XLOC_038061 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038061
Unique NameXLOC_038061
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_343:157424..171968-

Legend: gene
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>XLOC_038061 ID=XLOC_038061|Name=XLOC_038061|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14545bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_343:157424..171968- (Clytia hemisphaerica)
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ATTTTGATAATGATCTAATCCCTAACTTTTTAAACATTGTCAACTCTATC CATTAACTATATCCAACTGTGTGAAATATGTGGTATTATGTTCATCACAT AATGTTCAATCCAATCAAACAATGACGTCACATCCTTTATTATTTCCACT GGAACCCAAACTAAATCTACGCTATATATACAAAAATTTGGTTCCACCAT GCATTATCGCCACACTTATTACTTATTTTCTGTAAAACGTGGAGATTATA AGCGGTCGAGAAGCAGCGAAAAATGAAGAGACAAGTTCCCATCGTCGTAA CAGTGCAAGTAGCAAGACGAAGGATCGTATCGAACAGTTGAAACGTTTGC TACAAGAAGATACAAACAAAAATTCCTCAAGGTAAGATTGATTCCGCATC TCACTTCATCCTTAGAAAATGAGATGCTAAACAAACATTTGCTCTTTTTC GAACCTCAAAGACTGCCCTCGTCCTGCCAGATACTAATTTTTACCTCGAA AGAGGTCCTCTAGGAAAAAAGTGTAGTAACTATTTCTTAAGACATATGAT TCTGAACTGGGATTTAAACTAGAACACTAAATTTTGTTTAAATCGTTTGT GTGCTAAAGGGACAGGAAATTTTTTTTGAGCTACAGAGCTTCGCACTATG ATTATAAAACTTTTCGGTATTGAGCAATACCATATAATTTGCATCCTTCC TAAATCTAATAATGTTGCGGAAATCTGTTCATCCTGTAATAAGGTTTTTG ACGTTAATAATTCATCCAAAAAAATCATGAAATTGAAAAATCCTTAAAAA ATTGCACTGTCAGGTGAATAATTCTCATTTTCCCTTTAGTAATAGTCGTT TACCCTTAATGATAATTATTCGATTTGTTAATGTCAAATAGTTTAATGAA TCTTATTTCTTATTTTCCCCTTTTAAGGATTGTATTTTAACTGTTTATTC 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CGGTAAAAATAAATTAAAGTGATTTTGATGAAGATTTAAACCCTTTCGGC ATTTCAGTTTCGAAATTTATGTGTTTAAATTACTGAAAAATGCTTTTAAT CATGTAAAGGCTATTGCAATTACCAATTTTAATCTAAAAATTTGATAGGT CGATTTTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNATTCAATTGAGCATAACTTTTGATCTAATGAATCGAATT CAATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTTTATCTTTCTTCTTTCCAATGAA ATAGGAATGGTTCTTTTAAAGCTTTTAGATTCCTAGAAAATTAGTTTTAA AGAGAGAAACTTTTTTGTGGCGCACCCGGTATCATGTCCCACTCGATTTT TGAAGTCTTTTCTTCGTATTAATGTGTATATTTCATCCTTTCACACGCAG CAGTAAAGACATAACAATATGAGAAATGACAACGTCTGAAGATATCCCTT AACAGTTAGTAAGTTATTTTAAGATTTTCCAAATTTGTGAAATTTAAATT CACAATTAAAGACCTTCGCTTCAATGGCCTTTTATTATTATAGAACTTTT ATCTGAGGGTGATAAAGTTAGATAAGGTCGGTTGGGCTATAATCTTAGCG TGGGTCGCGGTTAAGGGGCGGGACCAACAATTTAAACAACTTACTTCAAA GATATAAATGACAATATTCATCATAATACAATATTCTGTAGCTAACCTTC TCATATCACCTTTCCGTCTAATTCGTACTTCGTGTTATTAACAGGTATTC TACGATGTATCTTTTTTTGTTACTGTCAGGTTATAGCCCCTAGTATTTTC CCATCCCTCGTTCTTTTTCTTAAGTCACGTTTAACACGCTTAACATGCTT AACAAGTTTACATTTCGATGTATCTTTGGCACACCCGGTATGAATCTGTA CTGTCTTCAACTAAATGGTTCGATAAAGATTGCTCTAAATTACTGATTAA TGAATCATGCATTTTAAGTAGAATTCTTTTTTCCTCTTTATTTATAGGTT GAAGTTTATTTTGAAAGTGGTTTTGTGGTATTTTATGATGGATTACATAA CTGCTGGGTTGATTGCTGCCATTGGGAGAGTTGCCAAGAAAAGTGTTTCA CTGTTTTACTGTTTTCACGACATGCTTTATGCGAAAGCTAAAAGATGGTA TTATCAACTTTATTTAATGACTATCTATGGGTTTCCTGTTTGGCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00060512TCONS_00060512Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060511TCONS_00060511Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060510TCONS_00060510Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060509TCONS_00060509Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060508TCONS_00060508Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060507TCONS_00060507Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060506TCONS_00060506Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060505TCONS_00060505Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060504TCONS_00060504Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060506-proteinTCONS_00060506-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_343supercontigscaffold_343:157424..171968 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TTC14tetratricopeptide repeat protein 14 isoform c Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.7 7.74 4.1 3.57 24.7 19.36 19.6 22.41 20.83 17.33 14.95 17.45 10.69 11.51 11.31 13.86 12.14 14.03 8.14 8.76 8.97 8.87 13.33 12.95 16.73 16.2 6.78 5.06 8.81 9.26