XLOC_012906 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_012906
Unique Name	XLOC_012906
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000437:40308..46632-

gene from alignment at sc0000437:40308..46632-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_012906 ID=XLOC_012906|Name=XLOC_012906|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6325bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000437:40308..46632- (Clytia hemisphaerica)
ACTGAACTTTTTTCTTCATCCAGTCACTGTTACGATTACAATCCAGCCAT
TCAACCACGTTGCAATGTTGTGTTGGGAGTGATCAGTAAAGAAAGCAAAG
AAGATGATATCAACAGGGCACTTGATGTTTTGACTAAGGTAAAAATAACA
TGGTGACCTAATCGTTTTTTGGTAAAGGGGTATATATCTTAAGGAGTGAT
CAGATGGTTTGAGGTATTTGTCATGCAGATTCCTTTATTGGGCCATTCCA
TTTTACATCCATACAGGGGGGGTGGGGTGGACGAACATTTCCAGAGGGTA
ATCTGAGAAAAATTTCCAGGGGGCGTTTTTCATTTGTTTTCATTTTCAAG
GGATTAAAAGGTTGTTCTAAAATTCAGTGAAAGACTGATTTTAGTTCGTC
CATCCTCACTTTAAGGGACGAGAAGAATTTTTTTAAGGGTATTCTTGCAA
ATTTTGCCATTTTCCAGGGGGTATCTACACATTTTCAATATTTTTTTGTG
ACTTGAAAACACGAACTAATTTGACGTTACCTTACTTCAATGCAAGGCAT
ATTACAGTTTTGTTATCGGCGCACGGCATTTTTAGGCTGCCTATAAAGTG
TTCCTAAAAGCTGACCGCGCCGCTAAGGGTTGATAAATGTACTGGAATTT
ACTTGGTTTTAAAAAGGAAGTGCGTAATCAAATAACCAAACACATATATC
CAACAATAATGGACTTTGATTTTCTAGGCAACTGGTGTTTATCAAGATTT
CAATTTAGCGGAAGCCACGCTGATGTGCTTGGCCAAATATCAAGCTCTCC
TTAAAAAGGTAAGTTTTGTAAGGCTAGGGCTGAAAAAAGACTAAAAGAAC
ATGTCACAGAGCTAGTTATATCCTTTCCCCGCCTTAAGATTTGTACGAAA
ATTCCCGGTGCCCGGTGATAAAACTACCCTGAAGAATTTTCTCTCGATCG
CAATCGTGGCTGGACTTTTTAGCTGTGCACAATAGAATTTGAAATCCCCA
CACCCTAGCAAGAAGGGCTTACACGTTTTTATTATATGATTATCAAAAAC
TTTTTGCAGCCTTCGATATTCTTTGCTTTTCTAGTTTAAAGCCTATAAAG
CCTTAACATGTTCTTAAAATTTCACCATTTTGTGCAATTTTTTCAAAATT
GGATATTTTCGAGTACGCGAAGCCTGTTAAAGTGTTCTTAACTTGTTCTT
AATATTTTAGCTATTGAAGCCTTTTGTTCTTGTATAATTTATTTTCATAA
GAAAATGTGTCAATTTATCCCCACTGGCTAACAATTCTCAAGTGGTCACT
GAGACCGGGAGGTTACTACAGATCCTTGTTCTTTACCCATTGAAGTCAAA
GACCCGAAGAGACTAGATCCGAAACTTTTAAATTGGAAATTAAGCCACTT
ATTTCCCATCCATCCATAAAACGAAATTTCTAAATGCGGGGCAAACTTGA
GGATTTGCTCTTTCTTGCTTGAGAAAAGTTTAAGATTACTATCTACAATC
GGTGACGAAATACTTGGCACAAAAAGGAAATCCACCGGGGTGTTTTGAAA
CCACAATCGATTTGCAAGTGCTCTAAAGTAGGTTCGAAGGGCAGAGTTTT
AACTTAACTTAAAACTTAGGACCTTAGGATCTGAGGATCTTAGGATCTGA
GGATCCAAAAGCTCAAAAATGGTCCAGTAGGGCTTGAAATATAGCCTAGA
AACCAATAAATCCCTCCCAGATCGAAATAATCGTTGAANNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNTGAAATCAAGTTGAAGGCCCGAAATTGACATTCTCGCTCGAACTT
CAATTTTCGAAAAATGGTAAATTAGCCAAAAGTGCCAATATGTTATGGCA
CTGATTGTAGACCCGAAGGGGCTTCAAACTCAATGCCCCAGCAAGCCAAT
GCCCATGCCAAGCAATCCGTTCAAATATTTTTACACAAAATCCATGTATT
AGATATTCTACCTCCCCCTTATATTTCCTTCCTTTTTTAGGATTCAAGTT
TTCACAAGATATTGTTTTGGGTTGCAGTCAGCGTTCTACAGGTTCGCATC
CCTTTGCTTCTTTTTATAAGAACCACTGAATTTTTTGTCGAGGCTCGGCC
TTTGTATCAAATTGTCCTTAACCTAAATTAAGATATTTTTGACTTTGTAC
CTAATTTTTACTTACTGACCCTTAATTTGCTTGAAGATTCAGTTGCTCTA
GAGTCTGCTGTTCTAAAGTTATTTTTAAATTGTTCTTATTTGTTGACGTT
TTGGAGCCTTATTGTTCTCATAAAAGAAGCAGCCCACTCTGAATCTCACA
ATCCATTTGAATGTGCCTTTAGACTTTTCAAAAATTGGTGAAAAAAATCA
AATACTGCAAGTAAAATTCTTTTCTTATGTTTTCAGTTTGGTGAACAAAG
TCTTTATCCAGCAGCTCTTTGTCTTCTTGAACAGAATCTTTATGTCTCCC
AAGAAAACAATTTGTACACTGTCCATGTAAGTTCAATTTGTCAACAGAAA
ACCTAGCCTGCCAGGGTCCCTCTGATTTTTTTAAGAGGGGATGCAAATTC
CAACAAATCACGTCCGCTTGGCCATTTTTTGGTTGTGTAAGTTTTTTGAG
CTGAGAATCATTATTAAGCAAAATTTTACCAAGAGGGAGTTGATTTTCGT
CAGCGAGTTAATGTATTATATAATAGTAGATATATTATATATGCAGTGTC
AAAAAGTTTCAGACGGATTCCGTCTCAGCAAAGTATACAAAGAGGTTTCT
CTTCCTGAAAATTTTGTACAACTAAACAAGAATCTGAGGAATATGTGCTC
ATCATCATCATCCTTCGACCGTTAGGTCGGAAATACCGAGTATCTCTCTT
TCCACAGCTCACGGTCTGACATAACTGTTTTCAGTTCTTCTAACTCGAGC
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
AAAAATAAGTTTGTATGTACAGGTTGAAAAATACGGTTACTATTCACAGT
CAAAAGTCTTAGTCAAATGAATCTGACTGAACTTTTGAAGATTGGCTCTG
CAGGGCAAGGGCGCCAGACTTCCAGGAGGAAGTCATCCTTGGGGAAGACT
TAAGTGCTAATTTGCTGTGTAACATTCATTTTCTGTGCATCTCAGACAAA
AAACTTGCTTTGAGCACTGCTTATAATTTGTGGGAATTAATTACTTTGTT
TCACTTTCCGTAGACTTTACAATCATCTCTCTTGGAATATCGAAATGACA
TCGCATACCATTGGATTTTTAAACAACTTGATCATATTTGTGGATTGAGC
TTCTCTTCCTCCTTCGACTTCGCAC

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00022955	TCONS_00022955	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00022955-protein	TCONS_00022955-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000437	supercontig	sc0000437:40308..46632 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.85	0	0	0.15	3.91	2.95	2.98	4.45	2.95	3.94	1	2.5	1.8	4.24	1.5	2.94	1.86	4.1	2.74	2.45	5.1	5.44	2.96	2.94	1.44	1.49	3.09	4.39	3.06	1.74

You are here

XLOC_012906 (gene) - C. hemisphaerica