCTAACGCCTCCCCTTTCTTTTTAG AGTACAAGCGACAACCCAAGTATATTTCCTACACCCATTTAGTGATTCGT TTTTCTCCTTTTCCTCTAAGGAAGGAAAACAACACAACATCTTCAAATTT TGAAACTAACCCATCCTTCGTTTTGTAGGATGCTCGTCCAATTTCGTCCC AGTCTTCTGCTTTTGTTGCCATGACAACAACAAAACTAACGAAAACAAAA AACTTAACAACGACACCGAGAATACGTACGACCTTTTACGAAAACCAAAT AATAACGACAACTCACGACAACAGCCGACTGATAACGAAGACAATAAACA TTACGTTAACATAAGCAATGAAAATACGCCGGCTCATTACGAGCCTGGAC GACCGACAAACGACAATACATACGAGAGTTACTCGGCAGAAAAAAATGCA CAAAAGAATCCGGACAGGAGTGTGTATTCGGAACTCGGAGAAGGCGGCCG TACGGGACCAAGAGATGCACCGATTCCGCAATCAAATTACGCCGAGGCCC GCGAATCGGATGCACTCAGAGAATGTTTGAATTCGCCTCCGAAAGATATC TTTGACTCACCGAATGAGCAGGATAATACTTATCAAAGCTTAGGAGGAAA TGTCCAAAATTCGTCCTACCCTGAACAAAAAGGAAGCCATCTTTTACCGG AAAATTACAACATTAATACCGGAGTTCCCGTATACAATGACCCCAAGTCA AGTATCCGGAATAACCCGCCCACATGGGAAAAACTTCAACGCCCTACAGC ACCAGGTGCTACGCCCCTTCAACCGGTCAACGTTCCAAAGTTTAATCGAT GATCGATAATTTGTTGAACTTCTTCTTGGATAGGCCATTTCACAGTCGCA AAGCGTAATGGGTAATCAGGACCACTGCGCGCTAATGACGACTTACTATT GGTCCAAAGTTTTGAAAATTTTTGAAGATTTTTGCGTCTAACCAACGGGA AACCGTTATCGGGGCGCAATCAGTCCTGATTACCCATGATCCATTTCGAC TGTGAAATGGCCTATTATTACAGCATTTGATTGGAGATCTTCATCACCTT TTGCAAACTGGCGAATGACTTCCCGTATACTTCAGCAACATCAGAAAAAA AATGCGTGCTGTCAATGTTCACCAACATTTCACAAGCGTTTGAATTTAAC TTGGTAAAGCTGCACAACTTGGTGCTAGAAATCTATAATTATATAACATG TTCGTGACAAATTAATTTTTGCGACTATTAGGTGTCATTCAGGAAAATAG AGACTTCTAAACGTTAGTATCCTGATATTAAAGTAGACAGCCCTACAGAC TACATGTTGGAGAGAATCGTCTTGAAAGTTATTTAGACAAAAACCAGAAA TCTTGGAAGATGCTAAATAATTTAACTTCAAATAAATCGGCAAATTCTTA ACAATCTTAGCCCTGGATCCCAAATTTGAGCTGTGTATTATAAAAGAGAA ATATGTAATGTAAATGGAACGCTTGGTTAAAGATCCAAAAAGTTGAGCTT TGGAATTGTAGAATGCAATAGTTATTTTAAAAATGATACCTTAGGCAAAA ATAAAAAAATGTAGTGTTTCCGGAAACGGGACAAGCTTGAGTTTTTACAA GCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCGTTAAGATGTAATAAAAGAATCTTATT ACTTTTTCTAAAGAACGCGTCATTTCTATCACTTTATATGACCAATTAGT GAAGTATCTTGTAAAAACTCCAAGGCATCTCCCGGAAACCGGCCGGGTGA AAAAAATAATCTTCTGAACCGGACGCAGACTTCGTGAGTAGTTGATACAT TAGTGTTCAGGGCTTGCTTCATGCTGTTTGTACATAAAAGTTATCTTAAA AGTTCTATTTCAATGATCAAAAATATCAAAAAAAGTTTTTTACCGGCCGG CCGCATGGGAGCTTTTTTCTATGACCCGCATTCCAAAAACACTACATTTT TTTTATTTTCGCCTTATTTTGCTTTTGCTTATCTACAATAAGTTAATGTG TAGGAAATAAGCCTAAATTTATATTTAACAGAATAAATAAAGTGACTTGG TAAAATTTCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00018006TCONS_00018006Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00018005TCONS_00018005Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00018004TCONS_00018004Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00018005-proteinTCONS_00018005-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000282supercontigsc0000282:162457..173966 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.77 0.68 0.94 1.37 1.21 1.04 1.4 1.57 2.69 1.88 3.2 2.99 12.07 11.33 23.17 26.71 10.3 11.25 18.47 19.33 1.9 1.95 2.5 2.66 3.69 3.68 19.62 15.59 6.34 6.6