XLOC_040406 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040406
Unique NameXLOC_040406
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_415:300702..308006+

Legend: transcript
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040406 ID=XLOC_040406|Name=XLOC_040406|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7305bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_415:300702..308006+ (Clytia hemisphaerica)
TAATTTagcattacgtcatttttccaatggaaatttgaccaaaattatCA CACAACAGTTGATGACCTCTCACACAACAATCGGTGTCACAACAATTCCA ATGggaatttgaccaaaattatCACACAACAGTTGATGACCTCTCACACA ACAATCGGTGTCACAACAATATTTAAAACATTATAATGCATTGGAAATTA AAGTCAAAACCATTTTCAAAACCAAATGAATAGTAAGTATTTCTTGTTGC AAATTGTTTTGGTGAACATAATGTGATTTTTTATTGGGTTAGCTAACCCT TTCGATTTACACCAGTACGTACCAgcaattataaaaaatataaataaatt tggTTGTTTGTgacaattttgccaaaaatttttaaaatgcgTCCACTGCA CTGGACTGCACTGGCATTTGGTCAggcttaaaaaataaatttgactgACT GACTGGACTGCTCCAGATGTGGATTTCGCTAGCTAtcgacacgctttgct ctgtacgatttgatttgaaatatcacgtttgttttcacccatccatTTAC GTTAGAGctgcgtggtgggcagaaaacaatcacgatCTGCTCTCAGGTTA CAGACTCTGGGCTGCATTCTTTGAAAGTAATACTCTTCAGaccattttat ttttgattttttaacaaCTGgcatttattttaattttttttttcaggaaa caACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTT TGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAacttggttttaaggtttgttttACTT ATCcctttttaaatgtttctttttaaaatatattagaccttttttcaaag aggacgtcctgttgaataattatgtagtccagccataaaaacaatgataa agccatgcataattactgtatcatgcatattgtaataattatgcatggtt ttatcattgtttttctgctggactacttaattattcaacagggtggcggT CCTACGGACTCGAACAAATTACAATTTTCTCCTTGTTACTCGACTCCTGA TAAATTGTTAATTGTATGACCAGACGTGCAATTACTGGTTAAATCATCAA GTTGATTAGACCAAAGACGTGTAACTAGGTGCTTGAGGAAGAAAGGAAAT GTAAAGAAGGGACaagcttctcaaaaacaaaatttatttcactgtTTTAC TAATTATGCATATCCATGTGTTATTGTTTTATTGCTGtagtttttaatta aattttataTTGAGAACTGCAAAACGCCTATTTAGAGTTGATTTTTCACT TTCTGTATTCAGCTTATGCACCTTATGTAGAGGTATCTAAAAAAAAAGTG ATTTAAGTGGGAGTGAAAGGATGGAGAAGATGATAGATATctacaagaaa aagaaataagatTTGACCTGGAATTGGTTTAaataaaacaaagattttga ccCAACTGTTTATTCTTAATCTTACTCCAACTtatcttatttattcaaaa atacctccagggtaatcttccatctgatgtcctatcaacacttaattttg gtgaaattgatcacaaaactggcaccaggggcaaagctattaaactacta aaactttcaacggtcaaaaccacaaattttggacttaactctttctctcg tctttcgtcaaaacaatggaatgagttaATAAATAAAGTTAATAactaat aaatcatcctgacaCTGATTATCACAACCTTcttgatactgatgaactaa aatctttagctacaaaattctatttagacaaatacaaagctgaagacgaa taatctttgtgtgtgtgcGTGTATTGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNGTGCGTGaacttagtgtgttttcccagggtgggaggg ggtgggtggtgtaacaggaagaactttataaataaaactactcaaagaaa ttgtcattaaataaaactaaaaatgtttcttatattcattattttgtgtc actattaatattatgataatcatttattcattttttctttagttctgtat aattttttagtttcttctaggttccccatagggtttttttgtaaggggtt atcctgctgtgttgcagcaaaaatatattcaattcaattcaattcaattc attcCTCTATGCCTCCATGActtacttttttattcttttttattcttttt tatttttgatgcaTAAAGTTAAAAAGATTATTCAGAAATAAAGTATATAC AATATACATAATTATTACACTTCATAGCTTACGACAACTAAAAAGAATAT TGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATT GTAAATGCTATCCAGGTATAATAACGATATCCATAATTATATGCTCTCAA AACTATGAGTGTGTTGATAAAGTGATTCAGGCAAAAGTAGAatgttaaaa ttcaaatttactttCTTTAATACAAAATCGAATATATTAATTATAATCTC TATTTACCTTTAAAAACTGAAGTGTATTTTATATATGTTAAACAACAGCT TTTATTGCATGCCCCCTCTTTCCAGTCCTTAATGTGACTTAGGATGTGTA AATTCTTTCACgtcaatttttaacttttaaaactAGAAAAAGTAATTTAC TTTCCTTCCTAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAG AAGCATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGT TAAGCCACATTTTAATTTacctatctatctatctatctatctatctatct atctatctatctatctaatcTAGTTTGTAAATAGAACTCTGATCACTACA ATAATATTTCGATGTTTAGCAGATCTTTTGCCTTTCACTAAGTCATCATG GTTGAATTAAAATTCAATACTGTAATTATAATCACAAACCTGTCCATTAC CATTACCAGCATTACCTTTTTCTGtggattcaaatttctttttggttggt tttaattgaattttaaaGACTAGATATGGCCATTATGGtcatattttgac attttagtcccAGTAATTTCAAAACTAAACTTCAGTTGTATAACTAAATG TCAGTTGTATAATTTTAGCTATTTATTTCTGTAGGGAACAAGTAAGATTG TTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaagaag attgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGTAAGGACTTAAAAAAtcgttg gtttgccgtcacccaaccctagattttggagctGGGTTGGTCGGtcggaa tttatttttattttagcgattatgaaattttcggccatggaagggttaac agtttgtttacatttaggtaatttggaataaaaaacagtttttagtCCAG CCTAATGTTTATGTCATTTTATGGAACTTATGTTATGTACTAAAAATGAA ATCTCAAACCAAGTAGAAATTTCAAGCTAATCTGAGCTAATTCATATTTT AATTCAAAGATTGTACactgtttcttttttttatttcttttgtgtAATTA TGTTCTGACTAAATCTCCTTTTTTTCAGCCATCCTACTCACCCTAGCCTC TTTCAGTCCGTTGAAACCCACATTGGTAATGGTTTTGCCATTAAAAAAAT AGTCTGTAAAATAGGTCAAAATATGAGTacagcttgaaaaaaaattgtac aaatAAGTTTTctaatgttttgtaattttttgagaattcatTTATAGATT TGGGGCTTAAGCTTTAAGGAGctctctgaaaaaaaaatttgccctgccCC TACCTCTGGTTGTGACAGTTTATAATCACACAATATCTTCCAGTGAGATT TGATTTACAAACTTTCAGTGTCAAAGAAACGGTCAAGATCTTCAGTTTTT Ctatctaaaatttttttccaaagaactttttcctttaaataaattcaacg atttagatttttttctttcatcaaGGGACCAAATGATGTATGGCATATTG ATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTC GATGGGTAAATTAAATATGATTAATGATGATTTAAATATAATGATGTGTA TAAAAgttaaactttaaactaatcAAACATTCATTCACATTGGCGAAGAT GAAATGTTGAACTAGTTTACTCTAAATTTTAAAAGGGACTGGTTTGTTTA CgatcttttaaatcaaaaatatagGCATAGAAGTAATTACTCTgggctat tttgaaaatatcagCACTCTTATTATTTTCAGCTACTCAAGGAAAGTGTT ATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGC ATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGTAATATACTCCTCTAGAAA TAAACTTGAATTGCAAATGAAGAAGAGTGAACGATAAAGCTGGGTGTCCa ccgataaaattttttttttatttataatggaacaaaaaaaatgcacgata gggaaaaaaacttttcttcattCCCTATTGCATATTTGTCGACCCTATCA GGTAAAACATGAGCATTTTGTTCTGAAAATCTGTGTGATCTTTGTTTCAG AAGcatgtgattttttatttgtgGTGAAAGAATGAATTACTTTTTTGGTG TACACAAGcttaacaaacaaacaaaataacacAAATCTTTATGCATTACA AGGATCGAACTCTTTTCAGCACTCAGTTATGACGTTTTTTAAATCAGCCA CACTGATCATTATGAAATCTTTTATTTAGGAACTGCAAGACGAATTAGGG CTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTC CGATTGCATGCGGTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTT TTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGGTTAATAATTGtgtaattcaaa ttttcttcagTTAGggcatttccaattttttaaagccACCTAGCTTTGCA GTTCATTCGTCTTCTAATTAGTTCCAATCTATTATAGTAATCTGACTGAT CAAATATTTGTTGTTTTATTCTTGCACGTGTGAAATGGCAATTTTCTTCA ACAAAAGACTTAGAAGTATATTATAAACAATACAATACTTTCTCTAACTT GAATAGCTAAGACATCGAAATATTTCTTCGAATATACGTGAAATTCGTGG TATAGAGGGGTCGTGAAAAAATCCAGCATTTACAAATTAATAACTTCATG TATTTTCCTCTTTGATAATTTGGTTTAAGGCAAAAAAGATGTGGCATTAT TTTGATaaacttattttcttttatagAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGG CTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaaagtaaaata tttctttaaattaCATTTCAAAAACTCGTGATAGAATTTTACCAGATCAT TAAAAATCGTTTGGTTGGAAGCACAAAATTTGACCTTGCAAAAAGTTCGC TTGACTTGACTGGGTACTGGGAAATATCTGTGTGCTGGATGGATCCTTTT CAGATAATTGTTACTAGAActaattttttaatgttttgctTCTCTAAGTA AGGGATTGTTGCTTGTTCAATTTTGCACGTAAACAATGCCAATACCAGTT GTAATTAATTATTTGcccatgtcgaaatttcttcgctttgcaaCCCCTTT CGCGTTGATTCTTTTATTATAGGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACG AAACAGATGATATCTACAGGTATTTTTTAGTCTTAACCAGTAACAGTCAT TTCACTCTACTAAATACGCTGTGGAATATGTTCTTTAATTTCTGATATTT CTTCAAATTAAAGTAGTGGACCAGACAATTAATCACCGCCACCTTTTGAT AGACTTCATAGGTTCTAATTGGTCATACTAGCTTGTAGTAATTTTAGATT CCATGGGGTTTACATATTGAAGCAGTCAGGTTTGggtatttattcatttt tcaattttagagaCTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAA TCTTTAGATGATGCAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATA TCCTTTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATAC CAGAAGCTTATGGTTAGaatagcttgtttattttcttttttattggtTTT TGAATCTTAATGTTAACGATTGAGAACTTAAATCACTGGATTATTATTGT CGTTTCATTATAGTTTTAATATATCGCCGAAAAAAAGTAgcattgaaaaa tataaaaacagttcacaattattttattaattttcagaACCGCTTCTTAT TTTGGTACCTGAAATTTTAGGTCACTTATTAcaattattgatatttttag aCACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCA CGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCT CGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAA ATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGT AATGGGCATATATAAAGATATTGGTTATTTCTGCAGGCTCTAATATATTG ATAGCTATTTTCTGATAATATAAAGTAATTTAATTGTGATCCTGATTGTA GTAGTACACATTGTGCATAATATAATAAAGTTTGAGGAAAATTTATTGCT CAAGAGGCGTAAGGAAATACcttaagtgtattaattttggcgggtactta atttggtggattggaaaatttttggcacttggaaatcaaaaattttaatg gttttaacttaaaaatggtgtttttcgatagaatttctatcctaaaaaga ttttgttaaatttgacgggtatttaatttggcggacggccaatttttaaa attttggcgggtatttaatttggcggattttaaAATCCGccaatttaatc cccgccaaaattaatacacttaGGGTATTTTTGGCTAGCATGTTCTTAGC TATATaacaatttaaaaactttttgggCATAATCTGGCTTCGTCGTTACA GAGATGGAAAATGTTTTCAGGTAGATTGTACAAAATTTTTTCCACTCAAA TATTTAacgaaaaatctaattttttcgccattttgatgacgtcaaagGAA AGTGCTTTGGAGCTCAAACTTTGACCGATGGTCATTATCAAGATTTgaat gagaaaaattaaaaagttgttcaaaaaattgatgacgtcaggaATTGCTT AAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064436TCONS_00064436Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064437TCONS_00064437Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_415supercontigscaffold_415:300702..308006 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.08 0 0.03 0.1 9.99 7.6 12.72 14.59 28.88 28.51 18.75 25.22 6.92 5.74 0.05 0.04 0.17 0.01 0.07 0.04 0.11 0.05 0 0.06 20.52 23.22 0 0.06 0 0