XLOC_011473 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011473
Unique NameXLOC_011473
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000356:87812..112627-

Legend: gene
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>XLOC_011473 ID=XLOC_011473|Name=XLOC_011473|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24816bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000356:87812..112627- (Clytia hemisphaerica)
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ATCATTTTCATCTTCGTGAATAGACCCCAACGAAAATGACAGGCCCTTAA AATTCTACTTTAAAGCCCTTTTATGGTGATGATCAATAAAATCTGAAAAT CGACTTTCTCAAAACCTGGTCATGTTGCAAACCAAAATGTCACAAATTTG ATGGAGATTTAGAAAAACATTAGAACCATAGGTCAAAAATGAAGCGAATG AAGGTTATGGCCTTTCGTAGCCGTTTTTGACGAAAAAACCACACACAATT GCATTATGGGCATGAAATCCTGAAAAATGAAAATATTGTTGTGGGAATGA ATTTCTAGCAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNGTATTTTGATTTTAACACATATTTTTGAGATCA TTTAGGTACTAATGGTATATTCATAACATTAGTAACTTTACAGTGAATCG CTGTTCAAAATTTGAGGTCAAAAGAACTCTTTTGTAAAAAGTTATTCGAG AAAAACCATTTTGTAGGTTTTAAGGGGTAAATAGCTAAAACTGCACTTTT TCACTTCCTCGTGAAAAACTGAAAACTGTTTTCTACAAAACATCACTGCT AGGGAAGACAATCATAGACAACGTACTTTCACCACAAAAAGTTTCAGCCT TACACTCCAACTAAACAATGAGATAGAGGGTACCACTTTTTATTGTGGGT TTTAAGGGGTATCCACTGGTACATAAGAAAAAGTTTGGCCAGAATCCGCC AAATTAAGTTCCCGCCAAAATTTCTTTTTTCCACTATCTGCCAAATTAAA TTCCCGCCAAACTAAACTTTTTGAAAATATGATCTATTTTAAGGTGTTTT TGCATTCTTTTTGCTGTTTTTACGCCATTTAAAGGATAAAGTTTTCAGAG GATGAGCAGAAGCCTATAGTGTTGAAGGAAAGAATGCAACACTGGCGAAG CGAGTTTATGATTGATTCACTCGCATGTTGCTAAAATAATTTCGGAATAG AAAATCACGATCTTTCAATTTCAGATATTTTCTTCAATTGATAAAGACAG TGAAGATGATCCTTGGAATCAAATCAATCGGAACAACCATTTCAGTACTT ATTTTTCTAGTACCCAAGTATTATTCAGGTATAACATTCATTTTTACACA TTGTTTATAAGAACAAAGTATATAAGAACATAAGACTTCGATGGCCAAAA TGTTAAAAACAAGTTAAGAACATTTCTAAGGCTTTGTGGACTCGAAAACA CCCGACTTTTTAGGAACATGGGTAAAAAATGGTCACAAGAACATTTTAGG CTTGAAATCAAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTTCAATAACTTTCTTA TAAAAAACGTGTACTTTAATTATTTGAATAACGTGTTTCGAGTACTGGAC CCTACTCAGCTGGTACTTGATGTCTGAAAAACGACCGTATTGCAGTGGTA GAGCATCCGGCTACGGTTCGCAAGGTTGTGGGTTCGATCCCCAGCCGGGT CATACCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTGATGCCTCTCTGCTTGATGCTC TACAATTAAGAGAGGGATCAAGGGTAAGCGGAGCAAAGAGTGGTGCCTTC CCCTAGCTTCTGGTAGATAGCTATCGAAAGAGAAGCCTTCGGGTCGCCTC CGACTGTGGTCACAGACTTACTTACTACTTACTAACGTCTGAAAAACGTC CGTCCGACGTCCATGACATTCACATAACATTAAAAATATTTTGTGCCAGC TGGGTACGGCTTGATTATTCCTGACCCAGGAATAGATGTTTGTAAGGAAA ATCTTCTTCCAGAAAATACTTCAAATTCCTTTTAACGGCAGTGGTGACAG TTTTTTTATGTTTAAAGGGATGTGTTAAGGGACACAAACTTTGAAGATAT AAACTAAAACAACAGCCACAAAACAGGATATTTTTAATTAAATTTTACTG ACGTTTAGAGTTGCTACGGGCGAGAATTGGCCGAACATAATGTTGGCGTG TACATCGGGTGCCAAATGTGATCAAAAGCTGAGATCTGTTCAAATTGATA ACATGCAAGATTGTGGCTCACCAATTGCTTATGTTTATTTCATCTCTTTT GTTTTCTTCTGCTCTTTTCTTGTAAGAATCTTCATTTGGAATAGGAAAAT TCACCGCGACTTATTTTACTGTGTGACTTGAATGAATGCTTAAAAAAAGG GAGACAATTTTTTTCAAAATAACTTAATTTTAACGAGACTTGAAATTTTC GTGGTGATTAGATTTTGCGAAACAGCCTCTTTTTGACCTAATTTCTTTCA TTTTCCATAGAGTTTCTGGGAAACGTCACGATTTTAAATTTTACGTGTGA ATTGTATTTCGCGAATGCAATGATTTTAGATATTCGCAAGCATTAAATTT CTCGAATTTTCGGTAAAACTTTCTTTCTTTAGATGTTGAATCTCTTCATT GCTGTCATTATGGATAACTTTGCATTTTTAACAGAAGATTCTAGTATCTT GGGACCACATCATTTGGATGAATTTGTCACCGTTTGGTCTGATTTCGATC CTAGAGCATCGTATGTTAAATTGAAAAGTTAACACTCTCCATTACCAAGT TGTCATATTTAAGATATTCGTAAAACAGAAAATGAAGCCATTGCTTTTGT TGCTTTTGTTACGTGACTTCATCAGCATCAAGTACTTCTACTCTCGGGTA CCTAATAGCCAGGGGGTTTGGAATAAACAGGGGGGGTTGGAAAAAATCTA AAAATTTAATAAGCGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNGGGGGGTTGGAAAAAATCTCAAAATTTAATAAGCGG GGGGGTTGGAATAAAAATGTCCTGGGTGGAAAATGTTCGAAAAGGAGGCT GATACAGCCGAATTAGGGCAAAAGAGGTAACTTTCAAAAAAAATTTTCCC AAAAATCAATAAGCGGGGGGTTTGGAATAAGAATGTCCTGGGTGGAAAAT TTTCGGAAAATTAATTAGCGGCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTAGT TAACATCTAGATTAACGTCTAGGAACACGCATTTCGTTGGACCTCGTACT TCGTGGAAGAATGTGTGGTTCAATTTCTTAACAAGAGATGATGAAAGCTT GCACAATGATCCAAAATTTCATCCAACTTTTAGAATTTTTTTTAAAATTA ACTTTCACACAGTTCTTCCAAAATTTGGTCCAGCCAGGTCCAGCAATGTT TTTCTGCTTAACCTTAACCATAACCAGCTATCATATTTTCTTTCAGAGGT CGTATACAACACACAGAAGTCTGTGAGTTATTACGTCAAATGTTACCGCC TGTTGGTCTTGGTTTGAAATGTCCAAAAACTGTAGCATACAAGGTATTGG AACTTCTATCGATTATTTTGAAATTATATCTTTGAGATTTTTACTCTTCC GAGGTACTGCTTTCTTATGTCTCATGGATGGCGCAAAACAAGGCTATAAC AAATTTCGCTAAATTTGATACAATTAGTGCAACTGGAAAATAGAAATGCC AATTTTCCTTCAGCCTAAAATAAAGTTCGGTAAAGGTGAAAAAACGGACA AAAGACATTCTTTTGAGATATTCAGGGTGATGTGGAGAGGGATGTGGCTT AGGTACGTGGCTTTAGATATATTTCGCTTTATATTATCTTTTCATATAGC GACTTGTGCAAATGAACATGCGATATTATCGTGATGGAACAGTCGATTAT ACAGGAACCTTCTTTGCTCTTGTTCGGACTGGTCTCAAAGTCGCCACTCA AGATGGTTAGTACTGAAAAACTATTAGAATCTCTCCATGTGACCATTAGA TAATCATATAAAAAAACATTCAGTTCTTTGTTTGTTACATGGAGGGTTGA TAAAGCAATAGTATTATATACAACTTGGCTATCCCAGAATCCTGTATGAC TCAGTGTTAAGGTGTAACATCAAAGGGGTGTTTAAATGGAAAATCTAGAT GGTCTGCAGATTTCGAGGATAAAAATCTCTAGAAAACAACTTCCACCTGG GAAGATTATTTCTCTAATCGAATAATTCACTCAACTTTCTACAAGACTGC AGCGTTCTTCCATTCTTTACTCAATTATTTCCAACTTTTTCAGCAAACTT GAAGAAGACAGACCAAGAATTTAAGAACATGTTGAAGAAACAAATAAAAG TACCAAAGCGAACGTTGGATATGATCATACCTCGTGTTCCACGAAGTAAG AGAATTATTATCTGATCATCAGTATTTAGTAGTGTTGCAACTTTTCCGTC CGTCCAGTTAAGATACCGGGTGCGCCACAAAAAAGTTTCTCTCTTTGAAA CTAATTTTCTTGAAATTTAAAAATCTTAAAAGAACCACTCCTATTTCATT GGAAAGAAGATAGATAGACTTAAATTTTGATGGGTCATTTATTAAATTCG ATTGATTAGATCAAAAGTTATGCTCAATTGAATAAAAAAGTTACTTTCGG AAAATGCTCGAAAACGTTAAGAATCGACCTATCAAGTTTTTACTTTAAAT TTGGCAATTGCAATAGCCTTTACATGATTTCAGAGCATTTTTCAGTAACA AAATACATAAATTTTGAAACTGAAGGGTTGAAAGGGTTTAAATTCTTCAT CAAAATCAATTTAATTTAGTTTTACCGAAAATTTCCTCAGATTTTTGGTT CTAGACTGGATAAAGTCTATGTAAGGCTGGATCTACCTCGAAACCCATAT TTGATGTATTTTTATGAATTTTACCAAATTATTTGGCCTTTTTTTGACGA ATTTTCTTCCTTTCATTGAAATTCAACCTTCCTTTATATAACAAAAGGTC ATTTCGACAGCTAATTATCATTTTTTATGACTGAAACGAAAATATTGATA TATCATGTAATTATGCTTCTGTTTAATTTGATAGGTCAATATTTAACGTT TTTAAGCATTTTCCGAAAGTAAATTTTTTATTCAATTGAGCATAACTTTT GATCTAATGAATCGAATTCAATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTTTATC TTTTTTCTTTCCAATGAAATAGGAATGGTTCTTTTAAAACTTTTAGATTT CGAGAAAATTAGTTTTAAAGGGAGAAACTTTTTTGTGGCGCACCCGGTAT AAATACATAAATTCCGTCTTGCCAGTAAGAGAATTTTTTGGTCAATATCC CAAAAAGCCAAAAAACTTCCTTCCAGATTTATAAAACCTAGTTGCCGCAC TGATTTAAAAAATTGGTATCATTCTTCAATGAAGTTTAAGTAAAAAAAGT AAAAAAGTTCCAGATTTATAAAACCTAGTTGCCGCACTGATTTAAAAAAT TGGTATCATTCTTCAATGAAGTTTAAGTAAAAAAAGTAAAAAAGTATTTA AAAAAAATAAGCCCGAATGGCTGGAACTGAACCTTTCTGAGGCAAGAAAA AGTGAAGCCTTAAAATATTCGCCGTATTTTTGACGACGGATTGAATCTAG CGATTCTTTTGTTTTCGGGTGATATCATTTTCGAAATTTGGGTGTAAATT TTAGTTCCAATCTGTCATTTGTGTAACAACAAGGTGGACCACGCTAGGCC GCGCAACTTTGGTTGGATTTGGTAGGCTTCAAATGCTACCAAGGAGATTC GATTCTAGCCCTTCTTATACTGCATTGTCATTCTTTCATTTGGACTTGTT GTTTTGATGGTTATTTTCAAACGATTTCTTGTACAATGTATTAGTATCGT ATCAGTATTAGAAAATTTTGAAAAGTTGTGATATTTTCTCCACATTTAAT TTTCAAATATCTTCATGTAAAGTGTCGTCATTTTCATGAAATTGATTTTA ATTTAAGCTCTTGAACCTTGTTATCACTTTTTCAGATGCCAAACACATGA CTATTGCGAAAATATATACAGCTAAATTGATATGGGAGAATTACAAAAAC ATGAAAAAAGCTCAACAACCAGAACGCAGAAAGTCCATATTCGTCCCTTC TGTAAGTCCAATTTATAACTATCCCTTTCTCCGTCCAAGATAGTCACCTT AAAATGCTCTTGGATTATCGTGAATTGATCATATCTAGAACCCAACCTTT GTATTAGATCTCAATATTTGTTTATAGCGAATAATAAGGAATTTACAGTT GATGCTCTCTAATTCGACGTTCTATTATTCGATACGCTCCATTATTCGAT AGTATTTAAAGTCCTCTTCAAGACCTAAACTATCGAAATCTGATTTTATC TTTTAGGCTGAACCACCCAAACCAGTAGCGAACGGTAAAGCTCCGGTACG TAACGGACATGCTAACGGAAGCGTCCCTAACGGCGGTGTTACGTTAAAAC AAGCAGATGAGGAATGGTGCTAAGTAAAAGCAAAACTTTGATTACGTCAT CTGTTAAGATTTTGGTTTGTTTTTTAACGCACCACGTTAAAACTTTTCAA AACACCCCTGTCTCAGTGCCCCGGTGGCATGATTTCAGTACATGATTTTT TTCAGTACATGGTTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020426TCONS_00020426Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020425TCONS_00020425Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020424TCONS_00020424Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020423TCONS_00020423Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020422TCONS_00020422Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020421TCONS_00020421Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020424-proteinTCONS_00020424-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000356supercontigsc0000356:87812..112627 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.47 0.33 0.31 0.35 0.73 0.47 2.09 1.91 1.49 1.23 1.8 1.08 9.45 10.31 5.68 4.57 2.45 2.66 9.38 10.2 6.73 6.23 2.68 4.22 4.08 5.48 2.92 1.96 0.23 0.29