XLOC_034633 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034633
Unique NameXLOC_034633
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_247:2344..13785-

Legend: gene
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>XLOC_034633 ID=XLOC_034633|Name=XLOC_034633|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11442bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_247:2344..13785- (Clytia hemisphaerica)
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GTTTTTTTTAACTTGAAATGGAAAGAATAGAATGGCGATAGTTATAGTAA ACTTCTACTTATATTTCAGACATTACAATGTGTGTGCAGGAGACATAATG CAGACGAGCATTCTTTACACCAGTATGACCGGCACATATATGGCCATCCG TGATCTACTGAAGAAATCTCCGCACACTTCCTTCCCGCTCGTCGACAAAC CAGGTAAGCAAACTCATTGAACAAGATCCCTTGGAAAGACTAAAATCCAA TTTTTTCCCTCCATGTTGACATCATTCTATGCGAGGAAGGTTGCTAAGTA GAGGGGACATTTTAATTATATGTTCAAAGATGGTAGATTTTTAAATTTGC CTCTCCCTTTGTTTTAATAGCAAAAAGTTTATATCAATTTATTATAGTTT GATATCTTCAATACCCTTAAATTTCAAAACCTAGTATGTTATAAAAAAGC AATGGACGATCTCCAATTACACATTTCCAATTTACTACCAACTACTAGAT TTCATTTCAATTAGTGGCCGTAACATGAAGGTAGAGTATCCAGCTACGGT GCGCAAGGTTGTGGGTTCGACCCCCAGTCGGGTGACACTAACTAAAGATT CCCAAAATAGTCATTGATGCCTCTCTGTTGGATTCTCAGCAGCTTAAGGG ACGGAGTAAGGTTAAGTGGAAAAGCCCAGGGAAAGAAGTGGCGCCCTACC TCTGGGCAGACGGCTCAAGAAAATGGCAGACGAGATAGAGTTTTTATAAG ATACTTTAATAATTGGTCATTTGAAGTAATAAAAATGATGCGTTCTTTAG AAAAAGTAACACAATTGTTTTATTACTGGTTAACGCAACCAAATCAAATA AGACCTTGTAAAAACTCTATCTCGTCCCGAAAATGGAGCCTTCGGGTCGC CTTTGACTGCAGTCGAAAACTTACGTCTTACTAGAATTCAATATGAATTT AAACACACTTTTTGTTGCATTTAGAGGGTATGATTTTGTTGGGGAGCGTA CGAAGACCACAATTAGAATGGATGTTGCAAAGACATTTGTTGAACGGTCA AATGAGGAACGATAACACGTATGTACCTTATTAAATAGTATTAATTTTGA CCAACATTTACATGGGAGGTTGGTAACTATAGGCTAAGACAGCCTATGAT ATAGAAGAGCTATATTGTGTTAAATACAACAGGTTTGTGGAAAGGACTTA ATGCACTTCACGATAAATTGCCAGCTCGATTTGTAATATTCCAGCGATGC AGGGGAATAGATCACCTATTGTGTCGTCTAAGTAGCCCTCAACACTATCC TTAACATTCATCTAACTTCATATTTTGAACATATTGTCTGACGTTTCCTT TCCTTCAACTTGAAGTAATAGTGAGGCTAGAAATGAAAATACCAATGTCT TATGAGATCTATGACGTTGTTTCTTCGCAGGATGTATTAGGAGGTTGCGG CCTTATAGACACGAAATCTACGACGTGACGTGAGATTGCGGAAACTTGCC GTGGGTATAGGGCTGGATAGCTAAGGTGTGGTATGATAAGATGCGAGTTG CGAGTTACGAGTTACGAGCTACGAGTTGCATTTAGAACCACGAGTTGCGA GTTACTTTTTACGAGTTACGAGTCAAATTAAAAGTGCGAGGTCGTAAATC AAAACTTTAATTAACTTTTTCTTTTATCGAAATTAGTGACGGACCAGATG GGAACGCTCGGCACGCTTCAGTTCATTTTTCATCCGGTGGTGAGGTATCC ATCAAGAACCTTCAAGCTCAACAACGTCCGAAAAAGAAAACTTTTGGTAG CAAACTCAAAACTGGTACCACCGCACATCCAGTATCTTTGCAACGATTAT TTAATACGAGTACATCAGAAATGGGTGAATCCGTTGCTACGCATGACTTC AGTGTTGATAATTCTCAGGTGAGAACGGAACATTTTGTGTGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054959TCONS_00054959Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054958TCONS_00054958Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054957TCONS_00054957Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054959-proteinTCONS_00054959-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_247supercontigscaffold_247:2344..13785 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CLCNKBchloride channel protein ClC-Kb isoform 1 Homo Sapiens
CLCNKAchloride channel protein ClC-Ka isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.16 5.82 8.72 7.37 8.92 6.33 8.24 8.83 9.43 12.61 12.7 9.41 19.9 20.48 14.83 17.83 16.89 19.53 14.83 18.64 14.55 15.96 11.27 12.65 13.63 14.42 10.34 8.41 9.92 8.13