TCONS_00012127 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00012127
Unique NameTCONS_00012127
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4280

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00012127 ID=TCONS_00012127|Name=TCONS_00012127|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4280bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000137:436167..450388-

Legend: exon
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>TCONS_00012127 ID=TCONS_00012127|Name=TCONS_00012127|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137:436167..450388- (Clytia hemisphaerica)
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ATTGATTTCGTGGTGGCTACACCACAACACTATCCAAAAGTTTGTCTCTT TGGCATGTTTAAATGTTAGATTTATAGATCAGAAATGAACGGAGAAACTT TTTCATACAGTATATCGAACTCATACATTAGGAATGTCGTTTGTAAAAAG TTTTTTTTTAACTAACTGATGAATGCTTGAAAGCGCAGGAAAAGTATTAG AAAAAAAATTTCTCCGTTCATTTCTGAACAATGATAACGCTCTAGGGTAT TAAGCACACACAATTTAAAGTCAGTCATACAATAATGTTAGATTTAAATA TTCTCTGTTAAGAATTAATTTAGGGTCTAGTTCATTCAATCTTTAAAAAA AGTTGAAATTTTAGAGTTATTTGAGATTTGAGGTCTGTATATAAATGTGA ACCATGAAATTTTTTAAATTGTATATATTTATTTTGTCAAAAGTCGCACC TTAAAATATCCACTATTCATTTTATTCCACTATTCAAATTTCGTAGCTCT TAAAATTTGACAGCAGTTTCATTTCAAGGGTTCCCTCTATTCCATTCCCA TCTATGATTTCAAACTTCTTTATGATGAAAATACTGTTAGTAAACACGAC CCTTCTCACAGTCCTGGTAGGGTTTTTCACCCAGTGTTGCTGACTGTAAC TCAGTAGAGATTTATATTCCCATATTCTTTAATGACACCTCCTTCTCACA GACCCACTGGAAAAATTGGCCGAAATATCGTCCCCGGTGGAAAATGATCC TCTAATTATTGTCCATACTGAATCAATTAAACCAGCCCTCACTGCAAATA TATTATGCTATTTTTCCTATCCCCAATGAATTTTCTGACTTTAGAATAAA AGAATTGAAATCCCCAGCCATAAAAAATATGGGAATTTCCAATCTGAGTT TATCCCCACTAATCCGATCGGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006818XLOC_006818Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000137supercontigsc0000137:436167..450388 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.0208138 0.000218475 0.107607 0 0 0.354302 0.00435525 0.0051555 1.15726 2.28632e-05 0.520215 0 0 0 0 0.000162255 0.0742035 0 0 0.232999 0.00288859 0 0 0 0 0 9.9451e-10 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00012127 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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