XLOC_013419 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_013419
Unique NameXLOC_013419
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000464:25933..34097-

Legend: gene
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>XLOC_013419 ID=XLOC_013419|Name=XLOC_013419|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8165bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000464:25933..34097- (Clytia hemisphaerica)
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CATTAAACCAAGCTCACGACAACTATGGGTGTCATTCAGTTGGTCGTGGA ACACTTAAACCGAAAGCATCTCTGCTCGCCTCGTCAAATCAACTGATACC ACACATAAAGTAATTATCTAATTTAATTTTAATTAAATACGTTCTCGAAC AGTCTTGACTACTTTAATACAGTCATTTTACATTTTTTTACNACGTTCTC GAAAAGTCTTGAATACTTTAATACAATCATTTTACAATAACCCTTTTGCA TTTCCAATCACTAGAGTGATTCAATATTCTCGACTTTAGTTGAGTTAGAA TTATGTGTATGTATGTATCTGTGTCTGTCAGTCCCCTCAAAGCTTTGGGG CAAGCCGAAGACTTTTTTCATTTTTAGGGTGGTCACAAGTTTTAGCCCAA ACGAGATTAAAAGCTTTGGGCCAGGCTGGAGACTATATTATGTAAAATGA TTTTCATATTGCTAAAGTTTTCTACGTTTGATCCTTGGGTGTGAATTAAA ATTAACTTGGCTTATATGGATTTTACAATTGGGCCTACGAATGACTTTAA AGATACTGAAATTGTGTCAGTGCGGTTAGCAAGTTAAAGAGTAGAATAAG TCATTGGTCAATTTTCTTTAGGCTGGACACACGAATCCAAATTATGACAT GTGAAGAGGGGGAAGACTTTGACAATGTCGTAGACAAAAGGGCTTTGGAT AATGATTTGACAAAATTGGTTGAATCAAATCCTGTAAGTAATCATTTTAT TTGTTTTCGAAGGCTTTTACATAATTCTATTAGAATCACATAGAAAACAG AGTTTATAGAAAAGAATGAGAGTATTGGTGATTTACTCTTTTGAAAATCA TAGGTTAAGAATTATAATGGTTCACAGTGCTCAGGCGGTGTGTTTAATGA CAACCCATGACAACACCAAAAAATATTTCATGTTTTATTCTCTTGATTTT AGGGATTTCTCATCGCCTGGTGTACCTGGCACAATGATATGGTTTTATAA CGATGGAAAGATTTGCAGACGAAGTTGCCAATGAAATTATCAGTTCACGC AACGACATTAAATCACGCTTGTTAGACGCCAAGCGCGACAACGTGATAAT TGCTTTCCTGGTTGGTGATTTTTTATTGTGCTCTTCATTCTTTTCTTTTT TGAATCTTTGTGGAAGTCTTATGAATTAACCTATGTTTGTTAGTTATTTT GTCCGTTCGTTAGTTTGCTCATTCGTTACCAGCTTTTCTCAAAATTGGCT CATTCAATTTTTCAGATTTTTTGCACAAAGATGCTAATTATTAACCCTTA AATAATACTGAGCTTGATTTCCAGAAAAAACTTTTTCAAATTTCTACAAT AGACAAAAGACAATCAGGTACATGCTCCAGAATGCAAATCTGCGGTTTTC TTCTTTTCAGCTCCTCGCTCAGTATGAGAATGATAGGGACTATATTAGCC CCTCAGCTATCTACAACAAGATTGTTGGCCATGCCAATTCGATTGATAAA GAAAAGTTTTGGGTTGAAGTCCTGGATCTAATTAAATCTGATACCGAGGT AACTTTTAGAAACGGAAAGAAAGTCCATTCGTATTATATGTGCACTTTCA TTTGATATTCTCAAGGTAATGAGAGAGTCTCTTGAGAGTGGTCGCCACAT GGTATCAAATAAAGGTGCACTTTTTTAACATCAAAACTTTTCGGTAATAA AATGTAACTAAAGTCAGTTCACGATAAGTGTGCACTCTTTTTTCTTTTAC CTATAACTTTTGAAGGAATTCTTCAAAATTTGATATCGTTGGAGAGATAT TTTTGACTGGAACAATTTAAAATAAAAAAGTTTTTAAAAAGATTCTAAAA ACGAAGAGCAAAAATATGAAGATCTTGTAGAAAGCTGCTATAACTTTCAT 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GCCTAATCAGTCCTACTTAAAAATATCGTGAACTTACTGTTCATTGGAAT GGACTAGGTATTAAAAATAGGTCACGGTGCTCCAGGTCTGACACCCTGCT ATATATTTGGTGAAAAATGTTCCTTTATATCCCTTAGGAAATGGAGCTTT ACTTGGGGACATATGGTAAGCACGCTCACAACGTACGCGTGAGATTCACC AACAAAAATGTTTGCTGGCCAGATTGGAAAAAGGCAGACAAAAGCAACAA AAGTCGAGGTTAAGCCCTGATTAAAAGAATTTTACTCTCAAATCACTGGA ACAAAATAACTAATTTACGGATTTATGGAAATGAGCTTTTTGTTTTATCA ATTATTGTGAATCGTGGAGACACGGTGGGTATTAAACTTGGGCCTCCCAG GCGGGAGTCAAAGATCATAACCACTATACCACTACGCCTAAAAATCATCT CCTGATCGATATGTGGTTTAACTACCATTTTCAGATCAGTGAATTTTCCA TCTTTGGGCATTATACCACTTTGAAAAATTTCAAAAATTATCAAATCTCT TTTGGAATTTATGATAATATACCACTCGGTTATCTTTTCAATTCAAAACT TGTCAAAGTTGCAAAACCATATACATTTAGATACACTTAAATTTGATATT TTCCAAAACCTGTATGGTGATGATTGATCTTAAAAGCGTAAACTAAATTG ATTACAATTTTTTTTCAGCATGCAAGTTTCCTTGGTCAGAAATTTCCAGA TAGTCATTTCGCCTTCAAGTATTTTTGCGAAAAAGTATAAGGGATGTCAT TAATTTCTATCAATTCTCTTTGCTCCTAGTTTGTGGAATTGCTGATATTC CAGAAGCACCAGCGTCCGAAGTCCAGTCGGCATCATTAGTGACTGAATTG TATTCAAAAGTGAAAGAATTTTATCAAGAGTATGGTATGGGATTTATATT GCGTCGACACTAAATTGATATGAGAATTATACCCTATGGTGTTTAACAAT GCATAGACGATTGGGGTTGGGTTATACGGAACCCTTAACAAGAGTAAAGA ATTATTCTAGAAAAGTCAATAGCGTACCAGTACCACCTCTTAGAATCTGC ATACACTACAAGATGTTCGCAATATATTGTCAGCTCGATTTGCAATATTT CAACAATACAGGGGGATTGTTTACAGAAAGAAAACTTTCCTTTTTATAAT AGAGTATCAGTTGTTTACTTCGCACATTACGGTCCGCAAGCCATATTGTC GATTATCGCCTACCTCTAAGCATGTCCATGCTCTAAGCAACTGACGGATA TAAAGCAGATATTCAATAAGTAAAAGTTGGTTATTGAGATTTATTAACCC GAGGCGGTGTCATATTCAACGAGGCGAAGCTTTGCTTCGTCGAATATTCA TCAAGCTCGACTGAATATTTTTTGATATTCGAATTTTCTTGTCGATTATC TGCTTAATATTCTCCATCAATATATTGTATAGTCTAAGTAGCCCTTTAGA TGTAGTGTGTCCGATATAGAAGTATCGACACGAGTATATATATTTCTAAA TAGTGATCTAAAATAAGTCATCTACGATGTAACTGTTTTGCATTTCAGGT CGGGATGATAATCTCAATGAAAATGATGTACCAACAAACTCGGATACAGT GAGTGTACTTTTAAAATTCTTAAACTGGGATTTTTCAAATATTTCTGTAA CCCAGTTATAAAAGGCATCTTAAAAACTGTCCTAAACTTAAAAAAGACAA GCTAAGTCATAAAAATCTAGTACCCGTACCTTCTCGGTTTGGTTAAAAGT TTAGAGTACCTCTCTATTGGGATCATTTTTTGTTTTAAGATAACGCTGAC GCCAGATGCAAAGCAGAAGTATGAAGAAATGAATACTCCTAATAAACGTA TTTACAAGCAGGTAATTTCGATTTTTTTTTAATTTGAAAAGCTATTCAAA TACCTGCAAGTCTAAGGTAATTTTCTGAGAAAAAAATCTGTTTAAATTTG TCGTTACTGTTAGATCGGGCTGTTTCCGTGTATTACGCCATGAATACAGT TGACACNATTACGGTTAGATCGGGCTGTTTCCGTGTATTACGCCATGAAA CAGTTGACACTCACTAATTCGATCTTCAAGGGGAATTGAGGAATTTATTA CAAATTTCTAAGGACGATTGACAGTTGATGTTGTATGAAATTTACATTGA TATTTTTAGGCATACGAAGATATCAAACGAGCCAAACTGATGTTTGAGGA ATAGTAGTAGAGAAGGGAAATTTTACTGGCTTTGAAAAACGATTCTTTTG TTTTGATTTAGTGTTTTTATTGTTTATNAAGAGAAGGGAAATTTTACTGG CTTTGAAAACGATTCTTTTGTTTTGATTTAGTGTTTTTATTGTTTATGTA ACAATTTTTGTGTTCAAATATTTCTTTTTTATAACTAAAAGACCTAAACT AATCTTTTATACACG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023875TCONS_00023875Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023874TCONS_00023874Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023874-proteinTCONS_00023874-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000464supercontigsc0000464:25933..34097 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.11 1.37 0.89 1.08 2.51 1.18 2.41 2.64 2.54 1.59 1.44 1.91 1.86 2.61 3.95 5.29 4.16 4.23 3.02 5.58 7.25 6.59 2.13 3.74 0.58 0.85 5.47 2.97 3.22 2.63