XLOC_042135 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042135
Unique NameXLOC_042135
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_47:71555..92076-

Legend: transcript
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TTTTTTACTGGATAAATTTTTTGAAAGTGTCTAGGGTCACAAGTCCTGGG GGCTAACAAAAAAATCATAAATCTTTGGGGGGACTTAAAACTCAGGGGGG ACCTAATTTTTGCCTGGGACCTAAACCCAGGCTGACGCTATGCAAAGATA GTGTTCTACGTAAAGGAGCAGTAAAGTAAAATAGATGTTCAATGTTTAGA ATTGTTTAAGATATTCCTGTAATGTGCATACACTTTGTCAATTATAGCTA TGGCCAAAATAATCGTATTACGCAACTGTGTTTTGCTTTTTAACTGTCAC TTCATGAAAAGTCCTCTTTTCTAACGCAAAATATCAATTTTCTTGTTTTG AAATCATTGAACTTTCTTCTGTGCGAAAACAAGTAACAGTTGTTCACAGT CTTCACTGATTCTCGAAAAGCTTAAATTTTCTAAATATAGAAAAAATTAA CTTTTTGATGTATAAAATGATTATATTTTTAGCCACGAAAAGCACACAAA GAGTTGATGTTTTACCTCTTGATGTCGATAATTGCAAAAGAAGGCGGATA ATGTCATTATTCAATTTTTCCCTAATCAATTTCTCTACGTAGGTTTTCGA AGCACCCTTTCATTGCGGATGCCTCTCAAGTGACGCCGCTCTTCGACGGA TCCCCGTCCGCCGTCTCTTACGCAGATTCACGTAACAACCGTTTCAAATA CATCCCCGGAGGCGTGGATATCTTTTCACGAATTCACCCTCCTTCAAAGG TGTTGCATTACTTCAACGCACCACCTGATTGCAGCGAAGATCACTTGAAA CAAGTCTTTCATTCTCTGGGTGCTGAAATCCCCATCAAACAAGCAACATT CTCAAAAAGTAAGTAACTACGGAAGGTATATTTCTTATCCTGTTCTTTTT TCTCGTTCTTGTTCTTGTTACTCTCACCGTTCTTGTCCCCTTCCCCCAAA GTGGCCCTTGGGTGAGACAATTTTCAAACNATCCTGTTCTTTTTTCTTGT TCTTGCTCTTGTTACTCTTACCGTTCTTGTCCCCTTCCCCCAAAGTGGCC CCTGGGTGCCTAAAAGTTTGAAAATTATTCCATGGCCAGCCACTATAAAT ATGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTAATTATTATTATTAGGTTACGACTTCA TTATAACTCTTTTATTAGAACCAATCAACAACAAGTTTCAACCCCAGATT GCCTTTTTAAGCATGTTTCGATACACTGGTTGATAGATAGGTCTATATCT TTGCATCATTTGTTAAAATTAAACTTCAATTCATACTCCAAGTTTCTTCA GTGTTTTACTATTGAAACACTAATCTCTTACGCTTTCAGGTAATGGGAAG TCATCTTCAGGACTTCTTGAGTTTTCATCAGTTCCCACAGCAGTAGAGGC GCTCATTTTGGCAAACCATTTCACCATGCAACGGGATATTCGCATCGAAG GTAAAGCCAACAGTGTTTTGCAAATGAAAAGATGTTTAGCTGGACTTATT TAATTCGACTTAATCAATTCGTATCATTTTGTCCATAGTATAGAGGTCTA CAGAGATGTAGCCATGCAGACATCAACTTGCATTGTCTTTTTTCATTCTT AGTTTTTTGGTTAAAGATCAGTATTTGAAATTTTGATTAATCGAGACCAA TCTCTAACTTTCTTATCTTTCTTTCTTTTCAGATCCCTTTCAAATGTTGG ACAAAGGTACACAACAAGTCACTCTACAAATCAACACGCTTTCTCTTTCT CCGCCCAACACCCACCCACAATTACACCCTAACGCCCCCGATAACGCCCT ACTTTCACTTCATGATTCACTGCACTCTGATCTTTCTCTTTCAGGAGGAG CAGCCTACACTTTAAAGCTTGCATTTTCACCTAGCAACGCCATCAACAAC TAAACAAAAGACCTGTAGATAGAGCTCTTATTTCCGTTCGATTCACACGC TTCGTTCGTTCGTTTGTCCGCGCAATCACAACACGGGACAATTTTATTTT CGCATTCTTCTGTTCAAGTAAGCAAGCATCAACCAGCAAAAGATCACACT CTATGCAGTTCAAACTAAACAAACAAAAAACATAATTTTGTCGATATTTT TTTGGAATTTTTCACGTCACATGTATTTTGCAGTGCAGTCATTCTTTCAT CAGTCTATGCATCTTTTTGGTTTCCATGGTTACGAAATGCAAACAAACAT GGCAGCCACACCACAACTCAAATGCAGCATATATTATAAATGCAATCTCA CTACTCGTTGTCACCCTTCTTAATGTCAAACATTTTGGGTGACATTTTTT TGTTCTTTTATTTTTTCGCTTTTATCGTTTGTTTTTATACTCTTACATAA AAAAAGTATATTTTTTGTTTTTTTTTGCGTTTTCATTCTATACTTTTCAT TATATTTGTTTTTGCAGTTCCCTTTTACCCCCGTCTTTCAGTGATCGCGA CCTGAGAGGTTTTAGAGTCCAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067463TCONS_00067463Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067462TCONS_00067462Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067461TCONS_00067461Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067460TCONS_00067460Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_47supercontigscaffold_47:71555..92076 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
HNRNPLheterogeneous nuclear ribonucleoprotein L isoform a Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.87 4.43 3.14 2.46 13.49 9.27 7.68 8.97 34.68 33.1 47.88 34.57 0.69 0.5 0.25 0.45 68.13 67.9 0.08 0.08 63.53 64.69 20.96 35.26 66.89 69.46 9.98 10.43 13.03 16.44