XLOC_039365 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039365
Unique NameXLOC_039365
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_372:373825..390352-

Legend: gene
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GACCCTTAGAGAGACTGATTTTCGAAAATTATGTCCATTTTTATTCAGTT TTTGCCACCATTTAGCCCCAAATTTTCTGACAAAATTTACAAATTTTTAG TCCAAATTTCAAGAATTTATGACCCTTTGACGGGTTTTGTTTTTAATTTT CGTAATTTTTGAGCTCTTATATGATTGTTTTTTAATGGTTTTTTACACCT TTGAGGGACCTTCGAGAATGTGGAAAAGGAACTTTTATGGCTCGTTCATA CCCAGCACGCATTTTACCCTCCCCCCTCCCGGAGGTTATTTACAATAAAT ATGTGTTTTGATCAATCTTGTGACATCTACATCATATGCTTTCTTACTCG AGCCGCAGTGACGAGTTCCGGGAAGGATGACAATGTGTCTGCTGGCTTTT AATCTGTTTGCCCGAGTTTTCAGTCTATAATCCGAGAATTTTAAGATTAA GAGTCGGGAACACTAAGAAATAGGGTGGGTGGATGAGGGGTATATGCGAA CGGGACCTCTGTAAACCGACCCTTAGAGAGTTTTGCTGAAAAGGTCACTC TTTGGGCCTTTCTTGAAAAATTTTCTTGGATTTTCGAAAAAAGTCTTACC CTTAGAGAGACTTTTTTACAAAAGTTTCCTAAAAATCGTGAATTTTCCGA CCCTTACAGAGACTAATCTAAAGTTTTCTGATATTTCCGACTCTTAAGAG AGACTTTGAAAAAACTGACTATTACCGTCCACAGCAGTCCATCCGTACCC ATCGCATATTTTTGCCTAAGTACACCCCACCCCCGCGAAATAGATAACTT TCTTCAAACTTTTGCTTCTCACATTTTTAGAACATTGCTGAAAAGTCAAA GAAAAAGAGTTTGATGGCCAGCTTTTACAGTCGTCAGCTTGGTGGAATTC AGCAGACTATCGGCATCAAAGTCATGAGGCTTTAAGGGTCTACAGGCAGT GGCGTGAATTTCTATTCTTGAACATAGTAGATAGTTGATAATGCAAACAA AGCATGGTGATATAGACGGTAGAACGCAGATCCGTCTCACGAGACTCGGT TGGAAACTCGTAACAAGTTAAGAAGTAGGTGAGATTGACTTCAAGTGGGA TGCAAAGCTTCCTTGATACATGGTTTTGGGAAGGAAAAGTGGAAACAATG CCCCTTACTTGTTTTGCTAAAGTTCCTTGTTGGCAATAAATAAATTTTGC AAATAGATAGTAAATATAAAAATTATAACGACGGTTAATTTAATTTTGAA TGAGAAATTGAAAATAGCTGAATACCACTTTGTTGCTGAAGTCAAATTAT TCCTGTTTCTTTTTGCCATTTTGAAGCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062854TCONS_00062854Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062853TCONS_00062853Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062852TCONS_00062852Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062851TCONS_00062851Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062853-proteinTCONS_00062853-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_372supercontigscaffold_372:373825..390352 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
F13A1PREDICTED: coagulation factor XIII A chain isoform X2 Homo Sapiens
TGM5protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5 isoform 1 Homo Sapiens
TGM3protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E Homo Sapiens
TGM2protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 isoform a Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0.07 0 0.55 0.65 2.84 1.65 3.91 2.21 41.05 31.95 25.83 46.34 33.99 38.26 4.21 8.56 40.63 40.08 31.64 35.96 41.87 48.73 1.87 0.84 0.03 0.03