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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000724:131138..153059+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_016546 ID=XLOC_016546|Name=XLOC_016546|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21922bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000724:131138..153059+ (Clytia hemisphaerica)
ttttagaagcATTACAAAAAATTCTAAGGCAGAAAGATGaaatggaaatg
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CTGACCCTCATCCATAGCACCCACTTCTTAAGTCTAGTCTCGATCTAGCT
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TCTTCCGACAGGTTCGTACCATTCCCCCCGTATCAAAAGatccctttttg
gacctacctggaggtcctataaattaaccgttgtccgttcgtccgtccgt
ccgtccgtctgttaccagcttttctcgagattggctcattagttttttct
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ccccgtcaacaatcaatgatgaaatttaatgtgttttgcattttcgctaa
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tgtgatgtgcaacaaaatcaaaataaaacataccaCATTTTTTGAAACGA
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GATTTTAATCATGTTCATGATTGACATTTGATTTTGGTGAAATTGTTTTA
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CTGCCAACCTTTGGAGACTCCCTACTGAAGCCATGGCCTTTAGAGCGAAT
ACGTGTCGTGCGTGGAGTATCGGAATGGTCGGAGATtaggctgaactttg
cttttgatactttttgatGTTCCAGTCCATTGAAGTTGACTAGAAGAACT
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taaaaaatttagggaaaataaaagaaattaggTAAAAAGAGGCTTCTTCT
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GTCAGCATTGTCTTTGTTACTTTCTAAAACCACCAGAGCCTTGCGACGTC
ACCAGTTTCGCAGAGTAATACGGTGTAAAACAAACCTGAAACCTGAGTAA
GCCGAAAACTTTTGGGTGTAACTTTCTcacacttttcttttttcaacagT
ATCTTTCAGCACCGGAAAGTCAAACACTTTTACCGGATATCGTGAGGTTT
ATTTGCGGTGTCATTCATCCTCCCAATGAAATCCTTGGATCAGAAGTTAT
CCCCAGATGGGCCATTCTTGGATGGTTGTACACTATATGCCAGGTAATTG
AATTTCAAAACCACAAAAGACTGAATCAAACCTAGAAAGTATAAATTTCT
CctgaaagatatttttgattCCTCTACAAATATTAAAAACTCTTTAGGTC
GCACTTCTTAccatattcatttttcaaaatcagtgCGCCCAAGTGCTGCT
TTATTATATTACACTTTTTTAGAATCCTGTATCACAAACAAACATGAAGC
TAGCATTGTTCTTCGATTGGTTGTTTTACCAAGGAGATAAAGATAATATT
ATGAATATAGGTACGCTGACTGACGATCTTTTTTGCTATACCCTATTTGC
ATACGTCCCTCAAAGGTTACAACTCATCTAGACTAAAATGCTTCCCGATG
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tttcactttcgtttttaagttgattttcaatttaaattgtTAGCCCATTG
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ACGCGCTCACTCCAACATCACTATGAGTCTATTGGACTTCATTTGTCGAG
TGAGTACCACAACACAAGATTGAAGtattattttttctcttttcggcAAA
CGTCGGTGTTTTGTGTTATAAAATCACTTTGATATACTTTGCTCTTGTTT
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attaaatttcatcatttgaaGACTGAAGATATTTTATTCTCTAGCATACA
CTGTTCGTATCAAAGTGCTGTCCCTCCAACTCATTTTCTCGTTTCTTTAT
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AAAACAACTAGTCTCGGAAACACTAGCTCCTTTCTGTGGCCCTTCTGAAA
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attaacTTTCgagatttcgcgaatttttgccattctTGCGAAATTaaaac
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aattttcgaaactctgactcgcgaaattaaatccaaaaaaatttcgcaat
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gaatattactagtcattttattaacacgaattgaaaaatttcgtatCTGC
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gttattttgataatttatggAAACTATGACTTCTGTTTCCAGCAAGTGGG
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tgggtTAGCCAACTACAATGTTATTAACTGTCGTTTTCTATTTGAAAGGA
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CGCTACCCAATGAAAAGAAGGAAAGCAAGGTAAATGAGCTGGACATTTCT
ATAGTATTTCTCACATTGTATTCTGTCTATAACTAATAATCTTTTGCAAG
CTCTATTAATCGAGAACTATATTCTAAAAtttattgaaagtaattttAAG
GGTAAAAACATTGTGGCATTTGAAGTTAAGTGATATTTGAAGCCAACAAC
TTTTAATTTATAAAGATATATTTCGAAACACTAGGTTCCATCATCAGTTT
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GCTTGATGCTCTCAAATGCTCCTTAAAGCGTCAATAAAATGTCGGGTAGT
TTCCCCaacataacacgaattacatcGTGGACAGCAAATTTGATAAATTA
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ATCTTAATGACCAATGCGTGACTTTTGTATTCATTCTTTCTATTCAGATT
AGGTTTTAAGTCCTTAATAAACAATGCTTTTAGTATCAACAATACGTCCT
CTCTCGATGACGATGCCAAAAAGGTGACGTCATCTGATGACAATTCAACG
TCACAACGTGTGATGTTTGCTCCAACTGGGCTTGATGCTCTCAAATGCTC
CTTAAAGCGTGCAATAAAATGTCGGGGAGTTTCCCCAACATAACACTTCG
CTTAGTCCAAGATTTTGacaaaattcaatcaaaatgacgTACTTGTCCAG
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CGACCCATTGATCAGAGGAGATGCAGCTTTATACGCTAGATATCTTGATT
ATATTCTGTCCAACTTGAAAAGCCAAAGTATTGAAAATAAACTTGAAGAA
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GACTCATCTTTACCGTTCTTAGACATGTTGATTTTTAATCGAAATGGAAA
GCTTTCATCTACTTGGCATACATAAAGCACCGACACTGGGCTAACAATGA
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ATGGTACATCGTATTTTGAGAGCATGTAGCTCGTGGTCAGCAGTTCATGA
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ttatgttGGGGAAACTACCCGACATTTTATTGACGCTTTAAGGAGCATTT
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TTCTAGGGTTTTGTATctgtattttttgtttcattacaAGGAGTGTTTTT
ATGATGTGAGGAGTATGTTGTacattttttagagattttagaatttttgc
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TTATAAATTAAAAGTTGTTGGCTTCAAATGTCACTTAAATTTATTGAAAG
GccaattaatttcaaaatataattctGTTTTGATGGTGATAATTTCTAAA
GTCACCGTGCGTTGCTAAAAAGGAATTTCTAGTCTCGCCAACTGTGGATT
TCATTGATAGGTTTATCCGCAGTGCGCTGTTATGTGTGGATTTAGAGCAT
TTGGATTTGAAGTGTCAGATTGAATCTTCGACGCCTGCTAAAACAAACAG
CGGAAAAATTCATTTGCTTTCTTTtagattgttttgattttattaccGTC
TGCGTAAACTCATTGCCTGGGGATGAGCAATGCAAAATTAGGCTAAAACT
TTAATTACATCAAATTAAATCATGATTGTACTGGGGTTGAACTGTAGAAA
ACCGAAGAAAGAAAAGAGGCAAATGCTTTTCTGGGTTTGCACTGGCTATA
GGGGACTGACTATGATTCTTacagtgaaaaatctaaattacaATAAACTC
TCTAattcaatgaaaattgattgaaattggtCAGAAATCAAGAATATACT
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TATAGTGCTTTTACCTGTTAAATGACCAGTTATCCCCTATCATTACCCAA
GACACTTGAGTTATGCACTACTTGTTTAGTTTAGATCCAGTTTGGATCCT
AGGAATATGGttataaatatattttacaGTGTGAAAAACGAGTTTGGTTT
ATATCGGTAAATCACCAGGAATTTGCGAATTTTTCCTTCGTTGTACATAC
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GCAACGGTAAACAGTTACAAAAAAAGCCTTTGTCTATATCAcacaaaaaa
ttgctttttaaaaacaaCGATTTTACGCTTTCAGAAAACACCGCCACCGC
CCTCCGCCATCCTTAACACTTTCATCCCCATCAACAATAAAACGACAACA
GAGGACTTCGATGCAAACAAAGTGGATGAGGGTTTCGCGGGAGACGACAT
CACCGAACTGGACGAATTCCAAAACCTCGATAGCAACTTACTCAAAGACA
ATGTCatcaaattgaaaaatgaaaagtaacTTATTAATTTATTAAATATC
GGCTAGATTCCCATAATATGCTTTCTTTCGAAATCGGTTGCTCTCTCTCC
TTCAACGACATTAAATGTTGCTGTCTCTGCAAAAAGCGctgatttttatt
ttggttgagGAAGAAGATAAACTACTTATGTCGTAAAACTTTTCTTGTAG
GGATGAATCTTCTCGCGTTGAAGCTATGGAATCGATCATCACAAGCATTG
AGTCTTTGGTAAGCTCATTAACTTCCTCAGCCTTCAAAAATGCTCGTTTC
AAGCTAGCTTCTGTCTCATTATTTTCCAACAACACttatttttagttaaa
ttctttTTCCAGGGTGACTTTGATGATGAACAAGCGACACCTTTATGTGT
TTGTTTGGCCAACTGCTTGACTGCTGATCTTTGTTTGCCTGTCATCCCTG
ATCAACTCAACGAAAAGTATgtcatagcgtcagcctgggtttagatCCCA
GGCAAAAAGTTAGGTtccccctgagttttaagtccccctaaagatttatg
aattttttgttagcctCCAGGACTTTCGACccagacactttcaaaaaatt
gatccagtaaaaaagttttttccaatgtaaattgcgttcagttctaagtt
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aaatttttcagattcatgagcttcaatttgggtaattgaagccaactatt
aagctgaattattttagcccccacattaagtgatgagattttagctcccc
cccaattacataggtccccccaaaaagtggtgtacttccagcccccttct
tttttaggaaaaatttagggtgtaaccccccccAACTAGCAGGGGGGCTA
ACGCTATGTATGTTCAGACTACCTTCAAAAAGTTGCTTGCCCTATTATCA
TTCCAGCAAAATATCCGCATGGCGATTTTTCACATCTCTTTTTGTGATTG
TTAGCCATAAAAGAAGGAGAGATTGCTTCAGAATTTTTGTTGTGCCACTC
CGATACACTTCGTTATCTTTTTCCCTTCTCAGGAGCATTGAATCTACTTT
GGAACGACCTCACTACACCTTGTTCAGGTAATTATATCTGAGTTGTATCA
TCATAGAGTGTAAAGTAAATCAAACTTGTAATAAAGACCAATTCCTGTAA
AGTCCTCTACTTTGACTAGCGCTCAAAATTGATCCATtaacttttctttg
ttttcatccaAAACTTTCACTAACTTTTGTGAAACAGTGGGCTGAAACCT
GACTTTCTTACACTTACATCAGCTTAAAATGTGTGCCAAAATTAGTGTTT
AAATTGCTTTAAAGATAATATCCTTTaggaaaagtgttttttttcgcTAG
AATAAACTTTCACGAATTAGGTTATTAGATTATTTGGCAGAATTCACTTT
GCGCTAAAATAAGTCCAGATTGGCATTCGTTTTCTTAGATAGGGTACGTA
CGTgcatttggaataaaaaatatttgacatttTGAAGTCAGGGAGTCTTA
ATGGATTAGAAATCTAACCTTCTCTCAATACAAGGATTATGTAATGAGAA
TCTATATAATAGGCATCCAagcaaatcttttttaaatcttcatgaTTTTA
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TGTTGTTGCAAAAAAACAGTTAATTTTCAATCAGAGCTCAATCCTCATTA
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AGTCGAGAAAATCTTTACATCCTTCTGTCGTCACTTCACGAACAAGAGCC
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TCTCTCTTGCAACAaggattgtgggttcgatcctTGGTCGCCGCTAAGAT
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GCGCCCATCTCAGCTTTCGCGCGCCCATGTATGGCGCGAAAAGAGCTACA
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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000724 | supercontig | sc0000724:131138..153059 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| INTS3 | integrator complex subunit 3 | Homo Sapiens |
|
