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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00009292 ID=TCONS_00009292|Name=TCONS_00009292|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1207bp
aaaaaataaagaagaagaagaagaagacaaaAGTATATTAATTGAAACAG
AAATAAAGATATTCTCCCTCAAcacaaaagaagaaataataTACAAGAGA
AAAGTATAGTAAAAGAAGAACCATAAtcacaaaaatggaaaattatcGAT
TAAACTCAAGTTCTAGTCTTGATGATCTACCGGACGAATTACCGAACGGA
ACTTCAACTCCACCTCCTCAATCttacaaagaaatcaaaagtccGGAACA
TTTAATCAACCGGAAAATCCGATCACCGGAATTGTATCCACGGCGTTTAT
CACATGATCCGTTCGGTGATAATTATTCCGACAGCGAAAAAGGTGACGAT
CATGACGACGAAGGTTCCGTCGTTTCCGACGTCGAACGAGCAAATATCGG
TCTTCGGCGAGAAGTCGGTTTCGCTGGATGTTTATCGCTTGTTATCGGTG
TTATGATTGGGAGTGGAATTTTCGCGTCGCCGTACGTCGTTTTCAGTAAA
GCAGAAAGTTCGGGGATGAGTCTCATAGTTTGGGCAGGCTCCGGTGTTTT
GTGTATTTTTGCGGCTCTTTGTTACGCTGAACTTGGTACTGCAATCAAAT
CATCTGGAGGCGAGAAAACTTATTTATCAAGAGCATTTGGTCCCTTGGTC
GGCTTCTTATACAGTTGGACGGCCATTTTGATTGTCAAGCCAGCCTCGCT
CGCAGGCGTATCCATGGCATTCAGTGCATACGTTTGTGAACCGTTTTATA
GAGGGACGACAGATGGAGCACCGTCATATTTGTTGAAATGCATTTCCGCT
GGTGGAATCGcggTGATTCTGATCGTGAATTGTTTGAGTGTGAAATGGGC
CACCCTGATGCAAGTCTTCTTTACGGCAGCCAAAATGATCGCTATCGTCA
TGCTTATCATTACAGGATTCGTTCGTCTCGGTCAAGGTCATGACGAGCAT
TTTAAAAACGCCTTCAACGGGACAAATACCGGTATATCAGACATCGGTTA
CGCGTTTTACGGTGGTCTATGGGCTTACGATGGTTGGAATAATTTGAATT
ACGTCAccgaagaattgaaaaatcctATCCGTGATTTACCGTTAGCCATT
ATGATTGGTATTCCCTTGGTAACGGGTTGCTATGTGATGGTGAATGTAGC
ATATTTGACGGTGATGTCCGCTTCACAGATTGCAACTGAAAAAGCAGTAG
CTGTGGT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000091:552803..568080- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00009292 ID=TCONS_00009292|Name=TCONS_00009292|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15278bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091:552803..568080- (Clytia hemisphaerica)
AAAAAATAAAGAAGAAGAAGAAGAAGACAAAAGTATATTAATTGAAACAG
AAATAAAGATATTCTCCCTCAACACAAAAGAAGAAATAATATACAAGAGA
AAAGTATAGTAAGTGAAAAACTTTTTATTTTATTTTCAGAAATTTGTTGG
CGCTATCCTAATTCATAACATTCGACCACCTGATGGAAATTTAAAAACTA
TTCATTTTCGATTCATTGAACAGTGTGAAGATTTTCAACTTTTGTAGTAG
TGGAGTTGATTGATTTGTTTTCATTTGTCGTTAAAGAAGTGTTCCTAAGC
TAGATGTAATCTACCTTCATTTGTTTGCTTGGTTCATTCAAATCTTTTTC
CAAGAATTTATAAGTTTTCAGTAGAGTGTTTTAATATGATCATAATTTTG
CTGACTCGCAACATTTCCTCAAAAGTTGACATCTTCTTCTCAAGGGAATA
GTGATATCATTGAAAGAAGTATCTCGTTGGAAAAACTATTTTGAGTAGAT
TGATGCTAGCTTTGAAGAATTTCCTATAATCTCGGAGATGAAGATGAGAA
CCAAAAAACTTTTTTTTGCAATTTTCTGAAACTTTCAACTTCCTCAAATA
TCTTATCCTTTGAATTAAAATTTTCAATCAAAGCGATACACTTTTCCAAT
AGAAAACTACACCTAACTAAGCTGAGGGATCATAATATTTTAATGGGAAT
TTATATAAACAAGTATATAAGCCTTGTTTTATTTTACCCTTACAAATCTC
AACAGATTGGCTTGAGATGTCATCTATTGTTCGTCCAATGATTATTTTAA
AACTATTCTTTGCCGGTGCCATATTTTCTTGCATTATTCATAAGAATGGT
ATTCAGTTACTTGCCATGGTCCATCAATACTTCATGCCCTCTTTATTCAT
TATTAAGGAGATAATTAATACTGTGTTAAGGAAAAACCACGATGCAAGGA
ACCATGGCATTTGTTATTGCGTAATTTATGTCTTCTTCTATTCGATTTTT
CCATCTTAATTTATTTTATAAAGTAAACATTTTGAATTCGAAGCAAGCTT
GAGTTAGCATTTCTCGTTCGTTTTAACGCTTACTCAATATTAAGCTTGCT
TTCTATATGGAGTGGTCAAAAATGGTTGTGTGTGTTTTTCAGTCTTAGCT
ATCATGTTATATGAATAAAATGATCTCCTTACAGTGCTACAAATAGCGGC
ATGTGACCGGTAACTACCGGTCATTTCGTACTTTCTACTGGTCATTCTGA
AGCTTACTTTTTCACTTTGTCCGGTTAGAATTTGAAGGCTATAGGCTTAT
TTTGTTAGTTAATCTTAGGGTCATTTCAGACTTTTGTAATTTTGTAAGGG
GGCACTGGCCCCCTAGAACCCCCGTTTGGAGCCCTTAGAGTGGCCCTGAA
CCCCCTACTCACACTATTTTCGCTATGCTACCAAAATTACTGGCCATTTC
TTTATTTTCAGCACTGTCTGATAAATTGATTAATTTAAGGTCAAGAACTT
TCCTAAAGGCAATTTTTTTGCCTCGCGTTTTTTTAATGGAAACTCTCTTT
AGAACGCATGCTCCAAATTAGTTGACACTCGTCTACCGTTGGTTCTGCTA
ACATACAACGTCCTAGACTAAGATTCCAACATTTTTCAACTACACGAAGT
CCTGGTCTTTTTTTTCGCTTGAAAGTGGTAATGTAATCGTTTAATATATT
TGACGGAAACGACGGTATTTCTCAACCGAATTTCCTTCTTTTTACATTCA
TCTTCGGTCTTTCATTTTGGGTGTATTGTAATGCTTTGGTATCTCTTTTA
ACTTTCCAGATAAAAGAATCAGAATATCAAAATGGAAAACGATCGATTAA
ACTCAAGTTCTAGTANTCCAGGTAAAAGAAGAACCATAATCACAAAAATG
GAAAATTATCGATTAAACTCAAGTTCTAGTCTTGATGATCTACCGGACGA
ATTACCGAACGGAACTTCAACTCCACCTCCTCAATCTTACAAAGAAATCA
AAAGTCCGGAACATTTAATCAACCGGAAAATCCGATCACCGGAATTGTAT
CCACGGCGTTTATCACATGATCCGTTCGGTGATAATTATTCCGACAGCGA
AAAAGGTGACGATCATGACGACGAAGGTTCCGTCGTTTCCGACGTCGAAC
GAGCAAATATCGGTCTTCGGCGAGAAGTCGGTTTCGCTGGATGTTTATCG
CTTGTTATCGGTGTTATGATTGGGAGTGGAATTTTCGCGTCGCCGTACGT
CGTTTTCAGTAAAGCAGAAAGTTCGGGGATGAGTCTCATAGTTTGGGCAG
GCTCCGGTGTTTTGTGTATTTTTGCGGCTCTTTGTTACGCTGAACTTGGT
ACTGCAATCAAATCATCTGGAGGCGAGAAAACTTATTTATCAAGAGCATT
TGGTCCCTTGGTCGGCTTCTTATACAGTTGGACGGCCATTTTGATTGTCA
AGCCAGCCTCGCTCGCAGGCGTATCCATGGCATTCAGTGCATACGTTTGT
GAACCGTTTTATAGAGGGACGACAGATGGAGCACCGTCATATTTGTTGAA
ATGCATTTCCGCTGGTGGAATCGGTAAGTTTTACGTCTATTTCATTGGTT
TTCTTCTTTCTCGTTTTGTTTATCGAAACTCCATGCCTGTGTTGCGTAAT
CGCATTATTCAGACCAGGACTAGATATAGACTAGAGTCTACTTCTGACTG
AACTTTGCTTTCTGATGGTTTTGATGGCGCTCGAGTCCAGTCTATCAAAA
TGCTATAAGTGGCCCCCGGGCTAGACTAGATATGACTATTAGTCTTACCA
CATGATCCTTTTGTTAGAGCTTCCTTAATGCTCTTCGAACCTTTCTTTGT
GTTTCATAAAGCACAAATTTTACACAGAATGCTTTTAAAAAGGAAGCTCT
ACTTCTCATTTTCAAAGTATTATAATAGTGAACAAGGATCGTTCATGATA
CAGGGTGTCGAGAAAACAACGGAGCGTACTTTATAGAAAGTAAAATCCCT
AAGATTTCGAATTCCCAGACAAGATAAATGATGTTGCAATAGATAGATCA
TAACAGATCCAAAGTCAAATAAATCAATATACACTGCAGTCTCTTTAACT
CGAACCTCTATAACTCGAATGTTTCCTTATAAAATTTACTCCATAACTCT
TTAACTCGGACAAATTTGTGTTCGAGTTTTGGGGACACAACTGTAAGATT
TTACTTAAAGATTATTTTTTGTTTTTTATGGACACAGTAGCACGATTTTG
GGTTGATAAGCCCTTGCACAACGTTAGAATGATTGCGAATCATGAATCAT
TATCTTTTGATGATGAAATCTTTGAATGAGAGATAAGATCGTGATCCCTT
GTCAAAACAAATTTTGTATGCGATAACTGGCTTAGCAAATCATTTTACCA
TACGATTGTAGGCTTTTTTGAAAGAGTGTGGTTGGTACTCTGTAGCCTTT
TATGGAGCTCCTTTGTTTTCTTGTGGAACGAACATAATTGTTGGTTGATT
TTAGAAGTATGCCTCTTCGAATTTTGTTCCTCCGAATCCTTTGCTTTATT
TTCTTTTGTGAAAAATGCATAAATGGGTGGAGAGGGTCTATTTGAGTTGA
GATTTGGAATAGACAACGTTCTTAACAATACGACGACTGCTTTAGGTGTA
CAAACTTCCGAAAATTCGGCAAATCGTGAATCTGACGGAAAAGTCTTTTT
CGTGAGCATAAACTTTCGCAAGTTAGAAGTTTATTTGCAGATTTTCTTTT
TTGTCAAGAATTTTTCGCGAATGACCCTTTCCAGAAATTTCAAAAGGCGT
TAACTTTCGTGATGACTAAAATTCACGAAAAATCGCAAAAGTTCCTGCTC
GCGAAAGTTTTTATGTCTAAAATAGTACACTTTTTTTTATAAAAACAATT
TTATAAGAACAATGAGGCTCAAAAATTACCTTAGAAAAAATAAGAACAAA
ATAACAATTCAAGGCTCAAAGTGCCAAAAAAATAAGAACAGCCGAGCCTC
AGCAAAAATTTATTTTGTATTGTAGTATATTACTGGACTTTGATTTATCA
TTTATTCACTGGGGTTATAAGATCTTACTTAATCTCATTCACCTACTCAT
CAAAATATTTTGCAAGATCATCATTTTGTAAGAGAGGTTCCATATCTTGT
TGACCGATTGACATTTTTGGGCATGTGACATTATCGGCGGAATGAGCCAT
TAAAACGCATCTCTCGATGTAGGACTATTGATACAGTGCAACTGTCGCAG
AGCTGCAGTTTATATTTATTGCAATGTCATTGTGTTGTTCATTTGTAGTT
AATTAGGTTATATACTTCATCGTTTGCTAATAGTTTTGTGCATTGTAATT
ATCTTAGGAATATTAATGTCTCTTGTGTATTGTATATATCTTGTAAGTCC
CTTGAGACAGTGCATTGTATGTTTCTTGTTAAATGTTCAATGAGTTTCCG
TGTTTGTCAGAAGTGTGTTAATATTGCTGTCAGTGTATGTTATAAGTGTA
CAGGGTGTCCCTAATTAAAGTATCGAGTCGAAACACAACTATGAGTAGAA
AGTTTTATGTGCGTGTTCACAAAATTGTATTTTAAGCTCTCCCTCTTTTT
TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTTAA
GCTCTCCCTCTTTTTTCTTTGTCATTACGATTAATTTATACGTTGTAACT
ACCTTTTGTAATAAGCCTGTGTGATGGAGAACGTTCTTATATTTCAGCGA
ATAACACACACAAACTTTTCTACTCAATCGCATGTTCAAACTCGATACTT
TAATTAGGGACACCCTGTATGTGGAAAGTGTTTTTACCGTTATTCGCAGA
ATAAATGCGTTTGAAAACTCAACCACGTTGACTCCTTATTGTTGCCTAAT
ATGAAGATTGGACGACAGTAACATACAGTATGTTTAATGTTAGAGTGTTG
ACTTTTGGATGTTCTTAACTTTCTGAGTTTGTGAGTCTAAAATGTTTTTA
TTTTCACCATTTTGTGAGTATTTTTACCCATTTTCCGGAAAATTGGGTGT
TCTTAAGTTATTCTTAATATTTTGGCCGACGAAGCCTTATTTTCTTATAA
AGTATTTTCTTATATATGTTCTTAAGTATCAAAAACATTTCTGTATAAGT
CAAAGGTATTTTCTTATAAAGAACTTTACATTTGCAATGACGCACTCAGT
AGCGTGATGAGTTGACATTTTGCCGTTCGTGGGAATTTCCTAACAAATGC
CCCTCTTTGTTTCAAATCGATTGCGCTTGTTAAGTTTTTGAATCGCGCTA
TCTTGACATAGAATCATAAAGTTTTGTTGACTGATTGTCCAATCAGAGGC
ATTCTTGTATAAACCTGCATTTCCCTACTATAGGCTTAAATCTTATTTTT
GGATGGGTGTCAAAATCTTTTCGCTGCTTTCTTTCTTTCAAATAACGATT
ACCCTTTTTTATCGAATTTTTGAAGAGATTTATCTTTGTAAAATGTGATG
TTTATTTTACGTATTATCAAAGGTGTGTTTGCATTTTGATTGCATTTTAT
AAAACAGTATCAAACTTTATGAAAAGTACTCGATAAATATATTAAGTTGG
TTCGAAACATGAAAAATACTGTATTGTCGTGAGAAGTATTTTGTTGGTGT
AATCTTCAGATAGTTTAGGTTTTAGGAAAATTCTGAGCTCTAACTTGAAT
GTGTTTCTTTGCATATCAAGATTGTGACTGGAAAGCAAGGGAGGTAAAAA
TTTAATGGTGTTTTCTCGTCCTAGTACATACTAGTTCAAGGTTTTGAAAT
CTCGAAAAAAAACAATTCCGTAAGGTCCGTACATGTTTCTCAATATTTTT
CAACCCTTTATCTATTTTCCGATTTGAACTATGATAAAAAGGGCGCTAAA
GTGGAATATTTAATTGACAATTAAGATTATCTAATGAGTGTAATTAAACA
AAACATAGCAAGGGTAATGATGTACTAATAAGTCACTAATCTTCGTAATA
CTCTCAATGGAATATTTCGTTTCTCGTATTAATCGCCATCATCAAAACAT
TAGTTTCATATTTGGAATGCAGTTCAATACTTCAAGAATATTTTTATTTC
ATTTTTATCGTAGCCCGGAAACCTGGCGACTAAAAGCCATTTGCTGAATC
CGGTTTCTTTGATTTTTATGATGGCGATGGCTTCTGGAAGGACTTGAGTA
CAGTTTTCTGTGCTTGTATTTTGATAGGTTAAAAAATCTCGAGAAAGCAA
TGCACCTTTTCGACCGTAGCCATCAATTGCCACGCGGCCATTTTTTTGTC
CGTTTTACCACCCTAAAACCGTCCCAGTCTTTTTTTCGCGCCTAAAGACA
ATAGAAAAAAGTTTAAAAAAAGGATTGGATCGAGTTTAAGGTGGTAAATT
AAAGAATAAATTGGCACGCGCCTGACCGCACGACTACGGTCGAAAAGGTG
TTTTATTTTACGCGTAATGACTTACAGTAATGGAGATTAGACGATCATTT
TCTAACGAAAAAGTTTATAATTGTGTCGTAATTAAATACCTCTTAATGAC
TATTAGCTTTTTGGATAGACTGTTATTTGAGAACTTTCACTTTAGCTTTA
AAAAAAGATACAGCATAGTAATTTTAGATAATACCTTTTCAACAAAAGAA
CTATTTTCTAGAAATCCCCAAAGCATTAGCAATTAATTTCTATTGGTTGA
AATATATTTACATTAAAACGTCTCGTATTTATGTTATCAAAAGAATCGCC
CTTTTGCACACGGCAACATTGGTTGCGTGTTTTCTATAAAAAGTGGCATT
AGAAGTAATATTTACACTGCTAGATTTAACCAGTGTAATTCATTTATAAT
CAAGTGAATAAAAAAGAAAATGGCGGCAGAAGATTCGAACCGATTATTGA
GCAATGGTGAAAATGAAAAAGAACTCAGTGAAGTGAATGGAATTGAGGCA
AAAGTGATGGGTACCGAAAAAGATGAATTATTCGCAAAAATCGAGGAGGA
CTCTGGGACTGGATTGAAACGACAAGTCAATTTGTTGGGCGGTATTTGTC
TACTGGTTGGAACGATTATCGGATCAGGTATATCCCGAAATCAAAACCCT
TTTCCCCTTTTTTTCAAAATCGATTTTCTTTTTTTACTGAATTTACTTGA
AAATGTCCCCAGTGTACTTGTTTCTTTTTTATTCCATCGCATTAACTCCT
TTCTGCGGCCACCTTTCGATAAAAACCACCCTCTCTTCCGCCCGTCCAAT
TAGGTATCTTTGCATCACCGACAACCATTGCTGAACGTGTACAAAGCCCT
GGAGCCACTCTTCTTGTATGGACTGGATGTGGATTAATCGCTATGTTTGG
TGCATTATGTTACGTTGAGCTTGGAACAATGTACCCAAACGAATCTGGTG
GTGAATACATCTACATTCAAAAAGCGTTCGGTGATTTGCCAGCTTTCTTG
TTAGCTTTCACCAGTGTTTCCATCATCAAGCCCTCCTCAATGGCACTGAT
CGCTCTTACTTGTGGTGATTACCTGATGGTGGCCATATCTAATCTAAATC
CCCACCAAATTTTACAAAATTGATCAATCGCCAAATTAAATCCTCGCCAA
AAATCGCATTTTGGCCAATCGCCAAATTAAATCCACGCCAAAATTAATCC
ACTTAAGGAAGATAACGAAATGGGGAGAGGTTTTTTTTCTCTCGCTTTTT
AAGGTAACATTTATATAGATTTAACAGAGCTTGATAATGTCTGTCATAGA
TCTGCTCTAGTCTAGTGATTGAAATTATTGTAGCTCGATGCAGTGTAGTA
ATATTCAGTTTACTGGATGGTGAGCCGTAATCTCTTTCTTGCTTTTTGCT
TCGATTTGTTTAAAGGCTTAACATTTTTGCAATTCTCACCCGAGGTTAGT
AAGCCGTGAAGGAGAATCATGCACTCACAAATTACTATTTTAAAGACGTT
AATTGTTCTCCACCCGTGTGGTGATGTGTATTTGTAACAAGGCAATATTA
TTAATTGGATTAATTAAGATTTGCTTTAGTAGCGAGGAAATCACTTTTTT
AAACATTGTGTTTTGAAATGGACTTTTTTAAATTTCTTGATGCTGTCATG
GCAGTGGACATTAATAGATGGTGTTATTTATTAATTATTAGTATGAAATT
TGGTCTGTAGCAACGAATAAATTCTCTATGGATGTATAAAGATTGTTGTA
GCCTTGTAGCTCAGTACGGTTTGAAGGAACAATTTGCTTTCACTTGTTTT
TAAGTGAAACATTGGTCCCAGAAACTTTAATAGTTTAAGTCAATAAGTTC
CTACTCAAACATTTAGGAAAGAACCCAGAGTAAACTTCAATCATCTTGAA
AAGGGAAATCGTTAGAATGTTATGTTGGTTTTAAGCATAGAGTTGTAACA
TCGTAAAATTGAAAGAAGTGATTTCTTATCAATCAGCTGAGAAGCATCAC
GTTTCAAAGGAAAACATTCGTTCTTTTGTTATACGAGACTGGGTACTAAA
TTGAGCAAATACAATAAAAATTGAAATGTCGAGTAAAAAGTCTTCACAAT
CCAGTAGTGATCACACGAGTGATGAGACGGTCGCTTTAATTAACTCTGAA
AACAAAATGTCTACAAAAATCGTACCAGTTGGTAGTGAACCATCTAAAAT
GGTAGACCAAGATGCAGGTCAAGGAGCTGGTTTACAGCGTCAAATCGGAC
TCATTGGAACAATAGCTATTCTCGTTGGAACAATAATTGGGAGTGGAATT
TTCGCTTCACCTGCTTCCGTATCAAGTCAAATGAATAGCCCAGGCGGCTC
TTTAGTCGTATGGGCGGGATGTGGCGTTATTGCTATGTTAGCCGCCTTAT
CTTGGATGGAACTTGGATGTATGTTTCCAAATAAGGGAGGCGGTGAATAC
GCCTACATTTACGCCGCTTTTGGGCCGTTACCCGCCTTCCTGTTTGCGTA
CGTTAACGTTTTGGTGACCAGGCCCGCTTCGTTGACCATCATCTCCTTAA
CTTGTGGCGATTATCTTATGAGAGCCTTCAATGTTCAAAATCATGAAAAT
TTTCAGTATAATAAACTGGTAGCTGCGCTGTTGTTAGGTTAGTCATAACA
AGTGTATTTTTCATTTTCGAAGCTTTTTCACTACCTGGTAGGAGAAATTT
AACAAACTTAACAAGGCTTAAAAAAAGTTTCTTAATTTCCAGTTTTCAAG
TTTCCACGTATCTTATCTGGCGGTGATTTGCGTCAGTTTGTTAGTTACAG
ATTCAGTATCAGTCTTTTATAAAATAAAATTGTTTTCAAGGACAAACACG
ACTGTCTGCTAAACCATTCATAATCTCTGATTGAAGACATTTTGTTTATT
CCGACCTAATACGTAAATCTTTTGAGGATTCCTCCTGTAGGTTGTTGTCA
CATGTTCAAATTGATTATGATTTTCCTTGAATGAAATTCCTTTTTGTTTA
TGTCTTGAGATTGTCATCGTTTGAACGTTCATTCGACGTCCGTGTGTGTT
ATTGGGCCATTTTCAAGTAATTTGTGAGCGTCATTGAGGTTTTGAGGGAA
ATAGTAACTTGAATGTCGAGAGTTTGTTTATTCAACTGAGTAGTGGGAGG
CCTTAAGTGATCTGAAATTACTTAAAGTTGGAGGATATTAGGTCATTAAG
CTAGACAGCTCAAAATTCTAAAAGACGCTTGAAATCCCTCATAGACTATA
ATGCTACTATATAGTTTCGAACATGTCTATTGTTTCTAAATTCCAAATTA
CACGCTTTTTCAACAATACACGTTTTTTTTTTATAAGGAACACGTTTATA
AGGAACTCGAGGCTGAAAATGGTTCAAAAAATAAGGAATTGTTAAGGAAC
TGCTCAGGCTGAGAATAAGTGGATTTGAAAATAATGTACCTTATTGGGAT
TAATTTGACCAAATTTGGATCTTTCAAGGGGCAAAAAGTTCAAAATTTCC
TATGTAGTAAGGAACTCGATAAGGAACTTTGAGACTGAAAATCTCTGTAA
AAATAAGGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTTCCTTATTAAAAAA
AAACGTGTAGCATGTAAATTTTGGCTGAATCTTGGCTGTTTTTATTTCAG
TCTGGTTTACTCGATGCTTACTTTGCTCCCTCATTGAGGAGCTTCAAGTC
GACATTTTCGTAGCCATTTCTAAAAGCTGAGAATGGAGTTCTTTAATTTG
TTTTTGTTGAAATTGAGTCTTCTGTTCTTATAGAATTATTCTTACAATTC
TGTTTCTTCTTAGTGCCAAAAGTGCCCAATGATATCTCAGAGTTTTTGAT
AAGGATGAAACTTATGTAAAAGAAAAGCTATGTCTTACTACCTAAAATAT
TCTACCGGAAGAATTTTACCGGAAAATAAGATCAGGAAAAAAAATTAAGG
TTGGAGCGCTAAAATTAAGACATCCAAATCTCAAAAGATGTTTACTGGTT
CTTAAAAATGAATATTTTTCAAACAATTCAATAATTAAGTAATATGACTA
CACATGACATTGATCTTGAGAAATTGACTGAAGTCTCTGAACTTTGGTCG
AGTGTCTTTAAACAGTTTAAGCGGTCCACCTTGGTGATTTCCAGTGAAAG
TTTGAAATGATCTCTCCTTCCTGCATTCTTAAAAAAGCAACGACTGAAGT
ATTCTCACAGATTCAAAACAAGCAAATCAATCATGAAATTTTAAAAATAC
TCATTTAACTGTTTAAGTTCACACTGAAGGAGTTCCAGTGTTTAATTTCA
TTCAAGTGTATTTTTTTGCTTTTACACAAAAACATCACCATTCACTCTGT
TTTGTTTCGTGTGATGTCATGGTGAATAGCTACAGTTACCAGAGGTTACA
ATCTTACTTTTAGGTGGGATTCTTGGACTCGTCAGACCCTCTTAATAAGA
ACAAACTATATAAGAACAAGGGAGGATATTAAGAACAAGTTAAGAACATT
TCAAGACTTTGTGGATTCTGAAACACCCGATTTCTTTGGAAATTACACCA
AAATACTCACAAAATGCTAAACCACGTCGTTGTATTTCGCTACAGCAAGC
TTGCAATAGGCTTAATGTCTATGTGAATCTTTCCAAACCACTCTTCTGCG
GAAATTTATATTTTTTATAAGAACTTTTTATAAGCACTATTCCCGCGTTC
CTGTGTCCAAGGAAAGATAGAGACGCTTGCTAGTCTAACAAAATGCTGAA
AATATGAACATTTAAAAGAACATTTTAAGGCTTAAAACTTTTTGATGTCA
TCAATCGATTCTCATTTCAACTGTTATTACCATGTGGAAACTGTGTGGAA
ACTCGAGAAGAATCTCATTCATAATTTGTACTTTCGTTGACCTTCCAAAG
TCACAATGTGACAAACATTTAGAACTCAAATATATGGCCTTCATGTTTTT
GAATATCAAATGACAAAATAGACAAAACTCAATCAATGTTGTCCCATCAT
GACAAAGTTGTAAAGTTGTTGATAGCCCAATGTTGTCAAAAATGTGACCT
ATGTACTGTCAATCAAACTTGAACATTACTAGAACTACCTCTTAAAATAT
ATGTTACTGAAGTAATATGCATTACACAGGCCCGACGGAACAACCGTTAA
AGTGGGGAGACTGTAGGCTCAAAGCGAGATAAAATTCCTTAGGAATTTGA
GGAGGCTGAAGTCTCCCCAGTCTCCCCGCTTCCACTTGGCCTGTACAAGA
AGTAAAGTTTGAAGCATATAAGGTGAAATATTCAAAGTTCAGTCATTTAG
AAATAAGTTTTAAAATCCCGTCCAAAAATGTATTAAACTTCTTTGACACA
GTTTTACGTATAACATTTTTTTTTTAATGAATCTGCTCAGTCTCGCCAGG
GTAAATTTTGTAGACGTTCTTATTACTCTTATCTAATTGGCTATTATATT
TTTTTATAAGAACAAACTTTATAAGACCATAAGGCTTCGATCACCTAAAT
AAAATATTAAGAACAAACTTTATAAGACCATAAGGCTTCGATCACCTAAA
TAAAATATTAAGAACAAGTTAAGAACAATTTAAAGATTTGCAGACTCTGA
AAATAAGAACACGTTAAGAACAGTTTTAGGTTTAAAACTAAGTTTAACTA
AGTTAAGAACATCCGAAGGCTTTAAAAAATTTGGATATTCTTATAAAAAA
AAAGTTATAAGAATCCAGATTTCGTAATCCTCGAAAAATAAAGAAAGTTT
CCATGTGAAGTATCAGATGGATTCGATAATTCTATATAACTCCTTCTTTA
TTTGACAGGTGAACAATTTTCACACCTTCATGTCAATCCCTTTTCTTCAT
TAAAAACTTTTACTTATTAAAATAGCGAATGAAATTTCCGCTTGAATTTC
ATCAGCTCGCTACTGACCGGATTTCACTCTAATTTTCATCATAATCCGGC
TACTATTTGGACTTTTTCTAAAATTAAAGGTCCATCAAAGATTTTCAATT
TTTCACCATATAGATTTTTTTCAGCTTTTCACCGTAAATGTTATGGTAAA
TCCTCATTAAACCGCCATAGGAAATACTAACTAACAAAAGAGAAATAGAT
TTTCTATGCCACTAATTGTTCTGCAAGTAATACAACTTTTAGTTTTGCCC
ACTCTGTACAGTGGAATCTCGAACCTCTATGACTGGAATATCTCCCATAT
CTCGAACAAGTTTTATGATCCCTGCTGGTAGCAATGCCTTATAAACCTAT
AAAAGGGGCCCCCTTTAAATGCCAAGTTTACATTTGCCCCTATAAATAAA
AAACAAACAGAAAATCCTGGCCATAGTTCAGCTCGATAGTTCTATGAATT
TTGATGATATTTTTAAATATACTTGATTGTTTTGTTGTTTCATATAATTT
TTGAAAACGAAATGTAAAATTTTCAAGATGGCAGAAATCTCTAATCTTCT
TCACTAGATTCAGCGCCAAAGAAAACTATAAAGTTCAGCTAGAAGAAAAC
TCTTATATATAGTATCATAGGATATGACACTACGTTGAAAATGGTTCTTA
AAATCATCTCAGGAATTAGATCTCACTGTGTCTGGGGTTGTCTTAAACAA
CGAAACCGCAGAAAGTTCATATCACTTGTTGTTTATGATGTCATTTTTCA
TCATATACATTTCAAAAATGTTCTGCTTTCAAAGTTTTTACTTTTCGTGT
GATCTGGCTTAACGTGTCGTTTTAAGATGGTAGTTTTAGCTGAAGTAAAC
TCCCATAAAAACTCTGTATACTTGAAATTTTGATACGTTCCATTTTTTGG
AAAACCTTTTTACAAAAGATGGAGATTTCGTACAAGAGAGCAAGTTTTTC
GTCTCAATCATCCGGTAGCAGTCAGGAAGAATTCGTTCAAATAAGACCGA
GTCATCGAGACAACGAAAACGCCGGATTTCTTATCCAACCGAATCGGAAA
AATGGATTGAAAGTGCATTTAACTTTATTCCATTGCTTGAATCTACTGTT
ATGTTTGGTCCTTAGTCCAAGTACTTTTGCGTCATGTCTTATTTACAAGC
ATGTTCAAGACCCTGGAATAATTTTAGTATTATGGACAACTTGCGGTGCT
TTTGTATTATGTTATGCTTTAGTATGGGTTGAACTTGGTACGATGTTCCC
TCGCGAGGCAGGTGGAGAATACACGTACCTCAAAAACGCATTCGGACCTT
TACCCGCGTTTGTATATAGCATGTTGCGCGTTTTGATTCTGCAACCCGCG
AGATTGACTTTGATCTGTTTGGCGAGTGGAGATTTTCTATTGAGAACGTT
TTCTGCTCAAATTGAGAATGTTGAAATTGCTCAAAAATTTATCGCTGCTG
CATTCATTGGTTTGTTTTCAAAGTCTTTTAATTTTGATGTTTGAAACATC
ACCCTCTATTTCATCCAGTCTAGGTTTCAAAGCACCAGGTTATATTGATA
TCAAAAGTTTGAAGCTACACGTTTATTTTAGTTTTCGAACTAAATGTGTG
TGGTCTTAAATTTAGATCTTGTCACAAGGTTGAATAGGGTGTTTTATGAC
CGTCTGATACCTCTGACCTCTTTGAAATATATATCCTTACTTGTATCAAA
TTCAGACTAGCCTGGTTTTATCCTTTTATCTCTGATATATGTATTTTCGT
TCTGCAAAGAAATTAACTGTCTATCTATTTGTGCGAAGTGTCAAATATTT
GTTAAGTCTTTAAACTAGACAAATAAGTTAAAGTTCTAGTTGGTAAGAGA
GTGCTGGTTTGGGTGGTCTCATTCCCTCGCGCCGACAATTTTTCTTCCTT
ACACTTACCTTATTCATACGCTTACTTTTCCCGCGTGATATTGTTCCAGT
CCGACTGACGTGCCAGTCGATGCCAAAACGATGTTTTTCTTCTTTTTTTT
TCAGCGGTGATTCTGATCGTGAATTGTTTGAGTGTGAAATGGGCCACCCT
GATGCAAGTCTTCTTTACGGCAGCCAAAATGATCGCTATCGTCATGCTTA
TCATTACAGGATTCGTTCGTCTCGGTCAAGGTAGGTTTTCATTTGACTTG
AAGCTTATTTACGCTCTTTACGATAGAATGCTTTCCTACTATGCTATCTG
AAATCTAATCATAAAAGTTTATAAAAGACTAACTCTTTGTCGATATTGAC
GTTGAAAGCCTTGGCGGAAGAAAATGAATGATCTCCATAGTTGGGAATGT
GGACAGAAGCCTTTCAATGTTTGTTTTTTTTCACCACTATTTTCACTAGA
ATTTCAACCTTTTATGATATATGGGCGATGTTTTGGTCCATTTAGATATT
GAAAGCCTGCGTGGATGGCTGGGGTAGGTATTGATAAAAAACGACCCTTG
TAAAAAGACACTACACCTTTAAAGCTGATTCACCGTCCCTGGCTAGTCAT
ATCACATAATTTATTGAGGGCGAAAATAATAATTTAGTATCACTTTTCTC
CACCTTGTTGTCTTTTGAACAATATATTTGACCGATTCTGTCTCTGTCTT
TTTTCAGGTCATGACGAGCATTTTAAAAACGCCTTCAACGGGACAAATAC
CGGTATATCAGACATCGGTTACGCGTTTTACGGTGGTCTATGGGCTTACG
ATGGTTGGAATAATTTGAATTACGTCACCGAAGAATTGAAAAATCCTATC
CGTGATTTACCGTTAGCCATTATGATTGGTATTCCCTTGGTAACGGGTTG
CTATGTGATGGTGAATGTAGCATATTTGACGGTGATGTCCGCTTCACAGA
TTGCAACTGAAAAAGCAGTAGCTGTGGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00009292-exon-sc0000091-1575043694:567973..568080 | TCONS_00009292-exon-sc0000091-1575043694:567973..568080 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009292-exon-sc0000091-1575043694:565508..566209 | TCONS_00009292-exon-sc0000091-1575043694:565508..566209 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009292-exon-sc0000091-1575043694:553551..553676 | TCONS_00009292-exon-sc0000091-1575043694:553551..553676 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000091 | supercontig | sc0000091:552803..568080 - |
Blast
BLAST of TCONS_00009292 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: BAT1 (b(0,+)-type amino acid transporter 1 OS=Homo sapiens GN=SLC7A9 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 294.278 bits (752), Expect = 5.602e-94 Identity = 140/292 (47.95%), Postives = 197/292 (67.47%), Query Frame = 3
Query: 330 DSEKGDDHDDEGSVVSDVERANIGLRREVGFAGCLSLVIGVMIGSGIFASPYVVFSKAESSGMSLIVWAGSGVLCIFAALCYAELGTAIKSSGGEKTYLSRAFGPLVGFLYSWTAILIVKPASLAGVSMAFSAYVCEPFYRGTTDGAPSYLLKCISAGGIAVILIVNCLSVKWATLMQVFFTAAKMIAIVMLIITGFVRLGQGHDEHFKNAFNGTNTGISDIGYAFYGGLWAYDGWNNLNYVTEELKNPIRDLPLAIMIGIPLVTGCYVMVNVAYLTVMSASQIATEKAVAV 1205
D+ +DE S+ S E L++E+G +S+++G +IGSGIF SP V S E+ G LI+WA GVL ALC+AELGT I SGGE YL A+GP+ +L+SW +++++KP S A + ++FS YVC PFY G P ++KC++A I I VN LSV+ + +Q FTAAK++ + ++II+G V L QG+ ++F N+F G + I AFY GLWAYDGWN LNY+TEEL+NP R+LPLAI+IGIPLVT CY+++NV+Y TVM+A+++ +AVAV
Sbjct: 3 DTGLRKRREDEKSIQSQ-EPKTTSLQKELGLISGISIIVGTIIGSGIFVSPKSVLSNTEAVGPCLIIWAACGVLATLGALCFAELGTMITKSGGEYPYLMEAYGPIPAYLFSWASLIVIKPTSFAIICLSFSEYVCAPFYVGCKP--PQIVVKCLAAAAILFISTVNSLSVRLGSYVQNIFTAAKLVIVAIIIISGLVLLAQGNTKNFDNSFEGAQLSVGAISLAFYNGLWAYDGWNQLNYITEELRNPYRNLPLAIIIGIPLVTACYILMNVSYFTVMTATELLQSQAVAV 291
The following BLAST results are available for this feature:
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