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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00010286 ID=TCONS_00010286|Name=TCONS_00010286|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2890bp tttttagaaaaaaaacaaaaatacaaaaaagaaattcaagaatgATACTA GTAACTCTGCTATTGATAGGAAGCCTGTTTCATCAAGCTCATTGTGTTAG TTCTGTAAAACCAGCGAATGAAGCAACATCAATTACAGTACAGAAAGGGG ATGATGCTCTATTTCAATGGAACATTGTACTCGAAAATGGTGACCAAGAT GTtggtttaaaacttttaaatggAACAACAGAATTATGGACTCAGCAAAC GGGTAAAGTCAGTGATGCAGGAAAAGAACTTTTGCAAGAAAGATTAAAAG TAGAAAAATCTGTAACAAATTTAAAAGCTACAATCAGAAACGTGGATTTC AATGATTCTTCAATTGAATTGAAACTAACAGGAGCCATTTCTGACAGCGG CTTCAATAAATTAAGTGATGTTGATTCTTCTATTGCATTGAATGTCCAAG TCGAAACACCAAGTCCACCACCATCGGGTGATGATCCAGAATCTGGTGGA TCCAATGCTGGTGCAATAGCTGGAGGAGTTATTGGTGCTATCATAGTACT TGTCATCATTGTCGGAGTTGTTTATTATTGCAAGGCCCACAAAACATCCA CCAGTCACCGATCCAGGAGTAATTACGGgGCCAACGGAGGAGAATTCGAG TACACTAAGAATGAAAGACAAGATGTTCCTCAGTATGAGAGACCAGAAAA CGTAGTTCCGCCTTCCACCCAAACTGATGGCGGTGCACAACAGCAACCAC AGCGTCAAAAATATGACGAATTAGGACCAGGCGGTCGCGTTGGACCGCGT GATCATGTTGTCCAATCGAAGTATGCGGAAGTGAAACAAGAAGAAGACTA TGGAGAATCGGATCaacatgaagatgaagaaggaaATTTGGTCAGCGATA GTGTTATCGTATGAGTAACACTTCATGTGAACTCTTTCCTTAATCTCTCT TTTTCTCGATCTCTTACTTGCCTCAAAACTTTGTTTCAGTCTTTCATCTA ATGTCCGTTACGTTAAAGTGATGCCAGATGCTAGGTATTGGCTGAGACGA CGTATTCTGCCTATTTTGCTACGGTAAATAATGGTAACCCTTTTCCTTGT TGGCCTTTCTCCTTCTATTGTAGCCTAGAATTTCTCTTTTGGTCCAACTG GTTCAAACACTAGCTTCCCCAGGTTCAATGAATAGTTTTGATTTGGTTCA TAATATATCCGTATAATATAGTTTGTAtcatatttttgtttacattattA CATGTACAAATTGTTTGTGTATGTATCAGTTTTCTAGTTCTTATTACTAT CATTCTCTTTGTTTTCATGCTCATCATCGTATGACGTTCGAAAGGAAATA TGTGAGACAGTCTGTACCGATGTGTATGaatatcactttcaaaaataaaa ccaaTAGCTGCAATAGTGAcacaagatttttgaaattttcgcaAGAGAAT TCAGCTGCAATTCATATCATCTGACCaactttgcttttttttaataaaag cagaaaaaatgagaacaattaaGAACACTGATGAAGAATACTGAGCCTCG TATTCCTAAATTACAAGCATAATagtaaaagtagtaaaaatggAGTATAA AGGCTTAAAACGTAAATTTTGacccaaaaataagaacaggttaggaacaa tttgaggctccaAGTATCAGTGTAAGAACTTTAACAAGTGTACATTAACT TTTCTGTGAACTttatttaaggatttttttttttgttggaaaaaacGATA ATTTCACCCCTTGGTTAAAAATATTGTAGACCTTTATTAGAGAGGCGATG TGGATCTCCATTGTAGATAACGTAGTTCTTGAGGTTAAGAGATTTCGAAT TTTTCTTTCTCCCATagaatattttgttttaaataatctGCCATGTCTCT CAAAATTATGTTCCTTTAagattattttcataatttaacaccattttatt tttaaattcgCACGAAATGTTATACTTTGATATGTAAACTTCTTCAATAT AACCCCCAACCTAGTCGCTTTAGAAGTTAAAGGTTACCATTTCAAGTACT AGTATTGTAGATGTTTTTAGCATCTGATCCTTATCTTAACAGGCCACCAA CATCTGGaaactttagtttttttaaatcagagtTGGATTTTTATTTTAAC TCATATTGTTCCATTTTTGGGTGTTTATATCCAGCTAAAATGATGCCCTT TTTAGATTTGAAAATACTCAAGTTTAAGAAACACAACTATTTAGtatctt aagggaacttattttggcgggaactaattttggcgagtgagcatgatatt taattttggcgggaactaattttggcgagcggcgaaaatcttaaaaaatt ttaattttggtgggaaccaattttggcgaatgacagcgtaaatctgttct attttgtcttattttgagcaattttgatgaatttcagggattatttaggc aaggaaacaaaaaaattaattttggcaggaacttattttggcgagtgagc ataatatttaattttggcgggaactaattttggcgaattttgtctaaatt cgccaaatccgccaaaattagttcccgccaaaataagttcccttaaggta taatCAAAATTCTAATAAGTAAGGGTTTCCAACAGTCTCGCTGAATAGTA TACTGTATATTACAtactttttaaagttcatcaAATTAACATTTTCTCTA CTAATAATGTAATCAATTTATTTGTGAACCAACTCATCAGTAAACTGTAT AAAATCATAGTTAACAATATTAGTTAGGTTATATCTTTTAGAAGAATTTT CAAATATCAGCTTCACAAGCTTCAATACTTTGTAACTATAAATGATATCA TTTATTTATCCTCTTGAAAGTGGGCGTGGTCATATTAAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000104:70956..82901- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00010286 ID=TCONS_00010286|Name=TCONS_00010286|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11946bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104:70956..82901- (Clytia hemisphaerica) TTTTTAGAAAAAAAACAAAAATACAAAAAAGAAATTCAAGAATGATACTA
GTAACTCTGCTATTGATAGGAAGCCTGTTTCATCAAGGTGAGCCTGATTT
TGTGTTTTGATTTGTGCAGCTCATTAATTCTTCTAGTCTATTTTTCATAG
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GATTTATTTTGAGAGTTGTTTGAGAGTAATTCAAAAGCCTGTTATCTTAT
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TGGACCAGTCTATTGTGGTGCACAGCTTAAATCTAGTTATAATATCGGAC
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GACCTACCATTAGATGTCACCATTTCCACCTTTTCATACGAGTATGGGAT
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GGCAACGAGTGACATTTGGATTTACCAAGACTACAACTACGACTACCACA
ACAACCACCACAGGTTAAGCATTGCTGATCTTAAACTTTCTAGCGCAATA
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ATGTCTTTAAGGAAATCAATGCAATGACTTAAGACATTATGACGTTAATC
CTACCTGGTAACTCTAACCTTACTCTTTTTTCCTGCTTTAATAAGGGAGA
CAGGTGAATTGAAAGTTTCTACTAATAATCTGTAATAGGCTGGATGATAT
GCATTATTACTAGCACCCTGTGTTTCAGTTTGTTTAGCCGTTTAGCCCTT
ATACAACCCTACTATTTAGAGGTTTCAGAAGATAAAATAGATTACCAAGC
TTGTTTGCTTCTTTCCAGTTTCAAGTGTTTTATTACAGTGTTTATATATA
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GGGAAGTACAGAGGTATGTAAATTTGCTAGTTTAGTTAGCCTTAATAAAG
CCTCCAATCAGCTTATTTTGAATAAATTTGATAAGGAAGATACCAGTATG
AGAAGTCCTTAATGATAGTTGAGATATTCCCTAATTCATTTTATATTTGG
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GTGATGTTCATTCTTCTAGTGAAACCTGCTGTGCCAGTCGCCAATGATCC
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GTGTAATTGTTCTTGCAGTCATTATCATCATTGTTGTGATTCTAATGCGT
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GAAAAAAAAATATGATAGTTTTACAAAAGAAAAGAGAAAGTTTGCTCTAG
CCTTTGTTTTTTCTATTTGAATTTTCTAGCAGCAAAACACGACTCCATTG
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AAGAGTTTTTACTGAACTTACTGCACACAGACAATGAAATACTAACCATA
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CCAAAGTTTTACTATTCCACTATCACACACATTTGGGGCTTCTTGTCCCA
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GCATGAGGTATTATACAAAATAACCTGGATGTTTAACACTAATTGTCCCC
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ATTCTCACATCTTTCCATAAAAACATTATGAAACTTCCTTAGAAAGGTTA
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TTGTACTAAAGTGCTTCTCTTTTTTCTACTATACATAGTTTGCACTATAC
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CCTTCATTACAGCTCCCAAAGGTAAAGAAGTAGCATTTCATACTTCGAGA
CACTTTTGCAATAGAGATTTTTTATCTGTCTTTTATCAGATCAAAAAAAT
TTATTCTTCAGCTTTTTTGCTATCATGGATCTGATTTCCTCAATTTTTCG
TCTACCCTATTACTCTGTGAACCTTCACCTCTATTTATATATTTTCAGTA
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TGCATTTCATAAATTCGAAATAATTATCACCATTTCAGTCTCAATGTTTT
CTAGTACTCATGATATCCACCACTGCAATGACTTCACGAAATTATGCAAT
TTTTCTGTTTTTGTTCCACCCAATACGTCACTTTTTCTATTGTTTAAGTG
ACGTACTGGGTGGAAAATTTTAAAAGTTCTCAGAGGACACTCCAGTGGTG
CATATCATGAATAGTCAGAAAACCTTAACCTTGGAATTTTCCTGTTTGTG
TTGAAGCCAAACTTTCCATTAAATTTTTGTTGAAAAGTTTCGGCAAATTT
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ACAGGGGACCAGTTATACCTATAATGAAACCTACTCAAGCCTTTATGTAG
GTCTTAATACTATTTTAACTGTATTTTTACCAATGACGAGAACAAATTAC
TGAAACCTGTTTATAACGTGAAGTCTTTCTTTTTTGCTCTTCTCGAAAAA
TCTAATAAAATGAACGAACATTTTTTTAAGTTCTATTTCTATATTTTCCA
TAAAAATAGGATGATTTTAATCCAAAACTCTTTAAAACTCAAACTTTGAA
GTTATAAAAATTATTTGAAAATCCTGAAATAATAAAACTTCAGTAAAGCA
GCTGCGCGCTTTTTTTTTTCCGGGAAATCATTTTTGGCGAGACAAGGAAG
TGACGTCAAGATTTTCCGTCTTGTAGAAATACCATTCTTTACTGTTATCT
CGATAATCCAAATAAGTTTAACTCGTTGCTATGGTAACAATTCTCTTTGC
ATTATTTCAGTCGAAACACCAAGTCCACCACCATCGGGTGATGATCCAGA
ATCTGGTGGATCCAATGCTGGTGCAATAGCTGGAGGAGTTATTGGTGCTA
TCATAGTACTTGTCATCATTGTCGGAGTTGTTTATTATTGCAAGGCCCAC
AAAAGTAGGTACAAAGACTCCTATCTTAATAAAATCTTATTCAAATTTAA
CCTCGAATTAAGGCAAGAACATGTGAAAACAACTTGCTGGCAAAACTCCT
CTCAGCTGAATAGTATTTCTGTACTTTTCAGCCACTGATTTGATTATCGA
TTCTCTCTCTTTACAGCATCCACCAGTCACCGATCCAGGAGTAATTACGG
GTATGAATTATAACTAAGTTTTGTCAGTCATTTTGCTTATCATTTTCTCA
GTTTAAAGAAGGTTTTGTGTTTTTTAACAATTGCTCTTTGGTCAGCTTCA
GCAATTCCCTCAAGTTCTATCGCATAGGACTATATGAATGAGCTTAGGAT
TTGTTCAACCAAAGCAAAAAAAACCTGAATGGCGCGAAGCAACGAGTCGA
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GGTTGGCTGCTCTTTATATATAATATAGAGAACATTTGTCCCTATCTAGT
TCGATCTTTAAGGACTAAGAATTTTATTCGAATTATAAAAATATTCTTAA
CATGTTCTTATTTTCACCATTTTGTGAGCAATTTTGTCCATTATTTTGAG
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TTTAATTGCGGGTACGTCATTGGCACTGACGAAGCATTAACTTTATTTAT
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TTTGAAAGGGAAATTTATCAAGGCAAATATCCATCAGGAATAAAAACAAG
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GTGATAATTTGTCTACTTTTATGCCTATTTTTAGACTTTTTGAAAAATTT
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AACCACAGCGTCAAAAATATGACGAATTAGGACCAGGCGGTCGCGTTGGA
CCGCGTGATCATGTTGTCCAATCGAAGTATGCGGAAGTGAAACAAGAAGA
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AGTACTAGTATTGTAGATGTTTTTAGCATCTGATCCTTATCTTAACAGGC
CACCAACATCTGGAAACTTTAGTTTTTTTAAATCAGAGTTGGATTTTTAT
TTTAACTCATATTGTTCCATTTTTGGGTGTTTATATCCAGCTAAAATGAT
GCCCTTTTTAGATTTGAAAATACTCAAGTTTAAGAAACACAACTATTTAG
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GATATTTAATTTTGGCGGGAACTAATTTTGGCGAGCGGCGAAAATCTTAA
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AAGGTATAATCAAAATTCTAATAAGTAAGGGTTTCCAACAGTCTCGCTGA
ATAGTATACTGTATATTACATACTTTTTAAAGTTCATCAAATTAACATTT
TCTCTACTAATAATGTAATCAATTTATTTGTGAACCAACTCATCAGTAAA
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ATATCATTTATTTATCCTCTTGAAAGTGGGCGTGGTCATATTAAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:82815..82901 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:82815..82901 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:74848..74991 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:74848..74991 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:74652..74685 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:74652..74685 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:73446..73494 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:73446..73494 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:70956..73168 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1575043694:70956..73168 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1510915933:82815..82901 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1510915933:82815..82901 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010286-exon-sc0000104-1510915933:82302..82664 | TCONS_00010286-exon-sc0000104-1510915933:82302..82664 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000104 | supercontig | sc0000104:70956..82901 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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