TCONS_00010286 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00010286
Unique NameTCONS_00010286
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2890

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00010286 ID=TCONS_00010286|Name=TCONS_00010286|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2890bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000104:70956..82901-

Legend: exon
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>TCONS_00010286 ID=TCONS_00010286|Name=TCONS_00010286|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11946bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104:70956..82901- (Clytia hemisphaerica)
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005778XLOC_005778Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:82302..82664TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:82302..82664Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:74848..74991TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:74848..74991Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:74652..74685TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:74652..74685Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:73446..73494TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:73446..73494Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:70956..73168TCONS_00010286-exon-sc0000104-1491911889:70956..73168Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000104supercontigsc0000104:70956..82901 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
12.2912 13.3525 8.82906 7.66505 5.61587 4.96585 10.0298 10.6538 7.49835 8.19713 7.10121 5.5619 6.91423 6.22831 7.7593 8.4064 11.629 13.9404 4.40204 5.856 12.0871 12.0104 7.37411 8.68959 10.1765 10.7273 15.2979 15.2793 9.47757 10.2672
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00010286 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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