XLOC_011307 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011307
Unique NameXLOC_011307
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000349:28793..37840-

Legend: gene
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>XLOC_011307 ID=XLOC_011307|Name=XLOC_011307|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9048bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000349:28793..37840- (Clytia hemisphaerica)
CGTAATGTATTTCTTCCAGATGTTGAAAATTTTCCCGACCTTCAGAGCTT TAGCGTGTCGGAAGAAAATTTCTACATCGGGTGCCAGATAAGATCTCCGA ACACCTTCTCTATTTAGAAAGCAGCATCTATAGTCATTTTAAAATTTTTC AGATTGAAAATGAGATTGAGGTAGACTAGGTTAGTAAGGAAATTCTTTTA CTTGATTGGTCAAGTAGGCGATTTATTACGTCATACAACAATAGTAATAA AAACTCGTGATTTTAAAAGATTTCATTCTACAAAAACTTTCGAGGAAAGA GAAGCCAGTGAATTTTAAAGAAAAATATACTAGCTGGAAAGCAAACATAA ATCTTTAAACAAAAAGATTTTATTTTCTTGCTCAGTCTGTTCAAACGTTA AATTATTATAAACATGGCTATCGTAACGTCTTGCACTAAAGGTTTATTCC TTATCTTCAACTTTGTTTTTTGGGTAAGATTCATTTTTATATTCATTCGC CTATTTTTGAGTGATCTTTTGAGCCTGATGCTATATGTCCCATATTAATT AGGATAGGTATTTTGTGAAACAAAAAAATGGTCTAACTATTAGGTAGTGA GCCATTAGCCTGTTAGCATCAAATTCTATCAAATAGAATTGGACAATAGG GACATGCCACTGCACTGGATGGAGTTTGCTGACACGCCCAACACCGGACG CAAAATGAGAAAAACCAGACAGGTTCTTGAATCAATCCGGTGCATCCGGT GGTGCGCAATAAAACACTAAAGAATTCCTATTTCTATTTCTGCAATCCAA AGCTCCTGAAAGAAGATAGTTGGACAGAAATTCTTTGAACTTCTTCACAT ATATGTGCATAAATTCATTATGGAATTACTTTCGCAAATATTTACCTCCA ACAACTGCTCTAACTTGGGAGTACCGTAAGTTGGTCTAATCCCTCGTCTA 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TGGTATTAGTGTCTACTTTTACTCAATATTGGCTTCTTTTATGTAAATTA CAGAAAAAACAAAAAAACAATGTTATAATATAATTTGAAGCCATTTTTTA AAAGTTCAAATTTTAAAAAGAATAAAGTGAAATATTTTGAGCAATGGGTT TTTAAAGTTTTTTCAAGGGACCTGTGTATCTGTAGTAAAGCAGGGTTTAT TTTATACTATACCTGACCCCTAACATTTTTACTTGTTTTACATAGGGATG TTACAGCGAGCTCTTAACAAAGACCAAGAAGAACTTTTTGATCGTCGGTG GATGCGCCCTTGGTATTGCTGTTTTCCAAGTAAGCGAAATTCATATCTCT GAACACACTTGTCACGGATATTTTCAAGAGGCTCCCAGTCACCTTTCAAA TCACGCAATCGAATCACACAAAAAGAATTTCCAAATCACCTTATCACGAG TTAAATTTCCTTTCTATCACGATCACGTTGATCACCTTCGTTCCTCCGTT CACGCAATCGCACACTTTAAAATCTAAATCACGAAATTACCAAAGCCGCT GGGGGGGCTCTTTCAAAAATCTAGACCGACCAAAATACCTAATGCAGTAA ATATGAGTTTGAATCTAATGCCTGTATTCATATCAATCAGATTGGGTCTG AGTAGGCTAGGGTGAAATTACGTCGATATCTACGCACCTGTGAACGTATC TACGCCGCAATGACTTCAGATATTTGACGTGTCTTGGCCCTCTGATAATC AAACCCAGGTTTTTTGACGCTTTAGGGTTCTGTGGTGGGTGTATTTACGA ATATGAATTTGTTCTAAAAAAAATGTATTCCCTTTAGGAGGGCTTTACCT CTTGAGCTTCCGATGAGATTTATCATTTTCAAATCTAAAGAACTGAAAAC GACTTTAGTTGAGAGTGGAGAGTGAAAAACTGCTGCCTCTCCATACTTGC AGCCTCTTTCTAGCCTCGTGAAAATTAAAAGTTGAGCAGGAAATAGTCTA GCAAGCTAGACGACTAATTCAGACATGAAATAAAGAAAAAAGTAATGGGG GAATAAATTTTAGTCTATACTTTAGTTTATACAAACTAAATTCCGTAACA ATAATCGTATTATCATATAATGCCTATACTACTGTATTACACGCATTATA AATGATTCCAGTCTATACAGGAAACGGAAATATTTACGATCTGATGTATC GCTGCTAGGAAACAGTTTGTCTTAACTAAAGCGATATCATTCTCTATGGA AAAATGGAAAAAATCGCATTGCCTGAAATGAAAATCAAGTTTTTTAAAGT GTCTCTTCGACACTTTAAAAACATAAGGCATCTTTCCCAAAAGTGTTTTC ATATTTTTTATGATTTTCTTCCTCCTTTAGATTCTTGGTATCTTATGCGC ATGGGCATTGACAAGACAATTCAATAGCGATAGCTACCAACAAATGTAGA TTCTGAAATCTCATAGCTGCAAAGGAAACTCATAGGGCTCATAGAGATGG TTAGAATATCTTTTGAGTATTTCTCATCAGCTTCTAGTCTGTGTACCCTC TTCTTGTTTCTCTTTTCCATTTTCTATTTGCACGCTCCATTTTATTTTGG TTTAATTCTTCTGTGGGAAGGGAGAAGTACTGATAATCTTGTAGAAAGCT CTCTCAAGATATAGAATTTCAATCTTGAAACGTGAACTTGTAGATTGTAG GAATTGTAAAAGTCTTTTGTTTTGAATCTTTGAATGCTTAGTCTTGCTAT TTTTATTTTGACAAAAATTACCATATCTTATTTGAAATTTTCAATAATTG TAGAAATTAGATTTTCGACATTATTTAGGTGTGTTTGTTGTTGACGAATT TTATGTGGATACTAAATGGTTGCTATTCTATATTTTTAACATTTGGGAAT TATCAGTTTTGTTCAAAAAAATAATATCTTTGCGAATATGTACAACAAGA GTTTTGAGGATAACTCCTACCCACTTATAGCTTTATATAAACCTTATAAA AAGGTAGTTTTTCAATCCCGGCCAAGCGGTAATGGTAGCACTACTCAATA GCGGTGTTATGCATCTACTTTTTCCTCGGACACTTGTGATGCCGCTTACG TTTCATGTTAGGCAAAGATTTGATACTGCTTGGCTTCTTTGCGGGTACAA CTCCGATCAACGTGTTCTTAACTCTCAGACTCAGTCGTAGGAAATCTTAT CAGATTATTCGCATAAATTTTAATTTTTTGCCTTTNTTCTTAACTCTCAG ACTCAGTCGTAGGAAATCTTATCAGATTATTCGCATGAATTTTAATTTTT TGCCTTTTTTTTTACTTGTCAGATATTTTGTTAGGGGATAGTTATACTTA TGTTTTGATTTAAAGAAAATTAATTTATATGATTCATTATCATGCGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020131TCONS_00020131Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020130TCONS_00020130Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020130-proteinTCONS_00020130-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000349supercontigsc0000349:28793..37840 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TSPAN6tetraspanin-6 isoform a Homo Sapiens
TSPAN7tetraspanin-7 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
230.38 226.85 141.53 129.08 44.51 31.12 74.68 83.18 187.1 158.42 207 164.46 148.71 145.88 185.25 225.05 132.47 140.12 163.1 188.68 151.94 155.35 185.1 203.19 114.81 118.82 239.69 239.33 396.16 356.58