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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00012688 ID=TCONS_00012688|Name=TCONS_00012688|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2094bp
ATATTACAATTAGGAGGACCAAATTCAGGGACAGCCTTTTAGGTTTCTAC
CCCCTCCATATCTGCACCATGTAATATAGTTTCGAAGGTACTCTTTTTTT
AATCATCTCGTTTGAAATAGCATGACATGTGTCACTGTAATGGTATCAAT
TAGAACTCCAACCTGGTAATTTATACCAGCTTAATAATTTATACCAACCT
GATAGTTTATCGGGTTATTATAATAATttattctttttctattttcaggc
TAGCGGACGCAATTAAAAGTCGACAATAACACAGGTCTTTTTATAGATAG
CAGTTCTTCTTTTTAAATTGAGAGCATCAGTTTTATTTGATGTCTATTTG
TATGGGTTACAACGAAGTCCTTCCACAAAAGAGGTTTCCAATGAAAATTC
AGCTAGAAGTTATCCTGTCACATTATGTTATATGGCTTCTGTAACTTATT
CGTGGAGTCACAAGGTGGATGGATTATTGCGTGAAACAGGTTTAAAACTA
TAAAATACAGCATGATGCATATTAAGTTggctaaaaaaaaagtttatagc
ATCCAAGTGTCATACAATAAAATTACATTCAATCCTATGCTGTGGTTAAA
AATCCCGTCAGAATAAAAATTCAAGGAATTACAGTAGGTTTTCGGTTCAT
AATTTTTGTTATTGATTCTCTTTATATTATGATTTTTCCCTTTCGGTAAC
TTTCAGTTAAAAGTTTAGTTTTTGGGTTAGAAACGTTTCTTTCTCTATGC
TGACTTCTAGTTCTTCCATTAATCATGGTTGACATATTCACATAATAAAT
TGACTAGATTTAGTCTTTCTTTCggtagcaaaaaaaaaacagaactcGAT
TGCAAATTGAAGTCTTTAAACGCTTGACTTGTTAAACTCGAATCGCTCCC
TGTACCTGAGCTGAGTAACNTCTTTTGgtagcaaaaaaaaacagaactcG
ATTGCAAATTGAAGTCTTTAAACGCTTGACTTGTTAAACTCGAATCGCTC
CCTGTACCTGAGTAAAGTGAGATAAAGGCAGGTTGGATTGATACCatcat
tttatttattattatcatttttttcttagttGTAATATATCATAGTATTC
AATATGCAGGGTATCATATAATAATTATGCGCGTTTCTTTCTTTATTATT
AGTGATGAAAACCTTAGTTTGAAATTTAGTAGNGAGAGCATCAGTTTTAT
TTGATGTCTATTTGTATGGGTTACAACGAAGTCCTTCCACAAAAGAGGTT
TCCAATGAAAATTCAGCTAGAAGTTGTCCTGTCACATTATGTTATATGGC
TTCTGTAACTTATTCGTGGAGTCACAAGGTGGATGGATTATTACGTGAAA
CAGGTTTAAAACTATAAAATACATCATGATGCATATTAAGTTggctaaaa
aaaaagtttatagcATCCAAGTGTCATACAATAAAATTACATTCAATCCT
ATGCTGTGGTTAAAAATCCCGTCAGAATAAAAATTCAAGGAATTACAGTA
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TCCCTTTCGGTAACTTTCAGTTAAAAGTTTAGTTTTTGGGTTAGAAACGT
TTCTTTCTCTATGCTGACTTCTAGTTCTTCCATTAATCATGGTTGACATA
TTCACATAATAAATTGACTAGATTTAGTCTTTCTTTCggtagcaaaaaaa
aaacagaactcGATTGCAAATTGAAGTCTTTAAACGCTTGACTTGTTAAA
CTCGAATCGCTCCCTGTACCTGAGCTGAGTAACGTGAGATAAAGGCAGGT
TGGATTGATACCatcattttatttattattatcatttttttcttagttGT
AATATATCATAGTATTCAATATGCAGGGTATCATATAATAATTATGCGCG
TTTCTTTCTTTATTATTAGTGATGAAAACCTTAGTTTGAAATTTAGTAGT
ATTTTTTATATATAGAATTTTTCCCCCTTGAATAAAAACTAATGGTACGT
CGTGTATTTTGGACTCATTTCATTTCTAAAAGCAAGAGCATCGTACATTT
TCCTAGAAATCGTTACAAATTTCCCAACTGTTTATAAGAAAATG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000147:317882..319975+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012688 ID=TCONS_00012688|Name=TCONS_00012688|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2094bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147:317882..319975+ (Clytia hemisphaerica)
ATATTACAATTAGGAGGACCAAATTCAGGGACAGCCTTTTAGGTTTCTAC
CCCCTCCATATCTGCACCATGTAATATAGTTTCGAAGGTACTCTTTTTTT
AATCATCTCGTTTGAAATAGCATGACATGTGTCACTGTAATGGTATCAAT
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TCCTAGAAATCGTTACAAATTTCCCAACTGTTTATAAGAAAATG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00012688-exon-sc0000147-1491911889:317882..319975 | TCONS_00012688-exon-sc0000147-1491911889:317882..319975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00012688-exon-sc0000147-1510915933:317882..319975 | TCONS_00012688-exon-sc0000147-1510915933:317882..319975 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00012688-exon-sc0000147-1575043694:317882..319975 | TCONS_00012688-exon-sc0000147-1575043694:317882..319975 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000147 | supercontig | sc0000147:317882..319975 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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