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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000400:80265..88112- Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012304 ID=XLOC_012304|Name=XLOC_012304|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7848bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000400:80265..88112- (Clytia hemisphaerica) TTTAGAGTAGGATTTAAAGTAAGACATATAAAATAAATGATGAAATTGTG
AGAAAAATTACTCGATGGCTGAAGAAAAACAAAAGGAGAGAAAACAAAGC
ATTGAGCTTTTGTATTATCAACAGGCTCGAAAGTCAATGAGCGAACAAGA
ACGATTGCAATTTGTTTTGAAAGAAAATGGAAATTGTGAAGGCTTTTTAG
AGTTTCAAGTACAGAGTATTTTCAAGAAATATTTTTTTGTTTTGGATTTG
CTGGAGCGCTCATTTTCTTATTATAATGTCAATCCAAAGGTTAGTTCTTC
TACTAGTCTTTATTTTTTAGTATTTTTGTGCTTAGTAATCTTTCTTACTC
CAATCATTTAGAAATTTGTTCGTTTTTTTGAGGTCGCTCGATTTTTTTAG
TCATAGCACTTTTTATACATTTTTGGAAAGCTAAGGGGTAGGGGAATCAA
AATAACTTGGATGCCAATTTTTTTTCGGACACTTTGAAAAATTAAGATTA
GAGATATATTGCAAGTATAGGTCATTTCTGTACCTAATTCGAGATGTTAA
CCCTTAAAACAGTGTTTTTCAGCCAGAAACAGCTGTTTTGACCAGTTTTT
GCGCTTTTTGAAGCTCAATATGTCGAGTTAGGTACTAAAATCGCCTATAC
TCGCAATATATCTCTAATCTTAATTTTTTGAGAGCTTTCCAAAAATATAC
AACAGGTCTATTTTCTCAAGCTAAAATTTCATTGATTTTTGACCCTATAA
TTTTTGCCTGAAACCGCCATATTTGTCTGAAAATCACACCAAAGTGTCCG
AAAAAAAATTGGCACCCAAGTTATTTTGATTCCCCTACCCCTTAGCCAAA
TTTGAAAGATTGCATCTCCAGTCACAGCATTTTATTAACGATGGATCCGG
GTAACTTCATTGTATATATAAAATGGATTTATCCATAAGGTGAAATTCTA
CTCTCAACACATTTAAAAGAGTTCCTAAACATACTACCATTTTCTTTTCT
TTTTTTAGAGATCCAATGCTTCACAGTGCACACTGGACTCCATTTCTGTC
TCAGATATTACAAAAGTATAATAATGTTGATTAGTTATCCAATGAAATCG
GAGCTTTGATTATCTTTAACTTGCTCTGGTTTCCTCGATCATTTGTCATG
GCATGAATTTTTCATGAAGATTTTTTGATACTATTTTTGCAAAGTGTAAA
AGTTCTTTAACCTTTATTAAGTGTGATTTATTCACTTAAAGTTTTTCAAA
ACAATATTATTAAGATTGCCATACTCCTAATTTGGTTTTTAAAGTTAACA
ATTTTAAAGAAATTCTAAATTTTTATCCAGGTCACTGCAAAACCGAATCT
AAAAGAGTTTGCTTTTGGTAAGTTTATTATATGGAGAGGTATCGAAGTTG
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AAGAGGTGTTTTTGACCAAAGAAGCTGGATTTTTCTTTTAAAATAAGCGT
GCTCACCCTGTGATAGAATAATGCCTAGGGTGGGTTCCGCAAAATTACTT
TAACCTTTAATTTTGAATGACTTGAATCTTTTTTTGTTACCTCAGTAATC
TTTGACGTCTTGGGTGTCAATCTAATTATTTTACTAGCGTGTAACCCAGA
GTTAAATATGAAAATGCCTATGGTCAACTGAGGATATAGGTATTATTTCA
TACTTAATAGAAGTTACTTCTGGAAATTTAAAGAAATGAGGAAAACGTGG
AATTTAATATTTGTATTCTTCTTTTTTAGAGGTCAGCACGCACAGCAATA
AATATTTTCTTGCGGCCAAAGATGAGCGTGACATGAAGATTTGGATTCAA
GCTTTGAAAAAAGCTGCAGTGAGTGAATTAATTTTTTTCCAATCTTAATC
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TTACTTATAAAAGTTTCCCTCTTCCAAAATTCAATGTACCGCTTTAACAA
TTAATGTAGTAATCTTACTTGCAGACCTGGGATAAAATATGTTTTCATAT
CAATAATCGACTTTAGCACATTTTACTGCCATGTTAGGAGATCATTACAG
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ACACTGAAAGCAATCCATTGAAATCGAGTTCATGTGAACAATTGAACAAA
GTCAATGAAGCTCATAGTACCTCTATTATCGGCGGCTGTGTTATTACTAC
GCCCGTATCACAGGTAGAAGACTAATTTTTTTAATTATTTTTATCATTAT
TTTAATGACCAAATACGATAAGATTTTGATGGAGACCTATTGCGGTAATG
TCAGATTTTTATAATACATTACCCAGTCTAGTCAAATTCTACTGATATCA
TTGGTTTACCTTTCAACTTTTACTTAATTGAAAATTGTGTTTAAAAGTTA
ATGAGAGACACCAAATACTGAAAGACTATCAACCCTCTATAAGGTTAATA
TCGAACATCTAAAATGCTATCAATCAAAATTTCCTATACAGTAATTGAAT
CCTAATGGATTGCCAACCCTATTTTTGTTTCATTTCTTTCATGTAGCAGA
TTGATAAGAAACGTAACAATAGCAATACAGTGGCAAGGAGTGCACTTCGT
ATAATACGGGAAGGATATTGCTGGAAGCAAGGTGCAGTGGTAAGATTCCT
CATTTAATGCCTAGAATTCTTCGAATTTAGGTTTTATTCTATAAATGTTA
AAGCAAGGTTCAATCATAGACACTGATTAAAATATCTTGAATGTGAATCT
TGAATATGCGTCGAGAAAATTGTCTACATCCATTTTTCGAAATTCTTTCG
ACAGAGAAAATGTGTGTATTACAATCAAGGTCACGCAATAATTCTTGATA
GAATCCTACAAATTCTTCTGTGACTCTGTAGGTTTTTGCCAGTAGACCAC
CCAACTGAAAGTAGTATTTTAAAATTGTTTTCGTAATTATTTATGGCCTT
TCTATCACATTTGCCCATTGCCTTTATTTAAAATTTGTTAATGCTCCACG
ACAACTTTTGCTTGTTAATTAAATCCAAATCCTGAAATCGTTACCTCATA
TCTTAAAGAAAATCCTATCTTTTTGGAGATCATTGTTTTAAAAAAATTGA
TTTTGGCTCTTTTCCAGTCATTTGAACCTCATGGATAATGATTTGATATT
TTTTGATTTGATCCCATTTTCAGATGAAGAATTGGAAACGACGCTACTTT
CGATTGAATGCTGTCAGCTTAGCATACTACGAAACTCATAACGAGCAGAA
TTACATTAAATCCATTTCCACAAATGATATTCGTAAAGTCAAAATCATGG
AAAGGTGAAACAAAATGCTCTTTCGTAAACCTTTTTGATTTTATTTATGG
GGAACTTAAAATCGCCAACATCGTTTTTTGATGAGAAATATTGGCTCGAT
AGCTCCCATTCGTTCTGTCATGTACTTGCGCTACTTTGAGAATCCCGGCA
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GGTGACTGACGATTCCACTGAGCCATTGCGACGCAAGTCCATTGCAAACG
AACGAGGCCGCCCCTGTGGGACGCCTCACCTTTAGCGTTGTGTTACACAC
TGATCGAATACACTCTTATGATGTTAATGATTTGCATACAATCTGAACAG
TTTTGACCCAATTTTCACTTGTGGTTTTTTTTTACGCATGCGTAGTACAA
GTATGGGAAATTGTACTTTCTCACCCTATATATTGTACTTTCCCACCCTA
TTAATTTTACTCTCCCACCCTATTAATTGTACTTTCCCACCCTATTAATT
TGACTTTCACACCCTATTAATTCGACTTTACCACCCGTGGGAACTAATGA
TTTTTTTCCTTTGTCTGCCTTGACCTTCTGCGTTTTTAGAGTTTTGTAGT
GTAAGTTTTCGTCAACTATAGTTGCTAAGTGTTTATTTGAAATTCACACC
TAAGATTATATGTATCAAATATAATTCCGCAGTGTGGTATTAGTAATACC
GATGTATCGATGTATCAACATATTTCAGATAAAGTCCAGGGTGTGAAATG
AGAAATCCTAAAGATTTAAATTTTATTTATGTACCCGTAATTTTATTGCG
GGAAAATTCCAATGGAGGAAATTATGTTTCACACTCGTATGATGTACTTT
TTGTAGTTAGAATTTCCATATTACACGTCTAAACTTCATAGACTATGATA
TCTTTTGGAAAAAGTCCGCATTGTGATTTTGCGAATCCTAGGGCTTAAAA
AATTCCACTTCACAGCTTGAGAAAATTTACCCGGAACAAATAATTTTACA
ATTTTCCAGCGCTGGGGTTTTCCCACCCGTGGGATCTGATGACTTTTTCC
TGTGATACTGTCATCGAGTTTTCAATGAAAAAAGTAATTTCGCTTACAAA
AATTCGGTTACATAATATATTTAGAAATTTTAGATTATTTTGAAAATGAA
TTCCCACCCACACCCAATTTCTTCATGAGCACTTAGCTGACTGATCGAAC
TGATTTATAATATTTTATGATAGTCGTTTTATGATAGCGACCGTAATGCA
GTGGTGGAGCATCTTGCTACGGTTCGCAAGGTTGTGGGTTCAACCCCCAG
CCGGGTCATACCAAATATTATCAAAATGGTACTTAAATCCTCTCTGCTTG
ATGCTCAGCAATTAAGAAGAGGATCAAGGGTAAGTGGAGCAATCCAGGGA
GAAAGAGTGGCGCCATCCCCTACTTTCGGGTAGATAGCTATCGAAAGAGG
AGCCTTAGGGTCGCCTCCCCGACTGCGCAGGTATACTTATGATAGTTGTC
AATATACCAATATTTTCATTGTAGGTTTTGTAACCGAATTAACGTGATTG
AAGTTGATACCCCTGGAAGGAAGTTTTACATGCATGTAAGGTGGTTTTCT
TTCTTATCACAATTCCAAATTCAAAACTCGAACCTTCATAACGTGGTGTT
TATTTTACCGAAAGGTTTCTGGTTATTTTTATTAAAATTTGTTGTTGAGT
TGTTATATTGTTGTATCGTTGCTTATTGGACCAAGAAACTTTCTTGATTG
GACTATTCCAGAAATAGTCTGTACCCCCAATTAATGGTCTGGTTTTTTGA
ATGATAAAATCCAGGGTGGTCCAAAGAAATGGGAGAAAAAAGTCCAAGGG
GATCCTGAAAATTTGGAAAAAAGTCCAGGGGGTCACTTTAAAAAAAAAGA
AGATCTCCCCAACATACATAGGGGGTACAAATCTTTTCTGGAATAGCCCA
TTAGAGGGAAAACAAAATTTGTCAATGTTAATTACTTTTATGTCTCCATA
AATCGGATTGTCTTTAACTCGTACTGTTACTGCCCCTTACCCTCTTTCTG
ATGTCGGAGTTTAGAATAGAGACTTGGCTTTATGACTTGTTATTGGGCTT
TTCCAGAAAACAATTTTACCCCACTGTTGACGATATTGATTTTCGAAGTA
TCGAACCCCCTGGATATCCACTCTTATAAAGATGGATATCGTATTTTTTA
CTTGAAAAGACACTTTACCCCCTGGATATCCGCTCCTTTGTAGATAAACC
CACTGGATATCCGATATCCTCAACAAGAGGGGGCACAGACTATTTCTGGA
AAAGCCTATGAAAAGTTCCCATGACATAGAGCTCCTACTTTTGTCCATTT
AAAGTAACAAAGTTTACATTGTCTTGTTCTTTTTTAGCCAGAGAACATTG
AAGAAGTACAAGTTTGGAGAACTGCTCTAGAAGACATTGCTCAAAGTAAC
TCTGTCTATCTACCACGTACCAAATCAGTTTAATAAGACAGAGGTTGTTT
CGGTTTTATATTAATTTTAACATTTATGCCTTTATTTATTTTTGCTAAAA
AACCAAACTATATTTTTCTTTTTGTGGACTGTTTATTCAACCATCATTTT
CGTTTTGAGATGTCGTATCTAGAAAAGTAATATATCATGTCATGTCTGTA
TATATTATGTATCTACACGTAGGTAACCAATTCTTTTATCCTGGATTTAT
TTTCATCTTTATTTTGACTTCATCATTAAGGATTCTTTTTTTGTTTTGCA
TCTTCAACCCTGAAAACTGTAAATATAAACTGTATATACACATCTGTATC
GAATTTAAAAGCGTTAAGAAAAGCTCATCTTAAGAATTCATACACACATA
CCCATTTTGTACCGTTTCGAACTACTTTCAATCTTAATTTTTTATATATA
ATTTATGTTTATGTTAGTACTTTAGTCTACGGGGTTGTGTTAGATAATAA
CAATGGGCTCTTTCGCAGAATGTTCGTGTCGATCGGGTACCTTAAGTGGA
GTAAATTTTGCGTGGATTAATTTTGGCGATTTTAGCGATTTTAGCAAATT
TTGGCCGTTTTCGCGAAAAAATTGGCCAAAGCCCCTAGGAAAATGAAACA
AATCGGGTGATAACCAAGCCGATTCGCGAAATTTTGTCCACGTGAAAATT
TTAAATTCTCTACTCGACTTAAGGTTAAAAAGATTATACATAATTTACCC
TCGGACATTTTTGTATTTACCTTTTTTTCAAGGAACTTTTCAGGAAGCCC
CAAGATAATTTAGATAGATAATTTCAACTTTGCATGTCATGAATAATATT
ATAATTTGGATTCAGCTTTGATGACATGTGATGAGTTTAGATGTGGATAA
GATAAAAAAGATCAGTCTTAAAGATTTATCCAAATCCTCGAAAAATATTA
CCTGCAAAAGGGTGGAAAGTTACCCATTCAATACTTTTCTAATACCGTTA
AGTTCCTCAAAGGAAAAAAATATTCAAAAAAGACATTTTCGTATGATTAA
ACACTCGTTCCAGTCCCGTAGGTTGGATCTGATGATTTTGATAGCACCCG
ATAAAGGTGAGATTGGGCTCTTCCAGAAAAAAACGTTCATAGGGGGTGGA
AGATATATTGTCCAGGGGCATCGAAAAATCCTGAAAAACTGTCCATGGGG
TGAACTTATGATGTCCAGGGGTAAATTTTAGTGTCCAGGGGGACGGTTTG
ATGCTTGTCCAGGGATAAAACGCGTGTCCAGGGGGTGAAAAGTCGAAATG
TCCAGGGGTAGATCATTGAAAATATAATCCACTCCCACTCCCATGAACGA
ATTTTTTTCTGGAAGAGCCCATTCAACCACATCTTAGGTTCTTTGTTTAG
GGTCGAGATCAAAATTCCGACCTGGGCTTTATCCTTTATCTCCAACAAGA
TTTTTTTGTTGATACTTGTAAAATGGGTGTTAAATAGTAGGTTACTTTGT
AGTGTGTACTAAAATGTAGAAGTAGTTTTTAAATACACTAGGTCACTTTA
ACTCCTTATAGTTTGTATATATTTAGAATATGATTTTCTTTGTAGTGAAA
GATTATCATCTATATTATAAGAACTTTATATAAAATTTATTACTTTTTTA
TTGTAATATCTTTACAAATTTCTTATAAATAAAAGAAGTATCTTTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000400 | supercontig | sc0000400:80265..88112 - |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog Name | Description | Organism |
PLEKHA1 | PREDICTED: pleckstrin homology domain-containing family A member 1 isoform X3 | Homo Sapiens |
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