|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_415:300702..308006+ Legend: transcript Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040406 ID=XLOC_040406|Name=XLOC_040406|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7305bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_415:300702..308006+ (Clytia hemisphaerica) TAATTTagcattacgtcatttttccaatggaaatttgaccaaaattatCA
CACAACAGTTGATGACCTCTCACACAACAATCGGTGTCACAACAATTCCA
ATGggaatttgaccaaaattatCACACAACAGTTGATGACCTCTCACACA
ACAATCGGTGTCACAACAATATTTAAAACATTATAATGCATTGGAAATTA
AAGTCAAAACCATTTTCAAAACCAAATGAATAGTAAGTATTTCTTGTTGC
AAATTGTTTTGGTGAACATAATGTGATTTTTTATTGGGTTAGCTAACCCT
TTCGATTTACACCAGTACGTACCAgcaattataaaaaatataaataaatt
tggTTGTTTGTgacaattttgccaaaaatttttaaaatgcgTCCACTGCA
CTGGACTGCACTGGCATTTGGTCAggcttaaaaaataaatttgactgACT
GACTGGACTGCTCCAGATGTGGATTTCGCTAGCTAtcgacacgctttgct
ctgtacgatttgatttgaaatatcacgtttgttttcacccatccatTTAC
GTTAGAGctgcgtggtgggcagaaaacaatcacgatCTGCTCTCAGGTTA
CAGACTCTGGGCTGCATTCTTTGAAAGTAATACTCTTCAGaccattttat
ttttgattttttaacaaCTGgcatttattttaattttttttttcaggaaa
caACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTT
TGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAacttggttttaaggtttgttttACTT
ATCcctttttaaatgtttctttttaaaatatattagaccttttttcaaag
aggacgtcctgttgaataattatgtagtccagccataaaaacaatgataa
agccatgcataattactgtatcatgcatattgtaataattatgcatggtt
ttatcattgtttttctgctggactacttaattattcaacagggtggcggT
CCTACGGACTCGAACAAATTACAATTTTCTCCTTGTTACTCGACTCCTGA
TAAATTGTTAATTGTATGACCAGACGTGCAATTACTGGTTAAATCATCAA
GTTGATTAGACCAAAGACGTGTAACTAGGTGCTTGAGGAAGAAAGGAAAT
GTAAAGAAGGGACaagcttctcaaaaacaaaatttatttcactgtTTTAC
TAATTATGCATATCCATGTGTTATTGTTTTATTGCTGtagtttttaatta
aattttataTTGAGAACTGCAAAACGCCTATTTAGAGTTGATTTTTCACT
TTCTGTATTCAGCTTATGCACCTTATGTAGAGGTATCTAAAAAAAAAGTG
ATTTAAGTGGGAGTGAAAGGATGGAGAAGATGATAGATATctacaagaaa
aagaaataagatTTGACCTGGAATTGGTTTAaataaaacaaagattttga
ccCAACTGTTTATTCTTAATCTTACTCCAACTtatcttatttattcaaaa
atacctccagggtaatcttccatctgatgtcctatcaacacttaattttg
gtgaaattgatcacaaaactggcaccaggggcaaagctattaaactacta
aaactttcaacggtcaaaaccacaaattttggacttaactctttctctcg
tctttcgtcaaaacaatggaatgagttaATAAATAAAGTTAATAactaat
aaatcatcctgacaCTGATTATCACAACCTTcttgatactgatgaactaa
aatctttagctacaaaattctatttagacaaatacaaagctgaagacgaa
taatctttgtgtgtgtgcGTGTATTGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGTGCGTGaacttagtgtgttttcccagggtgggaggg
ggtgggtggtgtaacaggaagaactttataaataaaactactcaaagaaa
ttgtcattaaataaaactaaaaatgtttcttatattcattattttgtgtc
actattaatattatgataatcatttattcattttttctttagttctgtat
aattttttagtttcttctaggttccccatagggtttttttgtaaggggtt
atcctgctgtgttgcagcaaaaatatattcaattcaattcaattcaattc
attcCTCTATGCCTCCATGActtacttttttattcttttttattcttttt
tatttttgatgcaTAAAGTTAAAAAGATTATTCAGAAATAAAGTATATAC
AATATACATAATTATTACACTTCATAGCTTACGACAACTAAAAAGAATAT
TGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATT
GTAAATGCTATCCAGGTATAATAACGATATCCATAATTATATGCTCTCAA
AACTATGAGTGTGTTGATAAAGTGATTCAGGCAAAAGTAGAatgttaaaa
ttcaaatttactttCTTTAATACAAAATCGAATATATTAATTATAATCTC
TATTTACCTTTAAAAACTGAAGTGTATTTTATATATGTTAAACAACAGCT
TTTATTGCATGCCCCCTCTTTCCAGTCCTTAATGTGACTTAGGATGTGTA
AATTCTTTCACgtcaatttttaacttttaaaactAGAAAAAGTAATTTAC
TTTCCTTCCTAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAG
AAGCATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGT
TAAGCCACATTTTAATTTacctatctatctatctatctatctatctatct
atctatctatctatctaatcTAGTTTGTAAATAGAACTCTGATCACTACA
ATAATATTTCGATGTTTAGCAGATCTTTTGCCTTTCACTAAGTCATCATG
GTTGAATTAAAATTCAATACTGTAATTATAATCACAAACCTGTCCATTAC
CATTACCAGCATTACCTTTTTCTGtggattcaaatttctttttggttggt
tttaattgaattttaaaGACTAGATATGGCCATTATGGtcatattttgac
attttagtcccAGTAATTTCAAAACTAAACTTCAGTTGTATAACTAAATG
TCAGTTGTATAATTTTAGCTATTTATTTCTGTAGGGAACAAGTAAGATTG
TTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaagaag
attgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGTAAGGACTTAAAAAAtcgttg
gtttgccgtcacccaaccctagattttggagctGGGTTGGTCGGtcggaa
tttatttttattttagcgattatgaaattttcggccatggaagggttaac
agtttgtttacatttaggtaatttggaataaaaaacagtttttagtCCAG
CCTAATGTTTATGTCATTTTATGGAACTTATGTTATGTACTAAAAATGAA
ATCTCAAACCAAGTAGAAATTTCAAGCTAATCTGAGCTAATTCATATTTT
AATTCAAAGATTGTACactgtttcttttttttatttcttttgtgtAATTA
TGTTCTGACTAAATCTCCTTTTTTTCAGCCATCCTACTCACCCTAGCCTC
TTTCAGTCCGTTGAAACCCACATTGGTAATGGTTTTGCCATTAAAAAAAT
AGTCTGTAAAATAGGTCAAAATATGAGTacagcttgaaaaaaaattgtac
aaatAAGTTTTctaatgttttgtaattttttgagaattcatTTATAGATT
TGGGGCTTAAGCTTTAAGGAGctctctgaaaaaaaaatttgccctgccCC
TACCTCTGGTTGTGACAGTTTATAATCACACAATATCTTCCAGTGAGATT
TGATTTACAAACTTTCAGTGTCAAAGAAACGGTCAAGATCTTCAGTTTTT
Ctatctaaaatttttttccaaagaactttttcctttaaataaattcaacg
atttagatttttttctttcatcaaGGGACCAAATGATGTATGGCATATTG
ATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTC
GATGGGTAAATTAAATATGATTAATGATGATTTAAATATAATGATGTGTA
TAAAAgttaaactttaaactaatcAAACATTCATTCACATTGGCGAAGAT
GAAATGTTGAACTAGTTTACTCTAAATTTTAAAAGGGACTGGTTTGTTTA
CgatcttttaaatcaaaaatatagGCATAGAAGTAATTACTCTgggctat
tttgaaaatatcagCACTCTTATTATTTTCAGCTACTCAAGGAAAGTGTT
ATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGC
ATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGTAATATACTCCTCTAGAAA
TAAACTTGAATTGCAAATGAAGAAGAGTGAACGATAAAGCTGGGTGTCCa
ccgataaaattttttttttatttataatggaacaaaaaaaatgcacgata
gggaaaaaaacttttcttcattCCCTATTGCATATTTGTCGACCCTATCA
GGTAAAACATGAGCATTTTGTTCTGAAAATCTGTGTGATCTTTGTTTCAG
AAGcatgtgattttttatttgtgGTGAAAGAATGAATTACTTTTTTGGTG
TACACAAGcttaacaaacaaacaaaataacacAAATCTTTATGCATTACA
AGGATCGAACTCTTTTCAGCACTCAGTTATGACGTTTTTTAAATCAGCCA
CACTGATCATTATGAAATCTTTTATTTAGGAACTGCAAGACGAATTAGGG
CTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTC
CGATTGCATGCGGTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTT
TTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGGTTAATAATTGtgtaattcaaa
ttttcttcagTTAGggcatttccaattttttaaagccACCTAGCTTTGCA
GTTCATTCGTCTTCTAATTAGTTCCAATCTATTATAGTAATCTGACTGAT
CAAATATTTGTTGTTTTATTCTTGCACGTGTGAAATGGCAATTTTCTTCA
ACAAAAGACTTAGAAGTATATTATAAACAATACAATACTTTCTCTAACTT
GAATAGCTAAGACATCGAAATATTTCTTCGAATATACGTGAAATTCGTGG
TATAGAGGGGTCGTGAAAAAATCCAGCATTTACAAATTAATAACTTCATG
TATTTTCCTCTTTGATAATTTGGTTTAAGGCAAAAAAGATGTGGCATTAT
TTTGATaaacttattttcttttatagAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGG
CTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaaagtaaaata
tttctttaaattaCATTTCAAAAACTCGTGATAGAATTTTACCAGATCAT
TAAAAATCGTTTGGTTGGAAGCACAAAATTTGACCTTGCAAAAAGTTCGC
TTGACTTGACTGGGTACTGGGAAATATCTGTGTGCTGGATGGATCCTTTT
CAGATAATTGTTACTAGAActaattttttaatgttttgctTCTCTAAGTA
AGGGATTGTTGCTTGTTCAATTTTGCACGTAAACAATGCCAATACCAGTT
GTAATTAATTATTTGcccatgtcgaaatttcttcgctttgcaaCCCCTTT
CGCGTTGATTCTTTTATTATAGGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACG
AAACAGATGATATCTACAGGTATTTTTTAGTCTTAACCAGTAACAGTCAT
TTCACTCTACTAAATACGCTGTGGAATATGTTCTTTAATTTCTGATATTT
CTTCAAATTAAAGTAGTGGACCAGACAATTAATCACCGCCACCTTTTGAT
AGACTTCATAGGTTCTAATTGGTCATACTAGCTTGTAGTAATTTTAGATT
CCATGGGGTTTACATATTGAAGCAGTCAGGTTTGggtatttattcatttt
tcaattttagagaCTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAA
TCTTTAGATGATGCAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATA
TCCTTTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATAC
CAGAAGCTTATGGTTAGaatagcttgtttattttcttttttattggtTTT
TGAATCTTAATGTTAACGATTGAGAACTTAAATCACTGGATTATTATTGT
CGTTTCATTATAGTTTTAATATATCGCCGAAAAAAAGTAgcattgaaaaa
tataaaaacagttcacaattattttattaattttcagaACCGCTTCTTAT
TTTGGTACCTGAAATTTTAGGTCACTTATTAcaattattgatatttttag
aCACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCA
CGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCT
CGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAA
ATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGT
AATGGGCATATATAAAGATATTGGTTATTTCTGCAGGCTCTAATATATTG
ATAGCTATTTTCTGATAATATAAAGTAATTTAATTGTGATCCTGATTGTA
GTAGTACACATTGTGCATAATATAATAAAGTTTGAGGAAAATTTATTGCT
CAAGAGGCGTAAGGAAATACcttaagtgtattaattttggcgggtactta
atttggtggattggaaaatttttggcacttggaaatcaaaaattttaatg
gttttaacttaaaaatggtgtttttcgatagaatttctatcctaaaaaga
ttttgttaaatttgacgggtatttaatttggcggacggccaatttttaaa
attttggcgggtatttaatttggcggattttaaAATCCGccaatttaatc
cccgccaaaattaatacacttaGGGTATTTTTGGCTAGCATGTTCTTAGC
TATATaacaatttaaaaactttttgggCATAATCTGGCTTCGTCGTTACA
GAGATGGAAAATGTTTTCAGGTAGATTGTACAAAATTTTTTCCACTCAAA
TATTTAacgaaaaatctaattttttcgccattttgatgacgtcaaagGAA
AGTGCTTTGGAGCTCAAACTTTGACCGATGGTCATTATCAAGATTTgaat
gagaaaaattaaaaagttgttcaaaaaattgatgacgtcaggaATTGCTT
AAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_415 | supercontig | scaffold_415:300702..308006 + |
|