XLOC_012345 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012345
Unique NameXLOC_012345
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000401:259889..270840-

Legend: gene
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>XLOC_012345 ID=XLOC_012345|Name=XLOC_012345|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10952bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000401:259889..270840- (Clytia hemisphaerica)
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AAACTCTGGCGCGCTACTACTGGATACGCTCCCTTATTCCAATTCTCCTT AAAAACGAATTAAAAAGCGTCATCAACTGTAGTATCAGCTTTGTATCAGC TTTGTTCACTTTTTCTTACAGTTTTACTACTCGAAACAATCATCCTCTAG CAGCACTGAGGACGAGAACAATACAGCTTCAAGAGAAGAACTACAACAAC GTGTTGCTTCTCTAGAAGCGATGACCCAAGAACTATATAAAGCCTCAACT AATAAACTCTTACAAACTTNGTTGCCTCTCTAGAAGCGATGACCCAAGAA CTATATAAAGCCTCAACTAATAAACTCTTACAAACTTTAAAAGAGAACTC TATGGAAACTTCCTCCGCCAGGTAACATACTGTTATTTGTTGATATTATT TTCTTTCTTTGGAGATCGCCACGGTCTGGTTGTTTTGAATGTTTTTATGG ATTTAGAGGGCTCAAACTCAGCTGTGAATTGAGCAACAACATATGTATTG GACCAAGACAGCTCGTATTGTTATTTTTGATTATGTCAGCATTAAAGGGT TGAAACTCGAACCACTAATAGAAGAGCATTATATGGTAGCTGTTTTATTG TTGTCATTTCTTTGGTTTCGATTATTTCAATCATCTGGTTGTTTTAAATG GTGTAGGGTTTAATAAAAGCTCTAACCGAACAACATATATCATTTCAAGA CGGCTCATTTTCTTTGGTATTTGGTAATGTTTGCCTGAAATTTTCGTATT CATAACAATATGAATATTGAACCAAGACATGGTTGTTTTTATCTTTGCTT TCGATTACCTCATTCTTCTGGTTGTTTTTATTATTTGAGGTATTTGAGTG AGGACTAGACCATGAGAGCATTATTGACTTTACTCGCTGGCCATACAATT TCTACGGCATGTTTGTTTTTATGGTTCCATTGGAATAGTTCCAACAACAC TATAGCTGGCCAGATAGTTACAGCTTGTTATTTTTTTTTGGTTGATTTTG TTCTATGGTTTTATTTTGGTTTGTTTGTCAGTGCGAGGTTGTTTCGAATT GAACTAAACTACCTCGCCCCATAGTTGATATATACGTGACTAGCATGAAG ACCAGGACCCTTCAGTATAAGAACTATGTTATGTTTTGCGCTCCTATCGA ACAATATCATGTCGAAGAGCTAGAGTTTTATTCGAGCGATATAAAAATTA TAACAAACTTCTGGTGAAAGCAACAATTTCGACTCTTTGTCCTTTACCAT CTCAGATAAAACACACAACAGAAAACAAGAAAACTTGATGACAAGTTTCT ATAATTTGTCAGTAATATGGAACTTTTTAGTATCATTTTCATAAGATAAG TTTTTATTATTATTATAACACTATATATAGTTCTGAAAAAGGTAAGAAAA CACCATACTACTAAAATAAAATCAATAAAACTAATTTTGATAATTTCCCT AAACTTTACAACCTGTAAAGTAAATGTATTGTCTGATTCGTCTGGCAGCT GAGATATTCAAGTTTTAATGATGACAACACCAGAGAAGTGTGGATCTTTC TAAGATTGTTTCTTTATCAAATCTTTCACTAAGGCTTTTGTTTCCATCGT TTTTGATTCTATTGCTCTATGATGTTTGGGCCTTTTTTCTTGCATAAAAT TCAAGATTCGGTTACCTCAAGAGCTGATGAATGATATATTCAACGTATTT GGAGTTATAGCTTAGAAGCCAGCTGGCTTTCCTCCTTTCCTATAATCACA ATAGGCGTTGAGTTTACCGCCTGGTAACCTTACTATAGCTTGAACAACTC CCATAATGGCGTCCATTTGACCTATGAGGAAAAAAGGAGAGTAGTAATTT TGAAGGACGGTGTTTTGATGCTTTTTTGTCAGTTTTTGGAACAAATTGAC CTATCCAAGACCGAAGGAGGGAGGGTGAAGCCACGCAGCTTGTCTGACTG CTGTATTACCCTCACTTACCCCCTCGACAGCCGTGCACCCTGCCCTTCCT CCTTAAGGCGGCGCCAAAGGTACTCTAAAAAAAGAGGAGATCCTTAGCTT TCTGATAACTATTAACTATTCCTTCTAGTTCCGGAGATCCAGTTTTAAGT TGTACTGCTCCAATTTTTGAGAAAGCTTAGTAAAAAGCATGCTACGACTG CACTTGAAAAACTAATCAGGACGTCGTTGTTTGACGTTTCCTGTAAACTT AGAAGAGTAAAATACCTACCTGATACATCATAAGTACTATTGGTGACATA TTCATGTTTATATTTGCTGATTGGGCCCAACAAATCTTTCGGAAACGTTG GCTCGTATACCACAGTTGGTGGGAAAAGTTGACAATGTATACGGGGCTTT GCGACAGCTACAGCGATATTGTTACGGAAAAATAACCAGTTAGCAATTGT CT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021997TCONS_00021997Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021996TCONS_00021996Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021995TCONS_00021995Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021997-proteinTCONS_00021997-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000401supercontigsc0000401:259889..270840 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
WDR18WD repeat-containing protein 18 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.24 6.81 4.07 2.77 12.75 8.85 8.46 9.6 5.95 6.53 3.94 4.32 3.44 3.97 5.88 7.54 8.79 7.85 0.74 1.21 5.39 5.67 9.93 8.92 5.38 6.58 1.78 1.42 6.33 7.29