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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00012887 ID=TCONS_00012887|Name=TCONS_00012887|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2881bp
CtctcatattttttatttcctttcttttgaattttaggtAACATTTAAAG
TTTGATGTCTCGCCATCATATAGAATTGGTCTTTGAGgTTATGCAAATCA
ACTACAAaattccctaaaaatgacacgTACATCAGCTTCGAAATATACTA
CGCAACTACTTTGGCTTCTACTCCTATCGACTTTCACTTTTGCTGAGAAT
ACCTTACCTGTTCTTTGCCATCGCGCTGGAATCACCAATTCAACATGCCA
GTGTCAAGACTTTATCGTGAATCAAAATAACGTTACTGCATCATTGTGTA
CAATCCTTCATACTAATCCACAAGCTTCAACGCTTAACATTACTAGTTTG
GAAAACACGCATCTGTTACCAGGTTTAGCCGTCAATTATTGTTCTTTCTT
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GGAACAAAGTATTGGATAATTGCCGGACACCAAGAACAACGGAACTCCCC
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GATCGCGCATCAAAATTGTTCTTGTGATCTTTTTACTGGCACCGATGTCT
GCTCATTCGTTAAACCAAAATTCGTACGTCGAATCAATATGCACGATTAT
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CGGTAACTCTCTCGTTATTTGCGTTTCCGAATCAAGCCGTAAACGTAAAA
CGGGAAACTTGAACAAACTCATTCGTCTGCTAGCGTTTTATGATTTAATA
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ATGGTTGTACGGACCGTTCCTGTGTTCACTTTTCAAATCTGTGGAATCGA
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TACTTAAAATTATTTCATCCAAACTTCGATATCACACCTATCAAATTACA
CAGTTTCTTAGCTGTTAATTTTATATTTGCCATAGCTGGTATCTCACCGC
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CTGGGGGTAATATTCGATTTAGATTTGATTACAATCGCATTGGGGTTTAA
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aattttgaaaacttcctCATATAATATAATCGATACCTCGATTTGTGAAT
TCATATCAGATCAGCCTTAAAATGTCTGTTGAAAGTGTCTTTAAATGTTC
CTTAAAAATTGCCGGTCACCCTTCACTGCTCCTCCAACAATAAGAGTTTA
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GTTAAAAGCGCCaccaaatctttctttcaaaaatctaCCTTCTCTGCTTC
CCAAAAAGTAACATTTTGACTTTGTGAAAGTCTTTAAAATGAAGTACTTG
AAATCGTATGCGATCTTGAGCTTCTTTTGAATAGACTGCTGTACTGGTCC
CATGTTGCTTTGCGAAGCTCTTTTCTCACCT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00012887-protein >TCONS_00012887-protein ID=TCONS_00012887-protein|Name=TCONS_00012887-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=508bp
MTRTSASKYTTQLLWLLLLSTFTFAENTLPVLCHRAGITNSTCQCQDFIV
NQNNVTASLCTILHTNPQASTLNITSLENTHLLPGLAVNYCSFFNMTQSE
CNCRSVRIISRNKVLDNCRTPRTTELPVTAHLIRDVYDLCDLFGIAHQNC
SCDLFTGTDVCSFVKPKFVRRINMHDYQRVYAIFAAVTAFVGIFGNSLVI
CVSESSRKRKTGNLNKLIRLLAFYDLIFAIFQFVNVVPKFWTPKWLYGPF
LCSLFKSVESISAMLAVGVILAISIERYLKLFHPNFDITPIKLHSFLAVN
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IILIGALYTKIIRYLNRLNARPIIRTASDLVYQVSHQKENKRIINSMVSV
VFVFILFVFPKHIVTLYFNIKGWSNYVSGKDLSVDAYFALMYLAHIPYLF
HICANPLIYSITDSRWRHEFKRFVMTVKAGGRKATGKFTKNQHSSIDLTN
LTSVDHGV Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000157:299001..314174+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012887 ID=TCONS_00012887|Name=TCONS_00012887|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15174bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000157:299001..314174+ (Clytia hemisphaerica)
CtctcatattttttatttcctttcttttgaattttaggtAACATTTAAAG
TTTGATGTCTCGCCATCATATAGAATTGGTCTTTGAGGTAAGCTGCTGTT
CATGTATTTCATTTATCCTTTGTTTTGAATGTTGTGGTTTATTTGCCTCT
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ATACCAAGAAAAACTCTTGCTTACGATTAAGGCTGGGTATGCATCCTGAC
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TATAcgccagcctgaaatattttttcaagttgtcaatttttttctgtact
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CTTACTAGAATTTGCCTTGAATGTGTGATGTTTGTGAATTTATTCCCCTG
AAGTTTCTatttcaaacaagaaaaaaagttcttCGTCAGTTTTCGTTCCA
AGAGTGTTATCGCccttttgttgatttttattgtcgaccgccggaggcgg
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gtctaccatttactttcggttttttttaactagattacccaggtgtttct
cttctttttttgtctgaatgtcttttattcggaattaaataatcgagaca
tgaaaaatgactacaTTGTGATCTGTTTttaatgaataatctaaaatgta
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TCCCCATTAGGGTTCCAACTtagggttcccacttaggttcccggTTTctc
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CCATTTTCTTTATGCTCACTGCTGTAGCAGAGATATTCTCCGtcggatat
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GTATCCACGACTTTGAAAATCACTTTCCGTAATCAAAGCGGGCTAATCTC
CTACTAACTCGGAGGCGGGTCTTCTTATCAACAATCGAAGTAATTTGAGA
GTCTTACGTCATCATTTCAAAATGTTCATCATTCGTATGTTAATTACCTT
ATATCTTTGAAACATGGGGGCTTGACTAAAAATAAGAAGAACAATAATTT
CTTCCTAACAGATGAAACACGAACAAACAAATACGATCATAAAAAATCTC
ACaaatattaaaagaaaatctgttCTATTCTAGCTCTTTGATTAGCCCCT
AATTTCGTGTTTCATCATATTTTTTTTTGCGCCATGTCTCTTATTTTTCT
CTTCCTGCTTTCTTCTGTTTACCTGACCGggaaaaaacactattttaccC
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TTTTTCGTTTGCGCGCAGTATTCCCGTTACATTTGTTGATTAAAGAAAAA
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tatttcaaaacataaaatatttttcctaaTGTCTTTGGTACCGCCCTCAa
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ATATAGTTTTGTTGGATATGATTTCTGGTAGACCCTTCAGCTTTCTTTAG
ACTTTAAATGCCATTCGTATACAATTGGATTAGGCGTGATGGTTCATGGG
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AGATATAGCTTGTTCAATATTCTTGTAGATTCTTTGATAAAACCATAATT
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CCTGACTCATTCAATAAAGGAGAACTTGACCAGGGCATCTGGTGTCAATC
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ATTGGTCGATTTTGCTCTCATTGATAAGACCACCAACAATGACCAGTCTG
AATACACGTCATTAAAGATTAAGGAGGTTGACTGTAAGTTTAAGACACTG
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AAGAAACTAAACCGGACGAGAGCTTTGTAGCTGGTTTCGAAGCACTTTGC
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CAGTTCAAAATTTGATACAGGCAGCATATTTTCTTCTACCCTACGCGACA
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CGCAGTTGCCGTTCGATTCCGAATCGGTTTAGCTCCATGCAAAATGTTGA
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TACGCTTTGCCAAAATTCTGGGTAGCCAAATTCATATATGGTAAATTCGT
ATGCAGAGTGTTACGAGGTGCAGAATACCTTGGTGTCTATCTAGCTATTG
GTGTTATCTTGACCATCAGTATTGAACGTTTTATCGGAATCGTTAATCCG
TTTAGNACAGACTGGCGAAAATGAATGCAGTTGTGATAATTTTGAAATCA
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AGCTTTGTAGCTGGTTTCGAAGCACTTTGCGCACTCATTAACAAAACTTT
AGACGATTGTGATTGTAAGCTTTTTAACCTTAGTGATAACACAACGAAGC
AATCCGTTTGTGATTTTCTCCAACCGAAACCAGTTCAAAATTTGATACAG
GCAGCATATTTTCTTCTACCCTACGCGACAGTAGAGACCGTTGCTTCAGT
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GAATCGGTTTAGCTCCATGCAAAATGTTGATCGCTCACTTGGCTCTTTAC
GACCTGTTTTTCGCTATCTTCCAGTTCACCTACGCTTTACCAAAGTTCTG
GGTAGCCAAATTCATATATGGTAAATTCGTATGCAGAGTGTTGCGAGGTG
CAGAATACCTTGGTGTCTATCTAGCTATTGGTGTTATCTTGACCATCAGT
ATTGAACGTTTTATCGGAATCGTTAATCCGTTTAGCCGAGGAATCTCCAA
GACGGGTTTGAATGTCATTCTGTTTATAAACGGCTTGTGTGGATTAATGG
CGTGTATCCCGATCTTTTATTACAGCAGCATTACCGACCTTGGAATCTGT
GAAGTCGATTGGCCGAATGGAAGCCAGGACATGTTCATATACAATATGTT
TGTCCTGATCGTATATCTTCTGATCCCAACAATCATCATCGCCACGCTGT
ATTCATTAATCATATCCACATTACATGGAACCATTGTTCTTGGTAAAAAT
TCTTTCATCGCTGACCCCCGTTTACGGAAAAAGCGTCTCCAAGACAACCG
CCGCACCATGTATGTCCTGATCGGTGTTGTGATcgcttttgtcatttttg
ttttcCCTAAACAAGTCATAATGACATTTTTAAGCTATAATGATTATGGA
TGGGGCTCTTTCGCGAATCAACGAGACATGAAAGCCTCCACTTTCGTGAT
TCTGGTATACATTGCCCACTTCACTTATCCATTTCACGTTTCCATCAACC
CACTTGTGTACAGCTTAATCGATGCCCGATGGCGTAAAGATGTCCGCAAT
TTCTTTACTGGTCATAACTGGCGTAAACGTAGCGCGTATTCGGCAACCAT
GTCGTCGACCATGACCCAGCGACGTCGCAGTAGTGTTGCCACCGTCCTCG
ATGATCCATGTACTAAGAGAAAAAGTCCACCCACAGTTGGCAAGTTAAAC
CCAAAcatcaacaacaataacaacatCTCCAGGCCCAGACAACTGGTTGT
AACCGCAACCGCTACTGGTAAATTTGAAACTTTACCAACACCGTTAACCA
GTAGTGATGAACTATGGATTGAGGAAAATGGTggtcaaaaaagtaaattt
actTTCTTGACTTGATGTTAAAGGATGTTGGATACAATTTTATGATATGA
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TCAAACTTTGTAGTGATAAGCTATTTCACGACATTATTTGAGGTTACGTA
ATGCAATTGAGTAATTCGATTCGAACGTTTATATAGTAAATAAGCAAGAA
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ATGTTGTGTACTCCAAAATGTTGttggattttgaaaataatatattttaa
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TCATTTTTGCCTTACAAGTAAACATTAAAATGCTCTAATTTTCGACGATC
GAATCAATCAATAGAGACTCCAATGAAATCGGACATTAGTAAGGCTTAAA
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TAACCTTTTAAGGTTCCTTTCAACTATTTGACATCTTAAAAACCAAATTT
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GGCTgtgtatcgtgtataaaattcccgtccaaGAGTTACTccgaaagttt
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CGATGATAAGAAGTTAGATTTatcttattacacgaatattactaggcaag
tattcaacggccttgaaattaacgagctaaaaattaacacaaattttgtt
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CAGCATATAATTTCCATCATGGATATTTTTATTAGTAGCTTACCAACTCA
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TCATTTGCATTACAGTATCAGATCATTAGTCGCGACTTAATATCATCCTT
CTATTGACACGTTCTTCATTTTCTACACAACACATCCTTGTTTTGACTAT
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GAAAATatgtcaaccaatcaaattattAGAAGAAAATGGTTACAACACGT
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TAATGGGTTATCACCTTCAACGAAATCTCATGATTTTGAAAAGTCAGCAG
ATCcgaacaaaaaaaactttttttcttactTACGTCCGTTTTGGACGTAA
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TGATTGGAATGGTTTAAGATAAACTGGGGCGGGTCTGGGTGGGGTTGGCT
CTGCTATAGGTGAGGTTGgatgattttttcaaatgtaatgttccttaaaa
aatgttcaattcATTGGAAATGGGTTTTTGATAGTGactattttgtttct
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gacaTTTCACACTTATTTAAAGGACGTTGAATTTTAGGGTGTATCTGCTA
GTTCGATACGTGACCCTTAAATAACTGAGATTATCACAGaatttattcat
tattttcgtcCGCGACAGACAACTTAAGAAGAGTTTCATAGTGATTTTAC
TTAAGATGCAGCACAGATGGACTCGCTCAGTAGGAAATACTGGTTAATTG
TTATCTCAAATAATTGGCTGATACTGAACAAGCCTAGCCACGAAATTGTT
GTACCGTCAACttctccaacttgggactatctgacgaaacatgggacggc
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cgaccaatcgcctcaagttagagcagttgacagtaacAACATAATAGAGT
GTAAGATTTACTTTATTTCGATAACTTCGGATAAGAACGATCTTTATTGG
GTAATAAAGCCTTGGTGTgcttattttttgacaattttcagtttagaatg
ttcttatttgTATTCATGAATTAATCCACTCAATAATTAACAAACAGAAT
TTACCTTGGGTTACAAATTGCTTTAATTTAAAGTTGGGAATTGAAAGAAT
TACTTATTTATATTACGAAAGTTATGAATTTATCTAGTCCACGCAATATG
GGGCACTTACCCCCATCTCAAGCTCTTCGactttttttgggttttttagt
tttttggacTATTTTTAATTATGAATTTAGATAATGTTGAGCAAATTTGG
TGCATGTCGTCGATTAGACTTACCATATTCTTACAATGTTataatttttc
ccaaattttgacGTAACTTTGGATTTTACGTGGGTCTTTGATAATGACTT
CGCCAATCGTATGGACTTGTTGGTTGTTAAGGTTATTTTAAAGTTAACAA
GAAGCTATCTAGTTTATCGCTATAAAGTGTAATTATCGAAACCACAGTTA
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TATCACAACTCATGCCTACATTTTTCGCAATTCATTTGCGCATTAAGCAA
GAATTTTGACAAATTCTTTCATTTCTATGATTGCTTCTGTTGTAATTGGT
TGTGCGAAATCTATAAAGGTAACGTGAGTTTGATattgaaagataaaaat
ttctctgtTTCTCTATTATATACGTGTTTTCAAACAAGGAAAGGGGTTTT
GCAAATCATTGGTAAATGTTGATGGTTGGTGTTCAATTTTACATACATCT
GCACCTGAAAATGCGGATATTCATgtcgtaatgttttctacggaaagacc
ccaaATTTTAactggcaaattttatacagctttatttgtctagtttaaat
ttgccactactggttaaaaccggggtatttatgtagaaaacattacttca
tgaatatcatgaagaTATCAGGTCTTATTTCCTGGAATTCagtcatttga
aagaaaaaataacttttgtgGCCCATACCCTCCCTCCATTTTCTACAAGG
TATACCGGTGACTGTTATCTTTTCAGTTGCAGTTTCAGGTctcagttttt
caaaatttgtgagatggattttttttacttgaaattcgccttttttcatt
ttttaggtcAAAAGTATTGAAATTTGCTGGTCAAAGCGATTTTTTGCTTA
CGTGACGCAACAGTGTTATTCACTCTTTCTTTACCAAGAAAAATTAGTTC
CTCAAAGGAGTAGACTGGCTACTTAAGCGTTATTAAAAACCTCCCCCATA
CTCAAATCCCTCAAATCCAAATACGTTTTGATGAGAAAAGCTAATTTTGA
CCCAACAAAACGTCAATTTTTGTGACGTGATCGAGGGAAActtgatttta
aagatttttagtCGATTTTTAGTCGCAAATCAATACGATGTACAAATAAT
GACGAAAATCTGTAATCAGTAGATTCTACATTTCACGTAGGTTTGCTGTT
AGGATGTTATTTTTAGtactcaaaaatctttttcaatcatATCCTAGATT
TGAGTAAGAAGAGAACATGATATTTGTTTAACTTTCAATATCGTACATCT
ATAAGTACAGGGAGGGAACGAGGAAATATAAACATCTGTCAGTTATAAAA
CCCCTGTCGGAATACTAAGTATGATTACTAGTAACCCAGAGGAAAGATAA
AATATTCTTGagctttttatctttttttagtcCTTTTTTAGGCTTATTAT
ATaagttcgaatgtttttttttgtgtcaTATTCTATCTTCTTCGCGCTGT
TGTTTTGTGCTCAAAACAGGCAAAAAGATCGATCATATATATTTTGCAAT
CATTTCAAAGCCACATGCTGGGTTGCGTCTCTGGtttttcagtttgaaaa
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TACGGGAAATGCAAAAAGGAAACTTCGATAGTTTTGGTTTTAATGCTCAC
GGATGCCCTCATTCAATAATAGGGAAATATTTTTAAGCTCTAATCTAATA
TAATATAGTGTTCAGTagagttttttgcttaaaactaAAGAGATGCAATG
CTCGGTCAATGATGACCGAGACCTGCTATTCTTTTGTCATGCGCCAAATT
TGACCTTGATATCCGTGTTTCAATTCATGCTTTTTCAATAATGTCCAATC
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TGTGCCTTTTAATTCTGAAATCGTTTTCACACTTGTCTCTCAAGAAGTAT
GATGTGAAATTTTAGTAGTAGTACTGTATGAGCTGATGATGGGGCCTTTT
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TTAAATCAACTttatcgctttcgttttcaggTTATGCAAATCAACTACAA
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ACTTTGGCTTCTACTCCTATCGACTTTCACTTTTGCTGAGAATACCTTAC
CTGTTCTTTGCCATCGCGCTGGAATCACCAATTCAACATGCCAGTGTCAA
GACTTTATCGTGAATCAAAATAACGTTACTGCATCATTGTGTACAATCCT
TCATACTAATCCACAAGCTTCAACGCTTAACATTACTAGTTTGGAAAACA
CGCATCTGTTACCAGGTTTAGCCGTCAATTATTGTTCTTTCTTCAACATG
ACACAATCTGAATGTAATTGCCGGTCAGTTAGAATCATATCCCGGAACAA
AGTATTGGATAATTGCCGGACACCAAGAACAACGGAACTCCCCGTTACGG
CTCATTTGATTCGCGATGTTTACGATTTATGTGACCTTTTCGGGATCGCG
CATCAAAATTGTTCTTGTGATCTTTTTACTGGCACCGATGTCTGCTCATT
CGTTAAACCAAAATTCGTACGTCGAATCAATATGCACGATTATCAACGCG
TTTACGCCATCTTTGCCGCCGTAACAGCTTTTGTTGGTATTTTCGGTAAC
TCTCTCGTTATTTGCGTTTCCGAATCAAGCCGTAAACGTAAAACGGGAAA
CTTGAACAAACTCATTCGTCTGCTAGCGTTTTATGATTTAATATTCGCTA
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CATGCTAGCCGTTGGAGTTATTCTAGCTATCAGTATTGAACGTTACTTAA
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TTAGCTGTTAATTTTATATTTGCCATAGCTGGTATCTCACCGCTCCTCGC
TCATTTCCAACTAGACCAAGAACTACAAATTTGTAAAATCCAATGGCCTC
TTGCCCATTCGGAAGGAACTGTATATCAAGGCGTTACTTTCATCTTATAT
TATGTCATCCCGATCATCCTAATCGGTGCTTTATACACTAAAATCATCCG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
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| GO:0007186 | G-protein coupled receptor signaling pathway |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
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| Term | Definition |
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
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G-protein coupled receptor signaling pathway |
| cellular_component |
GO:0016021 |
integral component of membrane |
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G-protein coupled receptor activity |
Blast
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