TCONS_00000815 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00000815
Unique Name	TCONS_00000815
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2508

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000005:560072..571566-
coding sequence from alignment at sc0000005:560072..571566-

transcript sequence

>TCONS_00000815 ID=TCONS_00000815|Name=TCONS_00000815|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2508bp
tatttttgattcggtttttagttttcaaaatcATGAATCTCAACACCTCT
AGCAATTTTCACCTAGCTGCatattagaatttaaaaatatttttcaaccc
CACTTTAATAAGGCACTAATTTactttcagaagaaaaaaaaataatgcaa
TGAGTAAAAGTAATTTATCTAACATTTCACTTGGAAGTTTCACTGAAAAC
TGTTTGGAGAGTTATGATCCTGTTGCTTGTTCAAGGGACATAACAGAATC
AGTGTTTGCATTTCTTACGATCATTGGATGTACATacaagGTTGTGAGAT
TACACATCTCAAAGCATAAACTGTTGAACCAATACTTGATATTCTATGCt
gcaatcattgaaatcattctacTGCTTGTTAATTGGATTTATGCTCATCA
TGCAAGCTTGGATTTGACTGCcgaattattcaaattatttcagtttCTGG
TTGTGTGCCGTTTTTATTGCGAAGTTGCATCAAGAATATCAAAAACCGAA
TATTTGTACAAAAGGATATGTCTGCCATTTTTAATCATTACGTCAACATA
TTATGTCATATTGATCATCGTCAGCATAGTTCGTATGAAAGCTGAACACG
AGTGTAAAGAACCTGAATGGATTCAATTATCTTCTTCGGAAGTAGCTTTG
GGGATTATTTTCATCGCTGTTGGTATCTATATCACCAATCACATCAATAA
CCTGAAAACAGATTCTACCTACAAAAGGAATATCCGATTGTCTCTATGGG
GgaTAATCTTGAGTTTCGAATTTTCGTCTCTCATTAGTGCTATCTATGAT
GTTCTAATGATCGTTTATGGTGAAATGAACAGATGTAGAGGCATTTTTGT
CACTGATGCTGCACTTTTCACGTCTGTACACATCTTTGTTAAGTTGACAA
AATGGTTGTTACCTATCTGGGCCATGATGATCATTTTCAAGCCGGAAACA
TTTGGAACGAAGAGCAGTAACtcagacgaagaagaaaatttcaacGATCA
ACCACCAATCATCAGAAATTCTCTTATGGGGGATTTCAAATCAGAATTTC
GTCCTCGGAACCGTAGTTTCAACTACAAGCATTTACGTGACCCTGACAAT
GAAGAAGAACGTCGACTGTTCAACGAACAAAAAGAAAACGCTATCGTCGA
AGCTGAAGAAACGCcaagaagaaaacgaaagaaGAACAAAAGTGGGAACA
GCGAATCTTCAAATACAAGTTCAGCTGGGAAAGCTGTTACCCAAGATGCA
CCAGTAGATTCTTCTTCCAGTAAAAGGCATAGAGATAAGAAtcgtaatcg
aaccaatcaaaaacAGAAGAAACCATCACGTAATGTTGGAATCAATTCTG
GTGATATAGAACCAGTCAAAGTTTGATACACGTGCGCCCGGTGCGCCAGT
GtttatgatgaaaatgatattttgattgtttgtgACAAGTTTGATTACAT
CAGAAAATATGTGGTGTTTTGTGCAGATTATTGATTTCAAAGAGAAGACC
CATTCTGTACAGCAAAGCTATCTGAATGTGGTCCTTTGTATCGTCTTAAT
GATATCTTGGCGTATGAAAACTTCAAATCGAATATCAAATATCAAGCTTA
GAGTTAGCTGTTTGGGTGATTTTTAGTTGCCTTCAAAACCTTTATTCGAT
TTTGTTTTTTGTCGCCATactttttgtatatattttcgaaatatttttgt
aaatattttaaagagATTTTATAAAGAAGTCGTTTTATAAATGAGCTGGT
ACAGACTTGTAGTAGTAGCTTCTTTTTTATTATGTTAATGATCAAATTGA
TGGCAATTAAAAAACTTAAGCCAGTATAAACTTCATAATTTCTTTATAGT
GAGCATTTTTATGGAAACAAATTTCCCTATAATTGCTTTAAAGATGATAG
AAATCTCGgtaaattgttttaaattgtGCGCCCAAAAACACGTTTACATA
AGAAGTGAGTATACATTACATTGAAGTTctattttgtgaataatatACCT
GTAAATATTATTTAGAAAACCCTTTATATATTTATGCATATAATCACTAT
ACCCCATAATTATAAGCAATTaactattttagatttagatttagatttta
gtTACAGATTTATTCCTGTTGAGTTTTAAGTTTGTCTATATTTTTTCGCT
GATCCACATAAAACAGATTTTTAATTTATGAGAGAGAGTTTTTTAAGTAG
GGTTGATTTGGCCTCTTGACAAGATTTCTGAAATGTTCCGACGAGAAAAA
TCAAagtttcaatatatttttttagcGAATGAGTCACAGTCCACAATCAT
CGATTCCTTCATCTAGGAAACTAATTTTCCCTTGATTTGGTCACCAAGTG
ACTCTTTCACACACGGATGTTTATTGCTACTTTTTCAGTTCCCCGCAAAA
ATAAAACGGATATGAATTGTACTtagttttctcttttattttataataag
gatattttttcaaaggtcAATTCCAAAAatatgtctaaacttttcaagtT
GAATTTTT

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00000815-protein

>TCONS_00000815-protein ID=TCONS_00000815-protein|Name=TCONS_00000815-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=408bp
MSKSNLSNISLGSFTENCLESYDPVACSRDITESVFAFLTIIGCTYKVVR
LHISKHKLLNQYLIFYAAIIEIILLLVNWIYAHHASLDLTAELFKLFQFL
VVCRFYCEVASRISKTEYLYKRICLPFLIITSTYYVILIIVSIVRMKAEH
ECKEPEWIQLSSSEVALGIIFIAVGIYITNHINNLKTDSTYKRNIRLSLW
GIILSFEFSSLISAIYDVLMIVYGEMNRCRGIFVTDAALFTSVHIFVKLT
KWLLPIWAMMIIFKPETFGTKSSNSDEEENFNDQPPIIRNSLMGDFKSEF
RPRNRSFNYKHLRDPDNEEERRLFNEQKENAIVEAEETPRRKRKKNKSGN
SESSNTSSAGKAVTQDAPVDSSSSKRHRDKNRNRTNQKQKKPSRNVGINS
GDIEPVKV

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000005:560072..571566-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00000815 ID=TCONS_00000815|Name=TCONS_00000815|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11495bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:560072..571566- (Clytia hemisphaerica)
TATTTTTGATTCGGTTTTTAGTTTTCAAAATCATGAATCTCAACACCTCT
AGCAATTTTCACCTAGCTGCATATTAGAATTTAAAAATATTTTTCAACCC
CACTTTAATAAGGCACTAATTTACTTTCAGAAGAAAAAAAAATAATGCAA
TGAGTAAAAGTAATTTATCTAACATTTCACTTGGAAGTTTCACTGAAAAC
TGTTTGGAGAGTTATGATCCTGTTGCTTGTTCAAGGTGAGTGAATATTTT
TATCAAGAGATCCTTGGATTATCCCAACATGATGACATTGGGGTAAAAAT
TAATATACAATTTTTTTCAAAGGGCAATACTTCCCTCCCCACGGTTTCAC
GTTCCACGGTTAATGTTTATCCAAAGTCTCTATATTAATGCCTTAGCTAA
CTCTACCTTAGATCAAATATAATACAATAAAACATACTAAACAGTACCTT
AAGGTAAAACATGTGTTTGATATAAAACATGATTGCTAAGATATAACTTT
TGAAGGTTTGAGGTTCGGAAATATAGTTCTACAAAAAAACAAACATTGTT
GTTGACTCCGATTAAAGTAATGACAAGACAATATCCTCAAATGATTATAA
ACACCTATTTCCAGGGACATAACAGAATCAGTGTTTGCATTTCTTACGAT
CATTGGATGTACATACAAGGTAAAAAAAATTTTAATGTAATAAGTTTGAG
TTTATCGACCCAGTGATATTCATATTGAAAATTTATTGTGGCTTGGATCA
CAAGATTTAAGTTTGGATATGTTACAAGAGATTCTTCTTCCATCATCGAG
AAAGATGAACATGGGGTTCACATCTTGTAAGAAAATCACACTTGATAAAT
TTGGATAATTATGAAGGTCTTAGTACTCATAGTAGAAAAAAAAGTCATCC
ACCTTGGCTGATGGTTAGAGAAGAATCTCTCAAAACGCAGCCAAACATAA
ATCTTGTGAACCAAGTCACCATGAACTTCCAATATAACTATTTTCAAGTT
TACAATGGACAAGTTTGGGAAGAGACAATGGGAAAGAGTGGGTCACTGGT
CAATGTTGCTTGTTTAGTTTCTAAAAATATCGACATGTTTCTAAAATCAC
TAAATTTGAAGGATATATCTGACATTTGATAATTTATGATTTATAATTTT
CACCACTTTTCAGTGTGTGTTTTTGAAAATTTTCGCCTGACAGCATATAA
GAGGCCCTCAACAGACCTTCAATTCATACAATCATTCAAAGTATTTTTCC
AAATTCAAGCATTCGCGCAATTTTTTTTCAAATTTCATGCAATTTTCCAA
TTCATTTAGAAGACGCATAAAGTCAAAAAGCCATAGTGTGGAAAAGGAGT
CTGACCCCCCCCCCTTCTTAAATGATCCCCCCTTCTTGGCATCCCCCAAC
CTTTAAAAATGCCTATCCCCCAAGGGTTTTGGGCTAAATTTTTTATGGTA
AAAAGGGAAGGGAAACAGTAAAGAAAAATTAAGTCTGGCAAATATAATAT
ACCACTTTTTAGTGAAAATAAAGAACTTCATTTCATGCAGACCAAATTTC
ATAACAGTGCTTGAAAATAATCTACAATATACGTAAGGGGGCTTCTTAAA
CAATCCCCCCCTCCTTTTTAATGAAATTTTCTGATCCCCCTCCTTCTTCA
CTTTTTTGGAAGGTGTCACCCCCCCCCCCTTAAAAAAAGGGGGGGGGGGC
CGAACTATGAAAGCCCACTCACACATTCATGCAAACCACAAGGGGTATCT
AAATTTATCCCATTTGCTTAAAATTGATATACAGGGTCAATTGTCAAGCT
CATAAACCTTCCCCAAGTTGATGATACAGTGTGCCTAACATCCTACTATT
TCGCCTTCAGGTTGTGAGATTACACATCTCAAAGCATAAACTGTTGAACC
AATACTTGATATTCTATGCTGCAATCATTGAAATCATTCTACTGTAAGTA
ATTTTCTCTTATTGCTTAGAACTATCTTTTAATATTAAGAGCTCAGGAGG
AGGATGGGGACCAGGGTTGGAGAATATCATTTGTGTGTAGACCGTACTTC
CATAAACCAACCCTTAGAGAGACTAAAACTAAAACTCAGCATTTTTTGCA
AAGAGACCCTCAAACAAGGGGAAAATCTTGACCCTTAGAGAGACTTTGAA
CTTGTTTTATTTGGTAGGTAACCCTTGGTGAGTTCAAAAAAACTAGCTAC
TGAAAAACATCTTGGTTTTAATGTTTGCCATACCCAAGTAAATTACCCTT
TGAAGCTTGATTTAAAGATATAATAAAACAGTTCAAAATGGAATATCATT
TTATAGATGAGGAAATCGAAGGAATACTGACCCAGTGGATTGATAAATAG
CTAATTGGGTTGTGTATTTCTCAAGCTAAATTTGAGTTGTTACATTGTAC
TAAAAAGGGTGTATAAACGAAAGTTCTGGTCATTATGCTAGTAATTTTAG
TGGTAAAAACAAAACAAATTTCAAAAAATTACATAAAATATCCAGTTCAG
TGTTATATATTTTCTTTGAGAACCCAAACTCCATTAATTATTATGTCCAA
GCTAGACCAAGCCATGCAATTTTGTTTATGCACTGCTTTGCTGCTTTTAT
ATTCCCATAGAATTAGAATTTTAGTTTGAAAATAATGCTTGGGGAAAAAT
TTGTCACAGGTTCTTTATATGGGTCATGGAACCACCAGAAAAAAAAGGCA
ATCGAATCAAAAGGTTTTTGGGAATGTTATAATGAACTCTGTTCCAAATT
TCTGCCACATGCATATTATTTTCAAGGTAAAAGCCTATATTGATAGTCCA
AGAAAATAGGGCGTCCTGTGACAACTAATGTAAAAGTTAGAGCAGTGAAC
CCTAAAAGTGGTGTCCAACTTAATTGGAAACAGTCAGTACTGTGTAGTAA
AAGGATGACGCCCAAACTCTGCAGAGTGAGGAAAACTTGTACAGTATTCT
TAAGATTCAAAACTTATGTCATGGAAAAGAGCTGGTAACGGTGTACCAAA
AAGGTGGTACCGAAAAGGTGGTACCAAAACCCCATATGTTGAAAATAAGC
AATTTCGTTGTACTAGGGTGGTATCACAACTCTGGCCGTGGAAAGAAAAA
GTTAGTACAGTTTACTAAAAAGGTTGGTGGTCAAATCTTTTGAAAAAAAA
CTCATGTTAGCTCTTTATGGCATGTGTTAGTTACATTGATTTGGTACCCC
CCCCCCCATCCTCCTTCTGAGAAAACATATATAAAAAATATAAAAATATC
TCAACATTTCTTTAAAAATGACATTTTTAGAAATGCTAAAATAATACAAT
ACCAATAATGGAAAAAAGATTTTAAGATCTCAGTACCTTAAAATCTACTA
CTCTAGGACCATCTTTTATAGGCACCAATGCTCTTTTTGAATATTATATT
TCATATGAAAATAACAAATATTGAGAAAATAAAGATCTGTCGAAGATCAA
ATCCTCACGAAAATACAGAGAAATATTTGAATTTTGCCATTGTTACCAAC
CTTTTTGACTATTTTTCTATCAAAAATAAGTAACTTCACTCTTCCCCAAA
ACGCTAATATTCTTAAATGAAAAGACAATCATTTACTCTCTCTTTTTACT
AGCTTCTATATTTTTTGCTAAGGTAAGATTCACCTTGTTTACTATATGTT
ATACTTCTATTAACGTTACTGTGAACTGTTAAAGTATTATGAACATAAAA
AAAGGTTGCAGTCACGCAGATGAAATCTGATTTAATTTGGAAATGGCAAA
GCTGTGATATGGTGTATTGTATTGGTTATGATTTTTGTCATAAAAAATGA
AAGAAATTATTAAACAGAAACTTGTTTTATTCAAATAAAAAGCCCCTATA
AAAATTTCCATTTCGAACAAAAACAATCTCATGAAAATTTCATAGCTATT
TTCGATAGACTTGCTTTGACCATTCGGTTTCAAAAAAAAGGGATTGGGTC
CTTCTTTAAAAGAATCAAAGACCAGTTGCTAGTAGAGCATTTAAATTCCG
ACAACACTATTTTTGAATTTCTTTTTCTAACCCTTTCTTGCTTTATCATT
TTAATCACTACTACCAAAATTTGAATCACTTCAACCAAGCATATTTCTGT
AACATTTACACTTTGAATCTCGTTATAACTGTCGGAAAGAATGTGAAATT
TCGAAGAAAATTGGCAGTTACCTTTAAGTGGAAAACCTTTGGTAAAGCAT
TTTTAAAAGCTTAGGCTTCACTCTACCTTGTTGTGTTGACAGCATACACG
TTTTTTTTTTCATTTATAACGCTTATAAACACAGCCAGCATGAGATTTGG
GCTTGAAAACATTATATATGTCATAGAGATTTAAGCATTATGCACTGCCT
TAACTGAAATGAACCCTATGATTGAAAGAGAGAAAAAAAGTTTATCAACC
GGAATCTAAATCTAGCAGTTACTTTAGTTTCTGTGGTTTACGAAGCCAAG
TAGAAGTTCCATTATACTACAGTAGAACCTCCAATTAGCGGACACTCAAA
AAGGTGGACACCTCTGATTAGGGGATAAAATATTTTTCCCCGGCCGTTTC
CTAGTCAATTCCTTATAAAAAAGTCTCCAAAAGGCGGACACTCAATTAGC
GGACACCTCCATTTAGCGGACAAACATTTTTGCACGGAATGGTCAAAAAC
CTGTTTTTTCCCTCCAATTAGCGGACACCGAGGAAAACATAGTTTCAGAC
ATTAAGATACAAGTAATAAGTGATTTTAAACCTTTATTTCAAGCATTTTT
TTGTGTTTTTTTTTCTCCAAATTTTGTTTACAAAGATTCAGTTTTTCCTT
TACCCAGTTGACAAGCTTTCCTGGGCCAGTAAAATAGTTAATGACTGGCA
CACCACACGAAGCCTTAATTTTCATTGACAAACTGATTAACTTAAAAGAA
ACTTAATAATGACGAAAAACCTCTCTATCTTCGCTAAAAAACAGACTTGA
GGTTGTTAGAATTAACAACAAAAAAACAAAAAACAATAAAGCTTTTTTTA
GATAATGGAAGTAACGATTACAGCTCTTCAAGCTCTTTCTCAACCCTGAA
GTTGACTTTGTTATTTTTAGTATTTTTAGACTTTTCTTGAACGATTGAAA
AAAAGTAGTTTGTTGTGTTTAAATAACTTTTCTCGAGTCTTTTCATGTTA
CTATGTCTTTAGGGAAATGCCTAAAGCCATAATTTCATGTTTGTGACCCC
CTAGTACGGTTTAATTTCGAAATCTGAGCCTGAAACTCAAAACCCTCCAA
AAGGCGGACACCTCTAATTAGCGGACACTAATCCGATTCCCCGATGGTGT
CCGCTAATTAGAGGTTCCACATCGACATTGAACCTTTCTTTTAGGCTTGT
TAATTGGATTTATGCTCATCATGCAAGCTTGGATTTGACTGCCGAATTAT
TCAAATTATTTCAGGTTTGCATCTGTTCCTTTTAAACACTCGTCAAGTTA
ACAAGGATTTTTAAGGCATACAGCATCACGCTGCGTAGCACACCACGGTG
AATTTTAAAAGTTAAGAATCAGAATAAATTTAATTGTTTGTACTACTTTG
CGGTAATTGCTCTACACGTCAATTACTTGTATTATTAAAATGAAAGTGAT
AACTTTAGCTATTTTCCAATCATTTGACAATGTACTTTGCAATTGAACGT
CGTACAAATTTCAGCTAAAAAATAATCATGACCTATGCGATGCGGATTGC
CATTGTCTTTTGATATAATTCTTGTCATTAAAATACTTTTCTTTCTTGCT
ACGAGGTCTAACACTTCTTCCGGCATATATCTATATCTATATGTAAGCCT
CAGTATTTAGGATTTGAGGTCGATGTATATATAACCCTTCCCATGACACT
AGAGGAGACGATCTTTCGGTGTGGGGGGGGGAGCGCATCACCGACCCGGT
AGGATTTTTTCAGCCAGTGAGGATAAAAATCACGGACTNGAACGATCTTT
CGGTGTGGGGGGGGGGTGCATCCCCTTCTCACCGACCCGGTAGGATTTTT
TCAGCCAGTGAGGATAAAAATCACGGACTGGAACTCGATGGGGATTGATA
TTCCCATATTTTTTGGCTTGGGATTTCAATTCTTTTGTTTTCAAGTCAGA
AAATTCAGTGGGGATGGGAAAAAGGCATATTATTTCGCAGGGAGGATTGG
TTTGTTTGATTGTTTACAGTGGGGACAAATATTGGAGGGTAATTCTCCAC
CGGGGACGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGGGTCCTAGGGGG
TCTGTGAGAAGAGGGTGTGGGAGAGAATCATAACTCAAAAAGTCTCCCAG
TCCCACCATTCACGTGGTTGACACATGATATTAATTGTTCGTTTCGCTCT
ACTATTTCTTTTTTAGTTTCTGGTTGTGTGCCGTTTTTATTGCGAAGTTG
CATCAAGAATATCAAAAACCGAATATTTGTACAAAAGGTTTGGTTGTGAT
TTTTCTTGCTCAAAGTTATTTTTATTAAATGAATGGCTAAATTTGAATTT
TGAGGCAAAACTTTAAATGTGAATGAATAATGTTACTTTGGACTTTTTAA
ATTCTAGGATATGTCTGCCATTTTTAATCATTACGTCAACATATTATGTC
ATATTGATCATCGTCAGCATAGTTCGTATGAAAGCTGAACACGAGTGTAA
AGGTATGGATATTTTTTGGGGTCATGCTTTTTTGTTGACAATTCAACACT
GATAACCATCTCTTCCGTAAAAACAACCCTTCTTGGTATAACTTGTATAC
CTAGGTGTAGTTGGAGCATCTTATAGCCAGGTTAAGGCAATCCAAATAGG
AACAGGGAAATTCTGATATGAAACCGCACTTACATAGGTTGGCGTCTTGT
ACAGGGCTCTCTCTTTGCCTCATGGGGTGTTTGACATTTTTAGACCATTA
GAAAAAAATAAGCTATCAAAAGAAACAATCATGACCTCTCTTAACCTCAC
CAGGGTTCAGCTCAACTGCTTTTCCGAGCTAAGTCTTCACAGACCTAGTT
TGAAGGATGACGATGATGATGTGGGAATGGGAGGAAGTTTAAGAACGACT
TACTATTTTCCCCTTTTCCACACTCTAAACTTTGTCTTGATTTAGAACCT
GAATGGATTCAATTATCTTCTTCGGAAGTAGCTTTGGGGATTATTTTCAT
CGCTGTTGGTATCTATATCACCAATCACATCAATAACCTGAAAACAGATT
CTACCTACAAAAGGAATATCCGATTGTCTCTATGGGGGTATGTTACATGG
AAAATTAATAAATCGACCATTTTGTTTCATTCTAACTTTCAGTACTAACT
GTCTATTGTCGGTAATTTGGCCAGCTGTGATGAATCATTTTGATTCCCGT
CTTGTCTCAAAATAATATTGGGTGATGATCCAATTATACTTAATATGATA
CAATTCGTTTGCAATATACTGGGCATTTTCCTCGATTGTTACGCCCAGGG
CGTATTTCTTTACGATGAAGCTTGATGCCCCGATACGAGAGCATATGTGA
CAGGACTGAGTACCAATTTTTTTTTTTTCTAGGATAATCTTGAGTTTCGA
ATTTTCGTCTCTCATTAGTGCTATCTATGATGTTCTAATGATCGTTTGTA
AGTATTTACTACCTTATCCATTATCTCACAAACATGCTTTTTTTTAAGGA
TTATAAAGTTTACTAGGCACTTGCGAGCCCCGGGGGGGGGGGGCACTGAC
CTTGAAAGCCGATGGGGACGTATCGCTGGAGTCTGAGAAATGGACCCATG
GATGGTAATTTTATGAGACCATGTTAGAAAGAAAGATTTTTCCATTTTCA
CCCTGAAAATTCTGATTTCCATCCTGAAAATTGTCAAAAGTTACCTAAAG
TCGACCCTTTCAGATACACATCTTGAAAATTATTAGATTTAAGACCCTGT
AAGATATCTTCAGAGATTAAAAAGGGACCCTGACCAGCGGCACACCCCGT
ACCCAATTTTGCCTAAGTCCCCCCCCCCCTGGTTGAGAGTACAGTGTAAA
TAGATAAGAGTCCAAAAGGAGCCTTGATGATTTTCAAAATAAGACTTTAG
ATTTGAAATTGCTCGAATACCTGCCAATTCTAAATGTTGTATTATCAGAC
TGTAATTTTATCTATCAATTGTTTTCAGATGGTGAAATGAACAGATGTAG
AGGCATTTTTGTAAGCATCTTATTACTTATCTTTTTATAAGACTTTATAT
GTTAGTATCTCTCGATTTTGTGTCAAGTTTAGTAAAAATATCTTGTTATA
TTTTAACATTGTTTTTGAAATTGACTATGCAAAGGGAAATTAAATTCTTT
TTCTTCGATGACAATGTTTGTTTGTAATTTCCACACAGGTCACTGATGCT
GCACTTTTCACGTCTGTACACATCTTTGTTAAGGTAATCTCTTTCTCTAC
TCTGCTCGGCTCTTTAGGATATTTATTAGCGCATTATGTACCAGTGATAT
CGTTTTCTGCTCTTGTGTCTCATGTATCATAAATTACTGCTCTTTTTGCT
TACCGCACCCGTTGGTTTACCTCAACATAAAACGACCTTGAGATCCTTTT
CATCGTCCAGCAATGTACTGGTCTTTTTTATATCTTTACATACTTCTGGG
TCAAGGTACATTGGTCTGAATGTATCCACGTAATGTTGTGTCTGTTTATT
TCGGAATCCCTAAAATTATTCTGTATCTATATGATAGCTTAAATACCTTT
AAACTAATAAGGTCAATCAGTGCTCAGAGTTCTTCCGTTTGTATCTAAAG
TATATAAAAATGTTTTTCCGTCTCAAAATTCAGCACAATTCACCGAAGTT
TTAAAAATATTTGCTAATTCTGGCTAATTTGATGTGTAAAATCCATCTTC
AGTCTCAGACGAAAAACCTTGCTTTGATCACTGGCCAAGTGTGTTTAACG
TCTTGAAGGTAGATGAAAGGAGTTTTTTTTACTTAGTTGACAAAATGGTT
GTTACCTATCTGGGCCATGATGATCATTTTCAAGCCGGAAACATTTGGAA
CGAAGAGCAGTAACTCAGACGAAGAAGAAAATTTCAACGATCAACCACCA
ATCATCAGAAATTCTCTTATGGGGGTAAATTACTCTTAAAATTATCATTT
AATTCCTTTTATTTTTACGGTAAATGAATATTGCTTGATTTAAGAAAAAA
TCTCCCTGTGGGTTTTTTCGTTAGTTTAAAAAGCAGTTGCCTTTTGATAA
ACTTGAACGAACTCTTTAAAACAGATGGTCCCGGTACAGCTTAAATAAGC
GAAAATCGTAGAACACTTATTACTTCTCAATTGTTGCTCTTTTTTTGCAA
GCGAAGCAGATATAATAGAGAATTCATAATAATTTTCATATTTGGCTAGA
ATTCGCCCGAAATTGTACTAGTTAGATATTTAGTTCATATATAAAGTTTT
TCATCGGCTAGAATTGTTGTAATCACAAAAAGAGTAAAACAACTTCGACT
GGTAACTATGTTTTTAATCGGTTTCTCGGGATTTTTGAGGTACCAAGAAC
TTGCAAACATTCGAAAAGGAGACATCATTTTTTATAAACATTTTATGAGA
ATTTTCATTGAGAAAAGCAAATGTGATCAATATCGTACAGGAAAATGGGT
ATTTATTGCTAGAACTGATAACATAACATGTCCATTTCGCTCTCTCAAAA
GATACATCAGAAAAATTAAGGCTTCCGAGTCAGAGTTTATCTTTCGTGGT
TTGACATACTTCAAATCGACGAACTCTTACTTGTATACAGAAACAGTGTT
TTCTTTATAGACCGGAGTGAATTTCACCCCGAGGTGATCTAGAGTAATGC
AGGGTTCGTTTACTTTCGGAACAAAATCTTTTTCTTTATTTCTAAGGTTT
CCTTGGATGTTTGCAAACTTTTTTCCTAGCCAGAACTTTAGGGTAACGTA
CTTCATAGTTTCAAACAATGACATTGCAAAGCCGTTATCATGTGTGACTG
CCACTGACTCTAAAGTGCGATAATATTAGATGCTTGATACCCGCTTTAAA
CTTGGTTTCATTTTGTAGGATTTCAAATCAGAATTTCGTCCTCGGAACCG
TAGTTTCAACTACAAGCATTTACGTGACCCTGACAATGAAGAAGAACGTC
GACTGTTCAACGAACAAAAAGAAAACGCTATCGTCGAAGCTGAAGAAACG
CCAAGAAGAAAACGAAAGAAGAACAAAAGTGGGAACAGCGAATCTTCAAA
TACAAGTTCAGCTGGGAAAGCTGTTACCCAAGATGCACCAGTAGATTCTT
CTTCCAGTAAAAGGCATAGAGATAAGAATCGTAATCGAACCAATCAAAAA
CAGAAGAAACCATCACGTAATGTTGGAATCAATTCTGGTGATATAGAACC
AGTCAAAGTTTGATACACGTGCGCCCGGTGCGCCAGTGTTTATGATGAAA
ATGATATTTTGATTGTTTGTGACAAGTTTGATTACATCAGAAAATATGTG
GTGTTTTGTGCAGATTATTGATTTCAAAGAGAAGACCCATTCTGTACAGC
AAAGCTATCTGAATGTGGTCCTTTGTATCGTCTTAATGATATCTTGGCGT
ATGAAAACTTCAAATCGAATATCAAATATCAAGCTTAGAGTTAGCTGTTT
GGGTGATTTTTAGTTGCCTTCAAAACCTTTATTCGATTTTGTTTTTTGTC
GCCATACTTTTTGTATATATTTTCGAAATATTTTTGTAAATATTTTAAAG
AGATTTTATAAAGAAGTCGTTTTATAAATGAGCTGGTACAGACTTGTAGT
AGTAGCTTCTTTTTTATTATGTTAATGATCAAATTGATGGCAATTAAAAA
ACTTAAGCCAGTATAAACTTCATAATTTCTTTATAGTGAGCATTTTTATG
GAAACAAATTTCCCTATAATTGCTTTAAAGATGATAGAAATCTCGGTAAA
TTGTTTTAAATTGTGCGCCCAAAAACACGTTTACATAAGAAGTGAGTATA
CATTACATTGAAGTTCTATTTTGTGAATAATATACCTGTAAATATTATTT
AGAAAACCCTTTATATATTTATGCATATAATCACTATACCCCATAATTAT
AAGCAATTAACTATTTTAGATTTAGATTTAGATTTTAGTTACAGATTTAT
TCCTGTTGAGTTTTAAGTTTGTCTATATTTTTTCGCTGATCCACATAAAA
CAGATTTTTAATTTATGAGAGAGAGTTTTTTAAGTAGGGTTGATTTGGCC
TCTTGACAAGATTTCTGAAATGTTCCGACGAGAAAAATCAAAGTTTCAAT
ATATTTTTTTAGCGAATGAGTCACAGTCCACAATCATCGATTCCTTCATC
TAGGAAACTAATTTTCCCTTGATTTGGTCACCAAGTGACTCTTTCACACA
CGGATGTTTATTGCTACTTTTTCAGTTCCCCGCAAAAATAAAACGGATAT
GAATTGTACTTAGTTTTCTCTTTTATTTTATAATAAGGATATTTTTTCAA
AGGTCAATTCCAAAAATATGTCTAAACTTTTCAAGTTGAATTTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005:560072..571566-

>TCONS_00000815 ID=TCONS_00000815|Name=TCONS_00000815|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1227bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:560072..571566- (Clytia hemisphaerica)
ATGAGTAAAAGTAATTTATCTAACATTTCACTTGGAAGTTTCACTGAAAA
CTGTTTGGAGAGTTATGATCCTGTTGCTTGTTCAAGGGACATAACAGAAT
CAGTGTTTGCATTTCTTACGATCATTGGATGTACATACAAGGTTGTGAGA
TTACACATCTCAAAGCATAAACTGTTGAACCAATACTTGATATTCTATGC
TGCAATCATTGAAATCATTCTACTGCTTGTTAATTGGATTTATGCTCATC
ATGCAAGCTTGGATTTGACTGCCGAATTATTCAAATTATTTCAGTTTCTG
GTTGTGTGCCGTTTTTATTGCGAAGTTGCATCAAGAATATCAAAAACCGA
ATATTTGTACAAAAGGATATGTCTGCCATTTTTAATCATTACGTCAACAT
ATTATGTCATATTGATCATCGTCAGCATAGTTCGTATGAAAGCTGAACAC
GAGTGTAAAGAACCTGAATGGATTCAATTATCTTCTTCGGAAGTAGCTTT
GGGGATTATTTTCATCGCTGTTGGTATCTATATCACCAATCACATCAATA
ACCTGAAAACAGATTCTACCTACAAAAGGAATATCCGATTGTCTCTATGG
GGGATAATCTTGAGTTTCGAATTTTCGTCTCTCATTAGTGCTATCTATGA
TGTTCTAATGATCGTTTATGGTGAAATGAACAGATGTAGAGGCATTTTTG
TCACTGATGCTGCACTTTTCACGTCTGTACACATCTTTGTTAAGTTGACA
AAATGGTTGTTACCTATCTGGGCCATGATGATCATTTTCAAGCCGGAAAC
ATTTGGAACGAAGAGCAGTAACTCAGACGAAGAAGAAAATTTCAACGATC
AACCACCAATCATCAGAAATTCTCTTATGGGGGATTTCAAATCAGAATTT
CGTCCTCGGAACCGTAGTTTCAACTACAAGCATTTACGTGACCCTGACAA
TGAAGAAGAACGTCGACTGTTCAACGAACAAAAAGAAAACGCTATCGTCG
AAGCTGAAGAAACGCCAAGAAGAAAACGAAAGAAGAACAAAAGTGGGAAC
AGCGAATCTTCAAATACAAGTTCAGCTGGGAAAGCTGTTACCCAAGATGC
ACCAGTAGATTCTTCTTCCAGTAAAAGGCATAGAGATAAGAATCGTAATC
GAACCAATCAAAAACAGAAGAAACCATCACGTAATGTTGGAATCAATTCT
GGTGATATAGAACCAGTCAAAGTTTGA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000489	XLOC_000489	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00000815-protein	TCONS_00000815-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000005	supercontig	sc0000005:560072..571566 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.12959	2.10678	1.04836	0.974375	8.61562	6.05171	6.74561	6.98382	5.37069	4.91284	5.48771	4.75848	5.9424	4.84959	4.27619	4.79589	6.25569	6.93433	4.80648	4.80647	8.62396	8.77682	4.24652	5.51758	7.57178	8.22155	3.00473	2.43892	4.04223	4.1533

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00000815 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00000815 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00000815 (transcript) - C. hemisphaerica