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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00012102 ID=TCONS_00012102|Name=TCONS_00012102|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3792bp GCTTAggcaaaaaataaacaaaacaaaacacaatgAAGATTAACGTGGTA ATAATGACCTTGATGACGTTCTATTTTACCGTCGCAGCAACAAGAGTGTA CAATGATGCTGGTGACGTACTGGAACGTCAAATAAATGCCAAAAATACAa aaCGATACGGTACATTTTGTGATGAATCAAAGACCGTTTGTGGATTTCGA CATTGGGGTAAAAGACAGATGGTTCGTGGAGGATTTTGTAATTCCGATCG CACTATCTGCAAAATCTTTGGCAAACGTGCTCTTTCcaatcatcttcaaa tttgTTTGAATAAATGCGGACGTCAGCTATATATGGTCTTTCCAAACTGC GTCAAAAACTGTCTAGCAGCTGGCATGAAACTATGATTCGTTTTGATAAT GCTGATTTAACCTaggaatagacgatatcggcttcacatgaaaagtcaga tttgacccccgataattccccacaatgctttgtgcgggaaaaatttcacc gtgaacttttttccgccaaagcattgtgggcaatattcgggggtcaaatc tgagttttcacgttaagccaaTGTCGTCtattattatacactggattaCA AGTAGCTGATATTTGcagatttctcatgttctagctatgtccgcagtaat gatagtTCACTCTCCTTTCCCTCAACAAAGgatttttcaaagcattttaa ttgcttttttatcgaaattcaatcaatcaattcaaTCCCAAAAGAGCGCT TGGCAATGGCAATGAGTCGgttatccagtgtctataataattcttTGATT TAAATAACacgcccttctcacagacttgGTGGGACCCCctcccattggaa aaattggccaaactATCGTCCCCCGGTGGAAAATAATACTCaatagttcc atttatactgagatggaaaaatcgtctgagacgTGATCTGTGGAGaagat cctatttattgaaacataaatggaaagtacactcttccataatgctcatt ttctaaattgctcgtctcagaGAAATTattcgtctcagtataaatagaac taaTACAATTTTTCCCcgctaaaaataatcaaataaaaaaatcccttcat tgcaaaatattgtgctatatTTTGATATCtcaactgattttttttttact tcggAAAAGTGGAATTGAAaccaataaaaaactttcaaaaaaaccttctc acagacccgatcGGATTAGTGGGGATAAACTCAGATTGGaaattcccata ttttttatggctggggatttcaattcttttattctaaagtcagaaaattc attggggataggaaaaatagcataatatatTTGCAGTGAGGGCTGGTTTA ATTGATTCAGTATGGACAATAATTAGAGGAtcattttccaccggggacga tatttcggccaatttttccagtgggtctgtgagaaggaggtgtcaTTAAA GAATATGGGAATATAAATCTCTACTGAGTTACAGTCAGCAACACTGGGTG AAAAACCCTACCAGGACTGTGAGAAGGGTCGTGTTTACTAACAGTATTTT CATCATAAAGAAGTTTGAAATCATAGATGGGAATGGAATAGAGGGAACCC TTGAAATGAAACTGCTGTCAAATTTTAAGAGCTACGAAATTTGAATAGTG GAATAAAATGAATAGTGGATATTTTAAGGTGCgacttttgacaaaataaa tatatacaatttaaaaaatttcatggtTCACATTTATATACAGACCTCAA ATCTCAAATAACtctaaaatttcaactttttttaaagattgaatGAACTA GACCCTAAATTAATTCTTAACAGAGAATATTTAAATCTAACATTATTGTA TGACTGACTttaaattgtgtgtgcttaatACCCTAGAGCGTTATCATTGT TCAGAAATGaacggagaaattttttttctaatactTTTCCTGCGCTTTCA AGCATTCATCAgttagttaaaaaaaaactttttacaaacgACATTCCTAA TGTATGAGTTCGATATACTGTATGAAAAAGTTTCTCCGTTCATTTCTGAT CTATAAATCTAACATTTAAACATGCCAAAGAGACAAACTTTTGGATAGTG TTGTGGTGTAGCCACCACGAAATCAATATAAAATCAATCTGGTGTGATAC TTAATCTGGGAAACACCTTTTACACACCTTTCATGGGTTATTTCATTTGT TGTTTTGTGTGGTTTCAAGTATTGGAAATTTGCATTTTCAGCAGAAATTA TTTGGGATATTGAGCGAATTCTTTTAAAGAAAGCCGTTATTCTaagcata gtccgtataaaaaaaccCGGTCTGGAGGCCTTtcgtttctttccattgtt tcttacttgaacttgcgttgataAAATAGTTTGTtatgctcactttttga tcatgtaattaaattttaaaCTCATCCCTaagtacttggtaacgtgatca aaaactgaggaaatcaattctcattttttgataataacaaaagaaaaagc taacaaaaagttaaaacaaaatGCTTACAGACCAGTGTTTTTCATAAGGA CAATGTTCAAAGTTATGGAAATATAAAGAGGGAAAAATttaatattatat tataatatatttatTGCAATGTATAATTATGTTgataaaattcctttttt tctttgttatttaCAATTTATAATTTACAATACTTTTAAATTTCATAATT GTGGAGAAAATAAATATAGAATTCTCTAAACCCCTTTTAAAAATACGCAA AAAAATGAGAGCATTGCTGCACCCTTACGAGTTTTTCGGGATAATgtacc cctgtttcacagccccgtTGGAATTTTTCCCATAGTGGGGATTAGAATCC CTATCGgagtcccaatggggatagaagttGTGAGGCTGATATATTCTTCA GATCAGGGACAAAATtttatagatttataaagcccaaagggtcagatgtc gtgctttggctgaaaagtgtgccgaggttaggtaggaaatcctacctagg tcacgtaaTATtagaatagaatttcagcgcttgaccaataagacgcttca catgttttcaaaaacaataacagcgatattttttgtgatattcacttttt tttgcttgttgcTTGTAAGAGCTGAAAGCACAACATCTGTGCAGtgaata ttccaaaaaaaaagaaatccatAAACCGTCTGTACTGTATTTGCCGTATC GTTGTGTCTGTGCATAAAAACAATGTTGAAACAAAAAgctattttttata aattcatAAATTACTTTGATGTTGAAATAGGTACGACCGCAATGAATCAT GAAAAAACAGGAACGGTGGCGCTTGATCGTAATAACGTCTTTTTATCAGT CAGTCAGTTAGACAAGAAAGCTCTGCAGAAATCCAGACGCAGAAGAAGCA GTTATCAAAGACATAAGtttaaatggggggggggggggttgttgGTGTCA GGTAAAGTGTTTTTGACACACCCATACCCACGCCCACTTCTTTCTCCTAT GGGAATAATATTACTTTTTACGGGGTAATCAGAAAACAAGATGCTTACCG CCTGCGTACTATATCCGCTTTGCTTTACTATCTGTTAATTTCTGATTTCT TCGTGGGATAAGTCTGCCTTACTTTtgagttaaaggttttatttttaaat aagagtgatattgtttgcttgctcatcaattttaatttacaagctttttc acattgaattgacacagatgtggagcaatgttggtcagaaagaggaaagg aaaacataacataacataatataacaataggcaaacACTGtt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000137:432948..438753+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012102 ID=TCONS_00012102|Name=TCONS_00012102|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5806bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137:432948..438753+ (Clytia hemisphaerica) GCTTAggcaaaaaataaacaaaacaaaacacaatgAAGATTAACGTGGTA
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ACTGtt
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00012102-exon-sc0000137-1491911889:432948..433096 | TCONS_00012102-exon-sc0000137-1491911889:432948..433096 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00012102-exon-sc0000137-1575043694:432948..433096 | TCONS_00012102-exon-sc0000137-1575043694:432948..433096 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00012102-exon-sc0000137-1510915933:434246..434317 | TCONS_00012102-exon-sc0000137-1510915933:434246..434317 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012102-exon-sc0000137-1575043694:434246..434317 | TCONS_00012102-exon-sc0000137-1575043694:434246..434317 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00012102-exon-sc0000137-1510915933:435183..438753 | TCONS_00012102-exon-sc0000137-1510915933:435183..438753 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012102-exon-sc0000137-1575043694:435183..438753 | TCONS_00012102-exon-sc0000137-1575043694:435183..438753 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000137 | supercontig | sc0000137:432948..438753 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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