XLOC_013106 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_013106
Unique NameXLOC_013106
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000450:92943..113675-

Legend: gene
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>XLOC_013106 ID=XLOC_013106|Name=XLOC_013106|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20733bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000450:92943..113675- (Clytia hemisphaerica)
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ACTATATCTGTTGCTAATTCATTTGTCAAATACAGCCAACGATCTTCTGT ATCTATTCTTCCACATTATTTCAGTACTTGGGATTTTGTTCTTCTTCATT GAAAAACCACTCATTGAAAAAGGCCCTTCTTGGTAAGCCATTTTACGTCA TTCCACCTTTCACAGTATGACGAGAGTATTACTGAATAATTGGTGTTTAC TGTTAGGGGCTGTCCATATGAAGGCGGGTTGGCCCGGTTGGTGGGATCGA ACGTCACGTGATCTATTTCAAAAACTGTGACGTAACATTCGAAAATCCAC CCCACCTCACTTTAACTAGCTGGACAAGCCCGTCTCCTTATAAACAACTC CTTAGTGTTACTGCAGCAAACTCATCAGAATGGTTTCATTTTGGTACCCT CTGTCAAGTAAAGTTGGTTCATTTGAGCACTAGACAGTTTCTTTAAAAAT CTTAGCATAGTTTAGGTATAAACTTATTTCTTTTTTTATAATTTTTGTTG ACGAACAACAAAAATCATAAAAAAAAGAAATAAGTTAATACCTAAACTAA TCAAAGGGAAATTAAAATTGAATGTTTGTCAGATCACTACATTCGTTGCA TCCGTTTAGAGCAGCATAGTATGGTGGGTACAGAATGGATGATCTATCAT GAGATTAGGATGTGGTAGATAAGTTTAAGAAGAGATAACAAAAAGTTGTC CAAAAGGTAGACATTGTAAAACAAATCAGAGAAGGGAGAAGTTTTTGACA AGTATGAAATGTTCTATTCTTCTTCTTCCTTTACAGTGAAAACCAACCCT GTTGAATGTGAAGTATGCCAATCAGCCATTGGTTATTTGGATTCTGTGTT GACAGAACAATCAACTGAAGATGAAATCAAGACAGCCGTGAAATCACTTT GTAGTCATTTACCAGCTGCTATTGATAATGAGGTAAGACCACTGATCTGT AACTACTTGACTGGATCGGGCTTCCCATACAAAAGGAAGCGTGTCCAGTT TTAAAGCTGACTTGTCTGCCATCTTGTTTTCGATTCTGGTCGTCAACNGG TGTCCTGTTTTAAAGCTGACTTGTCTGCCATCTTGTTTTCGATTCTGGTC GTCAACATTCGAATGTTTTGAAATTCGAACATCCAAAACTGGACACTTTC ACGAGAAATCTGTAGGCAGTTGGCCTATCTAGCATGTAAAGGAATATTAT ATCTGCCATGGAAAATGGCCAAAAATTTATCCTTGGTTATATCGTTACCG TGTAATTTCATCCCCATTTGACAAACTAAAATATTGCAGTAGTGGAGCCT TCCATGGTTCATAGCAAGACCATTATTTTCGAAAACTAATAAGACATAAT TTAAAGTGAGATATGAAGATTTGAAATCTAAATTTGTGTTTGATAGAATT TGAAAGTCTTTGAGTAAGGATGTCTGTCTTTTGGACCATGAAAGGAATCA AGAACTGAATCATTTTGGTACATCAAACTTTTCATACATAATTAGCATTC TTCATTCATTCACTTTTAGTGTGATGCTTTAATAACCGAATACGGAGATG AATTGATTAAACTTGTTGTCCAACAAATCAAACCTGACACCATCTGCAAG GTAGTACATTCATATTAAAAAATCGTGGTCCGCTCCCTTGTGAAAACGAG ATATTGTCTTGGTAATTTGTAATCTAATTTTTAGCCTCGATATAAAACAT GTGCATAAAGAAGAATGGTTTCTCCGAAGCTATCGGAATAGGCCCTAGCC TAGAACAACTTCGCTATCTTGAAGGATATAGAAATCACTGTCTTTGCCTG ACACCGTTTATGTTTAGTTTATGGTATGGTTTAATCGAAGATAACCAATA CCGGGTGGGTTAAAAAACAGTACTGGAAAATCTAAATGTCCATAACTTGA ATCTTATGCTCTAAAATTTTCAACACGTTTTATTCAGTCTATTTAATATC TTTTTGGAAAATTATAGCATTTTTAAGATGATGTATGAATTTTGCCTTGT TCGAAAAGCGTGAAAAACTGACGTCAAAACTTGTTTTAATGCAGGTAGTT CTTTGGTAATGTTCGTCTTTAGTAATGTTTTTCTTCCATTCTCCACTCTT TAGGCATTGAAAGTATGTTAAACAAGCTCACCGATCTTGGATTATCCTAA CTGGAATATGACAATGGATTTTGTCTTATAAATCACATATTCTTACTATT GTAAAAGAAAATTAACAAAACAAAATTATATAGAGATTATTCTGTAAGTT TGTATTACAGTCAACTACCTCCGTGAAAAGGATTTCATCAAAACTGAGTC ATACCATTCCCAAAGTCACTCATAAATTTTCAAAAATTCACAAACCCTAT TAATCTTTTGTTTATCTTATCCTTTTAGCGGAAGTTAGCACTGTATATCG ATAAAAATAAAAGTATTTTGTAGCTTTGTTGTTATATAAGGATTTTTGAA AATTTTCAGCTTATTATTTTGTACTTTTTAACTTATTTTGTGATTTTTTT TTGGGTTTATTAAAATTTTAATGATTTTTTGTTTAAAATATAGAGTGTAG CATCAAGATTTCGTTAGTTTCAAATTTTCTTAATATTTTCTTAATATCTG TATATTAATTTGCCCCTAAAAATCCTTAAATCAGCGGCCTGCGACAACGA GGACAAAACTATGGACTATCAAATTACTCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023311TCONS_00023311Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023310TCONS_00023310Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023309TCONS_00023309Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023308TCONS_00023308Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023307TCONS_00023307Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023306TCONS_00023306Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023305TCONS_00023305Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023308-proteinTCONS_00023308-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000450supercontigsc0000450:92943..113675 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
184.48 180.96 160.15 147.78 91.77 68.7 69.86 77.54 143.05 140.03 175.62 118.59 134.73 147.99 255.44 318.93 176.53 183.74 292.87 347.79 149.95 154.4 189.36 247.08 220.4 210.95 158.43 262.82 659.74 538.84