XLOC_038247 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038247
Unique NameXLOC_038247
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_35:46308..54310+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038247 ID=XLOC_038247|Name=XLOC_038247|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8003bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_35:46308..54310+ (Clytia hemisphaerica)
CCTGAATCTTGTTTCGATTTTCGTTTCTGTTTGAGATCGATGCTCTCGGT GGCCGAATCCTGATCGCTGATTTCTTCTTTCGGAAAGAAATATctcttct tcttttgttttttcgtNCCTGATCGCTGATTTCTTCTTTCGGAAAGAAAT AtctattcttcttttgttttttcgtgGAAGAAACAGTGACTGGTTCACTA GCTGGTTTAGTGACATTCTTCTTGGTTAGATCagcttttgatttttgaag agCAATCTGATCGAAGATGTTTAGAGGGACTTCTTTGTAGGTAGGCGGTT GGTTGCTGGATGTTCCTGCCATTTGCTTTGAAGGGAGTACTGCAACATCG TGCAAAACAACTTTACTTTTCTTGAGATGAAAAGCGGCGCTTGATGACGG TAACTGGTTGTCGGGGTGTGACTTGGCGGTTAGAGATGCTGATTTTGTTG GGTGGCTATTGGTAAGCGTTGAAGAAGGCGATACGGCTTTGTTTTGATCG AGCGTTTGTTGGGATGACGTTGGAAGTGAACTGAGGATACGAAGTTCTGC ATTCGGATTATTCATCCATTTTTGGATCCTTTGAACATCAACAATTTTAA TATTTGCTTTCTTAAAGTTCGTCTGATTCGTGATCGGGATATTACTGATG GCTTCTGCCAATTTCGACGCAACTGTCGTTGGGTTCACACTTTGTGGTTT AATGGTAAAAGAGCTGATTACTTGTCCAGCTTGTTGAGTTGGCGAgactg gtttgttttgattggaggTATTAGGGATATTCGAAGAAGCCTTTAGTTGT CCGCTATTCGATGTATAGTTAATTGAAGGGTACGCCGTACTGGTGATAAC AGCTGCTTGAGTGATTGTTGTAGGGTGTTTGTATGTTGTTGAAGCAAATG GCTGGTGCTGGTTGTTACCTCTTTGCAGGTGTTTCGAAGCCATTGTGTGT 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TTTGCTTTTGCTAACGATTCGTCGAGTGAAGTAGGGGCAGAGGCTGTCGA GGATGATTTTTGCTTTGAATGACTTTTAGGGGGCGGCGGTGCGGATGAAG TTGATCTGTGCGAAGGCTGCATTGCTGCTTGGTTCGAAGAATCAAGACTT TTGAAGTCAGCTTTCATAGGTGTGATAACTGATTTTCGCTCATGGGAAAG CTGTTGGTAATGATTTGTCGGTTCCTTATCAAGATGACAGGCTTGCCATT GAACCTGTTCGGATTGTGCCTGTATAGATGATTTGTGTTTTGTGTTTGAG TTTCCCGTTTGATTCAAACTTGCAGTGGCTTGGACGACTTGTATGAGCAG CTTTTCGTCAATAAATGATACGTCACCGGTAAGTTTCGTTGGTTTTGGTG GTTCAGCTTTATGGTTATCTTGACGAGATTGTGGTCTTTGGTGGCTTGTA TCTGGTTGAGAACTCTGTTGTTGGATTTGTGTATTATTGAGCTGGTAGTT TTCATTGAGCTGGTTGTCGATGGTGTTTGGATGAGACATTGACCGCTGAA TCTTGTTTGGTGTAACCGAGGAGGAGTGGACTTCGTATCCATTGCAAGAC ATGGTTCTGTTCAATGAACCTTGTGATCCTTGTTGGAAATGATATCCGGT GGGAAGGTAAGAGCTGATTCCACTCAAATTCACGTTACTGTTGGATGACT GTGGTTGTTGATGTGGCTGACCATACACTGCATGTTGTTGACCAGTGTGG TAAGCCTGTTGCGACTGATGTTGTCCATGTTGTGAGACCTGTCTATTTTG TTGGTACAATTTCTTAATATTCTGCGCGGTGGCCAAACATTCGTCCACGA ATTTGTGGAGCTTGAGATATATGACATTCCATTGTAAGGACTGGTCGCCT ACATCAAAGAGGGAATGTGGTTCATCTCTTTGCAGTGGTATCTGATACAC CAAAGACAATGCGTTGTCAAAGAAGCTTTGATTGGAAGTTGACATCTTTC GTTTGACATCGTCGTAAGTGTGGAACTTGTAGGTGATGAAATTCTGTAAA CAGACAATGGATTCGAAAGCAGCATCCCCTTGTTTGGTGTACAAAACGTG TTGGAATTCGTATTCTTGAAAGGNAGAGGCTGTCGAGGATGATTTTTGCT TTGAATGACTTTTAGGGGGCGGCGGTGCGGATGAAGTTGATCTGTGCGAA GGCTGCATTGCTGCTTGGTTCGAAGAATCAAGACTTTTGAAGTCAGCTTT CATAGGTGTGATAACTGATTTTCGCTCATGGGAAAGCTGTTGGTAATGAT TTGTCGGTTCCTTATCAAGATGACAGGCTTGCCATTGAACCTGTTCGGAT TGTGCCTGTATGGATGATTTGTGTTTTGTGTTTGAGTTTCCCGTTTGATT CAAACTTGCAGTGGCTTGGACGACTTGTTTGAGTAGCTTTTCGTCAATAA ATGATACGTCACCGGTAAGTTTCGTTGGTTTTGGTGGTTCAGCTTTATGG TTATCTTGACGAGATTGTGGTCTTTGGTGGCTTGTATCTGGTTGAGAACT CTGTTGTTGGATTTGTGTATTATTGAGCTGGTAGTTTTCATTGAGCTGGT TGTCGATGGTGTTTGGATGAGACATTGACCGCTGAATCTTGTTTGGTGTA ACCGAGGAGGAGTGGACTTCGTATCCATTGCAAGACATGGTTCTGTTCAA TGAACCTTGTGATCCTTGTTGGAAATGATATCCGGTGGGAAGGTAAGAGC TGATTCCACTCAAATTCACGTTACTGTTGGATGACTGTGGTTGTTGATGT GGCTGACCATACACTGCATGTTGTTGACCAGTGTGGTAAGCCTGTTGCGA CTGATGTTGTCCATGTTGTGAGACCTGTCTATTTTGTTGGTACAATTTCT TAATATTCTGCGCGGTGGCCAAACATTCGTCCACGAATTTGTGGAGCTTG AGATATATGACATTCCATTGTAAGGACTGGTCGCCTACATCAAAGAGGGA ATGTGGTTCATCTCTTTGCAGTGGTATCTGATACACCAAAGACAATGCGT TGTCAAAGAAGCTTTGATTGGAAGTTGACATCTTTCGTTTGACATCGTCG TAAGTGTGGAACTTGTAGGTGATGAAATTCTGTAAACAGACAATGGATTC GAAAGCAGCATCCCCTTGTTTGGTGTACAAAACGTGTTGGAATTCGTATT CTTGAAAGGGCGTCAGTGATGATTGATGGTGATGGTTAGAGTGGTGATTT TGCTTTCTAGATGCATGTTTTGATACCTGATGATATAATATGAAATGATT TGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060918TCONS_00060918Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060919TCONS_00060919Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_35supercontigscaffold_35:46308..54310 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.15 0.09 0.1 0.15 2.67 1.49 0.74 0.77 0.42 0.67 0.77 0.51 0.3 0.41 0.17 0.42 0.71 0.78 0.34 0.31 0.63 0.75 0.11 0.48 1.28 0.8 0.13 0.2 0.14 0.23