XLOC_014496 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_014496
Unique NameXLOC_014496
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000547:77548..89613-

Legend: gene
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>XLOC_014496 ID=XLOC_014496|Name=XLOC_014496|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12066bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000547:77548..89613- (Clytia hemisphaerica)
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GGGGTTTAGCAGCCGCTGGATTGGTTCTTTGCATCTGCGTCTTGTTCATT AATGTCAAGTATAGAAACATAAGGTAAGCAAGCTACAGTGACCACTTTGC TCGATAAAAAACCACCAGCTTTTACCTTTTTACCTTCTCCTTTTGACAAG TACTAAACTGGGACTCGAACCTAACTTTTGCATTACTANGAAACATAAGG TAAGCAAGCTACAGTGACCACTTTGCTCGATAAAAAACCACCAGCTTTTA CCTTTTTACCTTCTCCTTTTGACAAGTACTAAACTGGGACTCGAACCTAA TTTTTGCATTACTGGAGTTATTTCATAACTGGCTTTCCTCACTTATCCAA CTTTAATTACCAAAATTTTTAATTTGATTTTTCAGGATGATCAAGATGAG TTCTCCCAACATAAACAATGGCATTATAGCGGGAAGTATTATTTGTTATG CGTCTGTGGTTGTTTATGGGCTCGATTCACGCTTCTTAACACCCAGAGGA ATTGGTATAGCTTGTAACGTAAGTAAAGTTTAATTACCAGAGAATTTCAT TTTCTATTGTCATCTTCATTTTTCTTTACCCATGAAAACTAGAAACAATC ACAATGGGGTTAAACCGAAAGATTTTCTTTTCCTAAAAGTATTTGGCTGT TAAGNTCTTCATTTTTCTTTACCCATTAAAACTAGAAACAATCACAATGG GGTTAAACCGAAAGATTTTCTTTTCCTAAAAATTAAAGTTTTTTGTTTAG CTAACTTTTAATTTGGCTGATAAGTCTGCAGAAGTCTGTAACATTTTATA AATAGCCCTTGATCCTACCAATAATCTGATGCTAATGCGGGTCGTTTGCT GTATCTTTAACGCGATTCTCAATGATCGTATACTAACTCTCTATATACTA ACTCAAAATTACCTTTTTCTATCGTTGAATTTCTTTTGACATCTGGTTGT TTTATGTATATTTTCAGGCAGTGACCATTGCTCTCTCCATCGGCTTCACC TTATCTTTCGGTTGTCTCTTCACAAAGACATGGAGGATCTACAAAATATT CACAGCTGCAAAAACCATGGAAAAAGTGGTAAGTGTTTCTATCTACAAAT GCGTGACTGTATTCGTGACAATCTTTTCCCAAACAATTTCCATAACTCTA GAATATTCGATAAAAATTTGGGCCAAATTAACTGTAAATAGAACCGCTTA GGCGGCCCTTAGTGACTAAATTTTGACGAGGTGACTAAAATTAGGGCCGA CTAATAATTAAGGCCGACTAAAATTAAGGCCGACTAAGTTCTGGCCGATA AGGTATCTATTAACTCATAACCCTTAATTTAGTAGTTTTTTTATGCAGGG CGTTGCTTTCAAGGATTCGCAACACTGGTGTTAATACCAAATTTATAAAT ACTTCTATTTTTCGGTTTTCTTTCCTACAGTCGATCAAAGATACACATTT GTACTTCATCATCACGCTGTTGGTTAGCATTGATATTTTTGTTTTCTTGC TGTGGGTTTTCTTATCTCCATTCAACGTAGAAGAAAGCGAACTGGAGCAA ATCGTAAGTACCATTAGCGTTACGACTCTAAAACCCTACTTTAAGTCTTA CTGACAAGTCTTGGTGACAAAGTGAGAGTTTTAAATTTATTACAGTCCAA AAAATAAAGATTCCCTAAAGTTTTATACTGTCTTTTCTAGTGGGAAGGAG GGTAAAATGTAGATTTAAAGACAATGAAATGTCTACCCCACCGGGTACCT GTGGCAGGGCTGTGGTCTAAGTATTTTAGAATGAGATGTTAGAATTTGAA TATCTCTTGATTTTTCTAAATTGTAAGTATCTTATATTCCCAAATTTTTG TCCCTTTCAAGGTTTCATTTACACAACACCCGCTCTATCTTCAGGTTTAT CAAAATGCTGACGTCATCGATTCGTTCTTCTACCACAAATGCACGTGTGA ATATCAACTTCATTTCACGGTCACGATGTATTGCTATAAAGGCTTCTTAC TCATCTTCGGATTGTTCTTGGCATGGGAAACAAGGAATGTCAAAGTCGCT GTTCTCAATGATTCAAAATATATAGGTTTGTAGCACTTTGTTCACAATAG CAGTGTACATGCATGAATTCTGCACTAACATGCTCTCAAGAAAACTAAGA AATACGAGTAGCTTAAGAATACTGAGCTAGTAATTGCTTAAAACGAAAAA CTAATCAATTGTCTAAAGTCGATTTGTTTATATAGTTGACTGAATAGAAT TTACTTAGAACTCTTTGAAATTTGACATTAAGATGACAAAAAACACCTTT CTTTATTATTACTAGGCATGGCAGTATACAATGTGTGTGTAGTATCGGCA GTAGGGGTCATCTGTGCTTCAGCCCTCTACAACACACAACATTATACAAC TGGATATTTGGTGGTCACCATCAGTATCTTCCTCTGCACCACTGGAACCC TCCTTCTTATCTTTGTCCCTAAGGTAAGTCTACCAGCGAGTAAACATGCC AACCTTTAAGCCTTCAAAGAACTGTTTATCGATTTTTATCCTTGATTGAT TTAGCTGGTGATGAATTTTAGTTTTAACTAATTCAATCAAATGTCTCTGG CAGATTTAAAAAATGAAACATTCTAAGTAATTGTTAAAACTTTTAAATTT TAGATTTATCTGCTCTTCGGAAAATCATTTGATGTAACGTATGGCAACGT CTCAGTGCGAGCATTTTCATCCAGTTTCGCCGGTAAGAACATGCGGAAAG GAACTGTGAGCCACCAACCCTCCACCAGTATTGCTGAGAACCCTTTGGAG TTGAGCATGTATGAAAAACAACGAGAAAGTGATTTATACGCACACAATCG TTTCGTTAAAGCTAATAACGCTAAATCACAACATAATAACTCGAACGCTT CAAACATGGTTGGGGTCTGGGCACAACCTCGAATGAACTCTTGTTGAGCA GGTGTCCTCGCATATTGAACTGTATATATGGGTGTAAAAGATTGAGATAT TTATTGGATTGATGAATGATGAATGTTTTCAATCCGGTGAAACGCGCGAT TANGGGTGTAAAAGATTGAGATATTTATTTGATTGAATAATGATGGATGT TTTCAATCCGGTGTTTAAACGCGCGATTGTTCTGTCTCACATATATATTG GAAATGGTTGGTTATGGTCATCTGAAAACGTTAACATTGGGATTGGGAAT GAGAAATAATTATGCTTTTCCCTTAGGAAAAGAGCTTATCTGCTTCTTTT TCCTATCATAGACATATGGGAATCTAATTTCCATAAGAGTTAAGTCAGCC AAGTTTGATAAAACACCTGGATCTTAAATTTAGCAATGATGCAAACATAT ATGGTATTCTTTTGAAGTCTTGCCAGATAGATGTCACAAATTTCTGAAAA GACAATTGGAAAATAAGACCTCTTAAATGATGATGACGTAATTATAATAA GCATCAACGTGTCAGCTTTGCCAACATCATCGTCTCCTCTACAATTGGCG CGTAGAGCTCTGTGGTATGTTATCACTTACCATCAAATGGAATGACAAAA TTTTGTATCGTTATTTCGTATACATTGCTGCACTTTTACTTATAATATTT TACCCTTCTTTTAGCCCACCATTACCTTTATTTTACTCCCTTAAACACGA GACCAAAACTATTTTGTTCGCACCTTAACTAAGGAGGCTTACTCTGGGGT ACCGATAGGAGGAACACCCGTGTCTCAGTGGCATCCATCTTTCTTGTCTT TCTACTGAAAACTTTTTAAATATATCCATAATGCTTCTGCCCCATTAAAA ACTAAAAAAAAACATCTGGAAAAAGTTTTGAAGACCCAAAGAGTACAGGC AAAAATCTTCTGACCCCGGAAATGAGTAAATACCGAGTTTATGTATTTGC ACTTTTGAGGACGGTAGAGTGACTGAAGCGATTTGGAAAAACCCGCAATT CCGCCCCGCAATATCGAGGACGGTAAAAATGCTGATTTACCGTCGTCCTC AGCTGGTCAGGATCTAGTCAAATTAGAACCTTACCGTCTCCGTCGCTGAA AAACACACATACATAAACTCGCTAATGAGTTTCGAAGAGTTTCAAATATT GATTTCAACAAAAAATTGATATCAACGAATATTATTTATCAGGCCCACCC ATTGTTTTCTTGACTTTGACTCTGTTTTGAATTTCATCAGTATACCTAAG GGTTGGACAACAAGAATCTCACTCCAGTGAAATTCAAAGATATTATGGTC AAACAGCTTTGGTTTTATAAAGTATCGTTGTGAAATAAAAAACCTATTCT AGACTCATCGGAGTAAAAATATATATCCACCACTCACCACATATGGGGAT CTAAACCCTAAACAAAGGTTGTGAACAAGTGCTCGATTGGTTTTCTTCAG GGTCGAGTTTCTATCTATTTTCTGTCGATTTTATGGCATTATCATTGGAC GTATTAGATCCAAATATACACACAAGCTTGAAAATTGTAAAGAAAGGTAT GGTTTTAAATTTTCCTAAAGTTGTTATTCTACACACAAATACTTTGTACA ATTTATTTATTACTTTTTTAAATTATATGAAAAATAAAATTTAAGTTTTT TAGGTAAAATTGTAATCACAACTTCAAATACTCATACACGCTTTTTATAT AAGAATAACTTCTATAAGAATATCAGGGTGAGATTTCGGGGTTATAACAG TAAGTCTATTGTTTAGAACAATAGAAAAATGATTATAATGCCAAAGTACA CTATTCTTATAAATAGAAAAAGCGTGTAATTGCAAACAACTCATCAAACT TTCTAAAGATAGAGATGTCTTTTTCAGCACTAGGAAACTCACTGTCTTCT TCTACTTATACCTCAATAAAAGGCTAGGAAAAATCTTCTTGTCTGAAAGA AATGTAATCAACAGTAAAGCTTCAATTTAGAGAGTTTTTATTTTTACCTC CCATTCTCTCTCTTTTATCAGAGTGTTTGAAAGACCCCTCATTTTCCTTC CAGTGAAGGTGGAACCGTCTATTCATCAGGAAATTACTAGCAGTAATAAC CAAAATATATTCGAATTGTACGTTTTTTGCCAAGCAGTGGATACTCTCCT TTCCAACAACATAAACGTCTTCCGTAATCAAAAGTCCGTTGAATTCCACA ACTCGGTATTCGGACACGCCCAATAACGGGCATACCCGGCCAAGTGACTT TTCCATACGGTTTACACATGGAATTCATTTTATGATAGTTTTGTAAAACT CTATAGCCTTTCCTCCAACATTTTGATGGACACAGTCTATATGCTGACTT GCAGCCTCTATGCCAGTGATTGATAACGATGTCTTCCATTTGGTGAAGTT GAACAGAGTTATCATGAACACCTCGACGTAATTCACAAAAACATCTTGTC TGCTGGTTGTAAAGGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025804TCONS_00025804Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00025803TCONS_00025803Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00025802TCONS_00025802Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025804-proteinTCONS_00025804-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000547supercontigsc0000547:77548..89613 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.17 0.92 1.89 2.03 0.8 0.55 1.39 2.32 6.63 5.94 3.1 6.85 4.32 3.89 3.69 3.56 0.51 1.12 0 0.06 0.07 0 0.96 0.92 1.08 1.1 0.23 0.22 0.74 0.63